SASDD75: 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein...

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登録情報	データベース: SASBDB / ID: SASDD75
試料	'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1) Homeobox protein TGIF1 (protein), TGIF, Homo sapiens
機能・相同性	機能・相同性情報 co-SMAD binding / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / cellular response to growth factor stimulus / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / sequence-specific double-stranded DNA binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / response to xenobiotic stimulus / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity ...co-SMAD binding / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / cellular response to growth factor stimulus / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / sequence-specific double-stranded DNA binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / response to xenobiotic stimulus / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of gene expression / chromatin / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleoplasm 類似検索 - 分子機能 Homeobox KN domain / Homeobox KN domain / 'Homeobox' domain profile. / Homeodomain / Homeobox domain / Homeobox-like domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 Homeobox protein TGIF1 類似検索 - 構成要素
生物種	Homo sapiens (ヒト)
登録者	Ewelina Guca (Institute for Research in Biomedicine in Barcelona)

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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Data source

SASBDBのページ	SASDD75

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モデル #1828	タイプ: atomic / 対称性: P1 コメント: Two monomers (B) and (D) have been used as rigid bodies and N- and C-terminal loops were modelled. カイ2乗値: 1.721 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #1833	タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #1835	タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)
モデル #1836	タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.116 / P-value: 0.198541 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

試料	名称: 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1) 試料濃度: 6 mg/ml
バッファ	名称: 20 mM Tris, 150 mM NaCl / pH: 7.4
要素 #986	名称: TGIF / タイプ: protein / 記述: Homeobox protein TGIF1 / 分子量: 10.68 / 分子数: 2 / 由来: Homo sapiens / 参照: UniProt: Q15583 配列: GPDIPLDLSS SAGSGKRRRR GNLPKESVQI LRDWLYEHRY NAYPSEQEKA LLSQQTHLST LQVCNWFINA RRRLLPDMLR KDGKDPNQFT IS

ビーム

設備名称: PETRA III P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany

/ 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.124 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.5 mm

検出器

名称: Pilatus 2M

スキャン

タイトル: 'TG'-interacting factor homeodomain in solution (Homeobox protein TGIF1)
測定日: 2016年10月18日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 0.045 sec. / フレーム数: 120 / 単位: 1/nm /

	Min	Max
Q	0.095	7.9013

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 545 /

	Min	Max
Q	0.0950367	2.95664
P(R) point	1	545
R	0	9.21

結果

カーブのタイプ: single_conc /

	実験値	Porod
分子量	25.5 kDa	26 kDa
体積	-	42 nm³

	P(R)	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	11350	11423.2	73.9
慣性半径, Rg	2.753 nm	2.7 nm	0.05

	Min	Max
D	-	9.21
Guinier point	1	74

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