ChemComp-U3H: 3'-DEOXY-URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: U3H
• 名称: 名称: 3'-deoxy-uridine 5'-triphosphate

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₇N₂O₁₄P₃ / 原子数: 45 / 化学式量: 470.158 / 形式電荷: 0

その他

1n38

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: U3H / 理論座標の詳細: OpenEye/OEToolkits V1.4.2 / モデル座標のPDB-ID: 1N38

履歴

作成	2002年10月29日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C=CC(=O)NC1O)C(O)C2
• CACTVS 3.341: O[CH]1C[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH]1N2C=CC(=O)N[CH]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(OC(C1O)N2C=CC(=O)NC2O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@@H]1C[C@@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H]1N2C=CC(=O)N[C@H]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@H](O[C@H]([C@@H]1O)N2C=CC(=O)NC2O)CO[P@](=O)(O)O[P@](=O)(O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H17N2O14P3/c12-6-3-5(23-8(6)11-2-1-7(13)10-9(11)14)4-22-27(18,19)25-28(20,21)24-26(15,16)17/h1-2,5-6,8-9,12,14H,3-4H2,(H,10,13)(H,18,19)(H,20,21)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+,9+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: CVEDUOUYNXHQBA-HIORRCEOSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (2R)-1-{3-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-erythro-pentofuranosyl}-2-hydroxy-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2S,4R,5R)-4-hydroxy-5-(2-hydroxy-4-oxo-2,3-dihydropyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl (hydroxy-phosphonooxy-phosphoryl) hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-1n38:
reovirus polymerase lambda3 elongation complex with one phosphodiester bond formed

PDB-6sa1:
Post catalytic complex of Prim-PolC from Mycobacterium smegmatis with gapped DNA and 3'-dUTP