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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ags | ||||||
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タイトル | A SURFACE MUTANT (G82R) OF A HUMAN ALPHA-GLUTATHIONE S-TRANSFERASE SHOWS DECREASED THERMAL STABILITY AND A NEW MODE OF MOLECULAR ASSOCIATION IN THE CRYSTAL | ||||||
要素 | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE ALPHA | ||||||
キーワード | TRANSFERASE (GLUTATHIONE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Glutathione conjugation / Azathioprine ADME / glutathione transferase / glutathione transferase activity / epithelial cell differentiation / glutathione metabolic process / xenobiotic metabolic process / Gene and protein expression by JAK-STAT signaling after Interleukin-12 stimulation / extracellular exosome / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Zeng, K. / Rose, J.P. / Wang, B.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 1994 タイトル: A surface mutant (G82R) of a human alpha-glutathione S-transferase shows decreased thermal stability and a new mode of molecular association in the crystal. 著者: Zeng, K. / Rose, J.P. / Chen, H.C. / Strickland, C.L. / Tu, C.P. / Wang, B.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ags.cif.gz | 25.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ags.ent.gz | 13 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ags.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ags_validation.pdf.gz | 365.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ags_full_validation.pdf.gz | 365.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ags_validation.xml.gz | 1.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ags_validation.cif.gz | 5.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ag/1ags ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ag/1ags | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25687.020 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) synthetic construct (人工物) / 遺伝子: PGTH121-G82R / 器官: LIVER / プラスミド: PKK223-3 / 遺伝子 (発現宿主): PGTH121-G82R / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P09210, glutathione transferase #2: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.59 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.55 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 54 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: SIEMENS-NICOLET X100 / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 18098 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.0996 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / % possible obs: 92.6 % / Rmerge(I) obs: 0.0996 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | |||||||||||||||
精密化 | *PLUS | |||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |