+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7oh0 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Tetanus neurotoxin HC domain in complex with TT104-Fab1 | ||||||
要素 |
| ||||||
キーワード | TOXIN / tetanus / tetanus neurotoxin / humAbs / monoclonal antibody / tetanus prophylaxis / spastic paralysis / tetanus immunoglobulin / TIG | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of neurotransmitter secretion / metallopeptidase activity / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Clostridium tetani (破傷風菌) Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.9 Å | ||||||
データ登録者 | Grinzato, A. / Kandiah, E. / Zanotti, G. | ||||||
引用 | ジャーナル: J Clin Invest / 年: 2021 タイトル: Exceptionally potent human monoclonal antibodies are effective for prophylaxis and treatment of tetanus in mice. 著者: Marco Pirazzini / Alessandro Grinzato / Davide Corti / Sonia Barbieri / Oneda Leka / Francesca Vallese / Marika Tonellato / Chiara Silacci-Fregni / Luca Piccoli / Eaazhisai Kandiah / ...著者: Marco Pirazzini / Alessandro Grinzato / Davide Corti / Sonia Barbieri / Oneda Leka / Francesca Vallese / Marika Tonellato / Chiara Silacci-Fregni / Luca Piccoli / Eaazhisai Kandiah / Giampietro Schiavo / Giuseppe Zanotti / Antonio Lanzavecchia / Cesare Montecucco / 要旨: We used human monoclonal antibodies (humAbs) to study the mechanism of neuron intoxication by tetanus neurotoxin and to evaluate these antibodies as a safe preventive and therapeutic substitute for ...We used human monoclonal antibodies (humAbs) to study the mechanism of neuron intoxication by tetanus neurotoxin and to evaluate these antibodies as a safe preventive and therapeutic substitute for hyperimmune sera to treat tetanus in mice. By screening memory B cells from immune donors, we selected 2 tetanus neurotoxin-specific mAbs with exceptionally high neutralizing activities and extensively characterized them both structurally and functionally. We found that these antibodies interfered with the binding and translocation of the neurotoxin into neurons by interacting with 2 epitopes, whose identification pinpoints crucial events in the cellular pathogenesis of tetanus. Our observations explain the neutralization ability of these antibodies, which we found to be exceptionally potent in preventing experimental tetanus when injected into mice long before the toxin. Moreover, their Fab derivatives neutralized tetanus neurotoxin in post-exposure experiments, suggesting their potential for therapeutic use via intrathecal injection. As such, we believe these humAbs, as well as their Fab derivatives, meet the requirements to be considered for prophylactic and therapeutic use in human tetanus and are ready for clinical trials. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
---|---|
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7oh0.cif.gz | 159.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb7oh0.ent.gz | 128.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7oh0.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7oh0_validation.pdf.gz | 585 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 7oh0_full_validation.pdf.gz | 617.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | 7oh0_validation.xml.gz | 31.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7oh0_validation.cif.gz | 43.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oh/7oh0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oh/7oh0 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
|
---|---|
1 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50476.918 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Clostridium tetani (破傷風菌) / 参照: UniProt: C4PD05 |
---|---|
#2: 抗体 | 分子量: 23647.295 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) |
#3: 抗体 | 分子量: 23462.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
---|---|
EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 |
| ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
由来(天然) |
| ||||||||||||||||||||||||
緩衝液 | pH: 7.6 | ||||||||||||||||||||||||
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES | ||||||||||||||||||||||||
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
---|---|
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 40 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
-解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.15.2_3472: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CTF補正 | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 98170 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|