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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8vid | ||||||
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タイトル | CW Flagellar Switch Complex with extra density - FliF, FliG, FliM, and FliN forming single subunit of the C-ring from Salmonella | ||||||
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![]() | MOTOR PROTEIN / Domain Swap / Symmetry mismatch / Flagellar component / Switch complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() bacterial-type flagellum basal body, MS ring / bacterial-type flagellum basal body / bacterial-type flagellum-dependent swarming motility / positive chemotaxis / cytoskeletal motor activity / bacterial-type flagellum-dependent cell motility / chemotaxis / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.9 Å | ||||||
![]() | Singh, P.K. / Iverson, T.M. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis for rotation and directional switching by the combined MS- and C-rings of bacterial flagella. 著者: Singh, P.K. / Iverson, T.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 149.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 95.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 43.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 66.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 61295.645 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: fliF, fla AII.1, fla BI, STM1969 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 36860.930 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: fliG, AUA10_01480, AUA59_00550 / 発現宿主: ![]() ![]() |
#3: タンパク質 | 分子量: 32992.895 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
#4: タンパク質 | 分子量: 14801.823 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: fliN, flaN, motD, STM1977 / 発現宿主: ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Flagellar C-ring single subunit containing FliF, FliG, FliM, and FliN タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 3.5 MDa / 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm |
撮影 | 電子線照射量: 59.242 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 5.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 11106 / 対称性のタイプ: POINT |