ChemComp-B9D: 5-fluoro-alpha-L-idopyranose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: B9D
• 名称: 名称: 5-fluoro-alpha-L-idopyranose; 別称: (2R,3R,4R,5S,6R)-6-fluoranyl-6-(hydroxymethyl)oxane-2,3,4,5-tetrol; 5-fluoro-alpha-L-idose; 5-fluoro-L-idose

Chemical information

組成

組成式: C₆H₁₁FO₆ / 原子数: 24 / 化学式量: 198.146 / 形式電荷: 0

その他

3ij7

タイプ: L-saccharide, alpha linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: B9D / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3IJ7

履歴

作成	2009年8月18日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2012年12月21日
Other modification	2020年7月3日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: FC1(OC(O)C(O)C(O)C1O)CO
• CACTVS 3.370: OC[C]1(F)O[CH](O)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C(C1(C(C(C(C(O1)O)O)O)O)F)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: OC[C@]1(F)O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C([C@]1([C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)O)O)O)O)F)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C6H11FO6/c7-6(1-8)4(11)2(9)3(10)5(12)13-6/h2-5,8-12H,1H2/t2-,3-,4+,5-,6+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: YQZCKDSOGGIGPL-DVKNGEFBSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,3R,4R,5S,6R)-6-fluoro-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-2,3,4,5-tetrol (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (2R,3R,4R,5S,6R)-6-fluoranyl-6-(hydroxymethyl)oxane-2,3,4,5-tetrol

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-3ij8:
Directed 'in situ' Elongation as a Strategy to Characterize the Covalent Glycosyl-Enzyme Catalytic Intermediate of Human Pancreatic a-Amylase

PDB-4amw:
CRYSTAL STRUCTURE OF THE GRACILARIOPSIS LEMANEIFORMIS ALPHA-1,4- GLUCAN LYASE Covalent Intermediate Complex with 5-fluoro-idosyl- fluoride

PDB-5aeg:
A bacterial protein structure in glycoside hydrolase family 31.

PDB-5jov:
Bacteroides ovatus Xyloglucan PUL GH31 with bound 5FIdoF