ChemComp-IP9: (2R)-3-{[(R)-{[(1S,2S,3R,4S,5S,6S)-2,6-dihydroxy-3,4,5-tris(phosp...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: IP9
• 名称: 名称: (2R)-3-{[(R)-{[(1S,2S,3R,4S,5S,6S)-2,6-dihydroxy-3,4,5-tris(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}propane; 別称: L-a-Phosphatidyl-D-myo-inositol 3,4,5-triphosphate, dioctanoyl;; 日化辞名称: 1-O-(1-O,2-O-ジオクタノイル-L-グリセロ-3-ホスホ)-D-myo-イノシト-ル3,4,5-トリスりん酸

Chemical information

組成

組成式: C₂₅H₅₀O₂₂P₄ / 原子数: 101 / 化学式量: 826.546 / 形式電荷: 0

その他

3mdb

ITS

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: IP9 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3MDB / 置き換え元: ITS

履歴

作成	2010年7月28日
Modify synonyms	2010年11月12日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / ChEMBL / Metabolights / 日化辞 / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(OCC(OC(=O)CCCCCCC)COP(=O)(O)OC1C(O)C(OP(=O)(O)O)C(OP(=O)(O)O)C(OP(=O)(O)O)C1O)CCCCCCC
• CACTVS 3.370: CCCCCCCC(=O)OC[CH](CO[P](O)(=O)O[CH]1[CH](O)[CH](O[P](O)(O)=O)[CH](O[P](O)(O)=O)[CH](O[P](O)(O)=O)[CH]1O)OC(=O)CCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCCCCCCC(=O)OCC(COP(=O)(O)OC1C(C(C(C(C1O)OP(=O)(O)O)OP(=O)(O)O)OP(=O)(O)O)O)OC(=O)CCCCCCC

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CCCCCCCC(=O)OC[C@H](CO[P](O)(=O)O[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O[P](O)(O)=O)[C@@H](O[P](O)(O)=O)[C@H](O[P](O)(O)=O)[C@H]1O)OC(=O)CCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCCCCCCC(=O)OC[C@H](CO[P@@](=O)(O)OC1[C@@H]([C@H](C([C@H]([C@H]1O)OP(=O)(O)O)OP(=O)(O)O)OP(=O)(O)O)O)OC(=O)CCCCCCC

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C25H50O22P4/c1-3-5-7-9-11-13-18(26)41-15-17(43-19(27)14-12-10-8-6-4-2)16-42-51(39,40)47-22-20(28)23(44-48(30,31)32)25(46-50(36,37)38)24(21(22)29)45-49(33,34)35/h17,20-25,28-29H,3-16H2,1-2H3,(H,39,40)(H2,30,31,32)(H2,33,34,35)(H2,36,37,38)/t17-,20+,21+,22-,23+,24-,25-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ANFYVAHJWGJYAT-QLCNXWICSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R)-3-{[(R)-{[(1S,2S,3R,4S,5S,6S)-2,6-dihydroxy-3,4,5-tris(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}propane-1,2-diyl dioctanoate
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: [(2R)-3-[[(2S,3S,5R,6S)-2,6-dihydroxy-3,4,5-triphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-2-octanoyloxy-propyl] octanoate

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-3lju:
Crystal structure of full length centaurin alpha-1 bound with the head group of PIP3

PDB-3mdb:
Crystal structure of the ternary complex of full length centaurin alpha-1, KIF13B FHA domain, and IP4

PDB-7a17:
Crystal structure of the 5-phosphatase domain of Synaptojanin1 bound to its substrate diC8-PI(3,4,5)P3 in complex with a nanobody

PDB-8ox7:
Cryo-EM structure of ATP8B1-CDC50A in E2P autoinhibited "closed" conformation

PDB-8ox8:
Cryo-EM structure of ATP8B1-CDC50A in E2P autoinhibited "open" conformation

PDB-8ox9:
Cryo-EM structure of ATP8B1-CDC50A in E2P active conformation with bound PC