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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDBT6 |
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試料 | GppNHp bound form of full length ObgE from E.coli (ObgE_FL with GppNHp)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / negative regulation of ribosome biogenesis / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / GDP binding / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / ribosomal large subunit assembly ...guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / negative regulation of ribosome biogenesis / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / GDP binding / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / ribosomal large subunit assembly / rRNA binding / GTPase activity / GTP binding / magnesium ion binding / DNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #749 | タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIN (r7897M) / ダミー原子の半径: 3.25 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 19.209 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: GppNHp bound form of full length ObgE from E.coli (ObgE_FL with GppNHp) 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Hepes, 300 mM NaCl, 250 mM imidazole, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 400 µM GppNHp pH: 7.5 |
要素 #420 | 名称: ObgE_FL / タイプ: protein / 記述: GTPase ObgE/CgtA / 分子量: 44.441 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli (strain K12) / 参照: UniProt: P42641 配列: MKFVDEASIL VVAGDGGNGC VSFRREKYIP KGGPDGGDGG DGGDVWMEAD ENLNTLIDYR FEKSFRAERG QNGASRDCTG KRGKDVTIKV PVGTRVIDQG TGETMGDMTK HGQRLLVAKG GWHGLGNTRF KSSVNRTPRQ KTNGTPGDKR ELLLELMLLA DVGMLGMPNA ...配列: MKFVDEASIL VVAGDGGNGC VSFRREKYIP KGGPDGGDGG DGGDVWMEAD ENLNTLIDYR FEKSFRAERG QNGASRDCTG KRGKDVTIKV PVGTRVIDQG TGETMGDMTK HGQRLLVAKG GWHGLGNTRF KSSVNRTPRQ KTNGTPGDKR ELLLELMLLA DVGMLGMPNA GKSTFIRAVS AAKPKVADYP FTTLVPSLGV VRMDNEKSFV VADIPGLIEG AAEGAGLGIR FLKHLERCRV LLHLIDIDPI DGTDPVENAR IIISELELYS QDLATKPRWL VFNKIDLLDK VEAEEKAKAI AEALGWEDKY YLISAASGLG VKDLCWDVMT FIIENPVAQA EEAKQPEKVE FMWDDYHRQQ LEEIAEEDDE DWDDDWDEDD EEGVEFIYKR SAWSHPQFEK |
-実験情報
ビーム | 設備名称: SOLEIL SWING / 地域: Saint-Aubin / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.103 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.987 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: AVIEX / タイプ: CCD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: GppNHp bound form of full length ObgE from E.coli 測定日: 2015年6月17日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 2.8 sec. / フレーム数: 255 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 510 /
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結果 | カーブのタイプ: other コメント: The sample protein includes a C-terminal Strep-tag; frames corresponding to the peak in HPLC-SAXS run were averaged using DATAVER v0.2 (r3709)
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