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万見
- EMDB-73862: The structure of TMD with 3 TARPs and 1 CNIH from all native AMPA... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-73862
タイトルThe structure of TMD with 3 TARPs and 1 CNIH from all native AMPA receptor subtypes
マップデータ
試料
  • 複合体: Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH
    • タンパク質・ペプチド: Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4)
    • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor 2
    • タンパク質・ペプチド: Mix of protein cornichon homolog 2 and 3
    • タンパク質・ペプチド: Mix of voltage-dependent calcium channel gamma subunits
    • タンパク質・ペプチド: Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit
  • リガンド: (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate
  • リガンド: TETRADECANE
  • リガンド: 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol
キーワードIonotropic glutamate receptor AMPA receptor / MEMBRANE PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


Phase 0 - rapid depolarisation / Phase 2 - plateau phase / Activation of AMPA receptors / Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation / Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors / LGI-ADAM interactions / Trafficking of AMPA receptors / L-type voltage-gated calcium channel complex / regulation of AMPA receptor activity / perisynaptic space ...Phase 0 - rapid depolarisation / Phase 2 - plateau phase / Activation of AMPA receptors / Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation / Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors / LGI-ADAM interactions / Trafficking of AMPA receptors / L-type voltage-gated calcium channel complex / regulation of AMPA receptor activity / perisynaptic space / ligand-gated monoatomic cation channel activity / AMPA glutamate receptor activity / kainate selective glutamate receptor activity / AMPA glutamate receptor complex / extracellularly glutamate-gated ion channel activity / regulation of postsynaptic membrane neurotransmitter receptor levels / glutamate-gated receptor activity / somatodendritic compartment / synaptic membrane / calcium channel regulator activity / transmitter-gated monoatomic ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential / postsynaptic density membrane / Schaffer collateral - CA1 synapse / calcium channel activity / synaptic vesicle / synaptic vesicle membrane / chemical synaptic transmission / postsynaptic membrane / neuron projection / postsynaptic density / dendrite / synapse / glutamatergic synapse / endoplasmic reticulum / membrane / plasma membrane
類似検索 - 分子機能
Voltage-dependent calcium channel, gamma-8 subunit / : / PMP-22/EMP/MP20/Claudin family / Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit / PMP-22/EMP/MP20/Claudin superfamily / Ionotropic glutamate receptor, metazoa / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ionotropic glutamate receptor, L-glutamate and glycine-binding domain / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ligand-gated ion channel ...Voltage-dependent calcium channel, gamma-8 subunit / : / PMP-22/EMP/MP20/Claudin family / Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit / PMP-22/EMP/MP20/Claudin superfamily / Ionotropic glutamate receptor, metazoa / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ionotropic glutamate receptor, L-glutamate and glycine-binding domain / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ligand-gated ion channel / : / Ionotropic glutamate receptor / Eukaryotic homologues of bacterial periplasmic substrate binding proteins. / Receptor, ligand binding region / Receptor family ligand binding region / Periplasmic binding protein-like I
類似検索 - ドメイン・相同性
Glutamate receptor 2 / Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit
類似検索 - 構成要素
生物種Mus musculus (ハツカネズミ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.0 Å
データ登録者Park J / Gouaux E
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)R01 NS038631 米国
引用ジャーナル: Protein Sci / 年: 2026
タイトル: Efficient and rapid isolation of native AMPA receptor complexes for cryo-EM.
著者: Jumi Park / Eric Gouaux /
要旨: Isolating native ion channels for structural characterization is routinely achieved by extraction from membrane fractions of tissue with prolonged mild detergent treatment. AMPA receptors (AMPARs), ...Isolating native ion channels for structural characterization is routinely achieved by extraction from membrane fractions of tissue with prolonged mild detergent treatment. AMPA receptors (AMPARs), glutamatergic receptors that mediate fast excitatory transmission and synaptic plasticity, are coassembled with diverse auxiliary subunits and transiently-interacting partners to finely regulate processes from trafficking to gating kinetics. Previous studies of the composition and architecture of native AMPARs (nAMPARs) isolated from membrane fractions of rodent brain tissue have revealed many different subunit compositions and non-stochastic assemblies of the auxiliary subunits. However, elucidating the molecular architectures of nAMPARs complexed with less populated or transiently bound proteins has proven challenging. Here, we employ strategies for the rapid solubilization and purification of nAMPARs to increase the likelihood of isolating the greatest range of nAMPARs complexes. By utilizing whole brain tissue and reducing solubilization and purification duration, we purify nAMPARs complexed with a wider variety of auxiliary subunits and binding partners in a sufficient quantity and purity for cryo-electron microscopy studies. We resolve previously unreported subunit compositions and conformations that include ones with a half-splayed ATD layer, as well as complexes with four distinct auxiliary subunit arrangements in the TMD layer.
履歴
登録2025年11月14日-
ヘッダ(付随情報) 公開2026年2月4日-
マップ公開2026年2月4日-
更新2026年2月4日-
現状2026年2月4日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_73862.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_73862.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

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その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 429.568 Å		0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 429.568 Å		0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 429.568 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.839 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.1
最小 - 最大-0.38731825 - 0.66658306
平均 (標準偏差)0.00047648017 (±0.0123991035)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 429.568 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_73862_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_73862_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH

全体名称: Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH
要素
  • 複合体: Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH
    • タンパク質・ペプチド: Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4)
    • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor 2
    • タンパク質・ペプチド: Mix of protein cornichon homolog 2 and 3
    • タンパク質・ペプチド: Mix of voltage-dependent calcium channel gamma subunits
    • タンパク質・ペプチド: Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit
  • リガンド: (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate
  • リガンド: TETRADECANE
  • リガンド: 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol

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超分子 #1: Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH

超分子名称: Native AMPA receptors with 3 TARPs and 1 CNIH / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#5
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)

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分子 #1: Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4)

分子名称: Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 29.723635 KDa
配列文字列: KPGVFSFLDP LAYEIWMCIV FAYIGVSVVL FLVSRFS(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)N EFGIFNSLWF SLGA FMQQG CDISPRSLSG ...文字列:
KPGVFSFLDP LAYEIWMCIV FAYIGVSVVL FLVSRFS(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)N EFGIFNSLWF SLGA FMQQG CDISPRSLSG RIVGGVWWFF TLIIISSYTA NLAAFLTVER MV(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)SALS LSNVAGVFYI LAGGLGLAMA VALIEFCYKS RA

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分子 #2: Glutamate receptor 2

分子名称: Glutamate receptor 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 29.83883 KDa
配列文字列: KPGVFSFLDP LAYEIWMCIV FAYIGVSVVL FLVSRFS(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)N EFGIFNSLWF SLGA FMRQG CDISPRSLSG ...文字列:
KPGVFSFLDP LAYEIWMCIV FAYIGVSVVL FLVSRFS(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)N EFGIFNSLWF SLGA FMRQG CDISPRSLSG RIVGGVWWFF TLIIISSYTA NLAAFLTVER MV(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)TSALS LSNVAGVFYI LVGGLGLAML VALIEFCYKS RA

UniProtKB: Glutamate receptor 2, Glutamate receptor 2, Glutamate receptor 2

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分子 #3: Mix of protein cornichon homolog 2 and 3

分子名称: Mix of protein cornichon homolog 2 and 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 17.901887 KDa
配列文字列:
AFTFAAFCYM LALVLCAALI FFAIWHIIAF DELRTDFKAP IDQANPAAAR ERLANIERIC ALLRKLVAPE YSIHALFCAM FLCAAEWAT LGLNAPLLFY HAWRYFHAPA DASEAAYDAA AAMNADALAY CQKEAWCKLA FYLLSFFYYL YAMAYTLVSA

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分子 #4: Mix of voltage-dependent calcium channel gamma subunits

分子名称: Mix of voltage-dependent calcium channel gamma subunits
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 21.045174 KDa
配列文字列: VQALLTTAGA FAAFALMTIA AATDYWLYAR AAACATAAAA (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)AAAAKKAA AAATHSGLWR ACCLEGAAAG ACAAIAHFPE DADYAADAAE YALRAVRASS IFPILSA IL LAAGGACAAA ...文字列:
VQALLTTAGA FAAFALMTIA AATDYWLYAR AAACATAAAA (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)AAAAKKAA AAATHSGLWR ACCLEGAAAG ACAAIAHFPE DADYAADAAE YALRAVRASS IFPILSA IL LAAGGACAAA SAAYKAAANI ILAAGIAFVA AGLSNIIGAI VYISANAGAP AAAAAAAKKN AYSYGWSFYF GALSFIAA E AAGVLAVAAA IARAAAAAAA ARAA

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分子 #5: Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

分子名称: Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 43.371742 KDa
配列文字列: ESLKRWNEER GLWCEKGVQV LLTTIGAFSA FGLMTIAIST DYWLYTRALI CNTTNLTAGD DGPPHRGGSG SSEKKDPGGL THSGLWRIC CLEGLKRGVC VKINHFPEDT DYDHDSAEYL LRVVRASSIF PILSAILLLL GGVCVAASRV YKSKRNIILG A GILFVAAG ...文字列:
ESLKRWNEER GLWCEKGVQV LLTTIGAFSA FGLMTIAIST DYWLYTRALI CNTTNLTAGD DGPPHRGGSG SSEKKDPGGL THSGLWRIC CLEGLKRGVC VKINHFPEDT DYDHDSAEYL LRVVRASSIF PILSAILLLL GGVCVAASRV YKSKRNIILG A GILFVAAG LSNIIGVIVY ISANAGEPGP KRDEEKKNHY SYGWSFYFGG LSFILAEVIG VLAVNIYIER SREAHCQSRS DL LKAGGGA GGSGGSGPSA ILRLPSYRFR YRRRSRSSSR GSSEASPSRD ASPGGPGGPG FASTDISMYT LSRDPSKGSV AAG LASAGG GGSGAGVGAY GGAAGAAGGG GAGSERDRGS SAGFLTLHNA FPKEAASGVT VTVTGPPAAP APAPAPPAPA APAP GTLSK EAAASNTNTL NRKTTPV

UniProtKB: Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

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分子 #6: (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(tri...

分子名称: (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate
タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 23 / 式: POV
分子量理論値: 760.076 Da
Chemical component information

ChemComp-POV:
(2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate / リン脂質*YM

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分子 #7: TETRADECANE

分子名称: TETRADECANE / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 3 / 式: C14
分子量理論値: 198.388 Da
Chemical component information

ChemComp-C14:
TETRADECANE / テトラデカン

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分子 #8: 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol

分子名称: 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol
タイプ: ligand / ID: 8 / コピー数: 2 / 式: XVD
分子量理論値: 328.674 Da
Chemical component information

ChemComp-XVD:
6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

濃度0.12 mg/mL
緩衝液pH: 8
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.2 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 82389
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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