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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDAC4 |
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試料 | FilaminC 23-24
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
引用 | ジャーナル: J Mol Biol / 年: 2007 タイトル: Crystal structure of human filamin C domain 23 and small angle scattering model for filamin C 23-24 dimer. 著者: Ljiljana Sjekloća / Regina Pudas / Björn Sjöblom / Peter Konarev / Oliviero Carugo / Vladimir Rybin / Tiila-Riikka Kiema / Dmitri Svergun / Jari Ylänne / Kristina Djinović Carugo / 要旨: Filamin C is a dimeric, actin-binding protein involved in organization of cortical cytoskeleton and of the sarcomere. We performed crystallographic, small-angle X-ray scattering and analytical ...Filamin C is a dimeric, actin-binding protein involved in organization of cortical cytoskeleton and of the sarcomere. We performed crystallographic, small-angle X-ray scattering and analytical ultracentrifugation experiments on the constructs containing carboxy-terminal domains of the protein (domains 23-24 and 19-21). The crystal structure of domain 23 of filamin C showed that the protein adopts the expected immunoglobulin (Ig)-like fold. Small-angle X-ray scattering experiments performed on filamin C tandem Ig-like domains 23 and 24 reveal a dimer that is formed by domain 24 and that domain 23 has little interactions with itself or with domain 24, while the analytical ultracentrifugation experiments showed that the filamin C domains 19-21 form elongated monomers in diluted solutions. |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #55 | タイプ: dummy / ソフトウェア: Dammin / 対称性: P2 / カイ2乗値: 9.972964 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #56 | タイプ: mix / ソフトウェア: Bunch / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P2 / カイ2乗値: 19.7136 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: FilaminC 23-24 / Sample MW: 40 kDa / 試料濃度: 5.00-21.00 |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris-HCl / pH: 8 / 組成: NaCl 50.000 mM |
要素 #52 | 名称: FilaminC 23-24 / タイプ: protein / 記述: Filamin C 23-24 / 分子量: 20 / 分子数: 2 / 由来: Escherichia coli 配列: AGDPGLVSAY GPGLEGGTTG VSSEFIVNTL NAGSGALSVT IDGPSKVQLD CRECPEGHVV TYTPMAPGNY LIAIKYGGPQ HIVGSPFKAK VTGPRLSGGH SLHETSTVLV ETVTKSSSSR GSSYSSIPKF SAMGSDASKV VTRGPGLSQA FVGQKNSFTV DCSKAGTNMM ...配列: AGDPGLVSAY GPGLEGGTTG VSSEFIVNTL NAGSGALSVT IDGPSKVQLD CRECPEGHVV TYTPMAPGNY LIAIKYGGPQ HIVGSPFKAK VTGPRLSGGH SLHETSTVLV ETVTKSSSSR GSSYSSIPKF SAMGSDASKV VTRGPGLSQA FVGQKNSFTV DCSKAGTNMM MVGVHGPKTP CEEVYVKHMG NRVYNVTYTV KEKGDYILIV KWGDESVPGS PFKVKVP |
-実験情報
ビーム | 設備名称: DORIS III X33 / 地域: Hamburg / 国: Germany / 線源: X-ray synchrotron | |||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: MAR 345 Image Plate | |||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Filamin C 23-24 / 測定日: 2005年6月17日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 120 sec. / フレーム数: 2 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.5a / ポイント数: 480 /
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結果 | カーブのタイプ: merged /
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