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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDD75 |
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試料 | 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 co-SMAD binding / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / cellular response to growth factor stimulus / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / sequence-specific double-stranded DNA binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / response to xenobiotic stimulus / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity ...co-SMAD binding / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / cellular response to growth factor stimulus / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / sequence-specific double-stranded DNA binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / response to xenobiotic stimulus / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of gene expression / chromatin / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm / nucleus 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1826 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 2.25 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.123 / P-value: 0.657170 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #1828 | タイプ: atomic / 対称性: P1 コメント: Two monomers (B) and (D) have been used as rigid bodies and N- and C-terminal loops were modelled. カイ2乗値: 1.721 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1833 | タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1835 | タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #1836 | タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1) 試料濃度: 6 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris, 150 mM NaCl / pH: 7.4 |
要素 #986 | 名称: TGIF / タイプ: protein / 記述: Homeobox protein TGIF1 / 分子量: 10.68 / 分子数: 2 / 由来: Homo sapiens / 参照: UniProt: Q15583 配列: GPDIPLDLSS SAGSGKRRRR GNLPKESVQI LRDWLYEHRY NAYPSEQEKA LLSQQTHLST LQVCNWFINA RRRLLPDMLR KDGKDPNQFT IS |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.5 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1) 測定日: 2016年10月18日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 0.045 sec. / フレーム数: 120 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 545 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc /
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