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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1alb | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT MURINE ADIPOCYTE LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
要素 | ADIPOCYTE LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
キーワード | LIPID BINDING PROTEIN / LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Triglyceride catabolism / hormone receptor binding / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / cellular response to lithium ion / long-chain fatty acid binding / white fat cell differentiation / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / brown fat cell differentiation / fatty acid metabolic process ...Triglyceride catabolism / hormone receptor binding / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / cellular response to lithium ion / long-chain fatty acid binding / white fat cell differentiation / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / brown fat cell differentiation / fatty acid metabolic process / cholesterol homeostasis / fatty acid binding / response to bacterium / positive regulation of inflammatory response / cellular response to tumor necrosis factor / positive regulation of cold-induced thermogenesis / negative regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of cell population proliferation / nucleoplasm / nucleus / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Xu, Z. / Banaszak, L.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1992 タイトル: Crystal structure of recombinant murine adipocyte lipid-binding protein. 著者: Xu, Z. / Bernlohr, D.A. / Banaszak, L.J. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1991 タイトル: Expression, Purification, and Crystallization of the Adipocyte Lipid Binding Protein 著者: Xu, Z. / Buelt, M.K. / Banaszak, L.J. / Bernlohr, D.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1alb.cif.gz | 37.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1alb.ent.gz | 26.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1alb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/al/1alb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/al/1alb | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: THE SULFHYDRYL GROUP OF CYS 1 IS CHEMICALLY MODIFIED BUT NOT SHOWN IN THE ELECTRON DENSITY MAP. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14539.688 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P04117 |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THE SULFHYDRYL |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.47 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.26 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 19 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: used as seeds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 9999 Å / Num. all: 5227 / Num. measured all: 5115 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / Rfactor Rwork: 0.183 / Rfactor obs: 0.183 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection all: 4773 / σ(F): 0 / Rfactor all: 0.183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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