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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDBC9 |
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試料 | GDP bound form of C-terminal deletion mutant of ObgE from E.coli (ObgE_340 with GDP)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / negative regulation of ribosome biogenesis / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / GDP binding / rRNA binding ...guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / negative regulation of ribosome biogenesis / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / GDP binding / rRNA binding / GTPase activity / GTP binding / magnesium ion binding / DNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) |
引用 | 日付: 2017 Feb 21 タイトル: Structural and Biochemical Analysis of Escherichia coli ObgE, a Central Regulator of Bacterial Persistence 著者: Gkekas S / Singh R / Shkumatov A / Messens J / Fauvart M / Verstraeten N / Michiels J |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1118 | タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIN (v2.7.2) / ダミー原子の半径: 2.50 A / 対称性: P1 コメント: Average model generated by DAMAVER and used as a starting model for refinement with DAMMIN (r7897M) カイ2乗値: 0.606 / P-value: 0.531000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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-試料
試料 | 名称: GDP bound form of C-terminal deletion mutant of ObgE from E.coli (ObgE_340 with GDP) 試料濃度: 1.00-8.00 |
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バッファ | 名称: 20 mM Hepes, 300 mM NaCl, 250 mM imidazole, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 400 uM GDP pH: 7.5 |
要素 #421 | 名称: ObgE_340 / タイプ: protein / 記述: GTPase ObgE/CgtA / 分子量: 38.899 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli (strain K12) / 参照: UniProt: P42641 配列: MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MKFVDEASIL VVAGDGGNGC VSFRREKYIP KGGPDGGDGG DGGDVWMEAD ENLNTLIDYR FEKSFRAERG QNGASRDCTG KRGKDVTIKV PVGTRVIDQG TGETMGDMTK HGQRLLVAKG GWHGLGNTRF KSSVNRTPRQ KTNGTPGDKR ...配列: MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MKFVDEASIL VVAGDGGNGC VSFRREKYIP KGGPDGGDGG DGGDVWMEAD ENLNTLIDYR FEKSFRAERG QNGASRDCTG KRGKDVTIKV PVGTRVIDQG TGETMGDMTK HGQRLLVAKG GWHGLGNTRF KSSVNRTPRQ KTNGTPGDKR ELLLELMLLA DVGMLGMPNA GKSTFIRAVS AAKPKVADYP FTTLVPSLGV VRMDNEKSFV VADIPGLIEG AAEGAGLGIR FLKHLERCRV LLHLIDIDPI DGTDPVENAR IIISELELYS QDLATKPRWL VFNKIDLLDK VEAEEKAKAI AEALGWEDKY YLISAASGLG VKDLCWDVMT FIIENPVA |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Rigaku BioSAXS-2000 / 地域: Brussels / 国: Belgium / 線源: X-ray in house / 波長: 1.54 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 100K / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: GDP bound form of C-terminal deletion mutant of ObgE from E.coli (ObgE_340 with GDP) 測定日: 2015年2月1日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1800 sec. / フレーム数: 3 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.6 / ポイント数: 461 /
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結果 | カーブのタイプ: merged /
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