ChemComp-R52: 5-O-phosphono-D-ribose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: R52
• 名称: 名称: 5-O-phosphono-D-ribose / 日化辞名称: D-リボ-ス5-りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₁O₈P / 原子数: 25 / 化学式量: 230.11 / 形式電荷: 0

その他

2vvp

R51

タイプ: non-polymer / 3文字コード: R52 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2VVP / 置き換え元: R51

履歴

作成	2008年6月10日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEBI / CompTox / DrugBank / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCC(O)C(O)C(O)C=O
• CACTVS 3.341: O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH](O)C=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(C(C(C(C=O)O)O)O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C([C@H]([C@H]([C@H](C=O)O)O)O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H11O8P/c6-1-3(7)5(9)4(8)2-13-14(10,11)12/h1,3-5,7-9H,2H2,(H2,10,11,12)/t3-,4+,5-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: PPQRONHOSHZGFQ-LMVFSUKVSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5-O-phosphono-D-ribose
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3R,4R)-2,3,4-trihydroxy-5-oxo-pentyl] dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-2vvp:
Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase B in complex with its substrates ribose 5-phosphate and ribulose 5-phosphate

PDB-3k7s:
Complex of Trypanosoma cruzi ribose 5-phosphate isomerase type B with ribose 5-phosphate