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- EMDB-32325: Cryo-EM structure of Tetrahymena thermophila mitochondrial comple... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-32325
タイトルCryo-EM structure of Tetrahymena thermophila mitochondrial complex IV, composite dimer model
マップデータTetrahymena thermophila electron transport chain complex IV dimer composite map. Combined by Phenix from 3.02 angstrom protomer map focus-refined in cryosparc.
試料
  • 複合体: Cytochrome c oxidase dimer
    • タンパク質・ペプチド: x 58種
  • リガンド: x 7種
機能・相同性
機能・相同性情報


thiosulfate transmembrane transporter activity / oxaloacetate transmembrane transporter activity / malate transmembrane transporter activity / protein maturation by [2Fe-2S] cluster transfer / succinate transmembrane transporter activity / sulfate transmembrane transporter activity / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / phosphate ion transmembrane transport / : / cytochrome-c oxidase ...thiosulfate transmembrane transporter activity / oxaloacetate transmembrane transporter activity / malate transmembrane transporter activity / protein maturation by [2Fe-2S] cluster transfer / succinate transmembrane transporter activity / sulfate transmembrane transporter activity / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / phosphate ion transmembrane transport / : / cytochrome-c oxidase / antiporter activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / cytochrome-c oxidase activity / Golgi organization / transmembrane transporter activity / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / electron transport coupled proton transport / ATP synthesis coupled electron transport / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / protein transport / monoatomic ion channel activity / nucleic acid binding / mitochondrial inner membrane / membrane => GO:0016020 / copper ion binding / DNA-binding transcription factor activity / heme binding / endoplasmic reticulum / mitochondrion / zinc ion binding / membrane / nucleus / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Protein of unknown function DUF4441 / Domain of unknown function (DUF4441) / Surfeit locus 1/Shy1 / Surfeit locus 1/4 / TraB/PryY-like / SURF1 family / SURF1 family profile. / CTF transcription factor/nuclear factor 1, DNA-binding domain / CTF/NF-I DNA-binding domain profile. / Tim10-like ...Protein of unknown function DUF4441 / Domain of unknown function (DUF4441) / Surfeit locus 1/Shy1 / Surfeit locus 1/4 / TraB/PryY-like / SURF1 family / SURF1 family profile. / CTF transcription factor/nuclear factor 1, DNA-binding domain / CTF/NF-I DNA-binding domain profile. / Tim10-like / Tim10-like domain superfamily / Tim10/DDP family zinc finger / Mitochondrial substrate/solute carrier / Mitochondrial carrier domain superfamily / Mitochondrial carrier protein / Solute carrier (Solcar) repeat profile. / Iron-binding zinc finger, CDGSH type / MitoNEET, CDGSH iron-sulfur domain / CDGSH-type zinc finger. Function unknown. / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat / Regulator of chromosome condensation, RCC1 / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat profile. / Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II / Translocon Sec61/SecY, plug domain / Plug domain of Sec61p / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature. / Protein secY signature 1. / Protein secY signature 2. / Cytochrome c oxidase, subunit Vb / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. / SecY/SEC61-alpha family / SecY domain superfamily / SecY conserved site / SecY / Cytochrome c/quinol oxidase subunit II / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature. / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / Cytochrome oxidase subunit I profile. / Cytochrome c oxidase subunit I / Cytochrome c oxidase-like, subunit I superfamily / Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I / Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain / Cytochrome c oxidase subunit II-like C-terminal / Cytochrome oxidase subunit II copper A binding domain profile. / Pectin lyase fold/virulence factor / Cyclic nucleotide-monophosphate binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain / cAMP/cGMP binding motif profile. / Cyclic nucleotide-binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain superfamily / RmlC-like jelly roll fold / Cupredoxin / Ion transport domain / Ion transport protein / zinc finger / Zinc knuckle / Zinc finger, CCHC-type superfamily / Zinc finger, CCHC-type / Zinc finger CCHC-type profile. / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Cyclic nucleotide-binding domain protein / Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / Transmembrane protein / SURF1-like protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / SURF1-like protein / Transmembrane protein / Iron-binding zinc finger CDGSH type protein ...Cyclic nucleotide-binding domain protein / Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / Transmembrane protein / SURF1-like protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / SURF1-like protein / Transmembrane protein / Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / CTF/NF-I domain-containing protein / Transmembrane protein, putative / Protein phosphatase 2C, putative / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein / Transmembrane protein, putative / Carrier protein / Uncharacterized protein / Tim10/DDP family zinc finger protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / TraB family protein / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Cytochrome C oxidase subunit Vb protein / 2-oxoglutarate/malate carrier protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Ymf70 / Cytochrome c oxidase subunit 1 / Ymf68 / Ymf67 / Cytochrome c oxidase polypeptide II / Ymf75 / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein / Mitochondrial import inner membrane translocase subunit / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Tim10/DDP family zinc finger protein / Protein transporter Sec61 alpha subunit
類似検索 - 構成要素
生物種Tetrahymena thermophila (真核生物)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.02 Å
データ登録者Zhou L / Maldonado M / Padavannil A / Letts J
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R35GM137929 米国
引用ジャーナル: Science / 年: 2022
タイトル: Structures of 's respiratory chain reveal the diversity of eukaryotic core metabolism.
著者: Long Zhou / María Maldonado / Abhilash Padavannil / Fei Guo / James A Letts /
要旨: Respiration is a core biological energy-converting process whose last steps are carried out by a chain of multisubunit complexes in the inner mitochondrial membrane. To probe the functional and ...Respiration is a core biological energy-converting process whose last steps are carried out by a chain of multisubunit complexes in the inner mitochondrial membrane. To probe the functional and structural diversity of eukaryotic respiration, we examined the respiratory chain of the ciliate (Tt). Using cryo-electron microscopy on a mixed sample, we solved structures of a supercomplex between Tt complex I (Tt-CI) and Tt-CIII (Tt-SC I+III) and a structure of Tt-CIV. Tt-SC I+III (~2.3 megadaltons) is a curved assembly with structural and functional symmetry breaking. Tt-CIV is a ~2.7-megadalton dimer with more than 50 subunits per protomer, including mitochondrial carriers and a TIM8-TIM13-like domain. Our structural and functional study of the respiratory chain reveals divergence in key components of eukaryotic respiration, thereby expanding our understanding of core metabolism.
履歴
登録2021年11月30日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年4月6日-
マップ公開2022年4月6日-
更新2022年6月1日-
現状2022年6月1日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_32325.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_32325.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Tetrahymena thermophila electron transport chain complex IV dimer composite map. Combined by Phenix from 3.02 angstrom protomer map focus-refined in cryosparc.
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.88 Å
密度
表面レベル登録者による: 5.0
最小 - 最大-22.26331 - 33.16125
平均 (標準偏差)-0.019761126 (±1.2232604)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 450.56 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_32325_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map A for Tetrahymena thermophila electron transport...

ファイルemd_32325_half_map_1.map
注釈Half map A for Tetrahymena thermophila electron transport chain complex IV2 protomer map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map A for Tetrahymena thermophila electron transport...

ファイルemd_32325_half_map_2.map
注釈Half map A for Tetrahymena thermophila electron transport chain complex IV2 protomer map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Cytochrome c oxidase dimer

全体名称: Cytochrome c oxidase dimer
要素
  • 複合体: Cytochrome c oxidase dimer
    • タンパク質・ペプチド: Unknown peptide
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Unknown peptide
    • タンパク質・ペプチド: Unknown peptide
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Protein transporter Sec61 alpha subunit
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Ymf68
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 6B
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 6B-like
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 7C
    • タンパク質・ペプチド: CTF/NF-I domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: 2-oxoglutarate/malate carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: Carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: Tim10/DDP family zinc finger protein
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 5
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein
    • タンパク質・ペプチド: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase acyl carrier-like subunit
    • タンパク質・ペプチド: Ymf67
    • タンパク質・ペプチド: Ymf70
    • タンパク質・ペプチド: Ymf75
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Protein phosphatase 2C, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cyclic nucleotide-binding domain protein
    • タンパク質・ペプチド: SURF1-like protein
    • タンパク質・ペプチド: TraB family protein
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT7
    • タンパク質・ペプチド: SURF1-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT9
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT10
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT11
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT12
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT15
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT16
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT18
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT19
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT22
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT25
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit TT26
  • リガンド: HEME-A
  • リガンド: COPPER (II) ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

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超分子 #1: Cytochrome c oxidase dimer

超分子名称: Cytochrome c oxidase dimer / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58
詳細: Tetrahymena thermophila mitochondrial cytochrome c oxidase/complex IV dimer
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB255 / Organelle: Mitochondria / 細胞中の位置: Mitochondrial inner membrane
分子量理論値: 2.7 MDa

+
分子 #1: Unknown peptide

分子名称: Unknown peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB255
分子量理論値: 8.358294 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #2: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 417.001562 KDa
配列文字列: MLIQIVLVLC QYFQLISCFC QGRLECLNPI QKRCVQIDGL QFIGREKKTG FCVIDSVLYD EIDFCLSESN NVCITYDRKM CIKVESNNS IVAINQEDSI CGITIDGYCV DENQNYSQEI YCNDSHCKFT NKQYQKSCLN YKSPQIYGKA NKNECVLQDQ Y FHSDAQII ...文字列:
MLIQIVLVLC QYFQLISCFC QGRLECLNPI QKRCVQIDGL QFIGREKKTG FCVIDSVLYD EIDFCLSESN NVCITYDRKM CIKVESNNS IVAINQEDSI CGITIDGYCV DENQNYSQEI YCNDSHCKFT NKQYQKSCLN YKSPQIYGKA NKNECVLQDQ Y FHSDAQII CKPHYCIYFQ DKQITCVKMD HSIHPQIIGK DSDGICIFQK VEKQDFYLKY RNLQLCADQK HCYDTSQQTC MP LSASYPA VKMGGTCGNY NEPISISCFY EGNVCLLENP RVCIRIFFNQ DYDVCGIRKD GLCAASNIYY QNLQICASDY CMY GQANNA KCIKMDGQQA VGIDSQGFCV QNFEQKADRC STNFSYICYL NSSQICINLQ GYQNYCQQAN KCYEFSLQQY IGRD IYYYC IQSEQSLQPQ NVQNCLQNPS YICQKRDGTM CVYYYQIPTY FTYLGYINSS GYCAQEGYQT YTSQPQFQTI TNLNP NFCQ DDSYVIQKIL PPYYGRLDSY NYNRCLKQSD QSPYIESCIQ GYCISNNSCQ KIGFDSKNVS KLSNQYCGLV QQSSAI ECA YDQDYCIYNS ICYNLSDQNI QTSGIDYYGN CLQRGKYYQN WKKCSVNHCY QKKLLLNSFG CFYLDGTQGA AGIDSNG MC LDYGVSTPVR CALSSQVCLD FQKNTCQQTI NFGSTGNGCY YSGYCYQINL GQFIGRDTSL ICLSDQEATN NLDTCYND N QNICMAVYSS LKFCVVYPRT SLYLGYIVQN KQCAVENQQT NQGQLVDLVN LRNNYCQDQQ GYIRRLDGKQ YVGVDSSQY LCLESGKTPS KSIIQCYTGF CIVENACKAY DQQYVGRDKY YQCLKKGEGI SVECAANYCI DLSTKNCVQI NDTNPAQAGV LDNFQCAHS ERYYYSQILQ CSESYCLQQN PNNPSQQGCF ELDGDINRAG IDSKGNCLQQ DLPNAVRCSP GQFCLNDKFG N ACQSLLLS FKNNRFARQK GTGVCLSYID PSQFKGDNID ICVKGSCKYS DPKNLDFCFS LGQLAFGNQV VGRDINGDCV LK DQQTSTQ IVECFDMIYC ILDLGGGKQK CQLLQEKDLQ FPNLIYKAKN INQTCQDINM PNSMGCLYGL YCINPNDGYK CVL MNDDNK IGRSLVNQQC LQQGELIANY CQPDFCILNG ACVPLSNKFP GKENQTQKCL PEQIEGQYGA SNCYKEGFCL IINP QNQLA SCYQLDYSNP NTIGIQIDTQ HCLKEGETVA IMCAYEKYCI DPVSQSCKIQ DIKQGYCLGK NGMCAKNGSC VYCQV SQCL TNQNSGTCID LQQPPALFCK DINVHSENIF IQNQKGICQY LNSGQCDICP ENYCKFNNMC FGSQDLLKIL KGNQCF VYV PKLKTCQIQD LNTPNSQGNM NCMNNKGFCQ DTTVVKNQCL MCANYYFNPG NQQCFSIEEK ALLSSSQLFF NMQLIYV KQ DCYDQDYCQS IPSLKCPKGC FSCNSPNFCT QCIEGFFLYQ DTSNQQFCIQ CQKQIIQDNT LKIYYNQIPT YSCLDCSS E YGTWNQISSK YRNCQNFIVK LDNLLQITSQ KYAAQNYIIS PISTTQAPYQ LYFHRSRLCP TGCLSCVQIS DSKVMCLQC QDYYINDDNG SCQKCPDFCI NCQYATFISG KVIPKSQIEK NQQKYYYFVT ICLKCSQYYL VSYNLQSCDN CGINCLYCQY ENYKTVLNY NIRQLQYLSY YEFSTQNFIK KCIQCPQGYV VGYDGQFCQK EIQNCRYTTF QIAQSYDLTL YIWSFTQNST I ANQICKQC VDGYILSGDA SSCLDGCQQQ ISDNRCESCY SPLNKIQCQF CNSGQILNQV VNPGACQDDI CSRNIVGCQE CY KYQDPQN PSPFYQIYQC TKCIDQYSIP SIFSCIQCPT GCAKCYEGYR YYNFTSELVY KRTQFTVNQR LNYYQNDYQL YCT ECQKGY QFDQQQKKCI KIQCGPNCNL CILINNQPQC VQCNYDKLIA ELNQLSYFIG ILYFKQNYIP NPKTMISLTS SGND CQICP ILCETCVNNS DVSINPLFIY DAQCLSCKQS LDQSYVLQNY QITYDKSRRK CYLCNKSEQG CYYKKQKVIY AQCLD LSTR LGDGSLQNPI NFSRLNEIDL NQFLINEIEY NQAIIYYNEL QVKELEVQLI FVDGSCYDYR PQKFSINIKD SIRALS TSL NITTLNQNSV LKFYQLDAFT VQGFDQIYIK NIIFLQQRND AKLGLILVDK ALTNIQLFNC QFLQIQQLIQ SIQFMTF NL QTIQQTKVKL EQVVFQNIQI FESTSLININ NTQNSSIYLK MNQVKLNNVL FQQSKLISTN SMNITIDITN LFVNQSLF D QQSLLLDMKQ NLLVDQYIGI LLNNIIFLNS SFLHGSTILN SDFLDFLQID NLTFNNCTFQ QTQKQAVLPL IAANTFMLT QIQIISNTIT NYSFLQQYDN YFKDQNQSSS FSGIDIIDNK VNSDSYLFLF FQTQQNRNSS IHGINILRNQ FSSNYTQVIV QFNQQNFVQ IQNLTIVDNQ QFLFISTDSV RNILLQQVYQ YQTSSQYFAA QICYLRQTKN QINIKNIKLE GIYFQKNIFQ I ENSLNNYL QKDFQITVTN LFSTQSTLLL KRYTNDVTIF SLYSKQQISL TVQNVTFSFF KSQVLNNKTS LGKISLGFYF QG LQIKATI LNSTFADLDI SSPFNWIEGS VQQMILKSCN FTNSNGYQNY NSVRNGGFFK ITSQKLIIKK SIFINGNALN GGA FYLIMQ GKGTLNLINS TFINNKAYSN NDQETKGGAF YLDGFMSESL DVLVFKSIFS KNLALFSGGA INIQSSNQQN AFII QESFF FDNLSCQGSS INIQSSSDFQ SEVVISKTKV NNQIQNTIST VENIANLLSQ YTLLNIQQLS SSQIFIKDVR NVQFF QSRF QIVPYKFKDS NVLKYFKGII FSQMFSIQNV LNYLDINNIY EKSVFYGKLI NVNNVKNIQI QHTQILNNQN IIEDLS HQD NRVSNLASFH SQNCLVFNLT VNQNKCLQCN LGIIEILSSK LDMQNSTFQN NLAQYGSSLQ LQQNKQYIYN LSKLLQS FQ DKLVISNSTF SHNIANVNGG ALYIKESTVF IYQTLFDTNT ARQYGGALFL ENTKKNILTN LINLQNCTFS NNKAKFGG V LASTTGQRVN KYTNNTYKDN KGYQYGENIQ TSPTKFIITV NKTQLTDTQY INIQNHQGGT LRDEILLALC DDQNNYIQN IPQDSFLSIN ITQGSGFLNQ NKIAHKNGIF NLTQQIQVYG YSKQQLLLSI TSDLIQIPVF NKDEIIIGYD SYQLIINIQM VQVCLPGQI PKKFQEKFDL CYDCQDGSYS FQVSDTCQIC PSPQAKCFRD KILLPSNLWR VSQKSIVLFP CKNCVGDIQL Y KKFKKRSL LKIQSTDLNY YCKEGYIGAL CEDCDRNGQH WGDSYFMNLD LKCQRCSQTT FAEIAYPLMI SLIAFILMIF LT YYIQIQV HLKLTKKVLT ILSKKYYGFN DQSIARTIKF LVYQSSIIGI MFWYDCYIPN TFSYIFIDIG NLFTDQIRIS ECF LEQKFS GTSIIYKGIY FLLGTYFAII SCIIIFYMLL RIKFNYQNYL QDILISLSIF VYFSYNSILS KIFRSVIHLL FLKI KKNVI LQNITNRLIA KSLTKKDSQW SIYQFHVMK

+
分子 #3: Unknown peptide

分子名称: Unknown peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB255
分子量理論値: 2.91158 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #4: Unknown peptide

分子名称: Unknown peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB255
分子量理論値: 2.571161 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #5: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 20.909602 KDa
配列文字列:
MIQQMDQYIS MQNESSSEIS DIETRSPSHS FEDNLKYYSD IYEVLSKDQI KQEYEQLQKS NFVKNIIRSF YLFILESGDE IVIESMFEN QEKGIIQIRK EFQTFTRQKK FNQSTLNSLI NSKRFGKIFY YFLKYYIYDW VISRSVKDLK SHVIFITYLK K QLEQNIEN QQFD

+
分子 #6: Protein transporter Sec61 alpha subunit

分子名称: Protein transporter Sec61 alpha subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 53.674324 KDa
配列文字列: MGFIDLLKPA FSLIPEVQPA RQYIPKDHKI VWTGITLFIY LVCCQIPLYG VVRAQGSDPF YWMRVILASN RGTLMELGIS PLVTSSMIV QLLVNTRILD FNARVQDDRQ AIQGAQKLLG LIMSMCEAFA YIWSGQYGDP NKIGLGSCLL IFIQLVFSGI V VLLLDDML ...文字列:
MGFIDLLKPA FSLIPEVQPA RQYIPKDHKI VWTGITLFIY LVCCQIPLYG VVRAQGSDPF YWMRVILASN RGTLMELGIS PLVTSSMIV QLLVNTRILD FNARVQDDRQ AIQGAQKLLG LIMSMCEAFA YIWSGQYGDP NKIGLGSCLL IFIQLVFSGI V VLLLDDML NKGYGLGSGI SLFIATNICE NIVWRSFSPI TITTQQGTEF EGSIINLFHS LLTKDRVSNA LYHSFYRTSA PN LVNLIST LLVFLVVIYL QGVKYDLRIA RRQERNSESS YPIKLFYTSN YPIILQTALV SQIFFFSRIL SSKFKNNFFV KLL GQWQDG SVAGGQDHPI GGFVYFLTAP RDLNQVISDP IHAIFYVLII LTLCGVISRY WIEFSDESTS SVHKKFMEEK IEIP GHRQD SVYRTLDRII PTAATLGGIC VGVLTIVADF LGAIGSGTGI LLAVNIIYGY FEQVKKENKL KKTGIVQQQQ QQM

+
分子 #7: Cytochrome c oxidase subunit 1

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: cytochrome-c oxidase
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 80.564945 KDa
配列文字列: MWVDFIDQTK SLKVSVNNYF YYLDRIKKLF TYLNDLRKHI LKKYVYTINH KRIAINYLYF SMVTGLSGAA LATMIRLELA HPGSPFFKG DSLRYLQVVT AHGLIMVFFV VVPILFGGFA NFLIPYHVGS KDVAYPRLNS IGFWIQPCGY ILLAKIGFLR P QFWRYYDK ...文字列:
MWVDFIDQTK SLKVSVNNYF YYLDRIKKLF TYLNDLRKHI LKKYVYTINH KRIAINYLYF SMVTGLSGAA LATMIRLELA HPGSPFFKG DSLRYLQVVT AHGLIMVFFV VVPILFGGFA NFLIPYHVGS KDVAYPRLNS IGFWIQPCGY ILLAKIGFLR P QFWRYYDK TSFSFPFLEK MKYNQYKEYK NDYLFYLDFL KKEITDDHSF FWKARKVIKL PQYSVFSFVP LKLMMWKTMI NY PESFWYA ASRVVQSRRK KVFVTKCSAR TLTTAGWTFI TPFSSNIKYT GVGSQDILIL SVVFAGISTT ISFTNLLITR RTL AMPGLR HRRVLMPFVT ISIFLTLRML ATITPVLGAA VIMMAFDRHW QTTFFEYAYG GDPILSQHLF WFFGHPEVYV LIIP TFGFI NMIVPHNNTR RVASKHHMIW AIYVMAYMGY LVWGHHMYLV GLDHRSRTMY STITIMISMP ATIKVVNWTL SLVNG ALKI DLPFLFSMSF LLLFLVAGFT GMWLSHVSLN VSMHDTFYVV AHFHIMLSGA AMTGIFSGIY YYFNALFGVK YSRMFG YMH LIYYSGGQWV AFVPLFYLGF SGMPRRIHDY PVVFMGWHSM STTGHFITLV GIIFFFLMMF DSHIERRAST STTLGLP RW YKRISYYIFK IRYLQHTKSK MNGIPGSTVR LMLINRHFVE YEVYEK

+
分子 #8: Cytochrome c oxidase subunit 2

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: cytochrome-c oxidase
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 72.388883 KDa
配列文字列: MWGNLWTEAS YQLNFNIGFS SLRSDVLIHL AQWQYWWWFW FALIWSFYYF IILKVARFRV LKMRPKISTS YRPHGKWGDF LACIIPLIW CINILTNSNL ILRLIEWQNE SSLFTVRVRA RQWYWIYKFE LKNFTDILST PKNIGNNRWQ INTFGELQTA D DYLHVLQL ...文字列:
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+
分子 #9: Ymf68

分子名称: Ymf68 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 72.782539 KDa
配列文字列: MLICNFLMYS NFSRIYWFDF NGTVNENLPL NYNVLKICRN EINKLEKLNE NNLGTQKNPI KLNLSFEDKH YNTNNLVLDL NSYETFNSK NFISSIFDKT FESLNTVLMA PIYSFLEFKL KLSSTKINTN HYYVINGKLY ITYNDSFKLF TTINDYFNDL N ELSNTKLF ...文字列:
MLICNFLMYS NFSRIYWFDF NGTVNENLPL NYNVLKICRN EINKLEKLNE NNLGTQKNPI KLNLSFEDKH YNTNNLVLDL NSYETFNSK NFISSIFDKT FESLNTVLMA PIYSFLEFKL KLSSTKINTN HYYVINGKLY ITYNDSFKLF TTINDYFNDL N ELSNTKLF FLYRSFNIYN IKLNSLVDFV FLKLILFIHL LYLKSTNYNR FDYRLKQTDW GFYINNNSNY IQNIFSGLKY IW RGLRFWI IGLLLGLSSI YYLMYVRLLP FNKIIFAWIL VAMFLYWLLS GFVFFVKKYQ YSKFTAAIQR FWKRTYIIFW VIE AGTFSV FFYLTLNASS EPVYMYDQIK IYKTHLFSWR WFLIKLLPSV SIILLGYYLQ LTLKWNLFNK QNTIVLLITL LLLY ILWLE FYQFYHILSF YGNINWAFDY DEYIWTLELD TRRTRLANNY IAICLFAKFW HFVFIFLFWV FFVLRINELG RIRYP LLVA NVQNFIIIYI MSWAYMYPWL KFIFRKYLDV PYYWFYLNGR ELGIRVFFTD LKLFFYGITN RLFDFNPSSI KFEKYP FYY WINSSQLTEF NQYRKFVIRD SIIYSLNNYI I

+
分子 #10: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein

分子名称: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 75.431312 KDa
配列文字列: MKKQKRTQGK QNTKQIKQEK LSSKRKANNQ KEGKKKVKQE DYKEIKQKGK RMLSKIVKAS FSSKGFNLAN AVNTVKSTLN APIKHIKRN IEPTGSNYSR MTNTTEEAFD EVSHEWQALV TSNPFDLNVF NYLENTQTSN FGTVDNPLVV FTSETPFRYV G CTGQMNED ...文字列:
MKKQKRTQGK QNTKQIKQEK LSSKRKANNQ KEGKKKVKQE DYKEIKQKGK RMLSKIVKAS FSSKGFNLAN AVNTVKSTLN APIKHIKRN IEPTGSNYSR MTNTTEEAFD EVSHEWQALV TSNPFDLNVF NYLENTQTSN FGTVDNPLVV FTSETPFRYV G CTGQMNED DYEGHELLFF LLREGSLQRC MGCGQVFKLV RLRNEYSPEM DYYLSNFHPY EMQEMGESDT TVLMSPYKYA SH YEYTQFE TPSNMVYSMV NPDEHDRLLV DPAYRMERTK ALEEKYKVYT SSLREVEKQF EERYGRAGQI NISKVTYSTL IDV EKAVLK MDRLFRKVAK FENRAFIDRA NHSRREKRML ERAQQRWDSN YSFFTGSLTE EEQKYRDYYE (TPO)ELEAYPEDE GIEQQLDQQ EVLLSGRYDP KLYDFQEGYT KNPEDDQTSL IEKKAFKFRY RLANETSETF QRRNNRMVER QIKRFQQPQY K HAFEQLQK NIAISSNSGN ALHSEYGYLE LLSNESVQLY KDYYE(SEP)DAEE DFKVFENLSS KEKLVMIANF ENNLLPKY D RSEVHLIPKR QWEPAFGVWE NFLYDITEYA SFIAPRGKEI AADYQIQSAI PLTKEELIEA GLYKETIEKK VEPKLEAKK QTKSE

+
分子 #11: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 15.618258 KDa
配列文字列:
MIWKYLQRTN RGNIIQAGLQ HRKFENLPFK QNFDNLTKAY DLRMWYISNS PHEAKNLEYV NELEALHNEL NYQNSRQFLF RTVSFLLGW ALFYQFYELP KTYDWQDTQE PKHQVPAYGD LEEGGDEGGD D

+
分子 #12: Cytochrome c oxidase subunit 6B

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 6B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 27.946445 KDa
配列文字列: MSSAVEKKDL PADYGKMPAG YNFLTRGKDW REYDKDFILR TDAVWEKFQL EHFFRNYMKC FFFDHGLKKY QMFEPEDMYT VVFEGWALD DLITFPGFTP TGRTNSYQIG LSPRQRTVVP TQTFYQMQDY YMLCGLRFER WFRCDLVYHD QRHTKFDQVK N QKNYKTYP ...文字列:
MSSAVEKKDL PADYGKMPAG YNFLTRGKDW REYDKDFILR TDAVWEKFQL EHFFRNYMKC FFFDHGLKKY QMFEPEDMYT VVFEGWALD DLITFPGFTP TGRTNSYQIG LSPRQRTVVP TQTFYQMQDY YMLCGLRFER WFRCDLVYHD QRHTKFDQVK N QKNYKTYP CYREYYEAQY ACQDDMFDFL MELAYARRAA DNFESDFASH ELTTLPTFYD TPKAAERKTY TY

+
分子 #13: Cytochrome c oxidase subunit 6B-like

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 6B-like / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 10.228691 KDa
配列文字列:
(FME)EVKYRGPSD DKLECEFLEN NLLSCLREKS VQDNVAKMTC RPEFLVWFFL ECPTKAAVYH DPKGLRNIFI QDKIKQ KGS DDGVLSKDD

+
分子 #14: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 12.786321 KDa
配列文字列:
MGSVWFRNRY WWYRSLYDDY VAREAKLAFG IAAFIWLPHY YWGIHLNRAF EVNFSHRNYA HEWGPRRNRL AHSLEFEQFD MILENWQDL EDEYAQRGDG MLKK

+
分子 #15: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 16.413645 KDa
配列文字列:
(FME)NRFFKVSSK YQYYKYLEQY DAAFLRKYQS ETHWYLGRRG AWKNLVIKYA GDHISLEEEH NVKYKTHLSF VYLSYR LAW VLFAYVLIYN HFLLGDIGKT FNVGEWDHRL KPSAERDYPT RYESLYILDR TQKW

+
分子 #16: Cytochrome c oxidase subunit 7C

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 7C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 28.746639 KDa
配列文字列: MISKYRYLHC ARKLVKQSVQ AFGGGHHHHE YDWRDDPKVN KDIEEDIRDR GWHPETYDFP YTKKHDDWVF DVTMPSQNYQ TDLTVNIHP ENKKMHVMKQ VMRQSYWDAE HDMAHEYDYE (SEP)EDLDFQCES FKSQHFRKKG PISQYLILGL LPILYFG TE ...文字列:
MISKYRYLHC ARKLVKQSVQ AFGGGHHHHE YDWRDDPKVN KDIEEDIRDR GWHPETYDFP YTKKHDDWVF DVTMPSQNYQ TDLTVNIHP ENKKMHVMKQ VMRQSYWDAE HDMAHEYDYE (SEP)EDLDFQCES FKSQHFRKKG PISQYLILGL LPILYFG TE FFYNHYPDED YWRVAHPPPL DYPDTDDTDD TETFKDYK(SEP)F TGRRMVDTGI VDPLWYDIRE GKKVYYDWAG VNQP MEDI

+
分子 #17: CTF/NF-I domain-containing protein

分子名称: CTF/NF-I domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 116.81275 KDa
配列文字列: MNKSQDEVKE DYFSIKKKKY NSLDCVLSPI VTRKKQESIN SFQAGLQEDQ NSTAVPESPF IRNCSETLNR SQHKILDHYF EYDYSLKKK IEKIKISLQN KTGTDSSQSL VQKRLDDLRK KTLIYKQFNI QKNNNNINNT GQFFIEKDKQ NNLNLSQPHQ I IKSKQGHK ...文字列:
MNKSQDEVKE DYFSIKKKKY NSLDCVLSPI VTRKKQESIN SFQAGLQEDQ NSTAVPESPF IRNCSETLNR SQHKILDHYF EYDYSLKKK IEKIKISLQN KTGTDSSQSL VQKRLDDLRK KTLIYKQFNI QKNNNNINNT GQFFIEKDKQ NNLNLSQPHQ I IKSKQGHK RSFTNTLYCS SNDKKIFNIS SQKQNIKTVK QSNNSSMYEE QIKNDQNKKQ NFNKQAKSER KQAEFCDLFY ES MQKDAER QFKSNSDKSK SITQILENNC ENAIVLLNHL IQILTDSIPI SKNSILLDEK LSQCVNLSNN SKISQLMLVI QKL QGKISY YYNDFLKCIR MMKICKNFCQ LFGTLKFKIS CYKYIGLGFQ RLNKPKVALV YFVKMLRQSW FLKQEDQEIN SYDF IGMSY FYLGSIDKAY QYHQMMIDGI KADEEVKKIS NIMLKNRKYS NYPTLQNIRI IQETSDGQPL QKTIRKSKII NPQFQ LTQQ EWGENISSSE DEFELPQMQI AVKNAEEQTF QKKFLSTPWN DRFIQAQIHK LEIAQELNYN KFPIGLVFKN QSVLNF PNS SNQPQLVVGP YANKIYNQEL SSTYSSRQRI SHQTPNREFF NYHSQLQQVK EQTQLNQMKQ QYNQIVDSIE LANHLIV LK NLKKVKDLFQ NLIPYLNEKY YNIKQQNTKS LKQQQNSFDA QNSNQSFLGL QNYSIQINGI LNINNQTDEY VNNQSDRS Y QQQSDKLKLL IKSKSRNHSK EINMTQNYFK SPSNESKQIK NLRVIVDNSN KKKAQQKLNQ EFSMNFCESP KYDNSILSL FINKLSQESA LRLEIRQIGS ASRYQRKKQQ KGKQRKEKYQ KKQEENKLNI KQYKKERYNM ALFFMANTAI SVPSVLDTSP CMKQMLAYE DCVLDANVPQ QEVIHPQWPT IWPRLLTDGK LLEFDKVPFH PENIYNYTYM RPLTKKNKQY LYECEEERFV F KACLRKVI SLKKTDKHTS WDTAEVANLQ LT

+
分子 #18: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative

分子名称: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 40.392234 KDa
配列文字列: MFFELEDIKR RHSLYWDIYN VQGWVRRPDS TLYNNVKRGV TAGVVASLVQ ENITALVENC KLLATKYEKP QNLRQAATFM KEVFKLENY RKAVWNRSQY ALCIGTFDIG ARLATFRWLN NGWQRVFAGF EFNFVRKIPT TMLAALFTAP FSVPFELARM A YYGDKTFP ...文字列:
MFFELEDIKR RHSLYWDIYN VQGWVRRPDS TLYNNVKRGV TAGVVASLVQ ENITALVENC KLLATKYEKP QNLRQAATFM KEVFKLENY RKAVWNRSQY ALCIGTFDIG ARLATFRWLN NGWQRVFAGF EFNFVRKIPT TMLAALFTAP FSVPFELARM A YYGDKTFP KELQRGYSSY LSALARIPFE EGPYFLFKNS FPLIIRNFFQ TFTLFYTYDF LKDKASFAWR VGEQNEYACK MI IAGISTY LAAVFSYPWM VTREMVDFWP KVPGAPCTFN GNYRKAAVWI WYHEFSGNYF AGFFTKYFWK ASPGMFLTLM LAD KVGLFD QTTVDNFGGA GNNSWEDTFV

+
分子 #19: 2-oxoglutarate/malate carrier protein

分子名称: 2-oxoglutarate/malate carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 36.118289 KDa
配列文字列: (FME)NYSYKRYWE PSTAEVIGLS LSVNTISAAL TYPIEFVKVR SQIRTEGVGI RSKNLYMGIN PNKVFREIHA TGNGLR GFY QGFESHLIGR LSYLFIRNLT YKIIYDRTKP VKAHNDLSHR EKGVIAGFAG GLAAFLTSPA DLVNTRTIAE GGKPKEW RW ...文字列:
(FME)NYSYKRYWE PSTAEVIGLS LSVNTISAAL TYPIEFVKVR SQIRTEGVGI RSKNLYMGIN PNKVFREIHA TGNGLR GFY QGFESHLIGR LSYLFIRNLT YKIIYDRTKP VKAHNDLSHR EKGVIAGFAG GLAAFLTSPA DLVNTRTIAE GGKPKEW RW GYKGLMDGIN KIAATEGGNA ALFRGSYANV LRAVILNISL TGPFDYLNEK IWITFGDMTW NKYAALLWAS FWGSVATL P FDNIRTRLYA QNADPTKNRL TYSGWADAAK KLIQHEGISG FYVGFYAFYI RTFLYAWTTV FITDKITSDW KRKAGLKEW QI

+
分子 #20: Carrier protein

分子名称: Carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 37.095141 KDa
配列文字列: MANFVIPYLK PVADFWNSLC IDQHQDSLFQ FKGQTGSLGT DWTSKYLRSE QDVYNHKYLQ YHKRVHEAPE LTDVISDNVY RLTLFAGVE RVLSVRQAQA ILKTQFAGAT ENISGAFQTV LNGGIFRRGY FRGALLNLLQ FCGAPYQSLI WSRNSGITNQ V IVSSIFEA ...文字列:
MANFVIPYLK PVADFWNSLC IDQHQDSLFQ FKGQTGSLGT DWTSKYLRSE QDVYNHKYLQ YHKRVHEAPE LTDVISDNVY RLTLFAGVE RVLSVRQAQA ILKTQFAGAT ENISGAFQTV LNGGIFRRGY FRGALLNLLQ FCGAPYQSLI WSRNSGITNQ V IVSSIFEA FFYPLDTVKT LIYNDVQGKY KGAFHCASQV VQNAGWSRLY AGIFQKLIFN SALIFHLNQV WDGSSQQWAS LA LVAAAYP LLVLKTRFQV AGTPLALATS NEVLKVNRKT LYAGLVPYLI FNTLFAYEFA AWHSSTAQER VIGGLQNAMK QFS SPAAEQ VWSS

+
分子 #21: Tim10/DDP family zinc finger protein

分子名称: Tim10/DDP family zinc finger protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 8.00899 KDa
配列文字列:
MDTEVSNHNY TQAVAYLNRA TSSCVKKCDS LNNNGSLSSK QESCLKTCAE NHAIATKIHA EYIRKLAESK YL

+
分子 #22: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 2

分子名称: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 8.354574 KDa
配列文字列:
MSDKRKIQHE GIIALINYST LCAQKCDVLK GHDDKITDTE EQCLRVCAEK IRQTFEFTND IYLKNPNLTK PN

+
分子 #23: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 3

分子名称: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 10.435701 KDa
配列文字列:
MSTRKIFDSE EQSFIRLVDK FYLGLSLTKL CAQSCNLLRN DISGSALTQK EKDCLSICYN NIEKTQSAFY AKVKTTMNLP AVEDDGEEG GDDE

+
分子 #24: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 4

分子名称: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 8.109121 KDa
配列文字列:
(FME)EQNTTQVFS DLAYKVCFKV INDKNKPFVL HDEQRLANCL TRYVEAFNVT SEYFFRERAG ETKVTEKQ

+
分子 #25: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 5

分子名称: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 8.965917 KDa
配列文字列:
MEDNYAADVQ RQFNRTAFDS LYKICYNSLV QKNGSTIDFQ KQIDCHQRLI QVFAKIAPIV VKVEQDAASS GGAAAGGEDE E

+
分子 #26: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 6

分子名称: Cytochrome c oxidase small TIM subunit 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 8.183371 KDa
配列文字列:
(FME)DPVLGDVIA TRIYKACFKH VYGKNMKAYS EKDEAKFDQC LTSYVESYKS VTNHFITYLG QLPKKGLSLD GS

+
分子 #27: Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein

分子名称: Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 41.202629 KDa
配列文字列: GNLYTWGQYA SGTGFETASA VPRKVDYFSG NVSKVAMGPY HTAVITNDGS LYTFGWGQNG ALGNGAKEFQ LSPSPVSFFN DKKLKVKDV VVGESYTIAV TENGEVYSWG YGGEPSSKIN LDFFRNAILP QRCGALGSGD NKNRLTPQQI ANLKADGYKN I SGGDNFAT ...文字列:
GNLYTWGQYA SGTGFETASA VPRKVDYFSG NVSKVAMGPY HTAVITNDGS LYTFGWGQNG ALGNGAKEFQ LSPSPVSFFN DKKLKVKDV VVGESYTIAV TENGEVYSWG YGGEPSSKIN LDFFRNAILP QRCGALGSGD NKNRLTPQQI ANLKADGYKN I SGGDNFAT LVNQSGEVIN WGTGLFGSLG NGSDYPLFTP EVNAYFKHLK EHEGLTVQSI KSAGHFSAAL LSNGKLYTFG VN TQGQLGI RENLGHNTDQ NARLPTPVVD RHFVGQKVVD FEVGENTLVF LTDKNEVFFS GLELAYQPIR WEIPTDKKIV KLA ASKDTF AAVTETGKIY QFNEFVGVST NEVGNDYNVA DSKAFEGKVV DLGGSYGIRF AIVN

+
分子 #28: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein

分子名称: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 21.476887 KDa
配列文字列:
MSAILKRAAK YKRVSSILCE GEAHLRDPFT PPPVILKPPA PRKDKKPDDI TDFPAQKLIP LPESIPYQEG KYRPASIPMV AGFFPYNCY LQQGKVYSWC SCGISQSGPW CDGLCNSVVT RCRPVVFNVS QSGYYKICNC KFSANAPFCN NTHRKMVRYH H QTHRGFYE IWGAALFVLG WVYMGFNYYT

+
分子 #29: Cytochrome c oxidase acyl carrier-like subunit

分子名称: Cytochrome c oxidase acyl carrier-like subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 14.740897 KDa
配列文字列:
MMQNLKKFMS KTIQVQPVSF NQIPKAFYNF PEYRTGGVQA NPGITAKRII KCIGERLRKY DPARWENVPI TFKTHFRDEN GYSDVATSI QIHDALEREF GIDIKDRLAL VTDVETAFYI VMSHHDPL

+
分子 #30: Ymf67

分子名称: Ymf67 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 54.538531 KDa
配列文字列: MTALFLHILW SISYIIINIL YIFLSLLLSN NNEKIKQYNS NYFIKILLVL FYNKNLSFYK NLLSEDEISK IEFERLKNYP TLVLIHSNL NKLEKRNKII NSFINFKTKY RFYKFISTNF NLQTIIKNCN DKIIFSTLLY IVNLNYSFFY KTIKNTDLIV Y LLANKFSI ...文字列:
MTALFLHILW SISYIIINIL YIFLSLLLSN NNEKIKQYNS NYFIKILLVL FYNKNLSFYK NLLSEDEISK IEFERLKNYP TLVLIHSNL NKLEKRNKII NSFINFKTKY RFYKFISTNF NLQTIIKNCN DKIIFSTLLY IVNLNYSFFY KTIKNTDLIV Y LLANKFSI LNDNIIVSKF NISKFNDYIK YINNTNSIDT YLENQIILGL NNNTNSNITK NINTKLLNSY SNLKNLVNIT NN TFYLKKI NDNYNTVINS EFLTYLKSNY KISFSASNIV KYLSDKSVNN SVILYLRKNK IFNKSRYSRN RQTYRTGAYW CLY VNIIAV VAFYFWFYKF TMNFGYLWWL LYSLILSFFF SRALKHRFYN PLNVMTEFKN GFMWFIIILI NIFKPLLKLL ENNY INLYN HLVIKYYQSF ICNTLINKKK LEFNYILSSF KFIKELNNII IISLNKLF

+
分子 #31: Ymf70

分子名称: Ymf70 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 10.919931 KDa
配列文字列:
(FME)FRWLFLYWY NSTDTPSAIA KVNLWSYINL RLFKARLSSS IAYYILGLNN LELKKLKIFY KNTYFDYIYL KSIPCL FLI IFFTNLYLFL

+
分子 #32: Ymf75

分子名称: Ymf75 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 23.325801 KDa
配列文字列: MFLGIFKDVI KLLNKKVVPV YFWFFLYCFL STMDTNIFVS SCSFLKVEVF GKDENTTLVL LFYVFYSLFN FYLSRIKNKN NYLVRKHLY TTELLIELIL FKYKLIILKF SSIKYILNFN VRKFILFNLF LINNYKAYKI NTFFLYIYIY LNNLNIIWYP I FKAYSIFG ...文字列:
MFLGIFKDVI KLLNKKVVPV YFWFFLYCFL STMDTNIFVS SCSFLKVEVF GKDENTTLVL LFYVFYSLFN FYLSRIKNKN NYLVRKHLY TTELLIELIL FKYKLIILKF SSIKYILNFN VRKFILFNLF LINNYKAYKI NTFFLYIYIY LNNLNIIWYP I FKAYSIFG YYKSTRLNFI DTKNENIKRI KY

+
分子 #33: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 57.814465 KDa
配列文字列: MLSKVTRRFL NYNQIYCFAS QHGAEHHKLT ASDEAYLNEV RQRYVTPDME KWAYLDYKKH PSTTLSHYDH KSKDYVESER DDYNADVAT NSHNKLIDDF KRNLQMQRKV HDILQKMDRP YLRGVPGVTK NISAGLQDYS APVSKKSQSD PNDFYRDAYR N ENRWIDQS ...文字列:
MLSKVTRRFL NYNQIYCFAS QHGAEHHKLT ASDEAYLNEV RQRYVTPDME KWAYLDYKKH PSTTLSHYDH KSKDYVESER DDYNADVAT NSHNKLIDDF KRNLQMQRKV HDILQKMDRP YLRGVPGVTK NISAGLQDYS APVSKKSQSD PNDFYRDAYR N ENRWIDQS VFTPKTSKMT HYDVEWPKEL ASRPVTKKFH HDKGYKYDVT TPYDQRYNYV ADRLGHPEIL GNPFERLMRL EG DIYHPNY LDQPFVKVPN ANPNASLNFE EGEVLYENTR LLEWAKFWNY SVVVGYLWCA YFVPYNIFFK THMPLEHAYD NLF FPYFQH THFLWDNNAL HIPTVGGVAI YATYIALSYI NNIWKDYVVR AQFSKDKELL FVTRVSPFGT TEEEVYEVAH LEHL PPSVR SGVKDLSAQD ADGLVDVTCM SSQRSLVFYK GDQYWNPKVY NDFINQTSNL WTRNYTGYNR LEVQNSVEQV KIGFS HSSQ PKLEKK

+
分子 #34: Protein phosphatase 2C, putative

分子名称: Protein phosphatase 2C, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 53.011297 KDa
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MFRRIISNGA LLSTQTQRWQ DLSKFACLRA SLNKESEKAF QELAKKNNVS PQELVELSKI VSMNLDVLKQ NINSEQFLLE KESTLKRYR QSSIGTRGHL QTVNEAVNTK YPTLAEGLGQ VAGYKEAYQA LREIFVHPSI SVNNLRQGSY GQQFAVDFRT R ADEYVKAL LKDHSSNPQA VQTIQEIQHT LHQIIKNYEQ NPASIYARIL TVLQTRGVNT LPVSKTADQK AVATIQKTST PS LTIDQLT VPVQERVQTQ TVFDAELAFI KEANEMIQQN TGNLPWDGGK KKIFQGQANK YLETPYYLLA ALSGLGLLYF LYS GDAKYK TLVLTPVVGI AAFVLLRRNQ ILNRVPTLTE LFLHKDGKFV DAVVSVNGQL ISKNDIPVST LKLYRGDHTV KVNL NDFED ASAKKFLAQQ SGQEGVINVH FSKLRNLAAR NGQVLNLGDT EVVVPFENQA NRIILKQIFK GVEVLPSS

+
分子 #35: Cyclic nucleotide-binding domain protein

分子名称: Cyclic nucleotide-binding domain protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 172.272797 KDa
配列文字列: MSVPSLEYQK QYIYSMQKSQ CSIQNQSINI IADEQQAPQE SYLSRKCQRH LFETKCVQLE LGLNGDYSLS NNSLFIQNNN TVFDNLQQN TESNIKQTNR SNKERYETQI FEQHPIIKNP KNDQVSSIMN EQEQKKFINT DENVQQTAQV SKNSKQSFKN G IQQVQTLS ...文字列:
MSVPSLEYQK QYIYSMQKSQ CSIQNQSINI IADEQQAPQE SYLSRKCQRH LFETKCVQLE LGLNGDYSLS NNSLFIQNNN TVFDNLQQN TESNIKQTNR SNKERYETQI FEQHPIIKNP KNDQVSSIMN EQEQKKFINT DENVQQTAQV SKNSKQSFKN G IQQVQTLS IDKSQASIRE QKKISDCNLD KQFIKGDSRL DESSKIPSKC CGWIPEDIIF ENNIHQLNKK VTLVAKNNFS DS KIQNHKE KKYQQNFQKA AEIVNRLLNT SMNRIMRVRQ HVRNFIMLLK LRYLNRKIDD LTDRDYASIN DLSNFYKSHK KKR NSKAFM KHFNFVIKLS QKLPIFMPTD TLRVVWDVIL VLFTYIFLYF YSILMFFNQD NPDTEFIKEF YFCTFFIFLI DVLV NFNTA FFNKDLIIIN RRQIAKQYIF STVFFTDFVS LIVLGIKVIK RSNFIVYNPN HNLLTYCFNM LIFFKVNGIS SKKKG FDYV FTLKESEKHV IKLINQLFSV ITVAHLAAIG WYFLGILQVV NDNQTNWLVK LNISEGVYYQ KYIYSIYWSI TTMTTV GYG DISATNYGEA LYISIVMLLF SCVFAYSINN IGFILQEIEK SSKQLNDKIT TMQRYLNRKK VNISLKSRIR HYLSFLA QE QRDRDKQAED EIISILSNKL REEITVEINS KILNKFNIFS SNFSKQTLDK LVFKMTEVLI NPNEIIFREE QNDDMSIY F IQSGVIEVYQ QSVQKQDKVT VIQTLTDESL FGEISFFSGL SRKASARSIN LSTLYKISRE DFIYIIQENN EDYERFKMI QEQIVFQGEL PLLHVECYNC KKIGHISSSC PKTHQIFDKQ FIILREIYSS FQQRIFFDRT RYKNNLKPLN LIQDNQNVCK ILKQNLQDD NISIEIMFDS CNRYTGSSYY NSEDLEDDEY GQCDEYATSS NSQTNIDNFS NKSSLNNIKN NALQKKKTMK K KEVSKKYL DNNQICENIS SILNSDQYCN SQKVISNNIN DNLEIKKSYV KSFNLSNRQK SLDDFEKIKS SQNLEQNNNF NN SDIQHSK SQIQIKADSE QFQQNIKAYS QTNKNEVDGD QEQSNISQIF KKRKSQKQQE QINNTNTDIK LQTEYPKQQA RFS STSGST LQSQQLKMPS QKVQDELQLN INQNLKGQEF NINQSNKRVS TLLNQISNNH NQILKNCTEQ TNYRNSIDQI LLQG ILVNN LIQSHSSQNI LPIEQSFKYL KKADGDLEKK KNSILLQNFS LNNNKSSINI TKEFIEDQAA VSHKNLSQIK TKQSI GKSS ILNALSNINN IDGNTNDLNN KNNNSKLLQA QNSQITNGNQ LQIVDRLSKL LLNPQLPLLL KLTSVGMSFR EMNSIN SNN AMDMFDKMHN FKKFFPHNNI ENVLNKLKLL QLELKKQKKQ KQINKPRRQN ILFFRYYSNC GSQVHDNLKL LQQEFNI DD YRPTYLSYGV SKRRGQQFPC NKHNLTLYF

+
分子 #36: SURF1-like protein

分子名称: SURF1-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 47.087973 KDa
配列文字列: MYEGRWKMVN QIKQDVQNDI ELILRQMNER IHAMKKKKYN ELKGKIKQKC IDLLIDYAKQ KIGKKNKIKK EGNNIRHNKQ KKLKNIQKK IFKIISTRML QTTLSAFRPR GSNVTGKVAL ATLGALTGYG AFYHYNQYLN LSARWQQIQE NIAKDQPFDV D GFDAKVYP ...文字列:
MYEGRWKMVN QIKQDVQNDI ELILRQMNER IHAMKKKKYN ELKGKIKQKC IDLLIDYAKQ KIGKKNKIKK EGNNIRHNKQ KKLKNIQKK IFKIISTRML QTTLSAFRPR GSNVTGKVAL ATLGALTGYG AFYHYNQYLN LSARWQQIQE NIAKDQPFDV D GFDAKVYP WVRENNVNDW EYKLVKMRGY FKDQRFFVRR KRDGKEGFLV FAPFVTAVER VNHRLKQKDL LPVEYSVFVN LG WVPVENK KDVELGGEVC PPMDAPTDST LFVNDTFTGF NPDPANPEDT EQVTLTEITG IVRRGEQQDI LARRRNWNKE GIY NWVDLD YMGKIFRLFN LDAINTAYIE RVVPSFEEGE EGLYPIPATK DTFERPLNTP ERHSTFFNFY AATSALSFIS MLLL RR

+
分子 #37: TraB family protein

分子名称: TraB family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 45.050922 KDa
配列文字列: (FME)ISARAVHRF LRNPNLETGA AFRAGTRFDP FKNTLTVLKD PQNGRTLYLI GTTNSSTLLA NRTKDLVQKE KPDAVF VQT NKEWWNLAKN IQDVKCQQEL NRYNDLLSQA YTLSLDNTIR NLVFKAKFYS WLFVINWFKA FPDDFHPFIP GLEMKFA IE ...文字列:
(FME)ISARAVHRF LRNPNLETGA AFRAGTRFDP FKNTLTVLKD PQNGRTLYLI GTTNSSTLLA NRTKDLVQKE KPDAVF VQT NKEWWNLAKN IQDVKCQQEL NRYNDLLSQA YTLSLDNTIR NLVFKAKFYS WLFVINWFKA FPDDFHPFIP GLEMKFA IE EANKQNIPVV LGGLEVDDVT LSALKVEPRL DPFSQLYYGY RALHNSFWRR EHFDNYATLD VVGGEAYAES MDRFRTNW F VKYFEKLAPY QKKIIVDQKD LDLFYALYRD TPGKKIVAVV NQWHVPGIEN HWKSATNTHE PLKAINPIGD MDINKYMES QLVNDTLRAF VSKVGKTEPA TWKNYSTIYH KDNYEAERVR HVAFVDHKDP HMYHGLPQDY DDNIKPKHH

+
分子 #38: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 41.307387 KDa
配列文字列: MRYLKIEKEK LVSCKKQEQE VQRIRRRKGN QKLNSIAKQQ RVKRRDYQQN IKQNKEVKNP KKLIKQQIIN KVKKRKKMFR GLTKFNKVF ALNSFKNSLV AVPKANLNHV QNMLEENLKY DAQKYNDEVA VIQKTSRIYK PTYTIEFNRE GEVLVYSADP I KNSVVYFK ...文字列:
MRYLKIEKEK LVSCKKQEQE VQRIRRRKGN QKLNSIAKQQ RVKRRDYQQN IKQNKEVKNP KKLIKQQIIN KVKKRKKMFR GLTKFNKVF ALNSFKNSLV AVPKANLNHV QNMLEENLKY DAQKYNDEVA VIQKTSRIYK PTYTIEFNRE GEVLVYSADP I KNSVVYFK YPYVLYEAAI PLFIWAWIYN PLELSKNAVN SLLIYPNIAW IPRMWYWRSL QYKIQKMYLL RGGKVAKIET QS LAGDRFT SWVETYQFHP LTQDQKNFDN QDNAEFLEDE GQLKYELGVQ LDNLQEMGTT SQDIVINFMK EGTVHHPELF EAI VKGYNI DTSDYVINTA NNLRAREGNH NH

+
分子 #39: Cytochrome c oxidase subunit TT7

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 37.55298 KDa
配列文字列: MFLNRLVKET SKAKRLFSMA QNNFARAGPY NPNRYKDYYI PRTLPKNEEI VEFVQSQHSV PASPIRNQRH INPVRESGPL PSYDGTYTM EDIRAVFYNT TVGRDYCYCQ MDPEEIMRRV PGITRKEAEF ITKLGLSPQE QVDFAYIAYN IGLDIFYFTN Q MFVARQVV ...文字列:
MFLNRLVKET SKAKRLFSMA QNNFARAGPY NPNRYKDYYI PRTLPKNEEI VEFVQSQHSV PASPIRNQRH INPVRESGPL PSYDGTYTM EDIRAVFYNT TVGRDYCYCQ MDPEEIMRRV PGITRKEAEF ITKLGLSPQE QVDFAYIAYN IGLDIFYFTN Q MFVARQVV TNSKGEKVEV LWNAQCYEDI AQLNVGFAPV LESVDYHWEI FLWADPPIKP NNDFDLNVPC TWFEYEQEWW ME SCIQEDQ FNLPEDERPY NTPRNPHCRK ELWRSQDALQ EEELMVNENW YPKNTQYNIY NQPDFIKPKS GSGAAADDIR I

+
分子 #40: SURF1-like protein

分子名称: SURF1-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 35.794367 KDa
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MLQQVFGKSK GGEVTNSHLT PKVLNKAQEA EKLASQIQAQ RFSNRLVAFS SQYPRAKLFF AGIGIGTLLY GANQSSKARE NKVATETRK ERMAKPTIQL TGADSQNPPF TEKNINDWLY KTVSITGRPI HGKGMMIPAK SYGLHGFEYL VPFVTKENED G SVQEGLIL NLGFIPREYA PIWARARVEN VEEQTFTCVV TDGKHLSEQG GLFASNKPCE NQWEYADLDQ LAKHTGFVNQ EQ VRSCILE HVNTETPNDE RDCRHIDICS DYKEDYPYKF TRSGVLQQPG QMYWDLNKSA SYYSLLGLGC SVFSALLFLA K

+
分子 #41: Cytochrome c oxidase subunit TT9

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 29.865686 KDa
配列文字列: MVYHLFERIC NPDNFKLSGE AARVRTLIAA GFSKEEAEQV AWLQNHQVNG KILGLFTGGF ALYCCNNYFH YFERYFPRLR YQPFTKFLA QAATVYFFFK IGDYYFTSRR YGSNDARMNG LMYSNTYYST NKEALIQNFE PLNRKFTEEE VEQFLRNEGR S QEEKRNWI ...文字列:
MVYHLFERIC NPDNFKLSGE AARVRTLIAA GFSKEEAEQV AWLQNHQVNG KILGLFTGGF ALYCCNNYFH YFERYFPRLR YQPFTKFLA QAATVYFFFK IGDYYFTSRR YGSNDARMNG LMYSNTYYST NKEALIQNFE PLNRKFTEEE VEQFLRNEGR S QEEKRNWI YNPHIHGSTE GEWKADIHEK FDSGKAPWER EHVKAKILET NKAKIDAGEE IQLKPFKTLN HLDKTGLLHR LH PFIWTNN WTLLG

+
分子 #42: Cytochrome c oxidase subunit TT10

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 28.101486 KDa
配列文字列: MSSFIQYEFL KIYQGNQKIK NYYKRKRLIF QQKKVLKKKQ KEIQMSTNNL RLKPWFHWTD EERSHAIFSA YEKRILKSED LPSFLRANR INNVSTWVFP LIALPLFNQS IFKLGFAQRI LLTRPAIEWH CFKIATVAAS WLAWLNFSPF YRKLENEKEY L LDTLESRI ...文字列:
MSSFIQYEFL KIYQGNQKIK NYYKRKRLIF QQKKVLKKKQ KEIQMSTNNL RLKPWFHWTD EERSHAIFSA YEKRILKSED LPSFLRANR INNVSTWVFP LIALPLFNQS IFKLGFAQRI LLTRPAIEWH CFKIATVAAS WLAWLNFSPF YRKLENEKEY L LDTLESRI GINVLDLNDA LPRWTTSQEY NRRTQQLYNQ RNGFFAGLLY PQEESSRPLV DIASFPKNLH KEKLTK

+
分子 #43: Cytochrome c oxidase subunit TT11

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 27.034711 KDa
配列文字列: MFGRLVLKQT RRTLFNPVLK NTFCIYQAYQ NPLRHINTGH NPNNVYEDIV MLGDYPVQNR THDKVISQTY VPAIANIAFT HLSKKYPQA GLKVDQLNTL KEKTWNDLGV NIEHEKQEIL VELSEQIFVK ESKLRWVHEQ RQRLAHTTYV FSGLEFQNVK V GFFIDSYN ...文字列:
MFGRLVLKQT RRTLFNPVLK NTFCIYQAYQ NPLRHINTGH NPNNVYEDIV MLGDYPVQNR THDKVISQTY VPAIANIAFT HLSKKYPQA GLKVDQLNTL KEKTWNDLGV NIEHEKQEIL VELSEQIFVK ESKLRWVHEQ RQRLAHTTYV FSGLEFQNVK V GFFIDSYN FLLQELAHRS NLYQSKDIVG EKSFHEKHLE QQTAPYSGVK SLEEPVSQNK SFINSLMRAI HNH

+
分子 #44: Cytochrome c oxidase subunit TT12

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 26.738438 KDa
配列文字列: IKGNQKKQKG KNQSNNNNNI REEGKQIKEM ILPHNNRQLA RQYFDSLPEN DINRKYYEGL KYETPKTFFG RFLNQFNIDA KLDTLSKFY TYQKTIRATQ AELQEDRKSY LTNSLLFTAV SWFSIYQFAR KGAVLPVLRE YGRYFGTHRL FRQYLHTLVL P LLYTEYAL ...文字列:
IKGNQKKQKG KNQSNNNNNI REEGKQIKEM ILPHNNRQLA RQYFDSLPEN DINRKYYEGL KYETPKTFFG RFLNQFNIDA KLDTLSKFY TYQKTIRATQ AELQEDRKSY LTNSLLFTAV SWFSIYQFAR KGAVLPVLRE YGRYFGTHRL FRQYLHTLVL P LLYTEYAL NQKYYTHMEH LWTVHVNRLN QKILEDPLYT FYPQELNVPK HNIIVPTIFR DTPQ

+
分子 #45: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 26.601174 KDa
配列文字列: MSLSLFGVKN NWHKNGIWWF SKILNKTVGE ERYDALRVQR RIWSMRFYYA RQQCLYELFV DHPDLAQWTG TYPKVDSSHG FPFYSTYEM YRDFQENTLN SDGSFAQWIT LVCGIYVIHV IYNYMIPYYW VSTPLKNDEF TRLRMKDYIA STVLEEVYGI S YAEWGWLP ...文字列:
MSLSLFGVKN NWHKNGIWWF SKILNKTVGE ERYDALRVQR RIWSMRFYYA RQQCLYELFV DHPDLAQWTG TYPKVDSSHG FPFYSTYEM YRDFQENTLN SDGSFAQWIT LVCGIYVIHV IYNYMIPYYW VSTPLKNDEF TRLRMKDYIA STVLEEVYGI S YAEWGWLP HDFAYNRMRG LAGYMHPDDP RAMCTSTFHR KHKYIEHEVE KVGDYHHMTY PK

+
分子 #46: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 24.701131 KDa
配列文字列: MKKGTASEEE LKKLYDPNTF YEHGDNPAFK QFMNIAVENL REGKLTDHRT YVVDTYKKWM YARNWDDFLQ RDCKAITFPR AFALWIVGT LGMATASKWC RQILPVGSHG ITKISQTQFF HQFGPLGTLG AVGFYGLTAY LYYKTTIFTV KKFYSHCILQ E REWIFEQE ...文字列:
MKKGTASEEE LKKLYDPNTF YEHGDNPAFK QFMNIAVENL REGKLTDHRT YVVDTYKKWM YARNWDDFLQ RDCKAITFPR AFALWIVGT LGMATASKWC RQILPVGSHG ITKISQTQFF HQFGPLGTLG AVGFYGLTAY LYYKTTIFTV KKFYSHCILQ E REWIFEQE RQNPGYGEYF FKDVPLSAEE HFNDLARGEM AKKKFEKPNH EF

+
分子 #47: Cytochrome c oxidase subunit TT15

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 23.25766 KDa
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MKEKIFNELT RKMKRKEISA KIQREENKQI LIRQRNNKKY IQSIQGIQQE RKKGKLYLVE MATQNVEEMD TIQKMNYEAT VNMGRQDLI TREYTFYSDY EFIPIQEDRK QQMEDALNNL HKIIHPTVTQ LKKKANVQEI QDRVFRKLQG WEGELNTCVF S AKNVRDSN FCADRFTNRI NTEGVEFVKQ ILREY

+
分子 #48: Cytochrome c oxidase subunit TT16

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 20.00733 KDa
配列文字列:
(FME)NNTFKFLHQ VISKLTLKAQ VPNYGQYSHS LKRPINPKVV VFGNSSRAYE LISSQFRNFN HVNGLELKGQ EDNIQA NKV AQSVLSINDG FQDGYYITDF PQNSKQAERL DLITDGVNLA LYIKDPSDKV TVTRQQEAID YYRKTGALVE FEVDPRG DL EEQVKQLSNQ VLNGYKH

+
分子 #49: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 20.346227 KDa
配列文字列:
MDNNYHFWGN GDRQDVSLSY EDYYSILDCL LDEKLSPQGL MKFKNLHEVS MYGVSYVPLY CFPVAYGISH MLTGKVRRGH SGYRNLFSL MSVVLPFTCW YAYTTPIPRR LYTEIICSNN ADGAYVRNRI KQQKPGIWRK LSQQLYNKNF RFPELNQDLT A TEFPLDYV APHKF

+
分子 #50: Cytochrome c oxidase subunit TT18

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 20.025109 KDa
配列文字列:
MVFEFLFYNQ QHKTRNGYFI NHDNLMLASL EERKKLIFYF IANQVPEKLD PVDRVKFNEE LSDNLSTKAR LIGSLTGLIG LVGFPYIST RIYSRPVLNI GLSLLICPFL YYVGNQLTYS VWEPKFIANN NTVCELSKKY NFTVFDFAQA KKEAHLKALR T ELVSDNLL YSPGI

+
分子 #51: Cytochrome c oxidase subunit TT19

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 19.882758 KDa
配列文字列:
MAIRNFVFKI SNQIQNLAAK RSLAYLNQID SQSVPSRATI NMKDQVTQMQ REIDNMANVI RAQIPDEDRA EFEILKKYYV TGQHDSLVD PQDVLLQLDR IQVLKNLKMI ELNEEAYDPE LVRLEKLKAR VLLEEEGALL EYAHFISKRP YNKPYEKWGV S EEHVKQQI LG

+
分子 #52: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 18.801604 KDa
配列文字列:
MGFETVVPAP PTRDDELRMI KATEEQFLQQ PRYKLYMNEA HRIAKMNHGD RHNNIRAHFW SNFALGLLIT GPIFIIPFGK AFRNLRSGV PYYFRPKYVF TQKNQYNQDR NWGAMKKQIP LWLGLSTAYA YWFTDFSIND DEWLEKGKVI YPHQTIKVL

+
分子 #53: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 18.600445 KDa
配列文字列:
MSCTTRRFID EKEKLEYSRG YNQQELEASK LRKDFVKKYI VDFDTTLYKT QVERDWAYIA KREYRYEVQL KSIGYGGALA NAVLLWRIY ANKKMVFWPI PIVGALGYLY FQPVFFQKSN KRFFDMCNVG EEYYLGRERN KILRECNKIL NVEDF

+
分子 #54: Cytochrome c oxidase subunit TT22

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 17.701115 KDa
配列文字列:
MGKDQLDFSH FDKAFENKYD IVAPEFGDLH QKRAEFIAKN QGTYRPVPLV PNNIKGLIPK TCRLPATRNW YRRTSSFERN GFFNIHTPV LNTKMIPWLL FIVLTWGWSS FQIGGYNYER FDDNGERRNT LYWKLSPVEF PQSKLWNRPS

+
分子 #55: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 15.588598 KDa
配列文字列:
MVFHYTNFVQ ETNAWWLRRV RPVYCTVLAY YGWWLYDRYY LFGKNATQDI RKDTTEVWEK RAALNKRNWG YNAHYKPELE RSMKKVLYA DPNYKFPIEW PERYMAETKT LEQVMDEEEN WEYYK

+
分子 #56: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 14.302487 KDa
配列文字列:
MEPFGTDERN WTHEEKDIIT RFLKYDKHVN LKTAEMVYSA EVESAYFGKA GALAGGVISA LFFNFPIVRN LPIIRRSVIG VLPFLYCYT WGKNTQEELR WLKTFAAYQR FVVYHGQHCK LWV

+
分子 #57: Cytochrome c oxidase subunit TT25

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 12.273913 KDa
配列文字列:
MAQTAHQNRY QGGLCYAQCN ELFSFWNPSI QQCWKGCDFG VGRVNDPEGR IEAQQMCKRW AAELYWTYKG ELDTIKDLRV HADMYPTTP QNVYRACLAG VRRQKF

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分子 #58: Cytochrome c oxidase subunit TT26

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit TT26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物) / 株: SB210
分子量理論値: 10.418697 KDa
配列文字列:
MSSDPFKKVE RDYHNERSVH KHFASYPLKF WWGLNKFETI QGIHSILGNA ADLVVSTLSF IPGVQGRNNA SYIENSIRVT RFRGFDDKT Q

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分子 #59: HEME-A

分子名称: HEME-A / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 4 / 式: HEA
分子量理論値: 852.837 Da
Chemical component information

ChemComp-HEA:
HEME-A

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分子 #60: COPPER (II) ION

分子名称: COPPER (II) ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 6 / 式: CU
分子量理論値: 63.546 Da
Chemical component information

ChemComp-CU:
COPPER (II) ION

+
分子 #61: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #62: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 34 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #63: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 68 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

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分子 #64: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 4 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #65: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 4 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

濃度5 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMTris2-Amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol
50.0 mMNaClsodium chloride
5.0 mMMgCl2magnesium chloride
0.002 g/100 mlPMSFPhenylmethanesulfonyl fluoride

詳細: Solution were made fresh from concentrated stocks, filtered and de-gassed before equilibration onto Superose6 column
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 詳細: 30 mA
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK III
詳細: incubation time before blotting: 60s blot time: 9s blot force: 25 offset: -2 incubation after blotting: 0s.

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS GLACIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 17478 / 平均露光時間: 3.0 sec. / 平均電子線量: 60.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系倍率（補正後）: 56818 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN

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画像解析

粒子像選択選択した数: 1798857
CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 4.1)
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
In silico モデル: 3D ab-inito model reconstruction in cryosparc
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.02 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.2.0) / 使用した粒子像数: 394262
初期 角度割当タイプ: COMMON LINE / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.2.0)
最終 角度割当タイプ: COMMON LINE / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.2.0)
最終 3次元分類クラス数: 200 / 平均メンバー数/クラス: 9000 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.2.0)
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-7w5z:
Cryo-EM structure of Tetrahymena thermophila mitochondrial complex IV, composite dimer model

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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