A: major capsid protein B: major capsid protein C: major capsid protein D: major capsid protein E: major capsid protein F: major capsid protein G: major capsid protein
A: major capsid protein B: major capsid protein C: major capsid protein D: major capsid protein E: major capsid protein F: major capsid protein G: major capsid protein
A: major capsid protein B: major capsid protein C: major capsid protein D: major capsid protein E: major capsid protein F: major capsid protein G: major capsid protein
x 5
icosahedral pentamer
1.15 MDa, 35 ポリマー
分子量 (理論値)
分子数
合計 (水以外)
1,146,778
35
ポリマ-
1,146,778
35
非ポリマー
0
0
水
0
タイプ
名称
対称操作
数
identity operation
1_555
x,y,z
1
point symmetry operation
4
4
A: major capsid protein B: major capsid protein C: major capsid protein D: major capsid protein E: major capsid protein F: major capsid protein G: major capsid protein
中空か: NO / エンベロープを持つか: NO / ホストのカテゴリ: BACTERIA(EUBACTERIA) / 単離: STRAIN / タイプ: VIRION
天然宿主
生物種: Propionibacterium acnes / 株: 6919
試料
包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
試料支持
詳細: Purified sample was applied to a Quantifoil grid.
急速凍結
装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % 詳細: Blot for 15 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 手法: Blot for 15 seconds before plunging
モード: BRIGHT FIELD / 倍率(公称値): 38462 X / 倍率(補正後): 38462 X / 最大 デフォーカス(公称値): 2270 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 800 nm
試料ホルダ
試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
撮影
電子線照射量: 25 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 (4k x 4k)
画像スキャン
デジタル画像の数: 3168
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
-
解析
EMソフトウェア
名称: FREALIGN / カテゴリ: 3次元再構成
対称性
点対称性: I (正20面体型対称)
3次元再構成
解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 27504 / ピクセルサイズ(公称値): 1.3 Å / ピクセルサイズ(実測値): 1.3 Å 詳細: (Single particle details: The particles were selected using an in-house selection procedure.) (Single particle--Applied symmetry: I) 対称性のタイプ: POINT