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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-0894 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | The cryo-EM structure of coxsackievirus A16 mature virion in complex with Fab 14B10 | ||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | The cryo-EM structure of coxsackievirus A16 mature virion in complex with Fab 14B10 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MDA-5 activity / : / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||||||||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | He MZ / Xu LF / Zheng QB / Zhu R / Yin ZC / Cheng T / Li SW | ||||||||||||||||||||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Identification of Antibodies with Non-overlapping Neutralization Sites that Target Coxsackievirus A16. 著者: Maozhou He / Longfa Xu / Qingbing Zheng / Rui Zhu / Zhichao Yin / Zhenghui Zha / Yu Lin / Lisheng Yang / Yang Huang / Xiangzhong Ye / Shuxuan Li / Wangheng Hou / Yangtao Wu / Jinle Han / ...著者: Maozhou He / Longfa Xu / Qingbing Zheng / Rui Zhu / Zhichao Yin / Zhenghui Zha / Yu Lin / Lisheng Yang / Yang Huang / Xiangzhong Ye / Shuxuan Li / Wangheng Hou / Yangtao Wu / Jinle Han / Dongxiao Liu / Zekai Li / Zhenqin Chen / Hai Yu / Yuqiong Que / Yingbin Wang / Xiaodong Yan / Jun Zhang / Ying Gu / Z Hong Zhou / Tong Cheng / Shaowei Li / Ningshao Xia / ![]() ![]() 要旨: Hand, foot, and mouth disease is a common childhood illness primarily caused by coxsackievirus A16 (CVA16), for which there are no current vaccines or treatments. We identify three CVA16-specific ...Hand, foot, and mouth disease is a common childhood illness primarily caused by coxsackievirus A16 (CVA16), for which there are no current vaccines or treatments. We identify three CVA16-specific neutralizing monoclonal antibodies (nAbs) with therapeutic potential: 18A7, 14B10, and NA9D7. We present atomic structures of these nAbs bound to all three viral particle forms-the mature virion, A-particle, and empty particle-and show that each Fab can simultaneously occupy the mature virion. Additionally, 14B10 or NA9D7 provide 100% protection against lethal CVA16 infection in a neonatal mouse model. 18A7 binds to a non-conserved epitope present in all three particles, whereas 14B10 and NA9D7 recognize broad protective epitopes but only bind the mature virion. NA9D7 targets an immunodominant site, which may overlap the receptor-binding site. These findings indicate that CVA16 vaccines should be based on mature virions and that these antibodies could be used to discriminate optimal virion-based immunogens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
履歴 |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 777.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 18.7 KB 18.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 274.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6lhpMC ![]() 0887C ![]() 0888C ![]() 0889C ![]() 0890C ![]() 0891C ![]() 0892C ![]() 0895C ![]() 0897C ![]() 0898C ![]() 6lhaC ![]() 6lhbC ![]() 6lhcC ![]() 6lhkC ![]() 6lhlC ![]() 6lhoC ![]() 6lhqC ![]() 6lhtC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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注釈 | The cryo-EM structure of coxsackievirus A16 mature virion in complex with Fab 14B10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.128 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
+全体 : Coxsackievirus A16 complex
+超分子 #1: Coxsackievirus A16 complex
+超分子 #2: Fab antibody
+超分子 #3: Coxsackievirus A16
+分子 #1: light chain variable region of Fab 14B10
+分子 #2: heavy chain variable region of Fab 14B10
+分子 #3: VP1 protein
+分子 #4: VP2 protein
+分子 #5: VP3 protein
+分子 #6: VP4 protein
+分子 #7: SPHINGOSINE
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TECNAI F30 |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 40.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai F30 / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
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最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: I (正20面体型対称![]() |