ChemComp-ONH: N~5~-hydroxy-L-ornithine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ONH
• 名称: 名称: N~5~-hydroxy-L-ornithine / 日化辞名称: N⁵-ヒドロキシオルニチン

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₂N₂O₃ / 原子数: 22 / 化学式量: 148.16 / 形式電荷: 0

その他

3s5w

ALA

タイプ: L-peptide linking / PDB分類: ATOMP / 1文字コード: A / 3文字コード: ONH / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3S5W / 親要素: ALA

履歴

作成	2011年6月2日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / 日化辞 / PubChem / Rhea / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C(N)CCCNO
• CACTVS 3.370: N[CH](CCCNO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C(CC(C(=O)O)N)CNO

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: N[C@@H](CCCNO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C(C[C@@H](C(=O)O)N)CNO

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H12N2O3/c6-4(5(8)9)2-1-3-7-10/h4,7,10H,1-3,6H2,(H,8,9)/t4-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: OZMJDTPATROLQC-BYPYZUCNSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N~5~-hydroxy-L-ornithine
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: (2S)-2-azanyl-5-(oxidanylamino)pentanoic acid

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-3s5w:
Ornithine Hydroxylase (PvdA) from Pseudomonas aeruginosa

PDB-9ebm:
Piperazate synthase (PipS) in complex with haem and N5-OH-L-ornithine

PDB-9jn5:
Crystal structure of KtzT-C197A in complex with HEME and substrate

PDB-9oqt:
N-hydroxylamine dehydratase (NohD) T98A/K167A mutant crystal structure with heme and N-hydroxylated ornithine (2.5h soak)

PDB-9oqu:
N-hydroxylamine dehydratase (NohD) T98A/K167A mutant crystal structure with heme and N-hydroxylated ornithine (5h soak)

PDB-9or1:
N-hydroxylamine dehydratase (NohD) H2F/F4P/P5S/R6Y/A59N/R144Y/V96A/D172E/L172Q/D173P/R176V (P1/P2/A1/A2/A3) mutant crystal structure with heme and N-hydroxylated ornithine