+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDED9 |
---|---|
試料 | Relaxase domain of TraI
|
機能・相同性 | Uncharacterised domain, helicase/relaxase, putative / Putative helicase / Putative conjugal transfer nickase/helicase TraI, C-terminal / Putative conjugal transfer nickase/helicase TraI C-term / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / TraI 機能・相同性情報 |
生物種 | Neisseria gonorrhoeae (淋菌) |
引用 | 日付: 2019 Jul 5 タイトル: DNA processing by the MOBH family relaxase TraI encoded within the gonococcal genetic island 著者: Heilers J / Reiners J / Heller E / Golzer A / Smits S |
登録者 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2744 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 3.12 / P-value: 0.000001 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
---|---|
モデル #2745 | タイプ: atomic / 対称性: P1 / カイ2乗値: 91.005 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Relaxase domain of TraI / 試料濃度: 19.7 mg/ml |
---|---|
バッファ | 名称: 50 mM TRIS-HCl 100 mM NaCl / pH: 8 |
要素 #1426 | 名称: Tra_2 / タイプ: protein / 記述: Relaxase (Tra_2) domain of TraI / 分子量: 46.027 / 分子数: 1 / 由来: Neisseria gonorrhoeae / 参照: UniProt: Q5EPC7 配列: MHHHHHHSTD SVSHNDEVAH INQNIVNDRF RILNAHELIQ VLDLSPQISG IKMNLGLSDE NWSKDALPFL EKYIAFVQRL PASESHHHAG DGGLVRHTLD VAALALVAST SQSWPPNAKT EEIAKKTAVW RYGIMCAALL HDVGKTVTGF QVELFDSAIS LEKLLWLPDT ...配列: MHHHHHHSTD SVSHNDEVAH INQNIVNDRF RILNAHELIQ VLDLSPQISG IKMNLGLSDE NWSKDALPFL EKYIAFVQRL PASESHHHAG DGGLVRHTLD VAALALVAST SQSWPPNAKT EEIAKKTAVW RYGIMCAALL HDVGKTVTGF QVELFDSAIS LEKLLWLPDT GSMAESGKLY YRVEFPDAKS AYSTHAEIAW TFFQALVPSH VRQWLATTDP NLMITLRNYL SGKKDGSPLE QLIKNADMTS VSRDLRSGSR QRFSTAKRKP FIETIMETLK EMLSDRGVHF SIATTAGGDL FRKGDRIYLM SKNVPDYIRQ YLRKNQHPAA GSFPADNQRI FDTLFEYRAV IPPENDPHRA INHIEVEFTR MDGEKVRNIF SVLCFNAKTL YPDGDYPTEF LGNLSEV |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.099 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Relaxase domain of TraI / 測定日: 2018年7月11日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 4 °C / 照射時間: 2 sec. / フレーム数: 1500 / 単位: 1/nm /
| ||||||||||||||||||||||||||||||
距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 596 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||
結果 | カーブのタイプ: sec コメント: Please note: The protein contains unstructured regions that impart a level of flexibility to the overall structure in solution. As a consequence, the conformational state(s) sampled by ...コメント: Please note: The protein contains unstructured regions that impart a level of flexibility to the overall structure in solution. As a consequence, the conformational state(s) sampled by the protein differs from - and cannot be captured by - the single predicted PHYRE2 atomistic model/representation displayed in this entry (as evidenced by the poor fit of the model to the SAXS data; bottom).
|