ChemComp-AMV: methyl 2-acetamido-3-O-[(1R)-1-carboxyethyl]-2-deoxy-beta-D-gluco...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AMV
• 名称: 名称: methyl 2-acetamido-3-O-[(1R)-1-carboxyethyl]-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside; 別称: METHYL 2-(ACETYLAMINO)-3-O-[(1R)-1-CARBOXYETHYL]-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSIDE; methyl; 日化辞名称: メチル3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-β-D-グルコピラノシド
• ウィキペディア: ウィキペディア - メチル基: メチル基（メチルき、methyl group）とは、有機化学において、-CH₃ と表される最も分子量の小さいアルキル置換基である。特にヒドロキシ基やメルカプト基（チオール基）に対する保護基にも利用される...

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₂₁NO₈ / 原子数: 42 / 化学式量: 307.297 / 形式電荷: 0

その他

NAG

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: AMV / 親要素: NAG

履歴

作成	2006年10月25日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify internal type	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)C(OC1C(O)C(OC(OC)C1NC(=O)C)CO)C
• CACTVS 3.341: CO[CH]1O[CH](CO)[CH](O)[CH](O[CH](C)C(O)=O)[CH]1NC(C)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(C(=O)O)OC1C(C(OC(C1O)CO)OC)NC(=O)C

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@H](C)C(O)=O)[C@H]1NC(C)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C[C@H](C(=O)O)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](O[C@@H]([C@H]1O)CO)OC)NC(=O)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H21NO8/c1-5(11(17)18)20-10-8(13-6(2)15)12(19-3)21-7(4-14)9(10)16/h5,7-10,12,14,16H,4H2,1-3H3,(H,13,15)(H,17,18)/t5-,7-,8-,9-,10-,12-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: UXEQYDNCHCKBIL-PKKPQKKZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: methyl 2-(acetylamino)-3-O-[(1R)-1-carboxyethyl]-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-methoxy-oxan-4-yl]oxypropanoic acid

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-3itb:
Crystal structure of Penicillin-Binding Protein 6 (PBP6) from E. coli in complex with a substrate fragment

PDB-3zg5:
Crystal structure of PBP2a from MRSA in complex with peptidoglycan analogue at allosteric

PDB-7ajz:
The X-ray Structure of L,D-transpeptidase LdtA from Vibrio cholerae in complex with NAG-NAM(tetrapeptide)