ChemComp-VDP: (3R,5S)-5-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-7a-methyl-4-[(2Z)-2-[(3S,5R)-2...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: VDP
名称	名称: (3R,5S)-5-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-7a-methyl-4-[(2Z)-2-[(3S,5R)-2-methylidene-3,5-bis(oxidanyl)cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]propyl]-3-methyl-3-oxidanyl-1- ...名称: (3R,5S)-5-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-7a-methyl-4-[(2Z)-2-[(3S,5R)-2-methylidene-3,5-bis(oxidanyl)cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]propyl]-3-methyl-3-oxidanyl-1-(4-phenylbutyl)pyrrolidin-2-one

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: VDP

名称

名称: (3R,5S)-5-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-7a-methyl-4-[(2Z)-2-[(3S,5R)-2-methylidene-3,5-bis(oxidanyl)cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]propyl]-3-methyl-3-oxidanyl-1- ...

組成

組成式: C₃₇H₅₃NO₄ / 原子数: 95 / 化学式量: 575.821 / 形式電荷: 0

その他

4xwq
PDB 未公開エントリ

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4XWQ

履歴

作成	2015年2月11日
公開	2016年12月7日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ACDLabs 12.01	O=C2N(CCCCc1ccccc1)C(CC2(O)C)CC(C)C5CCC4C(=C\C=C3/C(=C)C(O)CC(O)C3)\CCCC45C
CACTVS 3.385	C[CH](C[CH]1C[C](C)(O)C(=O)N1CCCCc2ccccc2)[CH]3CC[CH]4C(CCC[C]34C)=CC=C5C[CH](O)C[CH](O)C5=C
OpenEye OEToolkits 1.9.2	CC(CC1CC(C(=O)N1CCCCc2ccccc2)(C)O)C3CCC4C3(CCCC4=CC=C5CC(CC(C5=C)O)O)C

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	C[C@H](C[C@H]1C[C@@](C)(O)C(=O)N1CCCCc2ccccc2)[C@H]3CC[C@H]4\C(CCC[C@]34C)=C\C=C5\C[C@@H](O)C[C@H](O)C5=C
OpenEye OEToolkits 1.9.2	C[C@H](C[C@H]1C[C@@](C(=O)N1CCCCc2ccccc2)(C)O)[C@H]3CC[C@@H]\4[C@@]3(CCC/C4=C\C=C/5\C[C@H](C[C@@H](C5=C)O)O)C

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C37H53NO4/c1-25(21-30-24-37(4,42)35(41)38(30)20-9-8-13-27-11-6-5-7-12-27)32-17-18-33-28(14-10-19-36(32,33)3)15-16-29-22-31(39)23-34(40)26(29)2/h5-7,11-12,15-16,25,30-34,39-40,42H,2,8-10,13-14,17-24H2,1,3-4H3/b28-15+,29-16-/t25-,30+,31-,32-,33+,34+,36-,37-/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	IVUJLUOFPHOBPG-HEMHZJQPSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	(3R,5S)-5-{(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-4-{(2Z)-2-[(3S,5R)-3,5-dihydroxy-2-methylidenecyclohexylidene]ethylidene}-7a-methyloctahydro-1H-inden-1-yl]propyl}-3-hydroxy-3-methyl-1-(4-phenylbutyl)pyrrolidin-2-one (non-preferred name)
OpenEye OEToolkits 1.9.2	(3R,5S)-5-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-7a-methyl-4-[(2Z)-2-[(3S,5R)-2-methylidene-3,5-bis(oxidanyl)cyclohexylidene]ethylidene]-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]propyl]-3-methyl-3-oxidanyl-1-(4-phenylbutyl)pyrrolidin-2-one

全2件を表示しています

PDB-5gid:
Crystal structure of VDR in complex with DLAM-4 (C2 form)

PDB-5gie:
Crystal structure of VDR in complex with DLAM-4P (P21 form)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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