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- PDB-7ezx: Structure of the phycobilisome from the red alga Porphyridium pur... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7ezx
タイトルStructure of the phycobilisome from the red alga Porphyridium purpureum in Middle Light
要素
  • (Allophycocyanin ...) x 4
  • (C-phycocyanin ...) x 2
  • (FAS1 domain-containing ...) x 2
  • (Phycobilisome ...) x 10
  • (R-phycoerythrin gamma chain, ...) x 4
  • B-phycoerythrin beta chain
  • CaRSPs1
  • CaRSPs2
  • LRC5
  • Lrc4
  • Phycoerythrin alpha subunit
キーワードPHOTOSYNTHESIS / light-harvesting complex
機能・相同性
機能・相同性情報


phycobilisome / chloroplast thylakoid membrane / photosynthesis / cell adhesion molecule binding / extracellular matrix organization / extracellular matrix / macroautophagy / cell adhesion / lyase activity / extracellular space
類似検索 - 分子機能
Allophycocyanin linker chain / FAS1 domain / FAS1 domain superfamily / Fasciclin domain / FAS1/BIgH3 domain profile. / Four repeated domains in the Fasciclin I family of proteins, present in many other contexts. / Phycobilisome linker protein / Allophycocyanin, beta subunit / Phycobilisome linker domain / Phycobilisome linker domain superfamily ...Allophycocyanin linker chain / FAS1 domain / FAS1 domain superfamily / Fasciclin domain / FAS1/BIgH3 domain profile. / Four repeated domains in the Fasciclin I family of proteins, present in many other contexts. / Phycobilisome linker protein / Allophycocyanin, beta subunit / Phycobilisome linker domain / Phycobilisome linker domain superfamily / Phycobilisome Linker polypeptide / Phycobilisome (PBS) linker domain profile. / Phycocyanin, alpha subunit / Phycocyanin, beta subunit / CpcD-like domain / CpcD/allophycocyanin linker domain / CpcD-like domain profile. / CpcD/allophycocyanin linker domain / Phycobilisome, alpha/beta subunit / Phycobilisome, alpha/beta subunit superfamily / Phycobilisome protein / Globin-like superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
PHYCOCYANOBILIN / PHYCOERYTHROBILIN / phenylmethanesulfonic acid / PHYCOUROBILIN / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Uncharacterized protein / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic / Uncharacterized protein ...PHYCOCYANOBILIN / PHYCOERYTHROBILIN / phenylmethanesulfonic acid / PHYCOUROBILIN / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Uncharacterized protein / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic / Uncharacterized protein / Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core / R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic / Phycobilisome 32.1 kDa linker polypeptide, phycocyanin-associated, rod / Uncharacterized protein / R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic / R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic / FAS1 domain-containing protein / Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Uncharacterized protein / Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod / FAS1 domain-containing protein / Phycoerythrin alpha subunit / B-phycoerythrin beta chain / C-phycocyanin alpha subunit / Allophycocyanin alpha subunit / Phycobilisome rod-core linker polypeptide / C-phycocyanin beta subunit / Allophycocyanin beta 18 subunit / Phycobiliprotein ApcE / Allophycocyanin gamma subunit / Allophycocyanin beta subunit
類似検索 - 構成要素
生物種Porphyridium purpureum (真核生物)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3 Å
データ登録者Ma, J.F. / Sui, S.-F.
資金援助 中国, 2件
組織認可番号国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)31670745 中国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)31861143048 中国
引用ジャーナル: Commun Biol / 年: 2023
タイトル: The structural basis for light acclimation in phycobilisome light harvesting systems systems in Porphyridium purpureum
著者: Dodson, E.J. / Ma, J. / Suissa Szlejf, M. / Maroudas-Sklare, N. / Paltiel, Y. / Adir, N. / Sun, S. / Sui, S.F. / Keren, N.
履歴
登録2021年6月2日登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.02022年9月28日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12024年4月3日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / citation_author / em_3d_fitting_list / pdbx_database_related / pdbx_initial_refinement_model
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year / _em_3d_fitting_list.accession_code / _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id / _em_3d_fitting_list.source_name / _em_3d_fitting_list.type

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
X1: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
A1: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
B1: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
C1: C-phycocyanin alpha subunit
D1: C-phycocyanin beta subunit
E1: C-phycocyanin alpha subunit
F1: C-phycocyanin beta subunit
G1: C-phycocyanin alpha subunit
H1: C-phycocyanin beta subunit
I1: C-phycocyanin alpha subunit
J1: C-phycocyanin beta subunit
K1: C-phycocyanin alpha subunit
L1: C-phycocyanin beta subunit
M1: C-phycocyanin alpha subunit
N1: C-phycocyanin beta subunit
O1: Phycoerythrin alpha subunit
P1: B-phycoerythrin beta chain
Q1: Phycoerythrin alpha subunit
R1: B-phycoerythrin beta chain
S1: Phycoerythrin alpha subunit
T1: B-phycoerythrin beta chain
U1: Phycoerythrin alpha subunit
V1: B-phycoerythrin beta chain
W1: Phycoerythrin alpha subunit
Y1: B-phycoerythrin beta chain
Z1: Phycoerythrin alpha subunit
a1: B-phycoerythrin beta chain
b1: Phycoerythrin alpha subunit
c1: B-phycoerythrin beta chain
d1: Phycoerythrin alpha subunit
e1: B-phycoerythrin beta chain
f1: Phycoerythrin alpha subunit
g1: B-phycoerythrin beta chain
h1: Phycoerythrin alpha subunit
i1: B-phycoerythrin beta chain
j1: Phycoerythrin alpha subunit
k1: B-phycoerythrin beta chain
l1: Phycoerythrin alpha subunit
m1: B-phycoerythrin beta chain
e2: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
M2: Phycoerythrin alpha subunit
N2: B-phycoerythrin beta chain
O2: Phycoerythrin alpha subunit
P2: B-phycoerythrin beta chain
Q2: Phycoerythrin alpha subunit
R2: B-phycoerythrin beta chain
S2: Phycoerythrin alpha subunit
T2: B-phycoerythrin beta chain
U2: Phycoerythrin alpha subunit
V2: B-phycoerythrin beta chain
W2: Phycoerythrin alpha subunit
X2: B-phycoerythrin beta chain
A3: Phycoerythrin alpha subunit
B3: B-phycoerythrin beta chain
C3: Phycoerythrin alpha subunit
D3: B-phycoerythrin beta chain
E3: Phycoerythrin alpha subunit
F3: B-phycoerythrin beta chain
G3: Phycoerythrin alpha subunit
H3: B-phycoerythrin beta chain
I3: Phycoerythrin alpha subunit
J3: B-phycoerythrin beta chain
K3: Phycoerythrin alpha subunit
L3: B-phycoerythrin beta chain
M3: B-phycoerythrin beta chain
N3: B-phycoerythrin beta chain
O3: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
d4: Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
B4: Phycoerythrin alpha subunit
C4: B-phycoerythrin beta chain
D4: Phycoerythrin alpha subunit
E4: B-phycoerythrin beta chain
F4: Phycoerythrin alpha subunit
G4: B-phycoerythrin beta chain
H4: Phycoerythrin alpha subunit
I4: B-phycoerythrin beta chain
J4: Phycoerythrin alpha subunit
K4: B-phycoerythrin beta chain
L4: Phycoerythrin alpha subunit
M4: B-phycoerythrin beta chain
B5: B-phycoerythrin beta chain
F5: B-phycoerythrin beta chain
G5: B-phycoerythrin beta chain
H5: B-phycoerythrin beta chain
I5: B-phycoerythrin beta chain
J5: Phycoerythrin alpha subunit
K5: B-phycoerythrin beta chain
L5: B-phycoerythrin beta chain
A5: B-phycoerythrin beta chain
C5: B-phycoerythrin beta chain
D5: CaRSPs2
E5: CaRSPs1
k6: FAS1 domain-containing protein
X7: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
A7: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
B7: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
C7: C-phycocyanin alpha subunit
D7: C-phycocyanin beta subunit
E7: C-phycocyanin alpha subunit
F7: C-phycocyanin beta subunit
G7: C-phycocyanin alpha subunit
H7: C-phycocyanin beta subunit
I7: C-phycocyanin alpha subunit
J7: C-phycocyanin beta subunit
K7: C-phycocyanin alpha subunit
L7: C-phycocyanin beta subunit
M7: C-phycocyanin alpha subunit
N7: C-phycocyanin beta subunit
O7: Phycoerythrin alpha subunit
P7: B-phycoerythrin beta chain
Q7: Phycoerythrin alpha subunit
R7: B-phycoerythrin beta chain
S7: Phycoerythrin alpha subunit
T7: B-phycoerythrin beta chain
U7: Phycoerythrin alpha subunit
V7: B-phycoerythrin beta chain
W7: Phycoerythrin alpha subunit
Y7: B-phycoerythrin beta chain
Z7: Phycoerythrin alpha subunit
a7: B-phycoerythrin beta chain
b7: Phycoerythrin alpha subunit
c7: B-phycoerythrin beta chain
d7: Phycoerythrin alpha subunit
e7: B-phycoerythrin beta chain
f7: Phycoerythrin alpha subunit
g7: B-phycoerythrin beta chain
h7: Phycoerythrin alpha subunit
i7: B-phycoerythrin beta chain
j7: Phycoerythrin alpha subunit
k7: B-phycoerythrin beta chain
l7: Phycoerythrin alpha subunit
m7: B-phycoerythrin beta chain
B8: B-phycoerythrin beta chain
F8: B-phycoerythrin beta chain
G8: B-phycoerythrin beta chain
H8: B-phycoerythrin beta chain
I8: B-phycoerythrin beta chain
J8: Phycoerythrin alpha subunit
K8: B-phycoerythrin beta chain
L8: B-phycoerythrin beta chain
A8: B-phycoerythrin beta chain
C8: B-phycoerythrin beta chain
D8: CaRSPs2
E8: CaRSPs1
X9: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
A9: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
B9: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
C9: C-phycocyanin alpha subunit
D9: C-phycocyanin beta subunit
E9: C-phycocyanin alpha subunit
F9: C-phycocyanin beta subunit
G9: C-phycocyanin alpha subunit
H9: C-phycocyanin beta subunit
I9: C-phycocyanin alpha subunit
J9: C-phycocyanin beta subunit
K9: C-phycocyanin alpha subunit
L9: C-phycocyanin beta subunit
M9: C-phycocyanin alpha subunit
N9: C-phycocyanin beta subunit
O9: Phycoerythrin alpha subunit
P9: B-phycoerythrin beta chain
Q9: Phycoerythrin alpha subunit
R9: B-phycoerythrin beta chain
S9: Phycoerythrin alpha subunit
T9: B-phycoerythrin beta chain
U9: Phycoerythrin alpha subunit
V9: B-phycoerythrin beta chain
W9: Phycoerythrin alpha subunit
Y9: B-phycoerythrin beta chain
Z9: Phycoerythrin alpha subunit
a9: B-phycoerythrin beta chain
b9: Phycoerythrin alpha subunit
c9: B-phycoerythrin beta chain
d9: Phycoerythrin alpha subunit
e9: B-phycoerythrin beta chain
f9: Phycoerythrin alpha subunit
g9: B-phycoerythrin beta chain
h9: Phycoerythrin alpha subunit
i9: B-phycoerythrin beta chain
j9: Phycoerythrin alpha subunit
k9: B-phycoerythrin beta chain
l9: Phycoerythrin alpha subunit
m9: B-phycoerythrin beta chain
AA: Phycoerythrin alpha subunit
BA: B-phycoerythrin beta chain
CA: Phycoerythrin alpha subunit
DA: B-phycoerythrin beta chain
EA: Phycoerythrin alpha subunit
FA: B-phycoerythrin beta chain
GA: Phycoerythrin alpha subunit
HA: B-phycoerythrin beta chain
IA: Phycoerythrin alpha subunit
JA: B-phycoerythrin beta chain
KA: Phycoerythrin alpha subunit
LA: B-phycoerythrin beta chain
MA: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
bB: Phycobilisome 32.1 kDa linker polypeptide, phycocyanin-associated, rod
AB: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
BB: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
CB: Phycoerythrin alpha subunit
DB: B-phycoerythrin beta chain
EB: Phycoerythrin alpha subunit
FB: B-phycoerythrin beta chain
GB: Phycoerythrin alpha subunit
HB: B-phycoerythrin beta chain
IB: Phycoerythrin alpha subunit
JB: B-phycoerythrin beta chain
KB: Phycoerythrin alpha subunit
LB: B-phycoerythrin beta chain
MB: Phycoerythrin alpha subunit
NB: B-phycoerythrin beta chain
OB: Phycoerythrin alpha subunit
PB: B-phycoerythrin beta chain
QB: Phycoerythrin alpha subunit
RB: B-phycoerythrin beta chain
SB: Phycoerythrin alpha subunit
TB: B-phycoerythrin beta chain
UB: Phycoerythrin alpha subunit
VB: B-phycoerythrin beta chain
WB: Phycoerythrin alpha subunit
XB: B-phycoerythrin beta chain
YB: Phycoerythrin alpha subunit
ZB: B-phycoerythrin beta chain
aB: Phycoerythrin alpha subunit
cB: B-phycoerythrin beta chain
dB: Phycoerythrin alpha subunit
eB: B-phycoerythrin beta chain
fB: Phycoerythrin alpha subunit
gB: B-phycoerythrin beta chain
hB: Phycoerythrin alpha subunit
iB: B-phycoerythrin beta chain
jB: Phycoerythrin alpha subunit
kB: B-phycoerythrin beta chain
lB: Phycoerythrin alpha subunit
mB: B-phycoerythrin beta chain
AC: Phycoerythrin alpha subunit
BC: B-phycoerythrin beta chain
CC: Phycoerythrin alpha subunit
DC: B-phycoerythrin beta chain
EC: Phycoerythrin alpha subunit
FC: B-phycoerythrin beta chain
GC: Phycoerythrin alpha subunit
HC: B-phycoerythrin beta chain
IC: Phycoerythrin alpha subunit
JC: B-phycoerythrin beta chain
KC: Phycoerythrin alpha subunit
LC: B-phycoerythrin beta chain
MC: Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
dD: Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
BD: Phycoerythrin alpha subunit
CD: B-phycoerythrin beta chain
DD: Phycoerythrin alpha subunit
ED: B-phycoerythrin beta chain
FD: Phycoerythrin alpha subunit
GD: B-phycoerythrin beta chain
HD: Phycoerythrin alpha subunit
ID: B-phycoerythrin beta chain
JD: Phycoerythrin alpha subunit
KD: B-phycoerythrin beta chain
LD: Phycoerythrin alpha subunit
MD: B-phycoerythrin beta chain
AE: Phycoerythrin alpha subunit
BE: B-phycoerythrin beta chain
CE: Phycoerythrin alpha subunit
DE: B-phycoerythrin beta chain
EE: Phycoerythrin alpha subunit
FE: B-phycoerythrin beta chain
GE: Phycoerythrin alpha subunit
HE: B-phycoerythrin beta chain
IE: Phycoerythrin alpha subunit
JE: B-phycoerythrin beta chain
KE: Phycoerythrin alpha subunit
LE: B-phycoerythrin beta chain
ME: Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
XF: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
AF: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
BF: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
CF: C-phycocyanin alpha subunit
DF: C-phycocyanin beta subunit
EF: C-phycocyanin alpha subunit
FF: C-phycocyanin beta subunit
GF: C-phycocyanin alpha subunit
HF: C-phycocyanin beta subunit
IF: C-phycocyanin alpha subunit
JF: C-phycocyanin beta subunit
KF: C-phycocyanin alpha subunit
LF: C-phycocyanin beta subunit
MF: C-phycocyanin alpha subunit
NF: C-phycocyanin beta subunit
OF: Phycoerythrin alpha subunit
PF: B-phycoerythrin beta chain
QF: Phycoerythrin alpha subunit
RF: B-phycoerythrin beta chain
SF: Phycoerythrin alpha subunit
TF: B-phycoerythrin beta chain
UF: Phycoerythrin alpha subunit
VF: B-phycoerythrin beta chain
WF: Phycoerythrin alpha subunit
YF: B-phycoerythrin beta chain
ZF: Phycoerythrin alpha subunit
aF: B-phycoerythrin beta chain
bF: Phycoerythrin alpha subunit
cF: B-phycoerythrin beta chain
dF: Phycoerythrin alpha subunit
eF: B-phycoerythrin beta chain
fF: Phycoerythrin alpha subunit
gF: B-phycoerythrin beta chain
hF: Phycoerythrin alpha subunit
iF: B-phycoerythrin beta chain
jF: Phycoerythrin alpha subunit
kF: B-phycoerythrin beta chain
lF: Phycoerythrin alpha subunit
mF: B-phycoerythrin beta chain
AG: Phycoerythrin alpha subunit
BG: B-phycoerythrin beta chain
CG: Phycoerythrin alpha subunit
DG: B-phycoerythrin beta chain
EG: Phycoerythrin alpha subunit
FG: B-phycoerythrin beta chain
GG: Phycoerythrin alpha subunit
HG: B-phycoerythrin beta chain
IG: Phycoerythrin alpha subunit
JG: B-phycoerythrin beta chain
KG: Phycoerythrin alpha subunit
LG: B-phycoerythrin beta chain
MG: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
kH: FAS1 domain-containing protein
XI: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
AI: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
BI: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
CI: C-phycocyanin alpha subunit
DI: C-phycocyanin beta subunit
EI: C-phycocyanin alpha subunit
FI: C-phycocyanin beta subunit
GI: C-phycocyanin alpha subunit
HI: C-phycocyanin beta subunit
II: C-phycocyanin alpha subunit
JI: C-phycocyanin beta subunit
KI: C-phycocyanin alpha subunit
LI: C-phycocyanin beta subunit
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NI: C-phycocyanin beta subunit
OI: Phycoerythrin alpha subunit
PI: B-phycoerythrin beta chain
QI: Phycoerythrin alpha subunit
RI: B-phycoerythrin beta chain
SI: Phycoerythrin alpha subunit
TI: B-phycoerythrin beta chain
UI: Phycoerythrin alpha subunit
VI: B-phycoerythrin beta chain
WI: Phycoerythrin alpha subunit
YI: B-phycoerythrin beta chain
ZI: Phycoerythrin alpha subunit
aI: B-phycoerythrin beta chain
bI: Phycoerythrin alpha subunit
cI: B-phycoerythrin beta chain
dI: Phycoerythrin alpha subunit
eI: B-phycoerythrin beta chain
fI: Phycoerythrin alpha subunit
gI: B-phycoerythrin beta chain
hI: Phycoerythrin alpha subunit
iI: B-phycoerythrin beta chain
jI: Phycoerythrin alpha subunit
kI: B-phycoerythrin beta chain
lI: Phycoerythrin alpha subunit
mI: B-phycoerythrin beta chain
AJ: Phycoerythrin alpha subunit
BJ: B-phycoerythrin beta chain
CJ: Phycoerythrin alpha subunit
DJ: B-phycoerythrin beta chain
EJ: Phycoerythrin alpha subunit
FJ: B-phycoerythrin beta chain
GJ: Phycoerythrin alpha subunit
HJ: B-phycoerythrin beta chain
IJ: Phycoerythrin alpha subunit
JJ: B-phycoerythrin beta chain
KJ: Phycoerythrin alpha subunit
LJ: B-phycoerythrin beta chain
MJ: Phycoerythrin alpha subunit
NJ: B-phycoerythrin beta chain
OJ: Phycoerythrin alpha subunit
PJ: B-phycoerythrin beta chain
QJ: Phycoerythrin alpha subunit
RJ: B-phycoerythrin beta chain
SJ: Phycoerythrin alpha subunit
TJ: B-phycoerythrin beta chain
UJ: Phycoerythrin alpha subunit
VJ: B-phycoerythrin beta chain
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XJ: B-phycoerythrin beta chain
YJ: Phycoerythrin alpha subunit
ZJ: B-phycoerythrin beta chain
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cJ: Phycoerythrin alpha subunit
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iJ: Phycoerythrin alpha subunit
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mJ: Phycoerythrin alpha subunit
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tJ: B-phycoerythrin beta chain
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yJ: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
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XK: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
AK: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
BK: Phycobilisome rod-core linker polypeptide
CK: C-phycocyanin alpha subunit
DK: C-phycocyanin beta subunit
EK: C-phycocyanin alpha subunit
FK: C-phycocyanin beta subunit
GK: C-phycocyanin alpha subunit
HK: C-phycocyanin beta subunit
IK: C-phycocyanin alpha subunit
JK: C-phycocyanin beta subunit
KK: C-phycocyanin alpha subunit
LK: C-phycocyanin beta subunit
MK: C-phycocyanin alpha subunit
NK: C-phycocyanin beta subunit
OK: Phycoerythrin alpha subunit
PK: B-phycoerythrin beta chain
QK: Phycoerythrin alpha subunit
RK: B-phycoerythrin beta chain
SK: Phycoerythrin alpha subunit
TK: B-phycoerythrin beta chain
UK: Phycoerythrin alpha subunit
VK: B-phycoerythrin beta chain
WK: Phycoerythrin alpha subunit
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bK: Phycoerythrin alpha subunit
cK: B-phycoerythrin beta chain
dK: Phycoerythrin alpha subunit
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fK: Phycoerythrin alpha subunit
gK: B-phycoerythrin beta chain
hK: Phycoerythrin alpha subunit
iK: B-phycoerythrin beta chain
jK: Phycoerythrin alpha subunit
kK: B-phycoerythrin beta chain
lK: Phycoerythrin alpha subunit
mK: B-phycoerythrin beta chain
AL: Phycoerythrin alpha subunit
BL: B-phycoerythrin beta chain
CL: Phycoerythrin alpha subunit
DL: B-phycoerythrin beta chain
EL: Phycoerythrin alpha subunit
FL: B-phycoerythrin beta chain
GL: Phycoerythrin alpha subunit
HL: B-phycoerythrin beta chain
IL: Phycoerythrin alpha subunit
JL: B-phycoerythrin beta chain
KL: Phycoerythrin alpha subunit
LL: B-phycoerythrin beta chain
ML: Phycoerythrin alpha subunit
NL: B-phycoerythrin beta chain
OL: Phycoerythrin alpha subunit
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SL: Phycoerythrin alpha subunit
TL: B-phycoerythrin beta chain
UL: Phycoerythrin alpha subunit
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hL: B-phycoerythrin beta chain
iL: Phycoerythrin alpha subunit
jL: B-phycoerythrin beta chain
kL: Phycoerythrin alpha subunit
lL: B-phycoerythrin beta chain
mL: Phycoerythrin alpha subunit
nL: B-phycoerythrin beta chain
oL: Phycoerythrin alpha subunit
pL: B-phycoerythrin beta chain
qL: Phycoerythrin alpha subunit
rL: B-phycoerythrin beta chain
sL: Phycoerythrin alpha subunit
tL: B-phycoerythrin beta chain
uL: Phycoerythrin alpha subunit
vL: B-phycoerythrin beta chain
wL: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
xL: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
yL: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
zL: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
bM: Phycobilisome 32.1 kDa linker polypeptide, phycocyanin-associated, rod
AM: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
BM: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
CM: Phycoerythrin alpha subunit
DM: B-phycoerythrin beta chain
EM: Phycoerythrin alpha subunit
FM: B-phycoerythrin beta chain
GM: Phycoerythrin alpha subunit
HM: B-phycoerythrin beta chain
IM: Phycoerythrin alpha subunit
JM: B-phycoerythrin beta chain
KM: Phycoerythrin alpha subunit
LM: B-phycoerythrin beta chain
MM: Phycoerythrin alpha subunit
NM: B-phycoerythrin beta chain
OM: Phycoerythrin alpha subunit
PM: B-phycoerythrin beta chain
QM: Phycoerythrin alpha subunit
RM: B-phycoerythrin beta chain
SM: Phycoerythrin alpha subunit
TM: B-phycoerythrin beta chain
UM: Phycoerythrin alpha subunit
VM: B-phycoerythrin beta chain
WM: Phycoerythrin alpha subunit
XM: B-phycoerythrin beta chain
YM: Phycoerythrin alpha subunit
ZM: B-phycoerythrin beta chain
aM: Phycoerythrin alpha subunit
cM: B-phycoerythrin beta chain
dM: Phycoerythrin alpha subunit
eM: B-phycoerythrin beta chain
fM: Phycoerythrin alpha subunit
gM: B-phycoerythrin beta chain
hM: Phycoerythrin alpha subunit
iM: B-phycoerythrin beta chain
jM: Phycoerythrin alpha subunit
kM: B-phycoerythrin beta chain
lM: Phycoerythrin alpha subunit
mM: B-phycoerythrin beta chain
AN: Phycoerythrin alpha subunit
BN: B-phycoerythrin beta chain
CN: Phycoerythrin alpha subunit
DN: B-phycoerythrin beta chain
EN: Phycoerythrin alpha subunit
FN: B-phycoerythrin beta chain
GN: Phycoerythrin alpha subunit
HN: B-phycoerythrin beta chain
IN: Phycoerythrin alpha subunit
JN: B-phycoerythrin beta chain
KN: Phycoerythrin alpha subunit
LN: B-phycoerythrin beta chain
MN: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
AO: Phycoerythrin alpha subunit
BO: B-phycoerythrin beta chain
CO: Phycoerythrin alpha subunit
DO: B-phycoerythrin beta chain
EO: Phycoerythrin alpha subunit
FO: B-phycoerythrin beta chain
GO: Phycoerythrin alpha subunit
HO: B-phycoerythrin beta chain
IO: Phycoerythrin alpha subunit
JO: B-phycoerythrin beta chain
KO: Phycoerythrin alpha subunit
LO: B-phycoerythrin beta chain
MO: B-phycoerythrin beta chain
NO: B-phycoerythrin beta chain
OO: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
AP: Allophycocyanin alpha subunit
DP: Allophycocyanin beta subunit
CP: Allophycocyanin alpha subunit
FP: Allophycocyanin beta subunit
EP: Allophycocyanin alpha subunit
BP: Allophycocyanin beta subunit
GP: Allophycocyanin alpha subunit
HP: Allophycocyanin beta subunit
IP: Allophycocyanin beta subunit
JP: Allophycocyanin alpha subunit
KP: Allophycocyanin alpha subunit
LP: Allophycocyanin beta subunit
MP: Allophycocyanin beta subunit
NP: Allophycocyanin alpha subunit
OP: Allophycocyanin beta subunit
PP: Allophycocyanin alpha subunit
QP: Allophycocyanin beta subunit
RP: Allophycocyanin alpha subunit
SP: Allophycocyanin beta subunit
TP: Allophycocyanin alpha subunit
UP: Allophycocyanin beta subunit
VP: Allophycocyanin gamma subunit
WP: Allophycocyanin beta 18 subunit
XP: Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core
YP: Phycobilisome linker polypeptide
ZP: Lrc4
aP: LRC5
bP: FAS1 domain-containing protein
cP: Allophycocyanin alpha subunit
dP: Allophycocyanin beta subunit
eP: Allophycocyanin alpha subunit
fP: Allophycocyanin beta subunit
gP: Allophycocyanin alpha subunit
hP: Allophycocyanin beta subunit
iP: Allophycocyanin alpha subunit
jP: Allophycocyanin beta subunit
kP: Allophycocyanin beta subunit
lP: Allophycocyanin alpha subunit
mP: Allophycocyanin alpha subunit
nP: Allophycocyanin beta subunit
oP: Allophycocyanin beta subunit
pP: Allophycocyanin alpha subunit
qP: Allophycocyanin beta subunit
rP: Allophycocyanin alpha subunit
sP: Allophycocyanin beta subunit
tP: Allophycocyanin alpha subunit
uP: Allophycocyanin beta subunit
vP: Allophycocyanin alpha subunit
wP: Allophycocyanin beta subunit
xP: Allophycocyanin gamma subunit
yP: Allophycocyanin beta 18 subunit
zP: Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core
1P: Phycobilisome linker polypeptide
2P: Lrc4
3P: LRC5
4P: FAS1 domain-containing protein
AQ: Phycoerythrin alpha subunit
BQ: B-phycoerythrin beta chain
CQ: Phycoerythrin alpha subunit
DQ: B-phycoerythrin beta chain
EQ: Phycoerythrin alpha subunit
FQ: B-phycoerythrin beta chain
GQ: Phycoerythrin alpha subunit
HQ: B-phycoerythrin beta chain
IQ: Phycoerythrin alpha subunit
JQ: B-phycoerythrin beta chain
KQ: Phycoerythrin alpha subunit
LQ: B-phycoerythrin beta chain
MQ: R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic
eR: Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod
MR: Phycoerythrin alpha subunit
NR: B-phycoerythrin beta chain
OR: Phycoerythrin alpha subunit
PR: B-phycoerythrin beta chain
QR: Phycoerythrin alpha subunit
RR: B-phycoerythrin beta chain
SR: Phycoerythrin alpha subunit
TR: B-phycoerythrin beta chain
UR: Phycoerythrin alpha subunit
VR: B-phycoerythrin beta chain
WR: Phycoerythrin alpha subunit
XR: B-phycoerythrin beta chain
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)13,831,4862120
ポリマ－12,972,401658
非ポリマー859,0851462
水00
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: mass spectrometry
タイプ名称対称操作数
identity operation1_5551

-
要素

-
Phycobilisome ... , 10種, 28分子 X1X7X9XFXIXKB1B7B9BFBIBKe2eRO3OOd4dDbBbMMCMEzJzLXPzPYP1P

#1: タンパク質
Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 39743.625 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YM59
#3: タンパク質
Phycobilisome rod-core linker polypeptide


分子量: 26996.689 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RZ90
#8: タンパク質 Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 32886.242 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4Z7F4
#9: タンパク質 Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 43968.605 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YMI8
#10: タンパク質 Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 37175.957 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4Z162
#15: タンパク質 Phycobilisome 32.1 kDa linker polypeptide, phycocyanin-associated, rod


分子量: 53601.336 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YX63
#18: タンパク質 Phycobilisome 27.9 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 34958.746 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4Z323
#19: タンパク質 Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod


分子量: 55146.727 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YI31
#24: タンパク質 Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core


分子量: 14108.206 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YVZ2
#25: タンパク質 Phycobilisome linker polypeptide


分子量: 99468.367 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RZJ2

-
R-phycoerythrin gamma chain, ... , 4種, 20分子 A1A7A9AFAIAKMAMGMNMQABwJxJwLxLAMBByJyLBM

#2: タンパク質
R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic


分子量: 31792.982 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YX19
#14: タンパク質
R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic


分子量: 36924.992 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YNU6
#16: タンパク質
R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic


分子量: 29453.639 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YZM7
#17: タンパク質
R-phycoerythrin gamma chain, chloroplastic


分子量: 31358.787 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YZH3

-
C-phycocyanin ... , 2種, 72分子 C1E1G1I1K1M1C7E7G7I7K7M7C9E9G9I9K9M9CFEFGFIFKFMFCIEIGIIIKIMI...

#4: タンパク質 ...
C-phycocyanin alpha subunit


分子量: 17478.664 Da / 分子数: 36 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RYI4
#5: タンパク質 ...
C-phycocyanin beta subunit


分子量: 18242.705 Da / 分子数: 36 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RZB2

-
タンパク質 , 6種, 488分子 O1Q1S1U1W1Z1b1d1f1h1j1l1M2O2Q2S2U2W2A3C3E3G3I3K3B4D4F4H4J4L4...

#6: タンパク質 ...
Phycoerythrin alpha subunit / R-phycoerythrin alpha subunit


分子量: 17824.029 Da / 分子数: 230 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: E2IH77
#7: タンパク質 ...
B-phycoerythrin beta chain


分子量: 18584.182 Da / 分子数: 250 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: P11393
#11: タンパク質 CaRSPs2


分子量: 36402.004 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YX67
#12: タンパク質 CaRSPs1


分子量: 31172.643 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YJY8
#26: タンパク質 Lrc4


分子量: 16915.260 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4YTV6
#27: タンパク質 LRC5


分子量: 30272.959 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4Z2M2

-
FAS1 domain-containing ... , 2種, 4分子 k6kHbP4P

#13: タンパク質 FAS1 domain-containing protein


分子量: 31332.955 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4Z027
#28: タンパク質 FAS1 domain-containing protein


分子量: 26620.727 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: A0A5J4ZA95

-
Allophycocyanin ... , 4種, 46分子 APCPEPGPJPKPNPPPRPTPcPePgPiPlPmPpPrPtPvPDPFPBPHPIPLPMPOPQPSP...

#20: タンパク質
Allophycocyanin alpha subunit


分子量: 17639.123 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RYM0
#21: タンパク質 ...
Allophycocyanin beta subunit


分子量: 17415.797 Da / 分子数: 22 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0S279
#22: タンパク質 Allophycocyanin gamma subunit


分子量: 18126.934 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0S1U6
#23: タンパク質 Allophycocyanin beta 18 subunit


分子量: 19778.740 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Porphyridium purpureum (真核生物) / 参照: UniProt: W0RZE2

-
非ポリマー , 4種, 1462分子

#29: 化合物...
ChemComp-PEB / PHYCOERYTHROBILIN


分子量: 588.694 Da / 分子数: 1298 / 由来タイプ: 合成 / 式: C33H40N4O6
#30: 化合物...
ChemComp-PUB / PHYCOUROBILIN


分子量: 590.710 Da / 分子数: 40 / 由来タイプ: 合成 / 式: C33H42N4O6 / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#31: 化合物...
ChemComp-CYC / PHYCOCYANOBILIN


分子量: 588.694 Da / 分子数: 120 / 由来タイプ: 合成 / 式: C33H40N4O6
#32: 化合物
ChemComp-PMS / phenylmethanesulfonic acid / ベンゼンメタンスルホン酸


分子量: 172.202 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C7H8O3S

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかY

-
実験情報

-
実験

実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

-
試料調製

構成要素名称: phycobilisome / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#28 / 由来: NATURAL
分子量値: 14700 kDa/nm / 実験値: NO
由来(天然)生物種: Porphyridium purpureum (真核生物)
緩衝液pH: 7
緩衝液成分
ID濃度名称式Buffer-ID
10.75 mol/Ldisodium hydrogen phosphateNa2HPO41
20.75 mol/Lmonopotassium phosphateKH2PO41
試料包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
試料支持グリッドの材料: COPPER / グリッドのサイズ: 200 divisions/in.
グリッドのタイプ: PELCO Ultrathin Carbon with Lacey Carbon
急速凍結装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 18 K

-
電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズモード: BRIGHT FIELD / 倍率（公称値）: 130000 X / 倍率（補正後）: 130000 X / 最大 デフォーカス（公称値）: 2300 nm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1300 nm / Calibrated defocus min: 1300 nm / 最大 デフォーカス（補正後）: 2300 nm / Cs: 2.7 mm / C2レンズ絞り径: 100 µm / アライメント法: COMA FREE
試料ホルダ凍結剤: NITROGEN
試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
最高温度: 70 K / 最低温度: 70 K
撮影平均露光時間: 8.2 sec. / 電子線照射量: 50 e/Å2 / 検出モード: SUPER-RESOLUTION
フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 6438
電子光学装置エネルギーフィルター名称: GIF Quantum ER
画像スキャン横: 4096 / 縦: 4096 / 動画フレーム数/画像: 32 / 利用したフレーム数/画像: 1-32

-
解析

EMソフトウェア
ID名称バージョンカテゴリ
4CTFFIND4.15CTF補正
7UCSF Chimeraモデルフィッティング
9RELION3.1beta初期オイラー角割当
10RELION3.1beta最終オイラー角割当
11RELION3.1beta分類
12RELION3.1beta３次元再構成
13PHENIXモデル精密化
CTF補正タイプ: NONE
粒子像の選択選択した粒子像数: 315046
対称性点対称性: C2 (2回回転対称)
3次元再構成解像度: 3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 87399 / アルゴリズム: FOURIER SPACE / クラス平均像の数: 2 / 対称性のタイプ: POINT
原子モデル構築B value: 62.05 / プロトコル: RIGID BODY FIT / 空間: REAL / Target criteria: 0,99
原子モデル構築PDB-ID: 6KGX

6kgx


Accession code: 6KGX / Source name: PDB / タイプ: experimental model

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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