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- PDB-8gxq: PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state -

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登録情報

データベース: PDB / ID: 8gxq

タイトル

PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state

要素

(DNA (162-mer)) x 2
(DNA (228-mer)) x 2
(DNA-directed RNA polymerase ...) x 8
(DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit ...) x 2
(General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit ...) x 2
(General transcription factor IIF subunit ...) x 2
(General transcription factor IIH subunit ...) x 5
(Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit ...) x 2
(Mediator of RNA polymerase II transcription subunit ...) x 24
(Transcription initiation factor ...) x 17
CDK-activating kinase assembly factor MAT1
Cyclin-H
Cyclin-dependent kinase 7
General transcription factor IIE subunit 1
HISTONE H2A.Z
Histone H2B
Histone H3
Histone H4
RNA_pol_L_2 domain-containing protein
RPB12
TATA-box-binding protein

キーワード

TRANSCRIPTION / PIC / Mediator / transcription initiation / +1 nucleosome

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of mediator complex assembly / positive regulation of T cell extravasation / negative regulation of smooth muscle cell differentiation / spermine transport / negative regulation of MHC class I biosynthetic process / enucleate erythrocyte development / positive regulation of type II interferon-mediated signaling pathway / regulation of RNA biosynthetic process / core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex / MMXD complex ...positive regulation of mediator complex assembly / positive regulation of T cell extravasation / negative regulation of smooth muscle cell differentiation / spermine transport / negative regulation of MHC class I biosynthetic process / enucleate erythrocyte development / positive regulation of type II interferon-mediated signaling pathway / regulation of RNA biosynthetic process / core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex / MMXD complex / androgen biosynthetic process / positive regulation of G0 to G1 transition / retinal pigment epithelium development / SAGA complex assembly / lateral mesodermal cell differentiation / mammary gland branching involved in thelarche / DNA-templated transcription open complex formation / allantois development / pre-snoRNP complex / G0 to G1 transition / Cytosolic iron-sulfur cluster assembly / nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding / thyroid hormone receptor signaling pathway / negative regulation of protein autoubiquitination / central nervous system myelin formation / DNA 5'-3' helicase / transcription factor TFTC complex / positive regulation of mitotic recombination / positive regulation of core promoter binding / core mediator complex / regulation of vitamin D receptor signaling pathway / meiotic sister chromatid cohesion / negative regulation of MHC class II biosynthetic process / hair follicle maturation / cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex / hair cell differentiation / ventricular system development / TFIIH-class transcription factor complex binding / nucleotide-excision repair factor 3 complex / transcription factor TFIIE complex / snRNA transcription by RNA polymerase II / regulation of cell cycle G1/S phase transition / RNA polymerase I general transcription initiation factor activity / nucleotide-excision repair, preincision complex assembly / phosphatase activator activity / SLIK (SAGA-like) complex / CAK-ERCC2 complex / RNA polymerase III general transcription initiation factor activity / transcription factor TFIIK complex / UV protection / embryonic cleavage / transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter / RNA polymerase transcription factor SL1 complex / TFIIF-class transcription factor complex binding / transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter / B-WICH complex positively regulates rRNA expression / RNA Polymerase I Transcription Initiation / RNA Polymerase I Promoter Escape / RNA Polymerase I Transcription Termination / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter / RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding / RNA polymerase II core complex assembly / hepatocyte differentiation / ventricular trabecula myocardium morphogenesis / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter / Formation of RNA Pol II elongation complex / Formation of the Early Elongation Complex / Transcriptional regulation by small RNAs / RNA Polymerase II Pre-transcription Events / TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes / FGFR2 alternative splicing / RNA polymerase II transcribes snRNA genes / mRNA Capping / mRNA Splicing - Major Pathway / mRNA Splicing - Minor Pathway / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA / RNA Polymerase II Promoter Escape / RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening / RNA Polymerase II Transcription Initiation / RNA Polymerase II Transcription Elongation / RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE / Estrogen-dependent gene expression / Formation of TC-NER Pre-Incision Complex / Dual incision in TC-NER / Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter / transcription factor TFIIF complex / thyroid hormone generation / nuclear retinoic acid receptor binding / positive regulation of response to cytokine stimulus / positive regulation of androgen receptor activity / mediator complex / maintenance of protein location in nucleus / positive regulation of keratinocyte differentiation / adult heart development / Generic Transcription Pathway
類似検索 - 分子機能

Mediator complex subunit 26, C-terminal domain / Mediator complex subunit 26, middle domain / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26 / Mediator complex subunit 26 C-terminal / Mediator complex subunit 26 middle domain / Mediator complex, subunit Med25, PTOV domain / Mediator complex, subunit Med25, synapsin 1 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25, von Willebrand factor type A domain / Mediator complex subunit 25, PTOV domain superfamily / Mediator complex subunit 25 PTOV activation and synapsin 2 ...Mediator complex subunit 26, C-terminal domain / Mediator complex subunit 26, middle domain / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26 / Mediator complex subunit 26 C-terminal / Mediator complex subunit 26 middle domain / Mediator complex, subunit Med25, PTOV domain / Mediator complex, subunit Med25, synapsin 1 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25, von Willebrand factor type A domain / Mediator complex subunit 25, PTOV domain superfamily / Mediator complex subunit 25 PTOV activation and synapsin 2 / Mediator complex subunit 25 synapsin 1 / Mediator complex subunit 25 von Willebrand factor type A / Mediator complex, subunit Med19, metazoa / Mediator of RNA pol II transcription subunit 19 / Mediator complex, subunit Med29, metazoa / Mediator complex, subunit Med24, / : / Mediator complex subunit 24 N-terminal / Mediator complex subunit 29 / Mediator complex subunit 16, central helical bridge / Mediator complex, subunit Med23 / Mediator complex subunit 23 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 / : / : / ARC105/Med15 mediator subunit N-terminal KIX domain / ARC105/Med15 mediator subunit central domain / ARC105/Med15 mediator subunit C-terminal domain / Mediator complex, subunit Med6, metazoa/plant / Mediator complex, subunit Med30, metazoa / Mediator complex, subunit Med28 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, metazoan / Mediator complex subunit 30 / Mediator complex subunit 28 / Mediator complex, subunit Med27 / Mediator complex subunit 27 / : / : / Mediator complex subunit 16, C-terminal / Mediator complex, subunit Med16 / Mediator complex subunit 16, N-terminal / Mediator complex, subunit Med10 / Transcription factor subunit Med10 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 / RNA polymerase II transcription mediator complex subunit 9 / Mediator complex, subunit Med4 / Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4 / Mediator complex, subunit Med31 / Mediator complex, subunit Med21 / Mediator of RNA polymerase II, subunit Med31 superfamily / Mediator complex, subunit Med7 superfmaily / SOH1 / Subunit 21 of Mediator complex / Mediator complex, subunit Med7 / Mediator complex, subunit Med7/Med21-like / MED7 protein / Mediator complex, subunit Med20 / Mediator complex, subunit Med14 / TATA-binding related factor (TRF) of subunit 20 of Mediator complex / Mediator complex subunit MED14 / Soluble quinoprotein glucose/sorbosone dehydrogenase / Mediator complex, subunit Med6 / Mediator complex, subunit Med17 / Mediator complex, subunit Med6 superfamily / MED6 mediator sub complex component / Subunit 17 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 / Mediator complex, subunit Med8, fungi/metazoa / Mediator complex, subunit Med11 / Surfeit locus protein 5 subunit 22 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription complex subunit 8 / Mediator complex protein / Mediator complex, subunit Med18 / Med18 protein / TAFII28-like protein domain / Transcription initiation factor TFIID subunit 11-like / hTAFII28-like protein conserved region / TAFII55 protein, conserved region / Transcription initiation factor TFIID subunit 7 / TAFII55 protein conserved region / TAFII55 protein conserved region / Transcription initiation factor TFIID subunit 2 / Transcription initiation factor TFIID subunit 8 / Transcription initiation factor TFIID component TAF4 / Transcription factor TFIID complex subunit 8 C-term / Transcription factor TFIID, subunit 8, C-terminal / : / Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type / Transcription initiation factor TFIID component TAF4 family / Domain in the N-terminus of transcription elongation factor S-II (and elsewhere) / Transcription initiation factor TFIID component TAF4, C-terminal / Transcription initiation factor IID, subunit 13 / Transcription initiation factor IID, 18kD subunit / TAFH/NHR1 domain superfamily / NHR1 homology to TAF / TAFH/NHR1 domain profile. / TAF homology / TAFH/NHR1 / : / Bromodomain associated
類似検索 - ドメイン・相同性

IRON/SULFUR CLUSTER / DNA / DNA (> 10) / DNA (> 100) / Histone H3 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / RNA polymerase II, I and III subunit K / DNA-directed RNA polymerase subunit beta / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a ...IRON/SULFUR CLUSTER / DNA / DNA (> 10) / DNA (> 100) / Histone H3 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / RNA polymerase II, I and III subunit K / DNA-directed RNA polymerase subunit beta / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 / DNA-directed RNA polymerase subunit / DNA-directed RNA polymerase II subunit E / DNA-directed RNA polymerase subunit / Histone H2B / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / Transcription initiation factor TFIID subunit 4 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26 / General transcription factor IIF subunit 2 / General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD / General transcription and DNA repair factor IIH helicase/translocase subunit XPB / TATA-box-binding protein / Transcription initiation factor TFIID subunit 1 / General transcription factor IIE subunit 1 / Transcription initiation factor IIE subunit beta / General transcription factor IIH subunit 1 / General transcription factor IIF subunit 1 / Transcription initiation factor TFIID subunit 6 / Cyclin-dependent kinase 7 / Cyclin-H / CDK-activating kinase assembly factor MAT1 / Transcription initiation factor IIA subunit 1 / Transcription initiation factor IIA subunit 2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / Histone H4 / Transcription initiation factor IIB / Transcription initiation factor TFIID subunit 10 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21 / General transcription factor IIH subunit 2 / General transcription factor IIH subunit 3 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 / Transcription initiation factor TFIID subunit 5 / Transcription initiation factor TFIID subunit 13 / Transcription initiation factor TFIID subunit 11 / Transcription initiation factor TFIID subunit 7 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 / Transcription initiation factor TFIID subunit 12 / Transcription initiation factor TFIID subunit 9 / Transcription initiation factor TFIID subunit 3 / Transcription initiation factor TFIID subunit 2 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27 / General transcription factor IIH subunit 5 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25 / Transcription initiation factor TFIID subunit 8 / General transcription factor IIH subunit 4 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
類似検索 - 構成要素

生物種

Homo sapiens (ヒト)

Xenopus laevis (アフリカツメガエル)

Sus scrofa (ブタ)
synthetic construct (人工物)

手法

電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.04 Å

データ登録者

Chen, X. / Wang, X. / Liu, W. / Ren, Y. / Qu, X. / Li, J. / Yin, X. / Xu, Y.

資金援助

1件

引用

ジャーナル: Science / 年: 2022
タイトル: Structures of +1 nucleosome-bound PIC-Mediator complex.
著者: Xizi Chen / Xinxin Wang / Weida Liu / Yulei Ren / Xuechun Qu / Jiabei Li / Xiaotong Yin / Yanhui Xu /

要旨: RNA polymerase II-mediated eukaryotic transcription starts with the assembly of the preinitiation complex (PIC) on core promoters. The +1 nucleosome is well positioned about 40 base pairs downstream ...

履歴

登録	2022年9月21日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2022年11月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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文書・要旨	8gxq_validation.pdf.gz	1.8 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8gxq_full_validation.pdf.gz	1.8 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gx/8gxq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gx/8gxq	HTTPS FTP

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集合体

登録構造単位

X: DNA (228-mer)

Y: DNA (228-mer)

BA: Transcription initiation factor IIB

DA: Transcription initiation factor TFIID subunit 1

EA: General transcription factor IIE subunit 1

FA: General transcription factor IIF subunit 1

HA: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD

NA: Histone H3

PA: DNA-directed RNA polymerase subunit

DB: Transcription initiation factor TFIID subunit 2

EB: Transcription initiation factor IIE subunit beta

FB: General transcription factor IIF subunit 2

HB: General transcription factor IIH subunit 1

NB: Histone H4

PB: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

HC: General transcription factor IIH subunit 4

PC: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

PE: DNA-directed RNA polymerase II subunit E

PF: DNA-directed RNA polymerase II subunit F

PH: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

PI: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

PJ: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

PK: RNA_pol_L_2 domain-containing protein

PL: RPB12

DP: TATA-box-binding protein

DQ: Transcription initiation factor IIA subunit 1

DO: Transcription initiation factor IIA subunit 2

Dc: Transcription initiation factor TFIID subunit 3

Dd: Transcription initiation factor TFIID subunit 4

De: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

Df: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

Di: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

Dj: Transcription initiation factor TFIID subunit 10

Dk: Transcription initiation factor TFIID subunit 11

Dl: Transcription initiation factor TFIID subunit 12

DD: Transcription initiation factor TFIID subunit 4

Dm: Transcription initiation factor TFIID subunit 13

DE: Transcription initiation factor TFIID subunit 5

DF: Transcription initiation factor TFIID subunit 6

DG: Transcription initiation factor TFIID subunit 7

DH: Transcription initiation factor TFIID subunit 8

DI: Transcription initiation factor TFIID subunit 9

DJ: Transcription initiation factor TFIID subunit 10

DL: Transcription initiation factor TFIID subunit 12

HD: CDK-activating kinase assembly factor MAT1

HE: General transcription factor IIH subunit 3

HG: General transcription factor IIH subunit 2

HH: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB

HF: General transcription factor IIH subunit 5

HI: Cyclin-dependent kinase 7

HJ: Cyclin-H

PD: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

PG: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

g: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7

j: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10

n: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

s: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19

u: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21

a: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1

d: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4

f: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6

i: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9

m: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31

q: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

z: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26

b: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29

c: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27

e: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28

l: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30

o: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

h: Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8

k: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

r: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18

t: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20

v: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

p: Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16

w: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23

x: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24

y: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25

NE: Histone H3

NF: Histone H4

NG: HISTONE H2A.Z

NC: HISTONE H2A.Z

ND: Histone H2B

NH: Histone H2B

NX: DNA (162-mer)

NY: DNA (162-mer)

ヘテロ分子

4.27 MDa, 87 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: 電子顕微鏡法

-
要素

+
DNA鎖 , 4種, 4分子 XYNXNY

#1: DNA鎖	DNA (228-mer) 分子量: 70328.703 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#2: DNA鎖	DNA (228-mer) 分子量: 70483.766 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#76: DNA鎖	DNA (162-mer) 分子量: 46802.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#77: DNA鎖	DNA (162-mer) 分子量: 53286.477 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)

+
Transcription initiation factor ... , 17種, 23分子 BADADBEBDQDODcDdDDDeDEDfDFDiDIDjDJDkDlDLDmDGDH

#3: タンパク質	Transcription initiation factor IIB / General transcription factor TFIIB / S300-II 分子量: 34877.949 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2B, TF2B, TFIIB / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q00403, histone acetyltransferase
#4: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 1 / Cell cycle gene 1 protein / TBP-associated factor 250 kDa / p250 / Transcription initiation factor ...Cell cycle gene 1 protein / TBP-associated factor 250 kDa / p250 / Transcription initiation factor TFIID 250 kDa subunit / TAF(II)250 / TAFII-250 / TAFII250 分子量: 212956.172 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF1, BA2R, CCG1, CCGS, TAF2A / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) 参照: UniProt: P21675, histone acetyltransferase, non-specific serine/threonine protein kinase
#10: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 2 / 150 kDa cofactor of initiator function / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit B / TBP- ...150 kDa cofactor of initiator function / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit B / TBP-associated factor 150 kDa / Transcription initiation factor TFIID 150 kDa subunit / TAF(II)150 / TAFII-150 / TAFII150 分子量: 137159.984 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF2, CIF150, TAF2B / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P1X5
#11: タンパク質	Transcription initiation factor IIE subunit beta / TFIIE-beta / General transcription factor IIE subunit 2 分子量: 33106.824 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2E2, TF2E2 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P29084
#26: タンパク質	Transcription initiation factor IIA subunit 1 / General transcription factor IIA subunit 1 / TFIIAL / Transcription initiation factor TFIIA 42 kDa ...General transcription factor IIA subunit 1 / TFIIAL / Transcription initiation factor TFIIA 42 kDa subunit / TFIIA-42 分子量: 41544.551 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2A1, TF2A1 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P52655
#27: タンパク質	Transcription initiation factor IIA subunit 2 / General transcription factor IIA subunit 2 / TFIIA p12 subunit / TFIIA-12 / TFIIAS / Transcription ...General transcription factor IIA subunit 2 / TFIIA p12 subunit / TFIIA-12 / TFIIAS / Transcription initiation factor IIA gamma chain / TFIIA-gamma 分子量: 12469.091 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2A2, TF2A2 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P52657
#28: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 3 / 140 kDa TATA box-binding protein-associated factor / TBP-associated factor 3 / Transcription ...140 kDa TATA box-binding protein-associated factor / TBP-associated factor 3 / Transcription initiation factor TFIID 140 kDa subunit / TAF(II)140 / TAF140 / TAFII-140 / TAFII140 分子量: 103769.320 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF3 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q5VWG9
#29: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 4 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit C / TBP-associated factor 4 / Transcription ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit C / TBP-associated factor 4 / Transcription initiation factor TFIID 130 kDa subunit / TAF(II)130 / TAFII-130 / TAFII130 / Transcription initiation factor TFIID 135 kDa subunit / TAF(II)135 / TAFII-135 / TAFII135 分子量: 110221.883 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF4, TAF2C, TAF2C1, TAF4A, TAFII130, TAFII135 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O00268
#30: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 / Transcription initiation factor TFIID 100 kDa subunit / TAF(II)100 / TAFII-100 / TAFII100 分子量: 86932.109 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF5, TAF2D / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15542
#31: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit E / Transcription initiation factor TFIID 70 kDa ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit E / Transcription initiation factor TFIID 70 kDa subunit / TAF(II)70 / TAFII-70 / TAFII70 / Transcription initiation factor TFIID 80 kDa subunit / TAF(II)80 / TAFII-80 / TAFII80 分子量: 72749.297 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF6, TAF2E, TAFII70 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P49848
#32: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 9 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit G / STAF31/32 / Transcription initiation factor ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit G / STAF31/32 / Transcription initiation factor TFIID 31 kDa subunit / TAFII-31 / TAFII31 / Transcription initiation factor TFIID 32 kDa subunit / TAFII-32 / TAFII32 分子量: 29006.838 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF9, TAF2G, TAFII31 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16594
#33: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 10 / STAF28 / Transcription initiation factor TFIID 30 kDa subunit / TAF(II)30 / TAFII-30 / TAFII30 分子量: 21731.248 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF10, TAF2A, TAF2H, TAFII30 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q12962
#34: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 11 / TFIID subunit p30-beta / Transcription initiation factor TFIID 28 kDa subunit / TAF(II)28 / TAFII-28 / TAFII28 分子量: 23340.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF11, TAF2I, PRO2134 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15544
#35: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 12 / Transcription initiation factor TFIID 20/15 kDa subunits / TAFII-20/TAFII-15 / TAFII20/TAFII15 分子量: 17948.467 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF12, TAF15, TAF2J, TAFII20 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16514
#36: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 13 / Transcription initiation factor TFIID 18 kDa subunit / TAF(II)18 / TAFII-18 / TAFII18 分子量: 14307.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF13, TAF2K, TAFII18 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15543
#37: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 7 / RNA polymerase II TBP-associated factor subunit F / Transcription initiation factor TFIID 55 kDa ...RNA polymerase II TBP-associated factor subunit F / Transcription initiation factor TFIID 55 kDa subunit / TAF(II)55 / TAFII-55 / TAFII55 分子量: 40325.117 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF7, TAF2F, TAFII55 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15545
#38: タンパク質	Transcription initiation factor TFIID subunit 8 / Protein taube nuss / TBP-associated factor 43 kDa / TBP-associated factor 8 / Transcription ...Protein taube nuss / TBP-associated factor 43 kDa / TBP-associated factor 8 / Transcription initiation factor TFIID 43 kDa subunit / TAFII-43 / TAFII43 / hTAFII43 分子量: 34304.359 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TAF8, TAFII43, TBN / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7C8

+
タンパク質 , 11種, 15分子 EANANENBNFPKPLDPHDHIHJNGNCNDNH

#5: タンパク質	General transcription factor IIE subunit 1 / General transcription factor IIE 56 kDa subunit / Transcription initiation factor IIE subunit alpha ...General transcription factor IIE 56 kDa subunit / Transcription initiation factor IIE subunit alpha / TFIIE-alpha 分子量: 49516.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2E1, TF2E1 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P29083
#8: タンパク質	Histone H3 分子量: 15435.126 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Xenopus laevis (アフリカツメガエル) 遺伝子: XELAEV_18002543mg / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A310TTQ1
#14: タンパク質	Histone H4 分子量: 11394.426 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Xenopus laevis (アフリカツメガエル) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P62799
#23: タンパク質	RNA_pol_L_2 domain-containing protein 分子量: 13310.284 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2J / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1UK25
#24: タンパク質	RPB12 分子量: 7018.244 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2K / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1TRS6
#25: タンパク質	TATA-box-binding protein / TATA sequence-binding protein / TATA-binding factor / TATA-box factor / Transcription initiation ...TATA sequence-binding protein / TATA-binding factor / TATA-box factor / Transcription initiation factor TFIID TBP subunit 分子量: 37729.938 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TBP, GTF2D1, TF2D, TFIID / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P20226
#39: タンパク質	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 / CDK7/cyclin-H assembly factor / Cyclin-G1-interacting protein / Menage a trois / RING finger ...CDK7/cyclin-H assembly factor / Cyclin-G1-interacting protein / Menage a trois / RING finger protein 66 / RING finger protein MAT1 / p35 / p36 分子量: 35873.965 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MNAT1, CAP35, MAT1, RNF66 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51948
#44: タンパク質	Cyclin-dependent kinase 7 分子量: 39032.242 Da / 分子数: 1 / Mutation: K41A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P50613
#45: タンパク質	Cyclin-H / MO15-associated protein / p34 / p37 分子量: 37695.473 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CCNH / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51946
#74: タンパク質	HISTONE H2A.Z 分子量: 13581.796 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#75: タンパク質	Histone H2B 分子量: 13979.291 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Xenopus laevis (アフリカツメガエル) 遺伝子: LOC108704303 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A8J0U496

+
General transcription factor IIF subunit ... , 2種, 2分子 FAFB

#6: タンパク質	General transcription factor IIF subunit 1 / General transcription factor IIF 74 kDa subunit / Transcription initiation factor IIF subunit alpha ...General transcription factor IIF 74 kDa subunit / Transcription initiation factor IIF subunit alpha / TFIIF-alpha / Transcription initiation factor RAP74 分子量: 58343.578 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2F1, RAP74 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P35269
#12: タンパク質	General transcription factor IIF subunit 2 / ATP-dependent helicase GTF2F2 / General transcription factor IIF 30 kDa subunit / Transcription ...ATP-dependent helicase GTF2F2 / General transcription factor IIF 30 kDa subunit / Transcription initiation factor IIF subunit beta / TFIIF-beta / Transcription initiation factor RAP30 分子量: 28427.309 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2F2, RAP30 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P13984, DNA helicase

#6: タンパク質

General transcription factor IIF subunit 1 / General transcription factor IIF 74 kDa subunit / Transcription initiation factor IIF subunit alpha ...

分子量: 58343.578 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2F1, RAP74 / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P35269

#12: タンパク質

General transcription factor IIF subunit 2 / ATP-dependent helicase GTF2F2 / General transcription factor IIF 30 kDa subunit / Transcription ...

分子量: 28427.309 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2F2, RAP30 / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P13984, DNA helicase

+
General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit ... , 2種, 2分子 HAHH

#7: タンパク質	General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD / TFIIH subunit XPD / Basic transcription factor 2 80 kDa subunit / BTF2 p80 / CXPD / DNA excision ...TFIIH subunit XPD / Basic transcription factor 2 80 kDa subunit / BTF2 p80 / CXPD / DNA excision repair protein ERCC-2 / DNA repair protein complementing XP-D cells / TFIIH basal transcription factor complex 80 kDa subunit / TFIIH 80 kDa subunit / TFIIH p80 / Xeroderma pigmentosum group D-complementing protein 分子量: 87021.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ERCC2, XPD, XPDC / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P18074, DNA helicase
#42: タンパク質	General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB / TFIIH subunit XPB / Basic transcription factor 2 89 kDa subunit / BTF2 p89 / DNA excision repair ...TFIIH subunit XPB / Basic transcription factor 2 89 kDa subunit / BTF2 p89 / DNA excision repair protein ERCC-3 / DNA repair protein complementing XP-B cells / TFIIH basal transcription factor complex 89 kDa subunit / TFIIH 89 kDa subunit / TFIIH p89 / Xeroderma pigmentosum group B-complementing protein 分子量: 89404.734 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ERCC3, XPB, XPBC / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P19447, DNA helicase

#7: タンパク質

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD / TFIIH subunit XPD / Basic transcription factor 2 80 kDa subunit / BTF2 p80 / CXPD / DNA excision ...

分子量: 87021.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ERCC2, XPD, XPDC / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P18074, DNA helicase

#42: タンパク質

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB / TFIIH subunit XPB / Basic transcription factor 2 89 kDa subunit / BTF2 p89 / DNA excision repair ...

分子量: 89404.734 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ERCC3, XPB, XPBC / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P19447, DNA helicase

+
DNA-directed RNA polymerase ... , 8種, 8分子 PAPBPCPEPFPIPDPG

#9: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit 分子量: 217450.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2A / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A8D1DPV6, DNA-directed RNA polymerase
#15: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit beta 分子量: 134041.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1TVZ5, DNA-directed RNA polymerase
#17: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / RNA polymerase II subunit C 分子量: 31439.074 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2C / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LCH3
#18: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit E / RPB5 homolog 分子量: 24644.318 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2E / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VTX4
#19: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit F / DNA-directed RNA polymerases I / II / and III subunit RPABC2 / RPB6 homolog 分子量: 14477.001 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2F / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VEK9
#21: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / RNA polymerase II subunit B9 / DNA-directed RNA polymerase II subunit I / RNA polymerase II 14.5 ...RNA polymerase II subunit B9 / DNA-directed RNA polymerase II subunit I / RNA polymerase II 14.5 kDa subunit / RPB14.5 分子量: 14541.221 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2I / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: P60899
#46: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 isoform X1 分子量: 16331.255 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A481BYI6
#47: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 分子量: 19314.283 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2G / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VKG7

+
General transcription factor IIH subunit ... , 5種, 5分子 HBHCHEHGHF

#13: タンパク質	General transcription factor IIH subunit 1 / Basic transcription factor 2 62 kDa subunit / BTF2 p62 / General transcription factor IIH ...Basic transcription factor 2 62 kDa subunit / BTF2 p62 / General transcription factor IIH polypeptide 1 / TFIIH basal transcription factor complex p62 subunit 分子量: 62116.492 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2H1, BTF2 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P32780
#16: タンパク質	General transcription factor IIH subunit 4 / Basic transcription factor 2 52 kDa subunit / BTF2 p52 / General transcription factor IIH ...Basic transcription factor 2 52 kDa subunit / BTF2 p52 / General transcription factor IIH polypeptide 4 / TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit 分子量: 52245.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2H4 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92759
#40: タンパク質	General transcription factor IIH subunit 3 / Basic transcription factor 2 34 kDa subunit / BTF2 p34 / General transcription factor IIH ...Basic transcription factor 2 34 kDa subunit / BTF2 p34 / General transcription factor IIH polypeptide 3 / TFIIH basal transcription factor complex p34 subunit 分子量: 34416.008 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2H3 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13889
#41: タンパク質	General transcription factor IIH subunit 2 / Basic transcription factor 2 44 kDa subunit / BTF2 p44 / General transcription factor IIH ...Basic transcription factor 2 44 kDa subunit / BTF2 p44 / General transcription factor IIH polypeptide 2 / TFIIH basal transcription factor complex p44 subunit 分子量: 44481.996 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2H2, BTF2P44 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13888
#43: タンパク質	General transcription factor IIH subunit 5 / General transcription factor IIH polypeptide 5 / TFB5 ortholog / TFIIH basal transcription factor ...General transcription factor IIH polypeptide 5 / TFB5 ortholog / TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit 分子量: 8060.362 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GTF2H5, C6orf175, TTDA / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6ZYL4

+
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit ... , 2種, 2分子 PHPJ

#20: タンパク質	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 分子量: 17162.273 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2H / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1ULF2
#22: タンパク質	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 分子量: 7655.123 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: POLR2L / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A493TD97

+
Mediator of RNA polymerase II transcription subunit ... , 24種, 24分子 gjnsuadfimqzbcelokrtvwxy

#48: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7 分子量: 27285.281 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED7 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43513
#49: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10 分子量: 15710.969 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED10 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BTT4
#50: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 分子量: 160787.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED14 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O60244
#51: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19 分子量: 26321.146 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED19 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: A0JLT2
#52: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21 分子量: 15575.234 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED21 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13503
#53: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 分子量: 168697.328 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED1 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15648
#54: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 分子量: 29781.424 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED4 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NPJ6
#55: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 分子量: 28464.627 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED6 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75586
#56: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 分子量: 16422.750 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED9 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWA0
#57: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31 分子量: 15826.116 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED31 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3C7
#58: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17 分子量: 72984.047 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED17 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NVC6
#59: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26 分子量: 65544.438 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED26 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95402
#60: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29 分子量: 21089.801 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED29 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NX70
#61: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27 分子量: 35478.742 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED27 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P2C8
#62: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28 分子量: 19540.107 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED28 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H204
#63: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30 分子量: 20301.229 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED30 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96HR3
#64: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 分子量: 86830.102 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED15 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96RN5
#66: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 分子量: 13145.829 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED11 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P086
#67: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18 分子量: 23693.730 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED18 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BUE0
#68: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20 分子量: 23243.762 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED20 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H944
#69: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 分子量: 22243.713 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED22 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q15528
#71: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 分子量: 156652.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED23 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9ULK4
#72: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 分子量: 110430.164 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED24 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75448
#73: タンパク質	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25 分子量: 78230.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED25 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q71SY5

+
Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit ... , 2種, 2分子 hp

#65: タンパク質	Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 分子量: 29112.906 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED8 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96G25
#70: タンパク質	Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 分子量: 93136.039 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MED16 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2X0

+
非ポリマー , 3種, 21分子

#78: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 19 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#79: 化合物	ChemComp-SF4 / IRON/SULFUR CLUSTER 分子量: 351.640 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₄S₄
#80: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg

+
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	N

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実験情報

-
実験

実験	手法: 電子顕微鏡法
EM実験	試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

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試料調製

構成要素	名称: PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#77 / 由来: MULTIPLE SOURCES
由来(天然)	生物種: Sus scrofa (ブタ)
由来(組換発現)	生物種: Sus scrofa (ブタ)
緩衝液	pH: 7.9
試料	包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
急速凍結	凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡撮影

実験機器	モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡	モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃	電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズ	モード: BRIGHT FIELD / 最大デフォーカス（公称値）: 2500 nm / 最小デフォーカス（公称値）: 1500 nm
撮影	電子線照射量: 50 e/Å² / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k)

-
解析

CTF補正	タイプ: NONE
3次元再構成	解像度: 5.04 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 26458 / 対称性のタイプ: POINT

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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