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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7dge | ||||||
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タイトル | intermediate state of class C GPCR | ||||||
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![]() | MEMBRANE PROTEIN / GPCR / intermediate state / metabotropic | ||||||
機能・相同性 | ![]() G protein-coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration / G protein-coupled receptor dimeric complex / G protein-coupled receptor homodimeric complex / phospholipase C-activating G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential / adenylate cyclase inhibiting G protein-coupled glutamate receptor activity / cellular response to electrical stimulus / regulation of sensory perception of pain / L-glutamate import across plasma membrane / neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration ...G protein-coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration / G protein-coupled receptor dimeric complex / G protein-coupled receptor homodimeric complex / phospholipase C-activating G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential / adenylate cyclase inhibiting G protein-coupled glutamate receptor activity / cellular response to electrical stimulus / regulation of sensory perception of pain / L-glutamate import across plasma membrane / neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration / G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway / Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors) / glutamate receptor activity / Neurexins and neuroligins / regulation of synaptic transmission, glutamatergic / sensory perception of pain / locomotory behavior / G protein-coupled receptor activity / postsynaptic density membrane / Schaffer collateral - CA1 synapse / Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste / G alpha (q) signalling events / chemical synaptic transmission / positive regulation of MAPK cascade / G protein-coupled receptor signaling pathway / glutamatergic synapse / dendrite / nucleus / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.65 Å | ||||||
![]() | Zhang, J.Y. / Wu, L.J. / Luo, F. / Hua, T. / Liu, Z.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insights into the activation initiation of full-length mGlu1. 著者: Jinyi Zhang / Lu Qu / Lijie Wu / Xiaomeng Tang / Feng Luo / Weixiu Xu / Yueming Xu / Zhi-Jie Liu / Tian Hua / ![]() | ||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 314.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 263.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 93398.867 Da / 分子数: 2 / 変異: T363H, P369Q, P381E, H383F, L384P, L385Q, and P388S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q13255 #2: 抗体 | 分子量: 13354.672 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #3: 化合物 | ChemComp-QUS / ( | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: dimer of intermediate state / タイプ: CELL / Entity ID: #1-#2 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / C2レンズ絞り径: 50 µm |
撮影 | 電子線照射量: 1.33 e/Å2 / 検出モード: SUPER-RESOLUTION フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 3.65 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 58627 / 対称性のタイプ: POINT |