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- EMDB-40774: Structure of the 48S translation initiation complex assembled on ... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-40774
タイトルStructure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES
マップデータ40SIC-EMCV-tRNA-eIF3
試料
  • 複合体: EMCV IRES 40SIC
    • 複合体: 40SIC
      • タンパク質・ペプチド: x 44種
      • RNA: x 2種
    • 複合体: EMCV IRES
      • RNA: x 1種
  • リガンド: x 1種
キーワードEMCV / IRES / Cryo-EM / 40SIC / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / IRES-dependent viral translational initiation / translation reinitiation / formation of cytoplasmic translation initiation complex / multi-eIF complex / eukaryotic translation initiation factor 3 complex / eukaryotic 43S preinitiation complex / translation factor activity, RNA binding ...viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / IRES-dependent viral translational initiation / translation reinitiation / formation of cytoplasmic translation initiation complex / multi-eIF complex / eukaryotic translation initiation factor 3 complex / eukaryotic 43S preinitiation complex / translation factor activity, RNA binding / eukaryotic 48S preinitiation complex / regulation of translational initiation / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / metal-dependent deubiquitinase activity / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Ribosomal scanning and start codon recognition / laminin receptor activity / Translation initiation complex formation / Formation of a pool of free 40S subunits / 90S preribosome / ubiquitin ligase inhibitor activity / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / phagocytic cup / translation regulator activity / rough endoplasmic reticulum / ribosomal small subunit export from nucleus / laminin binding / translation initiation factor binding / translation initiation factor activity / gastrulation / MDM2/MDM4 family protein binding / cytosolic ribosome / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / ribosome assembly / positive regulation of apoptotic signaling pathway / positive regulation of translation / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / small-subunit processome / translational initiation / PML body / spindle / fibrillar center / metallopeptidase activity / rRNA processing / positive regulation of canonical Wnt signaling pathway / rhythmic process / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / virus receptor activity / ribosome binding / ribosomal small subunit biogenesis / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / perikaryon / cytoplasmic translation / cell differentiation / tRNA binding / cysteine-type deubiquitinase activity / mitochondrial inner membrane / postsynaptic density / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / cell division / DNA repair / mRNA binding / apoptotic process / centrosome / synapse / dendrite / nucleolus / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus / DNA binding / RNA binding / zinc ion binding / nucleoplasm / membrane / identical protein binding / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能
Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / eIF3h, C-terminal / C-terminal region of eIF3h / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Translation initiation factor 3 complex subunit L / RNA polymerase I-associated factor PAF67 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / eIF3 subunit M, C-terminal helix domain / : / eIF3 subunit 6 N terminal domain ...Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / eIF3h, C-terminal / C-terminal region of eIF3h / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Translation initiation factor 3 complex subunit L / RNA polymerase I-associated factor PAF67 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / eIF3 subunit M, C-terminal helix domain / : / eIF3 subunit 6 N terminal domain / eIF3 subunit M, C-terminal helix / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, C-terminal / EIF3CL-like, C-terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, N-terminal / eIF3 subunit 6 N terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Translation initiation factor 3, subunit 12, N-terminal, eukaryotic / : / eIF3a, PCI domain, TPR-like region / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, N-terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 8 N-terminus / Translation initiation factor 1A (eIF-1A), conserved site / Eukaryotic initiation factor 1A signature. / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M eIF3m/COP9 signalosome complex subunit 7 COPS7 / eukaryotic translation initiation factor 1A / Translation initiation factor 1A (eIF-1A) / RNA-binding domain, S1, IF1 type / Translation initiation factor 1A / IF-1 / S1 domain IF1 type profile. / CSN8/PSMD8/EIF3K / CSN8/PSMD8/EIF3K family / Rpn11/EIF3F, C-terminal / Maintenance of mitochondrial structure and function / : / motif in proteasome subunits, Int-6, Nip-1 and TRIP-15 / PCI domain / Proteasome component (PCI) domain / PCI domain profile. / 40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ubiquitin-like protein FUBI / JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S12e / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic / S27a-like superfamily / JAB/MPN domain / 40S Ribosomal protein S10 / JAB1/MPN/MOV34 metalloenzyme domain / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S27a / : / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / MPN domain / MPN domain profile. / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S3Ae signature. / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S6, eukaryotic
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS32 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L / Small ribosomal subunit protein eS12 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein ...Small ribosomal subunit protein eS32 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L / Small ribosomal subunit protein eS12 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Small ribosomal subunit protein eS7 / Small ribosomal subunit protein uS12 / 40S ribosomal protein S24 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS25 / Small ribosomal subunit protein eS26 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein eS21 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein eS10 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Encephalomyocarditis virus (脳心筋炎ウイルス) / Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å
データ登録者Bhattacharjee S / Abaeva IS / Brown ZP / Arhab Y / Fallah H / Jeevan JC / Hellen CUT / Frank J / Pestova TV
資金援助 米国, 5件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM139453 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01 GM29169 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R35 GM122602 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01 GM097014 米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)R01 AI123406 米国
引用ジャーナル: bioRxiv / 年: 2025
タイトル: The mechanism of ribosomal recruitment during translation initiation on Type 2 IRESs.
著者: Sayan Bhattacharjee / Irina S Abaeva / Zuben P Brown / Yani Arhab / Hengameh Fallah / Christopher U T Hellen / Joachim Frank / Tatyana V Pestova /
要旨: The encephalomyocarditis virus (EMCV) IRES and other Type 2 IRESs comprise domains H-L and specifically interact with eIF4G/eIF4A through their essential JK domain. However, the JK domain is not ...The encephalomyocarditis virus (EMCV) IRES and other Type 2 IRESs comprise domains H-L and specifically interact with eIF4G/eIF4A through their essential JK domain. However, the JK domain is not sufficient for IRES function, which also requires the preceding domain I of unknown function. To identify interactions that drive ribosomal recruitment of eIF4G/eIF4A-bound Type 2 IRESs, we determined the cryo-EM structure of 48S initiation complexes formed on the EMCV IRES. It revealed that the apical domain I cloverleaf contacts ribosomal proteins uS13 and uS19 via its Id subdomain and that the essential GNRA tetraloop in subdomain Ic interacts directly with the TψC domain of initiator tRNA. Functional assays supported the exceptional role of these interactions for initiation on this IRES. The strong conservation of primary and secondary structures of the apex of domain I among Type 2 IRESs suggests that the reported interactions are a common essential feature of them all.
履歴
登録2023年5月12日-
ヘッダ(付随情報) 公開2026年3月18日-
マップ公開2026年3月18日-
更新2026年4月1日-
現状2026年4月1日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_40774.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_40774.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈40SIC-EMCV-tRNA-eIF3
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.24 Å/pix.
x 320 pix.
= 396.8 Å		1.24 Å/pix.
x 320 pix.
= 396.8 Å		1.24 Å/pix.
x 320 pix.
= 396.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.24 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.198
最小 - 最大-0.045131918 - 2.7301812
平均 (標準偏差)0.007889423 (±0.036183048)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 396.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : EMCV IRES 40SIC

全体名称: EMCV IRES 40SIC
要素
  • 複合体: EMCV IRES 40SIC
    • 複合体: 40SIC
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M
      • RNA: 18S rRNA
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal
      • タンパク質・ペプチド: uS2 (SA)
      • タンパク質・ペプチド: eS1
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
      • タンパク質・ペプチド: uS3
      • タンパク質・ペプチド: eS4 (S4 X isoform)
      • タンパク質・ペプチド: uS7
      • タンパク質・ペプチド: eS6
      • タンパク質・ペプチド: eS7
      • タンパク質・ペプチド: eS8
      • タンパク質・ペプチド: uS4
      • タンパク質・ペプチド: eS10
      • タンパク質・ペプチド: uS17
      • タンパク質・ペプチド: eS12
      • タンパク質・ペプチド: uS15
      • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS11
      • タンパク質・ペプチド: uS19
      • タンパク質・ペプチド: uS9
      • タンパク質・ペプチド: eS17
      • タンパク質・ペプチド: uS13
      • タンパク質・ペプチド: eS19
      • タンパク質・ペプチド: uS10
      • タンパク質・ペプチド: eS21
      • タンパク質・ペプチド: uS8
      • タンパク質・ペプチド: uS12
      • タンパク質・ペプチド: eS24
      • タンパク質・ペプチド: eS25
      • タンパク質・ペプチド: eS26
      • タンパク質・ペプチド: eS27
      • タンパク質・ペプチド: eS28
      • タンパク質・ペプチド: uS14
      • タンパク質・ペプチド: eS30
      • タンパク質・ペプチド: eS31
      • タンパク質・ペプチド: Receptor for Activated C Kinase 1 (RACK1)
      • RNA: Met-tRNAiMet
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: eL41
    • 複合体: EMCV IRES
      • RNA: EMCV mRNA
  • リガンド: ZINC ION

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超分子 #1: EMCV IRES 40SIC

超分子名称: EMCV IRES 40SIC / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#47 / 詳細: Cryo_EM

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超分子 #2: 40SIC

超分子名称: 40SIC / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#9, #11-#47
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

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超分子 #3: EMCV IRES

超分子名称: EMCV IRES / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #10
由来(天然)生物種: Encephalomyocarditis virus (脳心筋炎ウイルス)

+
分子 #1: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 164.902656 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MPAYFQRPEN ALKRANEFLE VGKKQPALDV LYDVMKSKKH RTWQKIHEPI MLKYLELCVD LRKSHLAKEG LYQYKNICQQ VNIKSLEDV VRAYLKLAEE KTEAAKEESQ QMVLDIEDLD NIQTPESVLL SAVSGEDTQD RTDRLLLTPW VKFLWESYRQ C LDLLRNNS ...文字列:
MPAYFQRPEN ALKRANEFLE VGKKQPALDV LYDVMKSKKH RTWQKIHEPI MLKYLELCVD LRKSHLAKEG LYQYKNICQQ VNIKSLEDV VRAYLKLAEE KTEAAKEESQ QMVLDIEDLD NIQTPESVLL SAVSGEDTQD RTDRLLLTPW VKFLWESYRQ C LDLLRNNS RVERLYHDIA QQAFKFCLQY TRKAEFRKLC DNLRMHLSQI QRHHNQSTAI NLNNPESQSM HLETRLVQLD SA ISMELWQ EAFKAVEDIH GLFSLSKKPP KPQLMANYYN KVSTVFWKSG NALFHASTLH RLYHLSREMR KNLTQDEMQR MST RVLLAT LSIPITPERT DIARLLDMDG IIVEKQRRLA TLLGLQAPPT RIGLINDMVR FNVLQYVVPE VKDLYNWLEV EFNP LKLCE RVTKVLNWVR EQPEKEPELQ QYVPQLQSNT ILRLLQQVAQ IYQSIEFSRL TSLVPFVDAF QLERAIVDAA RHCDL QVRI DHTSRTLSFG SDLNYATRED APIGPHLQSM PSEQIRNQLT AMSSVLAKAL EVIKPAHILQ EKEEQHQLAV TAYLKN SRK EHQRILARRQ TIEERKERLE SLNIQREKEE LEQREAELQK VRKAEEERLR QEAKEREKER ILQEHEQIKK KTVRERL EQ IKKTELGAKA FKDIDIEDLE ELDPDFIMAK QVEQLEKEKK ELQERLKNQE KKIDYFERAK RLEEIPLIKS AYEEQRIK D MDLWEQQEEE RITTMQLERE KALEHKNRMS RMLEDRDLFV MRLKAARQSV YEEKLKQFEE RLAEERHNRL EERKRQRKE ERRITYYREK EEEEQRRAEE QMLKEREERE RAERAKREEE LREYQERVKK LEEVERKKRQ RELEIEERER RREEERRLGE DPLSRRDSR WGDRDSEGTW RKGPEADSEW RRGPPEKEWR RGEGRDDERS HRRDEERPRR VGDDEDRESS LRPDDDRTLR R GMEDDRGP RRGPDEERFS RRGLEDERPS WRSTDDDRPP RRIGEEDRGS WRHAEDDRPP RRGLDDDRGS WRTADEDRGP RR MMDEDRG PRRGGADDER PSWRSADDDR GPRRGIDDDR GPRRGLDDDR GPWRNADDDR IPRRGADDDR GPWRNMDDDR MSR RADDDR ISRRGEDSRP GPWRPFVKPG GWREKEKARE ESWGPPRESR PPEEREWERE RDRDNPDREE NDKDPERERD RERD GDREE RFRRPRDEGG WRRGPAEEAS SWRDSSRRDD RDRDDRRRER DDRRDLRDRR DLRDDRDRRG PPLRSERDEV SSWRR ADDR KDDRAEERDP PRRVPPPVLS RDRDRDRDRD RDRDRERERE REREGEKEKT SWRAEKDRES LRRTKNETDE DGWTTV RR

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

+
分子 #2: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 97.923547 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MKIRDVTKCL EEFELLGKAY GKAKSIVDKE GVPRFYIRIL ADLEDYLNEL WEDKEGKKKM NKNNAKALST LRQKIRKYNR DFESHITNY KQNPEQSADE DAEKNEEDSE GSSDEDEDED GVSAAAFLKK KAEAPSGESR KFLKKMEDED EDSEDSEDDE E WDTGSTSS ...文字列:
MKIRDVTKCL EEFELLGKAY GKAKSIVDKE GVPRFYIRIL ADLEDYLNEL WEDKEGKKKM NKNNAKALST LRQKIRKYNR DFESHITNY KQNPEQSADE DAEKNEEDSE GSSDEDEDED GVSAAAFLKK KAEAPSGESR KFLKKMEDED EDSEDSEDDE E WDTGSTSS DSDSEEEEGK QTALASRFLK KAPTTEEDKK AAEKKREDKA KKKHDRKSKR LDEEEEDNEG GEWERVRGGV PL VKEKPKM FAKGTEITHA VVIKKLNEIL QARGKKGTDR AAQIELLQLL VQIASENNLG EGVIVKIKFN IIASLYDYNP NLA TYMKPE MWQKCLDCIN ELMDILFANP NIFVGENILE ESENLQNVDQ PLRVRGCILT LVERMDEEFT KIMQNTDPHS QEYV EHLKD EAQVCAIIER VQRYLEEKGT TEEICRVYLR RILHTYYKFD YKAHQRQLTP PEGSSKSEQD QAENEGEDSA VLMER LCKY IYAKDRTDRI RTCAILCHIY HHYLHSRWYQ ARDLMLMSHL QDNIQHADPP VQILYNRTMV QLGICAFRQG LTKDAH NAL LDIQSSGRAK ELLGQGLLLR SLQERNQEQE KVERRRQVPF HLHINLELLE CVYLVSAMLL EIPYMAAHES DARRRMI SK QFHHQLRVGE RQPLLGPPES MREHVVAASK AMKMGDWKTC HSFIINEKMN GKVWDLFPEA DKVRTMLVRK IQEESLRT Y LFTYSSVYDS ISMETLSDMF ELDLPTVHSI ISKMIINEEL MASLDQPTQT VVMHRTEPTA QQNLALQLAE KLGSLVENN ERVFDHKQGT YGGYFRDQKD GYRKNEGYMR RGGYRQQQSQ TAY

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

+
分子 #3: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 52.281633 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MAEYDLTTRI AHFLDRHLVF PLLEFLSVKE IYNEKELLQG KLDLLSDTNM VDFAMDVYKN LYSDDIPHAL REKRTTVVAQ LKQLQAETE PIVKMFEDPE TTRQMQSTRD GRMLFDYLAD KHGFRQEYLD TLYRYAKFQY ECGNYSGAAE YLYFFRVLVP A TDRNALSS ...文字列:
MAEYDLTTRI AHFLDRHLVF PLLEFLSVKE IYNEKELLQG KLDLLSDTNM VDFAMDVYKN LYSDDIPHAL REKRTTVVAQ LKQLQAETE PIVKMFEDPE TTRQMQSTRD GRMLFDYLAD KHGFRQEYLD TLYRYAKFQY ECGNYSGAAE YLYFFRVLVP A TDRNALSS LWGKLASEIL MQNWDAAMED LTRLKETIDN NSVSSPLQSL QQRTWLIHWS LFVFFNHPKG RDNIIDLFLY QP QYLNAIQ TMCPHILRYL TTAVITNKDV RKRRQVLKDL VKVIQQESYT YKDPITEFVE CLYVNFDFDG AQKKLRECES VLV NDFFLV ACLEDFIENA RLFIFETFCR IHQCISINML ADKLNMTPEE AERWIVNLIR NARLDAKIDS KLGHVVMGNN AVSP YQQVI EKTKSLSFRS QMLAMNIEKK LNQNSRSEAP NWATQDSGFY

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

+
分子 #4: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 37.84673 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MATPAVSASA PPATPAATPA AAAAPASAPA AAPAPTPAPA PAAAPAAGAA PAAAADPAAA AAAAGTGQTP ASAQAPAQTS APSLPGPAL PGPFPGGRVV RLHPVILASI VDSYERRNEG AARVIGTLLG TVDKHSVEVT NCFSVPHNES EDEVAVDMEF A KNMYELHK ...文字列:
MATPAVSASA PPATPAATPA AAAAPASAPA AAPAPTPAPA PAAAPAAGAA PAAAADPAAA AAAAGTGQTP ASAQAPAQTS APSLPGPAL PGPFPGGRVV RLHPVILASI VDSYERRNEG AARVIGTLLG TVDKHSVEVT NCFSVPHNES EDEVAVDMEF A KNMYELHK KVSPNELILG WYATGHDITE HSVLIHEYYS REAPNPIHLT VDTSLQNGRM SIKAYVSTSM GVPGRTMGVM FT PLTVKYA YYDTERIGVD LIMKTCFSPN RVIGLSSDLQ QVGGASARIQ DALSTVLQYA EDVLSGKVSA DNTVGRFLMS LVN QVPKIV PDDFETMLNS NINDLLMVTY LANLTQSQIA LNEKLVNL

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

+
分子 #5: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 39.952281 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MASRKEGTGS GGTSSSSATG VVGKGKGKGG SGDSAVKQVQ IDGLVVLKII KHYQEEGQGT EVVQGVLLGL VVEDRLEITN CFPFPQHTE DDADFDEVQY QMEMMRSLRH VNIDHLHVGW YQSTYYGSFV TRALLDSQFS YQHAIEESVV LIYDPIKTAQ G SLSLKAYR ...文字列:
MASRKEGTGS GGTSSSSATG VVGKGKGKGG SGDSAVKQVQ IDGLVVLKII KHYQEEGQGT EVVQGVLLGL VVEDRLEITN CFPFPQHTE DDADFDEVQY QMEMMRSLRH VNIDHLHVGW YQSTYYGSFV TRALLDSQFS YQHAIEESVV LIYDPIKTAQ G SLSLKAYR LTPKLMEVCK EKDFSPEALK KANITFEHMF EEVPIVIKNS HLINVLMWEL EKKSAVADKH ELLSLASSNH LG KNLQLLM DRVDEMSQDI VKYNTYMRNT SKQQQQKHQY QQRRQQENMQ RQSRGEPPLP EEDLSKLFKP PQPPARMDSL LIA GQINTY CQNIKEFTAQ NLGKLFMAQA LQEYNN

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

+
分子 #6: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 25.129709 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MAMFEQMRAN VGKLLKGIDR YNPENLATLE RYVETQAKEN AYDLEANLAV LKLYQFNPAF FQTTVTAQIL LKALTNLPHT DFTLCKCMI DQAHQEERPI RQILYLGDLL ETCHFQAFWQ ALDENMDLLE GITGFEDSVR KFICHVVGIT YQHIDRWLLA E MLGDLTDS ...文字列:
MAMFEQMRAN VGKLLKGIDR YNPENLATLE RYVETQAKEN AYDLEANLAV LKLYQFNPAF FQTTVTAQIL LKALTNLPHT DFTLCKCMI DQAHQEERPI RQILYLGDLL ETCHFQAFWQ ALDENMDLLE GITGFEDSVR KFICHVVGIT YQHIDRWLLA E MLGDLTDS QLKMWMSKYG WSADESGQIF ICSQEESIKP KNIVEKIDFD SVSSIMASSQ

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

+
分子 #7: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 66.804766 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MSYPADDYES EAVYDPYAYP SDYDMHTGDP KQDLAYERQY EQQTYQVIPE VIRNFIQYFH KTVSDLIDQK VYELQASRVS SDVIDQKVY EIQDIYENSW TKLTERFFKN TPWPEAETIA PQVGNDAVFL ILYKELYYRH IYAKVSGGPS LAQRFESYYN Y CNLFNYIL ...文字列:
MSYPADDYES EAVYDPYAYP SDYDMHTGDP KQDLAYERQY EQQTYQVIPE VIRNFIQYFH KTVSDLIDQK VYELQASRVS SDVIDQKVY EIQDIYENSW TKLTERFFKN TPWPEAETIA PQVGNDAVFL ILYKELYYRH IYAKVSGGPS LAQRFESYYN Y CNLFNYIL NADGPAPLEL PNQWLWDIID EFIYQFQSFS QYRCKTAKKS EEEIDFLRSN PKIWNVHSVL NVLHSLVDKS NI NRQLEVY TSGGDPESVA GEYGRHSLYK MLGYFSLVGL LRLHSLLGDY YQAIKVLENI ELNKKSMYSR VPECQVTTYY YVG FAYLMM RRYQDAIRVF ANILLYIQRT KSMFQRTTYK YEMINKQNEQ MHALLAIALT MYPMRIDESI HLQLREKYGD KMLR MQKGD PQVYEELFSY SCPKFLSPVV PNYDSVHPNY HKEPFLQQLK VFSDEVQQQA QLSTIRSFLK LYTTMPVAKL AGFLD LTEQ EFRIQLLVFK HKMKNLVWTS GISALDGEFQ SASEVDFYID KDMIHIADTK VARRYGDFFI RQIHKFEELN RTLKKM GQR P

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

+
分子 #8: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 42.555832 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MSVPAFIDIS EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEK LVKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE K KHTLLRLL ...文字列:
MSVPAFIDIS EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEK LVKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE K KHTLLRLL YEALVDCKKS DAASKVMVEL LGSYTEDNAS QARVDAHRCI VRALKDPNAF LFDHLLTLKP VKFLEGELIH DL LTIFVSA KLASYVKFYQ NNKDFIDSLG LLHEQNMAKM RLLTFMGMAV ENKEISFDTM QQELQIGADD VEAFVIDAVR TKM VYCKID QTQRKVVVSH STHRTFGKQQ WQQLYDTLNA WKQNLNKVKN SLLSLSDT

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

+
分子 #11: Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.488449 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MPKNKGKGGK NRRRGKNENE SEKRELVFKE DGQEYAQVIK MLGNGRLEAM CFDGVKRLCH IRGKLRKKVW INTSDIILVG LRDYQDNKA DVILKYNADE ARSLKAYGEL PEHAKINETD TFGPGDDDEI QFDDIGDDDE DIDDI

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal

+
分子 #12: uS2 (SA)

分子名称: uS2 (SA) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 32.958016 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA ...文字列:
MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA HSVGLMWWML AREVLRMRGT ISREHPWEVM PDLYFYRDPE EIEKEEQAAA EKAVTKEEFQ GEWTAPAPEF TA TQPEVAD WSEGVQVPSV PIQQFPTEDW SAQPATEDWS AAPTAQATEW VGTTTEWS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #13: eS1

分子名称: eS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 30.002061 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM ...文字列:
MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM MEIMTREVQT NDLKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHGEGSSS GK ATGDETG AKVERADGYE PPVQESV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.441846 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ...文字列:
KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ARGCTATLGN FAKATFDAIS KTYSYLTPDL WKETVFTKSP YQEFTDHLVK THT

+
分子 #15: uS3

分子名称: uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 31.146607 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MSARRRRRRA AFRRRAEPFI PISVREPLPF LSAARGGKMA VQISKKRKFV ADGIFKAELN EFLTRELAED GYSGVEVRVT PTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEKV ATRGLCAIAQ AESLRYKLLG GLAVRRACYG V LRFIMESG ...文字列:
MSARRRRRRA AFRRRAEPFI PISVREPLPF LSAARGGKMA VQISKKRKFV ADGIFKAELN EFLTRELAED GYSGVEVRVT PTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEKV ATRGLCAIAQ AESLRYKLLG GLAVRRACYG V LRFIMESG AKGCEVVVSG KLRGQRAKSM KFVDGLMIHS GDPVNYYVDT AVRHVLLRQG VLGIKVKIML PWDPSGKIGP KK PLPDHVS IVEPKDEILP TTPISEQKGG KPEPPAMPQP VPTA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #16: eS4 (S4 X isoform)

分子名称: eS4 (S4 X isoform) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 29.654869 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ...文字列:
MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ITDFIKFDTG NLCMVTGGAN LGRIGVITNR ERHPGSFDVV HVKDANGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWISL PR GKGIRLT IAEERDKRLA AKQSSG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4

+
分子 #17: uS7

分子名称: uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.913453 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列:
MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #18: eS6

分子名称: eS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 28.751906 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSLR AS TSKSESS QK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #19: eS7

分子名称: eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 47.356172 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: EPITNRVFQA LTSSDFKQQD GGSFSLSRTH LSGFRSRPRR TTIASAATRP PPIPSRGGSA PTGTPEGAGA SRSSRTVPRL PPQPSGPPR APRHPGFQRA LPSLIRPEPG VRAPLLASAG TRFKRPASQA VKALSARGLL QPQVQVGPRA NRVPQRREPR Q HLSGHAPG ...文字列:
EPITNRVFQA LTSSDFKQQD GGSFSLSRTH LSGFRSRPRR TTIASAATRP PPIPSRGGSA PTGTPEGAGA SRSSRTVPRL PPQPSGPPR APRHPGFQRA LPSLIRPEPG VRAPLLASAG TRFKRPASQA VKALSARGLL QPQVQVGPRA NRVPQRREPR Q HLSGHAPG ASEGGSASPT YWSLGITSWD ALGFPLRLGG SSGFRSSVAL FRPLSFRRGD LPRSREIWAS SSAGAQPGEA MF SSSAKIV KPNGEKPDEF ESGISQALLE LEMNSDLKAQ LRELNITAAK EIEVGGGRKA IIIFVPVPQL KSFQKIQVRL VRE LEKKFS GKHVVFIAQR RILPKPTRKS RTKNKQKRPR SRTLTAVHDA ILEDLVFPSE IVGKRIRVKL DGSRLIKVHL DKAQ QNNVE HKVETFSGVY KKLTGKDVNF EFPEFQL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS7

+
分子 #20: eS8

分子名称: eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.263387 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ ...文字列:
MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ GKLLACIASR PGQCGRADGY VLEGKELEFY LRKIKARKGK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #21: uS4

分子名称: uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.641564 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG ...文字列:
MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG RPGRVKRKNA KKGQGGAGAG DDEEED

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #22: eS10

分子名称: eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.156865 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRRSRP ETGRPRPKGL EGERPARLTR GEADRDTYRR SAVPPGADKK AEAGAGSATE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS10

+
分子 #23: uS17

分子名称: uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.468826 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MADIQTERAY QKQPTIFQNK KRVLLGETGK EKLPRYYKNI GLGFKTPKEA IEGTYIDKKC PFTGNVSIRG RILSGVVTKM KMQRTIVIR RDYLHYIRKY NRFEKRHKNM SVHLSPCFRD VQIGDIVTVG ECRPLSKTVR FNVLKVTKAA GTKKQFQKF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #24: eS12

分子名称: eS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.538987 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MAEEGIAAGG VMDVNTALQE VLKTALIHDG LARGIREAAK ALDKRQAHLC VLASNCDEPM YVKLVEALCA EHQINLIKVD DNKKLGEWV GLCKIDREGK PRKVVGCSCV VVKDYGKESQ AKDVIEEYFK CKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS12

+
分子 #25: uS15

分子名称: uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.259389 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MGRMHAPGKG LSQSALPYRR SVPTWLKLTS DDVKEQIYKL AKKGLTPSQI GVILRDSHGV AQVRFVTGNK ILRILKSKGL APDLPEDLY HLIKKAVAVR KHLERNRKDK DAKFRLILIE SRIHRLARYY KTKRVLPPNW KYESSTASAL VA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #26: Small ribosomal subunit protein uS11

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.133984 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MKARALSGSG VRRRRAAMAP RKGKEKKEEQ VISLGPQVAE GENVFGVCHI FASFNDTFVH VTDLSGKETI CRVTGGMKVK ADRDESSPY AAMLAAQDVA QRCKELGITA LHIKLRATGG NRTKTPGPGA QSALRALARS GMKIGRIEDV TPIPSDSTRR K GGRRGRRL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #27: uS19

分子名称: uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.049182 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MAEVEQKKKR TFRKFTYRGV DLDQLLDMSY EQLMQLYSAR QRRRLSRGLR RKQHSLLKRL RKAKKEAPPM EKPEVVKTHL RDMIILPEM VGSMVGVYNG KTFNQVEIKP EMIGHYLGEF SITYKPVKHG RPGIGATHSS RFIPLK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #28: uS9

分子名称: uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 19.213465 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
SARVAPRFPF PVVAPRGEDR HSSAAAMPSK GPLQSVQVFG RKKTATAVAH CKRGNGLIKV NGRPLEMIEP RTLQYKLLEP VLLLGKERF AGVDIRVRVK GGGHVAQIYA IRQSISKALV AYYQKYVDEA SKKEIKDILI QYDRTLLVAD PRRCESKKFG G PGARARYQ KSYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #29: eS17

分子名称: eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.552119 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERER RDNYVPEVS ALDQEIIEVD PDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPTVGMNFK TPRGAV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #30: uS13

分子名称: uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.759777 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MSLVIPEKFQ HILRVLNTNI DGRRKIAFAI TAIKGVGRRY AHVVLRKADI DLTKRAGELT EDEVERVITI MQNPRQYKIP DWFLNRQKD VKDGKYSQVL ANGLDNKLRE DLERLKKIRA HRGLRHFWGL RVRGQHTKTT GRRGRTVGVS KKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #31: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.235796 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MPGVTVKDVN QQEFVRALAA FLKKSGKLKV PEWVDTVKLA KHKELAPYDE NWFYTRAAST ARHLYLRGGA GVGSMTKIYG GRQRNGVMP SHFSRGSKSV ARRVLQALEG LKMVEKDQDW GRKLTPQGQR DLDRIAGQVA AAKKKH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #32: uS10

分子名称: uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.398763 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MAFKDTGKTP VEPEVAIHRI RITLTSRNVK SLEKVCADLI RGAKEKNLKV KGPVRMPTKT LRITTRKTPC GEGSKTWDRF QMRIHKRLI DLHSPSEIVK QITSISIEPG VEVEVTIADA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #33: eS21

分子名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS21

+
分子 #34: uS8

分子名称: uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.865555 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MVRMNVLADA LKSINNAEKR GKRQVLIRPC SKVIVRFLTV MMKHGYIGEF EIIDDHRAGK IVVNLTGRLN KCGVISPRFD VQLKDLEKW QNNLLPSRQF GFIVLTTSAG IMDHEEARRK HTGGKILGFF F

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #35: uS12

分子名称: uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.844666 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MGKCRGLRTA RKLRSHRRDQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPRS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #36: eS24

分子名称: eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.237104 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MNDTVTIRTR KFMTNRLLQR KQMVIDVLHP GKATVPKTEI REKLAKMYKT TPDVIFVFGF RTHFGGGKTT GFGMIYDSLD YAKKNEPKH RLARHGLYEK KKTSRKQRKE RKNRMKKVRG TAKANVGAGK KK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S24

+
分子 #37: eS25

分子名称: eS25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.645028 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
PPKDDKKKKD AGKSAKKDKD PVNKSGGKAK KKKWSKGKVR DKLNNLVLFD KATYDKLCKE VPNYKLITPA VVSERLKIRG SLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKGGDAPA AGEDA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25

+
分子 #38: eS26

分子名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.645794 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS26

+
分子 #39: eS27

分子名称: eS27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.480186 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MPLAKDLLHP SPEEEKRKHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27

+
分子 #40: eS28

分子名称: eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.855052 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MDTSRVQPIK LARVTKVLGR TGSQGQCTQV RVEFMDDTSR SIIRNVKGPV REGDVLTLLE SEREARRLR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #41: uS14

分子名称: uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.690821 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MGHQQLYWSH PRKFGQGSRS CRVCSNRHGL IRKYGLNMCR QCFRQYAKDI GFIKLD

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #42: eS30

分子名称: eS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.498884 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MQLFVRAQEL HTLEVTGRET VAQIKAHVAS LEGIAPEDQV VLLAGTPLED EATLGQCGVE ALSTLEVAGR MLGGKVHGSL ARVGKVRGQ TLKVAKQEKK KKRTGRAKRR MQYNRRFVNV VPTFGKKKGP NANS

UniProtKB: Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein

+
分子 #43: eS31

分子名称: eS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.431742 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MARHPLYQGS GIWCGRLRGG AFGGGAGKPR GPAALFLFDP PSARRWARHQ DADLRENPYG EDHHARGIPP DQQRLIFAGK QLEDGRTLS DYNIQKESTL HLVLRLRGGA KKRKKKSYTT PKKNKHKRKK VKLAVLKYYK VDENGKISRL RRECPSDECG A GVFMASHF DRHYCGKCCL TYCFNKPEDK

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein

+
分子 #44: Receptor for Activated C Kinase 1 (RACK1)

分子名称: Receptor for Activated C Kinase 1 (RACK1) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 35.115652 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC ...文字列:
MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC GWDKLVKVWN LANCKLKTNH IGHTGYLNTV TVSPDGSLCA SGGKDGQAML WDLNEGKHLY TLDGGDIINA LC FSPNRYW LCAATGPSIK IWDLEGKIIV DELKQEVIST SSKAEPPQCT SLAWSADGQT LFAGYTDNLV RVWQVTIGTR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1

+
分子 #46: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 36.16118 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列: MPGLSCRFYQ HKFPEVEDVV MVNVRSIAEM GAYVSLLEYN NIEGMILLSE LSRRRIRSIN KLIRIGRNEC VVVIRVDKEK GYIDLSKRR VSPEEAIKCE DKFTKSKTVY SILRHVAEVL EYTKDEQLES LFQRTAWVFD DKYKRPGYGA YDAFKHAVSD P SILDSLDL ...文字列:
MPGLSCRFYQ HKFPEVEDVV MVNVRSIAEM GAYVSLLEYN NIEGMILLSE LSRRRIRSIN KLIRIGRNEC VVVIRVDKEK GYIDLSKRR VSPEEAIKCE DKFTKSKTVY SILRHVAEVL EYTKDEQLES LFQRTAWVFD DKYKRPGYGA YDAFKHAVSD P SILDSLDL NEDEREVLIN NINRRLTPQA VKIRADIEVA CYGYEGIDAV KEALRAGLNC STENMPIKIN LIAPPRYVMT TT TLERTEG LSVLSQAMAV IKEKIEEKRG VFNVQMEPKV VTDTDETELA RQMERLEREN AEVDGDDDAE EMEAKAED

+
分子 #47: eL41

分子名称: eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32

+
分子 #9: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 9 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 603.100938 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC UAAUACAUGC CGACGGGCGC UGACCCCCUU CGCGGGGGGG AUGCGUGCAU UUAUCAGAUC AAAACCAACC CG GUCAGCC UCCCCCCGGC CCCGGCCGGG GGGGUGGGCG CCGGCGGCUU UGGUGACUCU AGAUAACCUC GGGCCGAUCG CAC GCCCUC CGUGGCGGCG ACGACCCAUU CGAACGUCUG CCCUAUCAAC UUUCGAUGGU AGUCGCCGUG CCUACCAUGG UGAC CACGG GUGACGGGGA AUCAGGGUUC GAUUCCGGAG AGGGAGCCUG AGAAACGGCU ACCACAUCCA AGGAAGGCAG CAGGC GCGC AAAUUACCCA CUCCCGACCC GGGGAGGUAG UGACGAAAAA UAACAAUACA GGACUCUUUC GAGGCCCUGU AAUUGG AAU GAGUCCACUU UAAAUCCUUU AACGAGGAUC CAUUGGAGGG CAAGUCUGGU GCCAGCAGCC GCGGUAAUUC CAGCUCC AA UAGCGUAUAU UAAAGUUGCU GCAGUUAAAA AGCUCGUAGU UGGAUCUUGG GAGCGGGCGG GCGGUCCGCC GCGAGGCG A GCCACCGCCC GUCCCCGCCC CUUGCCUCUC GGCGCCCCCU CGAUGCUCUU AGCUGAGUGU CCCGCGGGGC CCGAAGCGU UUACUUUGAA AAAAUUAGAG UGUUCAAAGC AGGCCCGAGC CGCCUGGAUA CCGCAGCUAG GAAUAAUGGA AUAGGACCGC GGUUCUAUU UUGUUGGUUU UCGGAACUGA GGCCAUGAUU AAGAGGGACG GCCGGGGGCA UUCGUAUUGC GCCGCUAGAG G UGAAAUUC UUGGACCGGC GCAAGACGGA CCAGAGCGAA AGCAUUUGCC AAGAAUGUUU UCAUUAAUCA AGAACGAAAG UC GGAGGUU CGAAGACGAU CAGAUACCGU CGUAGUUCCG ACCAUAAACG AUGCCGACCG GCGAUGCGGC GGCGUUAUUC CCA UGACCC GCCGGGCAGC UUCCGGGAAA CCAAAGUCUU UGGGUUCCGG GGGGAGUAUG GUUGCAAAGC UGAAACUUAA AGGA AUUUG GCGAAGGGCA CCACCAGGAG UGGAGCCUGC GGCUUAAUUU GACUCAACAC GGGAAACCUC ACCCGGCCCG GACAC GGAC AGGAUUGACA GAUUGAUAGC UCUUUCUCGA UUCCGUGGGU GGUGGUGCAU GGCCGUUCUU AGUUGGUGGA GCGAUU UGU CUGGUUAAUU CCGAUAACGA ACGAGACUCU GGCAUGCUAA CUAGUUACGC GACCCCCGAG CGGUCGGCGU CCCCCAA CU UCUUAGAGGG ACAAGUGGCG UUCAGCCACC CGAGAUUGAG CAAUAACAGG UCUGUGAUGC CCUUAGAUGU CCGGGGCU G CACGCGCGCU ACACUGACUG GCUCAGCGUG UGCCUACCCU ACGCCGGCAG GCGCGGGUAA CCCGUUGAAC CCCAUUCGU GAUGGGGAUC GGGGAUUGCA AUUAUUCCCC AUGAACGAGG AAUUCCCAGU AAGUGCGGGU CAUAAGCUUG CGUUGAUUAA GUCCCUGCC CUUUGUACAC ACCGCCCGUC GCUACUACCG AUUGGAUGGU UUAGUGAGGC CCUCGGAUCG GCCCCGCCGG G GUCGGCCC ACGGCCCUGG CGGAGCGCUG AGAAGACGGU CGAACUUGAC UAUCUAGAGG AAGUAAAAGU CGUAACAAGG UU UCCGUAG GUGAACCUGC GGAAGGAUCA UUA

GENBANK: GENBANK: OX463228.1

+
分子 #10: EMCV mRNA

分子名称: EMCV mRNA / タイプ: rna / ID: 10 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Encephalomyocarditis virus (脳心筋炎ウイルス)
分子量理論値: 28.627121 KDa
配列文字列:
CCUUUGCAGG CAGCGGAACC CCCCACCUGG CGACAGGUGC CUCUGCGGCC AAAAGCCACG UGUAUAAGAU ACACCUGCAA AGGAAUAUG

GENBANK: GENBANK: KC757343.1

+
分子 #45: Met-tRNAiMet

分子名称: Met-tRNAiMet / タイプ: rna / ID: 45 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.23151 KDa
配列文字列:
AGCAGAGUGG CGCAGCGGAA GCGUGCUGGG CCCAUAACCC AGAGGUCGAU GGAUCGAAAC CAUCCUCUGC UACCA

+
分子 #48: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態cell

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TECNAI F30
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 58.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: DARK FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
実験機器
モデル: Tecnai F30 / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4) / タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 262752
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る