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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-11881 | |||||||||||||||
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タイトル | DNA origami pointer object v2 | |||||||||||||||
マップデータ | DNA origami pointer object v2 | |||||||||||||||
試料 |
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キーワード | DNA Origami / DNA | |||||||||||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 7.4 Å | |||||||||||||||
データ登録者 | Thomas M / Feigl E / Kohler F / Nagel-Yuksel B / Willner EM / Funke JJ / Gerling T / Stommer P / Honemann MN / Martin TG ...Thomas M / Feigl E / Kohler F / Nagel-Yuksel B / Willner EM / Funke JJ / Gerling T / Stommer P / Honemann MN / Martin TG / Scheres SHW / Dietz H | |||||||||||||||
資金援助 | ドイツ, 2件
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2020 タイトル: Revealing the structures of megadalton-scale DNA complexes with nucleotide resolution. 著者: Massimo Kube / Fabian Kohler / Elija Feigl / Baki Nagel-Yüksel / Elena M Willner / Jonas J Funke / Thomas Gerling / Pierre Stömmer / Maximilian N Honemann / Thomas G Martin / Sjors H W ...著者: Massimo Kube / Fabian Kohler / Elija Feigl / Baki Nagel-Yüksel / Elena M Willner / Jonas J Funke / Thomas Gerling / Pierre Stömmer / Maximilian N Honemann / Thomas G Martin / Sjors H W Scheres / Hendrik Dietz / 要旨: The methods of DNA nanotechnology enable the rational design of custom shapes that self-assemble in solution from sets of DNA molecules. DNA origami, in which a long template DNA single strand is ...The methods of DNA nanotechnology enable the rational design of custom shapes that self-assemble in solution from sets of DNA molecules. DNA origami, in which a long template DNA single strand is folded by many short DNA oligonucleotides, can be employed to make objects comprising hundreds of unique DNA strands and thousands of base pairs, thus in principle providing many degrees of freedom for modelling complex objects of defined 3D shapes and sizes. Here, we address the problem of accurate structural validation of DNA objects in solution with cryo-EM based methodologies. By taking into account structural fluctuations, we can determine structures with improved detail compared to previous work. To interpret the experimental cryo-EM maps, we present molecular-dynamics-based methods for building pseudo-atomic models in a semi-automated fashion. Among other features, our data allows discerning details such as helical grooves, single-strand versus double-strand crossovers, backbone phosphate positions, and single-strand breaks. Obtaining this higher level of detail is a step forward that now allows designers to inspect and refine their designs with base-pair level interventions. | |||||||||||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol |
添付画像 |
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_11881.map.gz | 97.3 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-11881-v30.xml emd-11881.xml | 216.7 KB 216.7 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_11881_fsc.xml | 12.2 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_11881.png | 33.2 KB | ||
Filedesc metadata | emd-11881.cif.gz | 17 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-11881 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-11881 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_11881_validation.pdf.gz | 487.5 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_11881_full_validation.pdf.gz | 487.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_11881_validation.xml.gz | 13 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_11881_validation.cif.gz | 17.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-11881 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-11881 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 7areMC 7arqC 7artC 7arvC 7aryC 7as5C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | |
電子顕微鏡画像生データ | EMPIAR-10623 (タイトル: cryo-EM single particle dataset of a DNA nanostructure called "The Pointer-v2" Data size: 9.0 TB Data #1: Multi-frame micrographs of a DNA nanostructure called "The Pointer v2" [micrographs - multiframe]) |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_11881.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | DNA origami pointer object v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.8656 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-試料の構成要素
+全体 : DNA origami pointer object v2
全体 | 名称: DNA origami pointer object v2 |
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要素 |
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+超分子 #1: DNA origami pointer object v2
超分子 | 名称: DNA origami pointer object v2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all / 詳細: DNA Origami |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
+分子 #1: SCAFFOLD STRAND
分子 | 名称: SCAFFOLD STRAND / タイプ: dna / ID: 1 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 2.23640275 MDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA) (DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC) (DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA) (DG) (DC)(DT)(DC)(DG)(DC) ...文字列: (DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA) (DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC) (DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA) (DG) (DC)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC) (DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA) (DA)(DT) (DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DT) (DT)(DG)(DA) (DC)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT) (DG)(DC)(DG)(DA)(DA)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA) (DT)(DC)(DT)(DA) (DA)(DT)(DG)(DG)(DT) (DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT) (DC)(DT)(DA)(DC)(DT) (DC)(DG)(DT)(DT) (DC)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC) (DA)(DA)(DC) (DT)(DG)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA) (DC)(DT) (DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC) (DG)(DT)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DA) (DG) (DT)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT) 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+分子 #2: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 2 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #3: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 3 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #4: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 4 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #5: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #6: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 6 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #7: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #8: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 8 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #9: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 9 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #10: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 10 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #11: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 11 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #12: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 12 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #13: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #14: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 14 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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---|---|
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+分子 #16: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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---|---|
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+分子 #19: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 19 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #20: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 20 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #21: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #22: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 22 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #23: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 23 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #24: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 24 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 13.037403 KDa |
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+分子 #25: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 25 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #26: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #52: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 52 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #54: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #55: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 55 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #56: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 56 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #57: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.810541 KDa |
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+分子 #58: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 58 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.32401 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA) (DA)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC) (DT)(DG)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DT) (DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA) (DA) |
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分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 59 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.465038 KDa |
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+分子 #60: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 60 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.852258 KDa |
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+分子 #61: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 61 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.282271 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC) (DA)(DA)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT) (DG)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT)(DT) |
+分子 #62: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 62 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.35091 KDa |
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+分子 #63: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 63 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.87438 KDa |
配列 | 文字列: (DG)(DC)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA) (DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT) (DC)(DA)(DT) |
+分子 #64: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 64 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 13.973954 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG) (DG)(DG)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DG)(DT) (DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DG) (DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DG) (DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #65: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 65 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.389309 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT) (DA)(DG)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT) (DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA) |
+分子 #66: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 66 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.698229 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DA)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT) (DC)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC) (DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DT) (DT)(DC)(DG) |
+分子 #67: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 67 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.063119 KDa |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.904261 KDa |
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+分子 #69: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 69 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.473376 KDa |
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+分子 #70: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #71: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #72: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #73: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #74: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #75: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #76: STAPLE STRAND
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+分子 #77: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #78: STAPLE STRAND
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+分子 #80: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #81: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #82: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #83: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #85: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #86: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #87: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #88: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #90: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 90 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #91: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #92: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 92 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.218857 KDa |
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+分子 #93: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 93 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #94: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 13.593699 KDa |
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+分子 #95: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 95 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #96: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 96 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.536053 KDa |
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+分子 #97: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 97 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.425963 KDa |
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+分子 #98: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 98 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 15.064618 KDa |
配列 | 文字列: (DG)(DG)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC) (DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT) (DT)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT) (DT) (DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT) |
+分子 #99: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 99 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.000836 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DT)(DC) (DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DG)(DC) (DT)(DC)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA) |
+分子 #100: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 100 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.953298 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DA)(DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DC)(DC)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT) (DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DT) (DT) (DT)(DT) |
+分子 #101: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 101 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.227857 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA) (DA)(DG)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG) (DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC) (DT)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC) (DT) |
+分子 #102: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 102 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.301905 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA) (DG)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DC) (DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG) (DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DC) (DC) |
+分子 #103: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 103 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.864378 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA) (DA)(DG)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA) (DT)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT) (DT)(DT)(DC) |
+分子 #104: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 104 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.167829 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DT)(DT)(DT) (DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT) (DA)(DA)(DC)(DT)(DC)(DA)(DT)(DA)(DC) (DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DC) (DG) |
+分子 #105: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 105 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.756473 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT) (DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG) (DT)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA) (DG) (DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT) |
+分子 #106: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 106 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.349905 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DG)(DA)(DT)(DG) (DG)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT) (DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC) (DG) |
+分子 #107: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 107 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.498128 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DT) (DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC) (DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT) |
+分子 #108: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 108 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.798496 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA) (DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT) (DT) (DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG) |
+分子 #109: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 109 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.156876 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DA) (DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DA) (DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA) (DC)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC) (DG) |
+分子 #110: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 110 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.718462 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA) (DG)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT) (DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC) (DT) (DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DT)(DT) |
+分子 #111: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 111 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.398022 KDa |
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+分子 #112: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 112 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.366908 KDa |
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+分子 #113: STAPLE STRAND
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---|---|
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+分子 #114: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #115: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #116: STAPLE STRAND
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+分子 #117: STAPLE STRAND
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+分子 #118: STAPLE STRAND
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+分子 #119: STAPLE STRAND
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+分子 #121: STAPLE STRAND
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+分子 #127: STAPLE STRAND
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+分子 #128: STAPLE STRAND
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+分子 #130: STAPLE STRAND
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+分子 #131: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 131 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #132: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #133: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 133 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #134: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 134 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #135: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 135 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #136: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 136 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #137: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 137 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.272255 KDa |
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+分子 #138: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 138 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #139: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 139 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #140: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 140 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.827632 KDa |
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+分子 #141: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 141 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.340695 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DA) (DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DG) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #142: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 142 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.324009 KDa |
配列 | 文字列: (DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DA) (DA)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DG)(DA)(DA)(DC) (DA)(DA)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA) (DA)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DG) (DG) |
+分子 #143: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 143 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.18388 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT) (DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT) (DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG) (DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA) (DG) |
+分子 #144: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 144 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.577398 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT)(DC) (DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC) (DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT) (DA) (DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA) |
+分子 #145: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 145 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.760515 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DC) (DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG) (DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG) (DT)(DC)(DC)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT) (DC) (DC)(DC)(DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA) |
+分子 #146: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 146 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.43473 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC) (DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG) (DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DG)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #147: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 147 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 8.050228 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC) (DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT) (DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #148: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 148 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 13.584771 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA) (DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA) (DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA) (DG) (DC)(DC)(DA)(DT) |
+分子 #149: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 149 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.046506 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA) (DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG) (DA)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG) |
+分子 #150: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 150 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 8.042201 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT) (DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA) (DT)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG) |
+分子 #151: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 151 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.387019 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DA)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC) (DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DC) (DG)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA) (DG) |
+分子 #152: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 152 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.407726 KDa |
配列 | 文字列: (DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG) (DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG) (DA)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DC) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #153: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 153 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.439776 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA) (DG)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA) (DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DA) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #154: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 154 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.308945 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DT)(DG)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC) (DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT) (DA)(DG)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA) (DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA) (DC) |
+分子 #155: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 155 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.366025 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC) (DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT) (DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA) (DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA) (DG) |
+分子 #156: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 156 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.413019 KDa |
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+分子 #157: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #158: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #159: STAPLE STRAND
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+分子 #160: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #161: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #162: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #163: STAPLE STRAND
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+分子 #164: STAPLE STRAND
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+分子 #166: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #167: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #168: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #170: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #171: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #172: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #173: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #174: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #175: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #176: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 176 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #177: STAPLE STRAND
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #178: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 178 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #179: STAPLE STRAND
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---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
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+分子 #180: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 180 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.476095 KDa |
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+分子 #181: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 181 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.394002 KDa |
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+分子 #182: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 182 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.431996 KDa |
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+分子 #183: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 183 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 13.754833 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC) (DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DC)(DG) (DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG) (DC) (DT)(DT)(DA)(DG)(DG) |
+分子 #184: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 184 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 10.363658 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DA) (DG)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG) (DG)(DT)(DT)(DT)(DA) |
+分子 #185: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 185 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.747533 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT) (DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DA)(DG)(DT) (DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA) (DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DA) (DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DC)(DA) |
+分子 #186: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 186 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.791562 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG)(DA) (DA)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA) (DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA) (DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT) (DA) (DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC) |
+分子 #187: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 187 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.266893 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DG)(DA)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DG) (DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG) (DT)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DT) (DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT) (DA) |
+分子 #188: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 188 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.701474 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC) (DA)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DG)(DA)(DA) (DT)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DC)(DG)(DG) (DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA) (DA) (DA)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT) |
+分子 #189: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 189 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.549159 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT) (DT)(DT)(DA)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DT) (DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT) |
+分子 #190: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 190 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.369993 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DT) (DT)(DG)(DC)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA) (DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DA) (DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT) (DT) |
+分子 #191: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 191 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 15.414972 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA) (DT)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA) (DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT) (DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT) (DA) (DA)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT) |
+分子 #192: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 192 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 15.412998 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA) (DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA) (DT) (DA)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA) |
+分子 #193: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 193 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.352991 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DC) (DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA) (DT)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT) (DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DC)(DC) (DT) |
+分子 #194: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 194 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.815304 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DC) (DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA) (DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DA)(DT) (DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT) (DA) (DA)(DT) |
+分子 #195: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 195 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 11.28028 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT) (DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DC) (DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA) (DT)(DT)(DT)(DC)(DA)(DT)(DC)(DT) |
+分子 #196: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 196 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.809604 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA) (DT)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DG) (DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA) (DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA) (DA) (DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DG)(DT)(DA) |
+分子 #197: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 197 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.286966 KDa |
配列 | 文字列: (DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA) (DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DT) (DA)(DC)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT) (DA)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DC)(DT)(DT) (DT) |
+分子 #198: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 198 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.790327 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG) (DG)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA)(DT)(DT) (DC)(DT)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA) (DC)(DC)(DT) |
+分子 #199: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 199 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.842644 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC)(DG)(DA)(DA)(DG) (DC)(DT)(DA)(DA)(DT)(DG)(DA)(DA)(DA)(DT) (DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT) (DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DG)(DA) (DA) (DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA) |
+分子 #200: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 200 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 14.855573 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT) (DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DG)(DA) (DC)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA) (DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA) (DA) (DT)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG) |
+分子 #201: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 201 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 7.285729 KDa |
配列 | 文字列: (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT) (DT)(DT)(DT)(DT) |
+分子 #202: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 202 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
---|---|
由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 9.829398 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DG)(DA) (DA)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DC) (DA)(DA)(DG) |
+分子 #203: STAPLE STRAND
分子 | 名称: STAPLE STRAND / タイプ: dna / ID: 203 / コピー数: 1 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 12.420004 KDa |
配列 | 文字列: (DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC) (DA)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT) (DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DG)(DC) (DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA) (DG) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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グリッド | モデル: Quantifoil / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 詳細: Grid was coated with graphene oxide |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / チャンバー内温度: 293 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
詳細 | Monodisperse, 50nM |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 20.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 50.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm |
実験機器 | モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |
+画像解析
+万見について
-お知らせ
-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
- EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
- これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。
関連情報:EMDBヘッダ
-2020年8月12日: 新型コロナ情報
新型コロナ情報
URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php
新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。
関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
新型コロナウイルスの構造データ
- 国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病原ウイルスの略称を「SARS-CoV-2」と決定しました。
- 万見で扱っている構造データベースでは、"COVID-19 virus"、"2019-nCoV"といった別称・仮称でも登録されています。こちらでウイルスの詳細と構造データの一覧を見られます。
関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報
+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更
EMDBのIDの桁数の変更
- EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
- EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。
関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記
+2017年7月12日: PDB大規模アップデート
PDB大規模アップデート
- 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
- 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
- このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
- EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。
外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。
-万見 (Yorodumi)
幾万の構造データを、幾万の視点から
- 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
- EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。
関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点