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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis ATP synthase Fo in the apo-form | ||||||||||||
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![]() | ATP synthase / Mycobacterium tuberculosis / cryo-EM / MEMBRANE PROTEIN | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() proton motive force-driven plasma membrane ATP synthesis / proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) / proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism / hydrolase activity / lipid binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.15 Å | ||||||||||||
![]() | Zhang Y / Lai Y / Liu F / Rao Z / Gong H | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of Mycobacterium tuberculosis ATP synthase 著者: Zhang Y / Lai Y / Liu F / Rao Z / Gong H | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 483.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.7 KB 14.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 35.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 475.7 MB 475.7 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8j58MC ![]() 8j0sC ![]() 8j0tC ![]() 8j57C ![]() 8jr0C ![]() 8jr1C ![]() 8khfC ![]() 8ki3C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.73 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35983_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35983_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Mycobacterium tuberculosis ATP synthase Fo in the apo-form
全体 | 名称: Mycobacterium tuberculosis ATP synthase Fo in the apo-form |
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要素 |
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-超分子 #1: Mycobacterium tuberculosis ATP synthase Fo in the apo-form
超分子 | 名称: Mycobacterium tuberculosis ATP synthase Fo in the apo-form タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: ATP synthase subunit c
分子 | 名称: ATP synthase subunit c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 9 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 8.058423 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MDPTIAAGAL IGGGLIMAGG AIGAGIGDGV AGNALISGVA RQPEAQGRLF TPFFITVGLV EAAYFINLAF MALFVFATPV K UniProtKB: ATP synthase subunit c |
-分子 #2: ATP synthase subunit a
分子 | 名称: ATP synthase subunit a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 27.488436 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MTETILAAQI EVGEHHTATW LGMTVNTDTV LSTAIAGLIV IALAFYLRAK VTSTDVPGGV QLFFEAITIQ MRNQVESAIG MRIAPFVLP LAVTIFVFIL ISNWLAVLPV QYTDKHGHTT ELLKSAAADI NYVLALALFV FVCYHTAGIW RRGIVGHPIK L LKGHVTLL ...文字列: MTETILAAQI EVGEHHTATW LGMTVNTDTV LSTAIAGLIV IALAFYLRAK VTSTDVPGGV QLFFEAITIQ MRNQVESAIG MRIAPFVLP LAVTIFVFIL ISNWLAVLPV QYTDKHGHTT ELLKSAAADI NYVLALALFV FVCYHTAGIW RRGIVGHPIK L LKGHVTLL APINLVEEVA KPISLSLRLF GNIFAGGILV ALIALFPPYI MWAPNAIWKA FDLFVGAIQA FIFALLTILY FS QAMELEE EHH UniProtKB: ATP synthase subunit a |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: TFS Selectris X / エネルギーフィルター - スリット幅: 10 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.4 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.2 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: OTHER / 詳細: AlphaFold |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.15 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 66593 |
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |