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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8t8o | ||||||
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タイトル | CCW Flagellar Switch Complex - FliF, FliG, FliM, and FliN forming 34-mer C-ring from Salmonella | ||||||
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機能・相同性 | ![]() bacterial-type flagellum basal body, MS ring / bacterial-type flagellum basal body / bacterial-type flagellum-dependent swarming motility / positive chemotaxis / cytoskeletal motor activity / bacterial-type flagellum-dependent cell motility / ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Singh, P.K. / Iverson, T.M. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis for directional rotation of the Salmonella flagellum 著者: Singh, P.K. / Iverson, T.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 4.7 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 表示 | ![]() | |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 41100MC ![]() 8t8pC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5644.328 Da / 分子数: 34 / 断片: C-terminal domain (UNP residues 514-560) / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: fliF, fla AII.1, fla BI, STM1969 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: タンパク質 | ![]() 分子量: 36890.957 Da / 分子数: 34 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: fliG / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #3: タンパク質 | 分子量: 33758.836 Da / 分子数: 34 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #4: タンパク質 | ![]() 分子量: 14801.823 Da / 分子数: 102 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: fliN / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: Flagellar MS-ring and C-ring complex containing FliF, FliG, FliM, and FliN タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 3.5 MDa / 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
急速凍結![]() | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | 電子線照射量: 51.557 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正![]() | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 51268 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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