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- EMDB-7341: Conformation of methylated GGQ in the peptidyl transferase center... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-7341
タイトルConformation of methylated GGQ in the peptidyl transferase center during translation termination
マップデータnon-stop termination complex
試料
  • 複合体: nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2
    • 複合体: 50S subunit
      • 複合体: 50S ribosomal proteins
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L2
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L3
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        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L36
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      • 細胞器官・細胞要素: 23S rRNA
        • RNA: x 1種
      • 細胞器官・細胞要素: 5S rRNA
        • RNA: x 1種
    • 複合体: 30S subunit
      • 複合体: 30S ribosomal proteins
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          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S5
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          • タンパク質・ペプチド: x 1種
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        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S11
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S12
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
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          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S14
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        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S15
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        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S16
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S17
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S18
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S19
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S20
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S21
          • タンパク質・ペプチド: x 1種
      • 細胞器官・細胞要素: 16S rRNA
        • RNA: x 1種
    • 細胞器官・細胞要素: Peptide chain release factor 2
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 細胞器官・細胞要素: Alternative ribosome-rescue factor A
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 細胞器官・細胞要素: E-site or P-site tRNA fMet
      • RNA: x 1種
    • 細胞器官・細胞要素: nonstop mRNA
      • RNA: x 1種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


translation release factor activity, codon specific / negative regulation of cytoplasmic translational initiation / stringent response / ribosomal large subunit binding / ornithine decarboxylase inhibitor activity / transcription antitermination factor activity, RNA binding / misfolded RNA binding / Group I intron splicing / RNA folding / transcriptional attenuation ...translation release factor activity, codon specific / negative regulation of cytoplasmic translational initiation / stringent response / ribosomal large subunit binding / ornithine decarboxylase inhibitor activity / transcription antitermination factor activity, RNA binding / misfolded RNA binding / Group I intron splicing / RNA folding / transcriptional attenuation / endoribonuclease inhibitor activity / RNA-binding transcription regulator activity / positive regulation of ribosome biogenesis / negative regulation of cytoplasmic translation / four-way junction DNA binding / translational termination / translation repressor activity / negative regulation of translational initiation / regulation of mRNA stability / mRNA regulatory element binding translation repressor activity / rescue of stalled ribosome / ribosome assembly / positive regulation of RNA splicing / assembly of large subunit precursor of preribosome / transcription elongation factor complex / regulation of DNA-templated transcription elongation / cytosolic ribosome assembly / DNA endonuclease activity / response to reactive oxygen species / transcription antitermination / translational initiation / regulation of cell growth / DNA-templated transcription termination / maintenance of translational fidelity / response to radiation / mRNA 5'-UTR binding / ribosomal small subunit biogenesis / large ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome biogenesis / ribosome binding / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / ribosomal large subunit assembly / small ribosomal subunit / transferase activity / large ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / tRNA binding / molecular adaptor activity / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / viral translational frameshifting / translation / response to antibiotic / negative regulation of DNA-templated transcription / mRNA binding / DNA binding / RNA binding / zinc ion binding / membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Alternative ribosome-rescue factor A / Alternative ribosome-rescue factor A / Peptide chain release factor 2 / Peptide chain release factor / PCRF domain / PCRF / Peptide chain release factor class I superfamily / Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature. / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain ...Alternative ribosome-rescue factor A / Alternative ribosome-rescue factor A / Peptide chain release factor 2 / Peptide chain release factor / PCRF domain / PCRF / Peptide chain release factor class I superfamily / Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature. / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain / Ribosomal protein L10, eubacterial, conserved site / Ribosomal protein L10 signature. / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein S21, conserved site / Ribosomal protein S21 signature. / Ribosomal protein L25, short-form / Ribosomal protein S14, bacterial/plastid / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein L31 type A / Ribosomal protein S21 superfamily / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein S16, conserved site / Ribosomal protein S16 signature. / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / : / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L11, conserved site / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / : / : / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S4, bacterial-type
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Peptide chain release factor RF2 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein bL19 ...Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Peptide chain release factor RF2 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL36A / Large ribosomal subunit protein bL9 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Alternative ribosome-rescue factor A / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein bS21 / Large ribosomal subunit protein bL25
類似検索 - 構成要素
生物種Escherichia coli (大腸菌)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.24 Å
データ登録者Zeng F / Jin H
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01-GM120552 米国
引用ジャーナル: Sci Rep / 年: 2018
タイトル: Conformation of methylated GGQ in the Peptidyl Transferase Center during Translation Termination.
著者: Fuxing Zeng / Hong Jin /
要旨: The universally conserved Gly-Gly-Gln (GGQ) tripeptide in release factors or release factor-like surveillance proteins is required to catalyze the release of nascent peptide in the ribosome. The ...The universally conserved Gly-Gly-Gln (GGQ) tripeptide in release factors or release factor-like surveillance proteins is required to catalyze the release of nascent peptide in the ribosome. The glutamine of the GGQ is methylated post-translationally at the N position in vivo; this covalent modification is essential for optimal cell growth and efficient translation termination. However, the precise conformation of the methylated-GGQ tripeptide in the ribosome remains unknown. Using cryoEM and X-ray crystallography, we report the conformation of methylated-GGQ in the peptidyl transferase center of the ribosome during canonical translational termination and co-translation quality control. It has been suggested that the GGQ motif arose independently through convergent evolution among otherwise unrelated proteins that catalyze peptide release. The requirement for this tripeptide in the highly conserved peptidyl transferase center suggests that the conformation reported here is likely shared during termination of protein synthesis in all domains of life.
履歴
登録2018年1月12日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年2月21日-
マップ公開2018年2月21日-
更新2020年1月8日-
現状2020年1月8日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.06
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.06
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6c4i
  • 表面レベル: 0.06
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_7341.png

ダウンロードとリンク

-
マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_7341.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 216 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈non-stop termination complex
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.2 Å/pix.
x 384 pix.
= 460.8 Å		1.2 Å/pix.
x 384 pix.
= 460.8 Å		1.2 Å/pix.
x 384 pix.
= 460.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.2 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.06 / ムービー #1: 0.06
最小 - 最大-0.28294364 - 0.44829115
平均 (標準偏差)-0.00000127641 (±0.01619885)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ384384384
Spacing384384384
セルA=B=C: 460.80002 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.21.21.2
M x/y/z384384384
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z460.800460.800460.800
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ281156
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS384384384
D min/max/mean-0.2830.448-0.000

-
添付データ

-
ハーフマップ: non-stop termination complex, half map #1

ファイルemd_7341_half_map_1.map
注釈non-stop termination complex, half map #1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: non-stop termination complex, half map #2

ファイルemd_7341_half_map_2.map
注釈non-stop termination complex, half map #2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2

全体名称: nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2
要素
  • 複合体: nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2
    • 複合体: 50S subunit
      • 複合体: 50S ribosomal proteins
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L2
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L3
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L4
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L5
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L6
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L9
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L10
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L11
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L11
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L13
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L14
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L15
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L16
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L17
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L18
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L19
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L20
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L21
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L22
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L23
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L24
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L25
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L27
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L28
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L29
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L30
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L31
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L32
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L33
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L34
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L35
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
        • 細胞器官・細胞要素: 50S ribosomal protein L36
          • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
      • 細胞器官・細胞要素: 23S rRNA
        • RNA: 23S rRNA
      • 細胞器官・細胞要素: 5S rRNA
        • RNA: 5S rRNA
    • 複合体: 30S subunit
      • 複合体: 30S ribosomal proteins
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S2
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S3
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S4
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S5
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S6
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S7
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S8
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S9
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S10
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S11
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S12
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S13
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S14
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S15
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S16
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S17
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S18
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S19
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S20
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
        • 細胞器官・細胞要素: 30S ribosomal protein S21
          • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S21
      • 細胞器官・細胞要素: 16S rRNA
        • RNA: 16S rRNA
    • 細胞器官・細胞要素: Peptide chain release factor 2
      • タンパク質・ペプチド: Peptide chain release factor 2
    • 細胞器官・細胞要素: Alternative ribosome-rescue factor A
      • タンパク質・ペプチド: Alternative ribosome-rescue factor A
    • 細胞器官・細胞要素: E-site or P-site tRNA fMet
      • RNA: E-site or P-site tRNA fMet
    • 細胞器官・細胞要素: nonstop mRNA
      • RNA: mRNA
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: water

+
超分子 #1: nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2

超分子名称: nonstop ribosomal complex with ArfA/RF2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58

+
超分子 #2: 50S subunit

超分子名称: 50S subunit / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#33
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #3: 30S subunit

超分子名称: 30S subunit / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #34-#54
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #11: 30S ribosomal proteins

超分子名称: 30S ribosomal proteins / タイプ: complex / ID: 11 / 親要素: 3 / 含まれる分子: #35-#54
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #12: 50S ribosomal proteins

超分子名称: 50S ribosomal proteins / タイプ: complex / ID: 12 / 親要素: 2 / 含まれる分子: #3-#33
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #4: Peptide chain release factor 2

超分子名称: Peptide chain release factor 2 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #55
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #5: Alternative ribosome-rescue factor A

超分子名称: Alternative ribosome-rescue factor A / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #56
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #6: E-site or P-site tRNA fMet

超分子名称: E-site or P-site tRNA fMet / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #57
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #7: nonstop mRNA

超分子名称: nonstop mRNA / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 7 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #58
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #8: 23S rRNA

超分子名称: 23S rRNA / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 8 / 親要素: 2 / 含まれる分子: #1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #9: 5S rRNA

超分子名称: 5S rRNA / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 9 / 親要素: 2 / 含まれる分子: #2
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #10: 16S rRNA

超分子名称: 16S rRNA / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 10 / 親要素: 3 / 含まれる分子: #34
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #13: 50S ribosomal protein L2

超分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 13 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #3
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #14: 50S ribosomal protein L3

超分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 14 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #4
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #15: 50S ribosomal protein L4

超分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 15 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #5
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #16: 50S ribosomal protein L5

超分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 16 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #6
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #17: 50S ribosomal protein L6

超分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 17 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #7
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #18: 50S ribosomal protein L9

超分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 18 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #8
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #19: 50S ribosomal protein L10

超分子名称: 50S ribosomal protein L10 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 19 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #9
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #20: 50S ribosomal protein L11

超分子名称: 50S ribosomal protein L11 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 20 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #10
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #21: 50S ribosomal protein L13

超分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 21 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #11
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #22: 50S ribosomal protein L14

超分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 22 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #12
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #23: 50S ribosomal protein L15

超分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 23 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #13
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #24: 50S ribosomal protein L16

超分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 24 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #14
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #25: 50S ribosomal protein L17

超分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 25 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #15
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #26: 50S ribosomal protein L18

超分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 26 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #16
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #27: 50S ribosomal protein L19

超分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 27 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #17
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #28: 50S ribosomal protein L20

超分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 28 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #18
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #29: 50S ribosomal protein L21

超分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 29 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #19
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #30: 50S ribosomal protein L22

超分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 30 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #20
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #31: 50S ribosomal protein L23

超分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 31 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #21
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #32: 50S ribosomal protein L24

超分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 32 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #22
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #33: 50S ribosomal protein L25

超分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 33 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #23
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #34: 50S ribosomal protein L27

超分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 34 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #24
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #35: 50S ribosomal protein L28

超分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 35 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #25
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #36: 50S ribosomal protein L29

超分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 36 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #26
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #37: 50S ribosomal protein L30

超分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 37 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #27
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #38: 50S ribosomal protein L31

超分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 38 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #28
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #39: 50S ribosomal protein L32

超分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 39 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #29
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #40: 50S ribosomal protein L33

超分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 40 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #30
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #41: 50S ribosomal protein L34

超分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 41 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #31
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #42: 50S ribosomal protein L35

超分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 42 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #32
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #43: 50S ribosomal protein L36

超分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 43 / 親要素: 12 / 含まれる分子: #33
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #44: 30S ribosomal protein S2

超分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 44 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #35
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #45: 30S ribosomal protein S3

超分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 45 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #36
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #46: 30S ribosomal protein S4

超分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 46 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #37
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #47: 30S ribosomal protein S5

超分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 47 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #38
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #48: 30S ribosomal protein S6

超分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 48 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #39
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #49: 30S ribosomal protein S7

超分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 49 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #40
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #50: 30S ribosomal protein S8

超分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 50 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #41
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #51: 30S ribosomal protein S9

超分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 51 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #42
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #52: 30S ribosomal protein S10

超分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 52 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #43
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #53: 30S ribosomal protein S11

超分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 53 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #44
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #54: 30S ribosomal protein S12

超分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 54 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #45
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #55: 30S ribosomal protein S13

超分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 55 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #46
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #56: 30S ribosomal protein S14

超分子名称: 30S ribosomal protein S14 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 56 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #47
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #57: 30S ribosomal protein S15

超分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 57 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #48
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #58: 30S ribosomal protein S16

超分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 58 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #49
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #59: 30S ribosomal protein S17

超分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 59 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #50
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #60: 30S ribosomal protein S18

超分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 60 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #51
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #61: 30S ribosomal protein S19

超分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 61 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #52
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #62: 30S ribosomal protein S20

超分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 62 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #53
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #63: 30S ribosomal protein S21

超分子名称: 30S ribosomal protein S21 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 63 / 親要素: 11 / 含まれる分子: #54
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
分子 #1: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 941.832625 KDa
配列文字列: GGUUAAGCGA CUAAGCGUAC ACGGUGGAUG CCCUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAGGACGUG CUAAUCUGCG AUAAGCGUCG GUAAGGUGA UAUGAACCGU UAUAACCGGC GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGUGUGUUU CGACACACUA UCAUUAACUG A AUCCAUAG ...文字列:
GGUUAAGCGA CUAAGCGUAC ACGGUGGAUG CCCUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAGGACGUG CUAAUCUGCG AUAAGCGUCG GUAAGGUGA UAUGAACCGU UAUAACCGGC GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGUGUGUUU CGACACACUA UCAUUAACUG A AUCCAUAG GUUAAUGAGG CGAACCGGGG GAACUGAAAC AUCUAAGUAC CCCGAGGAAA AGAAAUCAAC CGAGAUUCCC CC AGUAGCG GCGAGCGAAC GGGGAGCAGC CCAGAGCCUG AAUCAGUGUG UGUGUUAGUG GAAGCGUCUG GAAAGGCGCG CGA UACAGG GUGACAGCCC CGUACACAAA AAUGCACAUG CUGUGAGCUC GAUGAGUAGG GCGGGACACG UGGUAUCCUG UCUG AAUAU GGGGGGACCA UCCUCCAAGG CUAAAUACUC CUGACUGACC GAUAGUGAAC CAGUACCGUG AGGGAAAGGC GAAAA GAAC CCCGGCGAGG GGAGUGAAAA AGAACCUGAA ACCGUGUACG UACAAGCAGU GGGAGCACGC UUAGGCGUGU GACUGC GUA CCUUUUGUAU AAUGGGUCAG CGACUUAUAU UCUGUAGCAA GGUUAACCGA AUAGGGGAGC CGAAGGGAAA CCGAGUC UU AACUGGGCGU UAAGUUGCAG GGUAUAGACC CGAAACCCGG UGAUCUAGCC AUGGGCAGGU UGAAGGUUGG GUAACACU A ACUGGAGGAC CGAACCGACU AAU(1MG)(PSU)(5MU)GAAA AAUUAGCGGA UGACUUGUGG CUGGGGGUGA AAGGCCA AU CAAACCGGGA GAUAGCUGGU UCUCCCCGAA AGCUAUUUAG GUAGCGCCUC GUGAAUUCAU CUCCGGGGGU AGAGCACU G UUUCGGCAAG GGGGUCAACC CGACUUACCA ACCCGAUGCA AACUGCGAAU ACCGGAGAAU GUUAUCACGG GAGACACAC GGCGGG(PSU)GCU AACGUCCGUC GUGAAGAGGG AAACAACCCA GACCGCCAGC UAAGGUCCCA AAGUCAUGGU UAAGUG GGA AACGAUGUGG GAAGGCCCAG ACAGCCAGGA UGUUGGCUUA GAAGCAGCCA UCAUUUAAAG AAAGCGUAAU AGCUCAC UG GUCGAGUCGG CCUGCGCGGA AGAUGUAACG GGGCUAAACC AUGCACCGAA GCUGCGGCAG CGACGCUUAU GCGUUGUU G GGUAGGGGAG CGUUCUGUAA GCCUGCGAAG GUGUGCUGUG AGGCAUGCUG GAGGUAUCAG AAGUGCGAAU GCUGACAUA AGUAACGAUA AAGCGGGUGA AAAGCCCGCU CGCCGGAAGA CCAAGGGUUC CUGUCCAACG UUAAUCGGGG CAGGGUGAGU CGACCCCUA AGGCGAGGCC GAAAGGCGUA GUCGAUGGGA AACAGGUUAA UAUUCCUGUA CUUGGUGUUA CUGCGAAGGG G GGACGGAG AAGGCUAUGU UGGCCGGGCG ACGGUUGUCC CGGUUUAAGC GUGUAGGCUG GUUUUCCAGG CAAAUCCGGA AA AUCAAGG CUGAGGCGUG AUGACGAGGC ACUACGGUGC UGAAGCAACA AAUGCCCUGC UUCCAGGAAA AGCCUCUAAG CAU CAGGUA ACAUCAAAUC GUACCCCAAA CCGACAC(6MZ)GG UGGUCAGGUA GAGAAUACCA AGGCGCUUGA GAGAACUCGG GUGAAGGAA CUAGGCAAAA UGGUGCCGUA ACUUCGGGAG AAGGCACGCU GAUAUGUAGG UGAGGUCCCU CGCGGAUGGA G CUGAAAUC AGUCGAAGAU ACCAGCUGGC UGCAACUGUU UAUUAAAAAC ACAGCACUGU GCAAACACGA AAGUGGACGU AU ACGGUGU GACGCCU(2MG)CC CGGUGCCGGA AGGUUAAUUG AUGGGGUUAG CGCAAGCGAA GCUCUUGAUC GAAGCCCCG GUAAACGGCG GCCG(PSU)AAC(3TD)A (PSU)AACGGUCCU AAGGUAGCGA AA(5MU)UCCUUGU CGGGUAAGUU CCGA C(5MC)UGC ACGAAUGGCG UAAUGAUGGC CAGGCUGUCU CCACCCGAGA CUCAGUGAAA UUGAACUCGC UGUG(6MZ)AG AU GCAGUGUACC CGCGGCAAGA CGGAAAGACC CCGU(G7M)AACCU UUACUAUAGC UUGACACUGA ACAUUGAGCC UUGA UGUGU AGGAUAGGUG GGAGGCUUUG AAGUGUGGAC GCCAGUCUGC AUGGAGCCGA CCUUGAAAUA CCACCCUUUA AUGUU UGAU GUUCUAACGU UGACCCGUAA UCCGGGUUGC GGACAGUGUC UGGUGGGUAG UUUGACUG(OMG)G GCGGUCUCCU CC UAAAGAG UAACGGAGGA GCACGAAGGU UGGCUAAUCC UGGUCGGACA UCAGGAGGUU AGUGCAAUGG CAUAAGCCAG CUU GACUGC GAGCGUGACG GCGCGAGCAG GUGCGAAAGC AGGUCAUAGU GAUCCGGUGG UUCUGAAUGG AAGGGCCAUC GCUC AACGG AUAAAAGGUA CUCCG(2MG)GGAU AACAGGC(PSU)GA UACCGCCCAA GAGUUCAUAU CGACGGCGGU GUUUGGC A(OMC) CUCG(2MA)(PSU)GUCG GCUCAUCACA UCCUGGGGCU GAAGUAGGUC CCAAGGGUAU GGC(OMU)GUUCGC CA UUUAAAG UGGUACGCGA GC(PSU)GGGUUUA GAACGUCGUG AGACAGU(PSU)CG GUCCCUAUCU GCCGUGGGCG CUGGA GAAC UGAGGGGGGC UGCUCCUAGU ACGAGAGGAC CGGAGUGGAC GCAUCACUGG UGUUCGGGUU GUCAUGCCAA UGGCAC UGC CCGGUAGCUA AAUGCGGAAG AGAUAAGUGC UGAAAGCAUC UAAGCACGAA ACUUGCCCCG AGAUGAGUUC UCCCUGA CC CUUUAAGGGU CCUGAAGGAA CGUUGAAGAC GACGACGUUG AUAGGCCGGG UGUGUAAGCG CAGCGAUGCG UUGAGCUA A CCGGUACUAA UGAACCGUGA GGCUUAACCU U

+
分子 #2: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 38.79009 KDa
配列文字列:
UGCCUGGCGG CCGUAGCGCG GUGGUCCCAC CUGACCCCAU GCCGAACUCA GAAGUGAAAC GCCGUAGCGC CGAUGGUAGU GUGGGGUCU CCCCAUGCGA GAGUAGGGAA CUGCCAGGCA U

+
分子 #34: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 34 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 497.404969 KDa
配列文字列: AAAUUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAACGGU AACAGGAAGA AGCUUGCUU CUUUGCUGAC GAGUGGCGGA CGGGUGAGUA AUGUCUGGGA AACUGCCUGA UGGAGGGGGA UAACUACUGG A AACGGUAG ...文字列:
AAAUUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAACGGU AACAGGAAGA AGCUUGCUU CUUUGCUGAC GAGUGGCGGA CGGGUGAGUA AUGUCUGGGA AACUGCCUGA UGGAGGGGGA UAACUACUGG A AACGGUAG CUAAUACCGC AUAACGUCGC AAGACCAAAG AGGGGGACCU UCGGGCCUCU UGCCAUCGGA UGUGCCCAGA UG GGAUUAG CUAGUAGGUG GGGUAACGGC UCACCUAGGC GACGAUCCCU AGCUGGUCUG AGAGGAUGAC CAGCCACACU GGA ACUGAG ACACGGUCCA GACUCCUACG GGAGGCAGCA GUGGGGAAUA UUGCACAAUG GGCGCAAGCC UGAUGCAGCC AUGC CGCGU GUAUGAAGAA GGCCUUCGGG UUGUAAAGUA CUUUCAGCGG GGAGGAAGGG AGUAAAGUUA AUACCUUUGC UCAUU GACG UUACCCGCAG AAGAAGCACC GGCUAACUCC G(PSU)GCCAGCAG CC(G7M)CGGUAAU ACGGAGGGUG CAAGCGUU A AUCGGAAUUA CUGGGCGUAA AGCGCACGCA GGCGGUUUGU UAAGUCAGAU GUGAAAUCCC CGGGCUCAAC CUGGGAACU GCAUCUGAUA CUGGCAAGCU UGAGUCUCGU AGAGGGGGGU AGAAUUCCAG GUGUAGCGGU GAAAUGCGUA GAGAUCUGGA GGAAUACCG GUGGCGAAGG CGGCCCCCUG GACGAAGACU GACGCUCAGG UGCGAAAGCG UGGGGAGCAA ACAGGAUUAG A UACCCUGG UAGUCCACGC CGUAAACGAU GUCGACUUGG AGGUUGUGCC CUUGAGGCGU GGCUUCCGGA GCUAACGCGU UA AGUCGAC CGCCUGGGGA GUACGGCCGC AAGGUUAAAA CUCAAAUGAA UUGACGGGGG CCCGCACAAG CGGUGGAGCA UGU GGUUUA AUUCGAU(2MG)(5MC)A ACGCGAAGAA CCUUACCUGG UCUUGACAUC CACGGAAGUU UUCAGAGAUG AGAAUG UGC CUUCGGGAAC CGUGAGACAG GUGCUGCAUG GCUGUCGUCA GCUCGUGUUG UGAAAUGUUG GGUUAAGUCC CGCAACG AG CGCAACCCUU AUCCUUUGUU GCCAGCGGUC CGGCCGGGAA CUCAAAGGAG ACUGCCAGUG AUAAACUGGA GGAAGGUG G GGAUGACGUC AAGUCAUCAU G(2MG)CCCUUACG ACCAGGGCUA CACACGUGCU ACAAUGGCGC AUACAAAGAG AAGCG ACCU CGCGAGAGCA AGCGGACCUC AUAAAGUGCG UCGUAGUCCG GAUUGGAGUC UGCAACUCGA CUCCAUGAAG UCGGAA UCG CUAGUAAUCG UGGAUCAGAA UGCCACGGUG AAUACGUUCC CGGGCCUUGU ACACACCG(4OC)C CGU(5MC)ACACC AUGGGAGUGG GUUGCAAAAG AAGUAGGUAG CUUAACCUUC GGGAGGGCGC UUACCACUUU GUGAUUCAUG ACUGGGGUGA AGUCG(UR3)AAC AAGGUAACCG UAGG(2MG)G(MA6)(MA6)CC UGCGGUUGGA UCA

+
分子 #57: E-site or P-site tRNA fMet

分子名称: E-site or P-site tRNA fMet / タイプ: rna / ID: 57 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 24.802785 KDa
配列文字列:
CGCGGGGUGG AGCAGCCUGG UAGCUCGUCG GGCUCAUAAC CCGAAGGUCG UCGGUUCAAA UCCGGCCCCC GCAACCA

+
分子 #58: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 58 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 5.922644 KDa
配列文字列:
GGCAAGGAGG UAAAAAUG

+
分子 #3: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 29.923619 KDa
配列文字列: MAVVKCKPTS PGRRHVVKVV NPELHKGKPF APLLEKNSKS GGRNNNGRIT TRHIGGGHKQ AYRIVDFKRN KDGIPAVVER LEYDPNRSA NIALVLYKDG ERRYILAPKG LKAGDQIQSG VDAAIKPGNT LPMRNIPVGS TVHNVEMKPG KGGQLARSAG T YVQIVARD ...文字列:
MAVVKCKPTS PGRRHVVKVV NPELHKGKPF APLLEKNSKS GGRNNNGRIT TRHIGGGHKQ AYRIVDFKRN KDGIPAVVER LEYDPNRSA NIALVLYKDG ERRYILAPKG LKAGDQIQSG VDAAIKPGNT LPMRNIPVGS TVHNVEMKPG KGGQLARSAG T YVQIVARD GAYVTLRLRS GEMRKVEADC RATLGEVGNA EHMLRVLGKA GAARWRGVRP TVRGTAMNPV DHPHGGGEGR NF GKHPVTP WGVQTKGKKT RSNKRTDKFI VRRRSK

+
分子 #4: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 22.277535 KDa
配列文字列: MIGLVGKKVG MTRIFTEDGV SIPVTVIEVE ANRVTQVKDL ANDGYRAIQV TTGAKKANRV TKPEAGHFAK AGVEAGRGLW EFRLAEGEE FTVGQSISVE LFADVKKVDV TGTSKGKGFA GTVKRWNFRT QDATHGNSLS HRVPGSIGQN QTPGKVFKGK K MAGQMGNE ...文字列:
MIGLVGKKVG MTRIFTEDGV SIPVTVIEVE ANRVTQVKDL ANDGYRAIQV TTGAKKANRV TKPEAGHFAK AGVEAGRGLW EFRLAEGEE FTVGQSISVE LFADVKKVDV TGTSKGKGFA GTVKRWNFRT QDATHGNSLS HRVPGSIGQN QTPGKVFKGK K MAGQMGNE RVTVQSLDVV RVDAERNLLL VKGAVPGATG SDLIVKPAVK A

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 22.121566 KDa
配列文字列: MELVLKDAQS ALTVSETTFG RDFNEALVHQ VVVAYAAGAR QGTRAQKTRA EVTGSGKKPW RQKGTGRARS GSIKSPIWRS GGVTFAARP QDHSQKVNKK MYRGALKSIL SELVRQDRLI VVEKFSVEAP KTKLLAQKLK DMALEDVLII TGELDENLFL A ARNLHKVD ...文字列:
MELVLKDAQS ALTVSETTFG RDFNEALVHQ VVVAYAAGAR QGTRAQKTRA EVTGSGKKPW RQKGTGRARS GSIKSPIWRS GGVTFAARP QDHSQKVNKK MYRGALKSIL SELVRQDRLI VVEKFSVEAP KTKLLAQKLK DMALEDVLII TGELDENLFL A ARNLHKVD VRDATGIDPV SLIAFDKVVM TADAVKQVEE MLA

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 20.073234 KDa
配列文字列:
AKLHDYYKDE VVKKLMTEFN YNSVMQVPRV EKITLNMGVG EAIADKKLLD NAAADLAAIS GQKPLITKAR KSVAGFKIRQ GYPIGCKVT LRGERMWEFF ERLITIAVPR IRDFRGLSAK SFDGRGNYSM GVREQIIFPE IDYDKVDRVR GLDITITTTA K SDEEGRAL LAAFDFPFR

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 18.932791 KDa
配列文字列:
MSRVAKAPVV VPAGVDVKIN GQVITIKGKN GELTRTLNDA VEVKHADNTL TFGPRDGYAD GWAQAGTARA LLNSMVIGVT EGFTKKLQL VGVGYRAAVK GNVINLSLGF SHPVDHQLPA GITAECPTQT EIVLKGADKQ VIGQVAADLR AYRRPEPYKG K GVRYADEV VRTKEAKKK

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L9

分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 15.78902 KDa
配列文字列:
MQVILLDKVA NLGSLGDQVN VKAGYARNFL VPQGKAVPAT KKNIEFFEAR RAELEAKLAE VLAAANARAE KINALETVTI ASKAGDEGK LFGSIGTRDI ADAVTAAGVE VAKSEVRLPN GVLRTTGEHE VSFQVHSEVF AKVIVNVVAE

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L10

分子名称: 50S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 17.736596 KDa
配列文字列:
MALNLQDKQA IVAEVSEVAK GALSAVVADS RGVTVDKMTE LRKAGREAGV YMRVVRNTLL RRAVEGTPFE CLKDAFVGPT LIAYSMEHP GAAARLFKEF AKANAKFEVK AAAFEGELIP ASQIDRLATL PTYEEAIARL MATMKEASAG KLVRTLAAVR D AKEAA

+
分子 #10: 50S ribosomal protein L11

分子名称: 50S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 14.894362 KDa
配列文字列:
MAKKVQAYVK LQVAAGMANP SPPVGPALGQ QGVNIMEFCK AFNAKTDSIE KGLPIPVVIT VYADRSFTFV TKTPPAAVLL KKAAGIKSG SGKPNKDKVG KISRAQLQEI AQTKAADMTG ADIEAMTRSI EGTARSMGLV VED

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 16.050606 KDa
配列文字列:
MKTFTAKPET VKRDWYVVDA TGKTLGRLAT ELARRLRGKH KAEYTPHVDT GDYIIVLNAD KVAVTGNKRT DKVYYHHTGH IGGIKQATF EEMIARRPER VIEIAVKGML PKGPLGRAMF RKLKVYAGNE HNHAAQQPQV LDI

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.565067 KDa
配列文字列:
MIQEQTMLNV ADNSGARRVM CIKVLGGSHR RYAGVGDIIK ITIKEAIPRG KVKKGDVLKA VVVRTKKGVR RPDGSVIRFD GNACVLLNN NSEQPIGTRI FGPVTRELRS EKFMKIISLA PEVL

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 15.008471 KDa
配列文字列:
MRLNTLSPAE GSKKAGKRLG RGIGSGLGKT GGRGHKGQKS RSGGGVRRGF EGGQMPLYRR LPKFGFTSRK AAITAEIRLS DLAKVEGGV VDLNTLKAAN IIGIQIEFAK VILAGEVTTP VTVRGLRVTK GARAAIEAAG GKIEE

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 15.312269 KDa
配列文字列:
MLQPKRTKFR KMHKGRNRGL AQGTDVSFGS FGLKAVGRGR LTARQIEAAR RAMTRAVKRQ GKIWIRVFPD KPITEKPLAV RMGKGKGNV EYWVALIQPG KVLYEMDGVP EELAREAFKL AAAKLPIKTT FVTKTVM

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 14.393657 KDa
配列文字列:
MRHRKSGRQL NRNSSHRQAM FRNMAGSLVR HEIIKTTLPK AKELRRVVEP LITLAKTDSV ANRRLAFART RDNEIVAKLF NELGPRFAS RAGGYTRILK CGFRAGDNAP MAYIELVDRS EKAEAAAE

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 12.794668 KDa
配列文字列:
MDKKSARIRR ATRARRKLQE LGATRLVVHR TPRHIYAQVI APNGSEVLVA ASTVEKAIAE QLKYTGNKDA AAAVGKAVAE RALEKGIKD VSFDRSGFQY HGRVQALADA AREAGLQF

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.159278 KDa
配列文字列:
MSNIIKQLEQ EQMKQDVPSF RPGDTVEVKV WVVEGSKKRL QAFEGVVIAI RNRGLHSAFT VRKISNGEGV ERVFQTHSPV VDSISVKRR GAVRKAKLYY LRERTGKAAR IKERLN

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.528024 KDa
配列文字列:
MARVKRGVIA RARHKKILKQ AKGYYGARSR VYRVAFQAVI KAGQYAYRDR RQRKRQFRQL WIARINAAAR QNGISYSKFI NGLKKASVE IDRKILADIA VFDKVAFTAL VEKAKAALA

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 11.586374 KDa
配列文字列:
MYAVFQSGGK QHRVSEGQTV RLEKLDIATG ETVEFAEVLM IANGEEVKIG VPFVDGGVIK AEVVAHGRGE KVKIVKFRRR KHYRKQQGH RQWFTDVKIT GISA

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 12.253359 KDa
配列文字列:
METIAKHRHA RSSAQKVRLV ADLIRGKKVS QALDILTYTN KKAAVLVKKV LESAIANAEH NDGADIDDLK VTKIFVDEGP SMKRIMPRA KGRADRILKR TSHITVVVSD R

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 11.22216 KDa
配列文字列:
MIREERLLKV LRAPHVSEKA STAMEKSNTI VLKVAKDATK AEIKAAVQKL FEVEVEVVNT LVVKGKVKRH GQRIGRRSDW KKAYVTLKE GQNLDFVGGA E

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 11.33925 KDa
配列文字列:
MAAKIRRDDE VIVLTGKDKG KRGKVKNVLS SGKVIVEGIN LVKKHQKPVP ALNQPGGIVE KEAAIQVSNV AIFNAATGKA DRVGFRFED GKKVRFFKSN SETIK

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 10.713465 KDa
配列文字列:
MFTINAEVRK EQGKGASRRL RAANKFPAII YGGKEAPLAI ELDHDKVMNM QAKAEFYSEV LTIVVDGKEI KVKAQDVQRH PYKPKLQHI DFVRA

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 9.14654 KDa
配列文字列:
MAHKKAGGST RNGRDSEAKR LGVKRFGGES VLAGSIIVRQ RGTKFHAGAN VGCGRDHTLF AKADGKVKFE VKGPKNRKFI SIEAE

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 9.027551 KDa
配列文字列:
MSRVCQVTGK RPVTGNNRSH ALNATKRRFL PNLHSHRFWV ESEKRFVTLR VSAKGMRVID KKGIDTVLAE LRARGEKY

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 7.286464 KDa
配列文字列:
MKAKELREKS VEELNTELLN LLREQFNLRM QAASGQLQQS HLLKQVRRDV ARVKTLLNEK AGA

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 6.55482 KDa
配列文字列:
MAKTIKITQT RSAIGRLPKH KATLLGLGLR RIGHTVERED TPAIRGMINA VSFMVKVEE

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L31

分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 7.887117 KDa
配列文字列:
MKKDIHPKYE EITASCSCGN VMKIRSTVGH DLNLDVCSKC HPFFTGKQRD VATGGRVDRF NKRFNIPGSK

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L32

分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 6.463445 KDa
配列文字列:
MAVQQNKPTR SKRGMRRSHD ALTAVTSLSV DKTSGEKHLR HHITADGYYR GRKVIAK

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 6.057179 KDa
配列文字列:
GIREKIKLVS SAGTGHFYTT TKNKRTKPEK LELKKFDPVV RQHVIYKEAK IK

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 5.397463 KDa
配列文字列:
MKRTFQPSVL KRNRSHGFRA RMATKNGRQV LARRRAKGRA RLTVSK

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 7.313032 KDa
配列文字列:
MPKIKTVRGA AKRFKKTGKG GFKHKHANLR HILTKKATKR KRHLRPKAMV SKGDLGLVIA CLPYA

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 4.37739 KDa
配列文字列:
MKVRASVKKL CRNCKIVKRD GVIRVICSAE PKHKQRQG

+
分子 #35: 30S ribosomal protein S2

分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 26.78167 KDa
配列文字列: MATVSMRDML KAGVHFGHQT RYWNPKMKPF IFGARNKVHI INLEKTVPMF NEALAELNKI ASRKGKILFV GTKRAASEAV KDAALSCDQ FFVNHRWLGG MLTNWKTVRQ SIKRLKDLET QSQDGTFDKL TKKEALMRTR ELEKLENSLG GIKDMGGLPD A LFVIDADH ...文字列:
MATVSMRDML KAGVHFGHQT RYWNPKMKPF IFGARNKVHI INLEKTVPMF NEALAELNKI ASRKGKILFV GTKRAASEAV KDAALSCDQ FFVNHRWLGG MLTNWKTVRQ SIKRLKDLET QSQDGTFDKL TKKEALMRTR ELEKLENSLG GIKDMGGLPD A LFVIDADH EHIAIKEANN LGIPVFAIVD TNSDPDGVDF VIPGNDDAIR AVTLYLGAVA ATVREGRSQD LASQAEESFV EA E

+
分子 #36: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 26.031316 KDa
配列文字列: MGQKVHPNGI RLGIVKPWNS TWFANTKEFA DNLDSDFKVR QYLTKELAKA SVSRIVIERP AKSIRVTIHT ARPGIVIGKK GEDVEKLRK VVADIAGVPA QINIAEVRKP ELDAKLVADS ITSQLERRVM FRRAMKRAVQ NAMRLGAKGI KVEVSGRLGG A EIARTEWY ...文字列:
MGQKVHPNGI RLGIVKPWNS TWFANTKEFA DNLDSDFKVR QYLTKELAKA SVSRIVIERP AKSIRVTIHT ARPGIVIGKK GEDVEKLRK VVADIAGVPA QINIAEVRKP ELDAKLVADS ITSQLERRVM FRRAMKRAVQ NAMRLGAKGI KVEVSGRLGG A EIARTEWY REGRVPLHTL RADIDYNTSE AHTTYGVIGV KVWIFKGEIL GGMAAVEQPE KPAAQPKKQQ RKGRK

+
分子 #37: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 23.514199 KDa
配列文字列: MARYLGPKLK LSRREGTDLF LKSGVRAIDT KCKIEQAPGQ HGARKPRLSD YGVQLREKQK VRRIYGVLER QFRNYYKEAA RLKGNTGEN LLALLEGRLD NVVYRMGFGA TRAEARQLVS HKAIMVNGRV VNIASYQVSP NDVVSIREKA KKQSRVKAAL E LAEQREKP ...文字列:
MARYLGPKLK LSRREGTDLF LKSGVRAIDT KCKIEQAPGQ HGARKPRLSD YGVQLREKQK VRRIYGVLER QFRNYYKEAA RLKGNTGEN LLALLEGRLD NVVYRMGFGA TRAEARQLVS HKAIMVNGRV VNIASYQVSP NDVVSIREKA KKQSRVKAAL E LAEQREKP TWLEVDAGKM EGTFKRKPER SDLSADINEH LIVELYSK

+
分子 #38: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 17.629398 KDa
配列文字列:
MAHIEKQAGE LQEKLIAVNR VSKTVKGGRI FSFTALTVVG DGNGRVGFGY GKAREVPAAI QKAMEKARRN MINVALNNGT LQHPVKGVH TGSRVFMQPA SEGTGIIAGG AMRAVLEVAG VHNVLAKAYG STNPINVVRA TIDGLENMNS PEMVAAKRGK S VEEILGK

+
分子 #39: 30S ribosomal protein S6

分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 15.727512 KDa
配列文字列:
MRHYEIVFMV HPDQSEQVPG MIERYTAAIT GAEGKIHRLE DWGRRQLAYP INKLHKAHYV LMNVEAPQEV IDELETTFRF NDAVIRSMV MRTKHAVTEA SPMVKAKDER RERRDDFANE TADDAEAGDS EEEEEE

+
分子 #40: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 20.055156 KDa
配列文字列:
MPRRRVIGQR KILPDPKFGS ELLAKFVNIL MVDGKKSTAE SIVYSALETL AQRSGKSELE AFEVALENVR PTVEVKSRRV GGSTYQVPV EVRPVRRNAL AMRWIVEAAR KRGDKSMALR LANELSDAAE NKGTAVKKRE DVHRMAEANK AFAHYRWLSL R SFSHQAGA SSKQPALGYL N

+
分子 #41: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 14.146557 KDa
配列文字列:
MSMQDPIADM LTRIRNGQAA NKAAVTMPSS KLKVAIANVL KEEGFIEDFK VEGDTKPELE LTLKYFQGKA VVESIQRVSR PGLRIYKRK DELPKVMAGL GIAVVSTSKG VMTDRAARQA GLGGEIICYV A

+
分子 #42: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 14.88627 KDa
配列文字列:
MAENQYYGTG RRKSSAARVF IKPGNGKIVI NQRSLEQYFG RETARMVVRQ PLELVDMVEK LDLYITVKGG GISGQAGAIR HGITRALME YDESLRSELR KAGFVTRDAR QVERKKVGLR KARRRPQFSK R

+
分子 #43: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 11.755597 KDa
配列文字列:
MQNQRIRIRL KAFDHRLIDQ ATAEIVETAK RTGAQVRGPI PLPTRKERFT VLISPHVNKD ARDQYEIRTH LRLVDIVEPT EKTVDALMR LDLAAGVDVQ ISLG

+
分子 #44: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.870975 KDa
配列文字列:
MAKAPIRARK RVRKQVSDGV AHIHASFNNT IVTITDRQGN ALGWATAGGS GFRGSRKSTP FAAQVAAERC ADAVKEYGIK NLEVMVKGP GPGRESTIRA LNAAGFRITN ITDVTPIPHN GCRPPKKRRV

+
分子 #45: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.814249 KDa
配列文字列:
MATVNQLVRK PRARKVAKSN VPALEACPQK RGVCTRVYTT TPKKPNSALR KVCRVRLTNG FEVTSYIGGE GHNLQEHSVI LIRGGRVK(0TD) LPGVRYHTVR GALDCSGVKD RKQARSKYGV KRPKA

+
分子 #46: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 13.128467 KDa
配列文字列:
MARIAGINIP DHKHAVIALT SIYGVGKTRS KAILAAAGIA EDVKISELSE GQIDTLRDEV AKFVVEGDLR REISMSIKRL MDLGCYRGL RHRRGLPVRG QRTKTNARTR KGPRKPIKK

+
分子 #47: 30S ribosomal protein S14

分子名称: 30S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 11.60656 KDa
配列文字列:
MAKQSMKARE VKRVALADKY FAKRAELKAI ISDVNASDED RWNAVLKLQT LPRDSSPSRQ RNRCRQTGRP HGFLRKFGLS RIKVREAAM RGEIPGLKKA SW

+
分子 #48: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 10.290816 KDa
配列文字列:
MSLSTEATAK IVSEFGRDAN DTGSTEVQVA LLTAQINHLQ GHFAEHKKDH HSRRGLLRMV SQRRKLLDYL KRKDVARYTQ LIERLGLRR

+
分子 #49: 30S ribosomal protein S16

分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 9.207572 KDa
配列文字列:
MVTIRLARHG AKKRPFYQVV VADSRNARNG RFIERVGFFN PIASEKEEGT RLDLDRIAHW VGQGATISDR VAALIKEVNK AA

+
分子 #50: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 9.724491 KDa
配列文字列:
MTDKIRTLQG RVVSDKMEKS IVVAIERFVK HPIYGKFIKR TTKLHVHDEN NECGIGDVVE IRECRPLSKT KSWTLVRVVE KAVL

+
分子 #51: 30S ribosomal protein S18

分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 7.734896 KDa
配列文字列:
FCRFTAEGVQ EIDYKDIATL KNYITESGKI VPSRITGTRA KYQRQLARAI KRARYLSLLP YTDRHQ

+
分子 #52: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 10.455355 KDa
配列文字列:
MPRSLKKGPF IDLHLLKKVE KAVESGDKKP LRTWSRRSTI FPNMIGLTIA VHNGRQHVPV FVTDEMVGHK LGEFAPTRTY RGHAADKKA KKK

+
分子 #53: 30S ribosomal protein S20

分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 9.708464 KDa
配列文字列:
MANIKSAKKR AIQSEKARKH NASRRSMMRT FIKKVYAAIE AGDKAAAQKA FNEMQPIVDR QAAKGLIHKN KAARHKANLT AQINKLA

+
分子 #54: 30S ribosomal protein S21

分子名称: 30S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 8.524039 KDa
配列文字列:
MPVIKVRENE PFDVALRRFK RSCEKAGVLA EVRRREFYEK PTTERKRAKA SAVKRHAKKL ARENARRTRL Y

+
分子 #55: Peptide chain release factor 2

分子名称: Peptide chain release factor 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 43.384945 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: AHHHHHHSAA LEVLFQGPGM FEINPVNNRI QDLTERSDVL RGYLDYDAKK ERLEEVNAEL EQPDVWNEPE RAQALGKERS SLEAVVDTL DQMKQGLEDV SGLLELAVEA DDEETFNEAV AELDALEEKL AQLEFRRMFS GEYDSADCYL DIQAGSGGTE A QDWASMLE ...文字列:
AHHHHHHSAA LEVLFQGPGM FEINPVNNRI QDLTERSDVL RGYLDYDAKK ERLEEVNAEL EQPDVWNEPE RAQALGKERS SLEAVVDTL DQMKQGLEDV SGLLELAVEA DDEETFNEAV AELDALEEKL AQLEFRRMFS GEYDSADCYL DIQAGSGGTE A QDWASMLE RMYLRWAESR GFKTEIIEES EGEVAGIKSV TIKISGDYAY GWLRTETGVH RLVRKSPFDS GGRRHTSFSS AF VYPEVDD DIDIEINPAD LRIDVYRTSG AGG(MEQ)HVNRTE SAVRITHIPT GIVTQCQNDR SQHKNKDQAM KQMKAKLYE LEMQKKNAEK QAMEDNKSDI GWGSQIRSYV LDDSRIKDLR TGVETRNTQA VLDGSLDQFI EASLKAGL

+
分子 #56: Alternative ribosome-rescue factor A

分子名称: Alternative ribosome-rescue factor A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 6.513396 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
GSMSRYQHTK GQIKDNAIEA LLHDPLFRQR VEKNKKGKGS YMRKGKHGNR GNWEASG

+
分子 #59: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 317 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #60: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #61: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMC8H18N2O4S4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid
15.0 mMMg(CH3COO)2magnesium acetate
150.0 mMCH3CO2Kpotassium acetate
4.0 mMHOCH2CH2SHbeta-mercapthoethanol
2.0 mMC7H19N3spermidine
0.05 mMC10H26N4spermin
グリッドモデル: C-flat-2/0.5 4C / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: Grids were blotted for 3.5 seconds..

-
電子顕微鏡法

顕微鏡JEOL 3200FS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 20.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系倍率（補正後）: 83822 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
試料ステージホルダー冷却材: NITROGEN

+
画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 4)
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

8505

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.24 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2) / 使用した粒子像数: 143372
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2)
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2)
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る