PDB-6u06: Discovery of Lysine-Targeted eIF4E Inhibitors through Covalent Docking

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6u06

タイトル

Discovery of Lysine-Targeted eIF4E Inhibitors through Covalent Docking

要素

Eukaryotic translation initiation factor 4E

キーワード

TRANSLATION / cap-binding site / anti-neoplastic / inhibitor / translation initiation blocking / TRANSLATION-INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S / Transport of the SLBP independent Mature mRNA / Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA / Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript / Deadenylation of mRNA / Translation initiation complex formation / Ribosomal scanning and start codon recognition / ISG15 antiviral mechanism / mTORC1-mediated signalling / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Mus musculus (ハツカネズミ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.96 Å

データ登録者

Wan, X.B. / Shoichet, B.K. / Taunton, J.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2020
タイトル: Discovery of Lysine-Targeted eIF4E Inhibitors through Covalent Docking.
著者: Wan, X. / Yang, T. / Cuesta, A. / Pang, X. / Balius, T.E. / Irwin, J.J. / Shoichet, B.K. / Taunton, J.

履歴

登録	2019年8月13日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2019年10月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年12月18日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.2	2020年3月11日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.3	2020年3月25日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.4	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.5	2024年10月23日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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PDB形式	pdb6u06.ent.gz	261.7 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6u06_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6u06_full_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u0/6u06 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u0/6u06	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6u09C 4dt6S S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5j5y-2 5m7x-2 5m7v-1 6gkk-1 5j5y-1 5j5o-1 5m7x-1 6gkj-2 5m7w-1 5m7v-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#230 - 2019年2月開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E) 類似性 (17)

登録構造単位

A: Eukaryotic translation initiation factor 4E

B: Eukaryotic translation initiation factor 4E

C: Eukaryotic translation initiation factor 4E

D: Eukaryotic translation initiation factor 4E

ヘテロ分子

90.6 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Eukaryotic translation initiation factor 4E

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
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2

B: Eukaryotic translation initiation factor 4E

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3

C: Eukaryotic translation initiation factor 4E

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4

D: Eukaryotic translation initiation factor 4E

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
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単位格子

Length a, b, c (Å)	38.110, 38.290, 146.820
Angle α, β, γ (deg.)	87.960, 94.870, 101.640
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1
Symmetry operation	#1: x,y,z

#1: タンパク質	Eukaryotic translation initiation factor 4E / mRNA cap-binding protein / eIF-4F 25 kDa subunit 分子量: 22145.113 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: covalent lysine inhibitor / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Eif4e / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63073
#2: 化合物	ChemComp-EI8 / 3-{[(4-cyanophenyl)methyl](1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-7-yl)sulfamoyl}benzene-1-sulfonyl fluoride 分子量: 497.519 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₃H₁₆FN₃O₅S₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 156 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.31 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.68 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: batch mode / pH: 7.2 / 詳細: HEPES, MPD, PEG 6K, NDSB-256

-
データ収集

回折	平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 8.3.1 / 波長: 1.11685 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 S 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年6月30日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.11685 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.78→146.21 Å / Num. obs: 55811 / % possible obs: 95.89 % / 冗長度: 2.8 % / CC_1/2: 0.988 / R_merge(I) obs: 0.106 / Net I/σ(I): 11.51
反射シェル	解像度: 1.78→1.86 Å / Num. unique obs: 5583 / CC_1/2: 0.467

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	phenix-1.13-2998	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4DT6

4dt6

解像度: 1.96→73.132 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 25.42

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2394	2721	4.88 %
R_work	0.1972	-	-
obs	0.1994	55775	95.87 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 133.65 Å² / B_iso mean: 53.4701 Å² / B_iso min: 16.19 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.96→73.132 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5929	0	132	156	6217
B_iso mean	-	-	70.73	41.73	-
残基数	-	-	-	-	728

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)	R_factor R_free error
1.96-1.9956	0.3017	129	0.2669	2822	95
1.9956-2.034	0.308	133	0.2546	2770	96	0
2.034-2.0756	0.3289	119	0.2568	2764	96	0
2.0756-2.1207	0.2933	158	0.2468	2820	94	0
2.1207-2.17	0.2888	127	0.2474	2774	97	0
2.17-2.2243	0.2914	129	0.228	2791	94	0
2.2243-2.2844	0.2629	165	0.2191	2770	96	0
2.2844-2.3517	0.2461	140	0.2163	2769	96	0
2.3517-2.4276	0.2898	132	0.2137	2769	95	0
2.4276-2.5143	0.2414	137	0.2093	2810	96	0
2.5143-2.615	0.2483	137	0.2169	2771	96	0
2.615-2.734	0.2798	163	0.2178	2826	96	0
2.734-2.8782	0.3004	125	0.2138	2828	98	0
2.8782-3.0585	0.2585	157	0.2066	2778	96	0
3.0585-3.2947	0.2441	173	0.2064	2766	96	0
3.2947-3.6262	0.2361	131	0.1919	2816	97	0
3.6262-4.1509	0.2236	154	0.1707	2824	96	0
4.1509-5.2295	0.2078	146	0.1586	2729	95	0
5.2295-73.132	0.1957	166	0.1807	2857	98	0

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.0488	-0.1914	1.2531	3.4057	-1.169	7.3255	0.4631	-0.3962	-0.331	-0.1852	-0.4273	-0.0446	1.0318	0.1849	-0.0025	0.2121	0.1423	-0.0544	0.4284	-0.0135	0.4169	14.2314	-22.0894	-7.6744
2	0.7999	-0.8621	0.1273	2.6271	-0.6804	1.5107	-0.2668	-0.1703	0.739	0.2767	0.3494	-0.2029	-0.4356	0.3599	-0.002	0.2518	-0.0528	-0.0261	0.1741	-0.0171	0.5651	-0.3079	3.472	-14.5752
3	0.4355	-1.1834	0.3638	5.3943	-2.6079	1.5786	-0.4768	-0.1126	1.1078	-0.1658	-0.0422	0.6516	-0.6892	-0.1343	0.0621	0.4366	-0.0147	-0.3037	0.3001	-0.0621	0.8596	4.235	1.3854	-13.726
4	2.0915	0.5913	0.8254	2.1381	-0.5852	2.6099	0.0015	-0.3629	0.3802	0.1597	-0.0954	-0.1334	-0.1953	-0.1751	0.1025	0.1707	-0.0042	-0.0333	0.244	-0.0193	0.2441	-0.9787	-9.0281	-10.6601
5	3.7131	-0.29	1.9532	2.647	-1.1746	5.7662	-0.2617	0.7359	0.7574	-0.577	0.3308	-0.1249	-0.9366	0.7605	0.1469	0.3394	-0.154	-0.0426	0.3995	0.1014	0.4299	8.8279	-1.0662	-26.3133
6	1.4592	0.2395	0.8317	1.6786	-0.3983	2.0162	-0.1892	0.1126	0.1386	-0.2508	0.125	0.2207	0.0816	-0.3728	0.0243	0.2023	-0.0451	-0.0432	0.2474	-0.0127	0.28	-6.8467	-13.2235	-20.959
7	2.5656	0.6652	-1.0222	1.7238	-0.0701	3.1132	-0.1984	0.4876	0.3711	-0.3356	0.177	-0.2031	-0.0616	0.0555	0.0362	0.2428	-0.0613	-0.0113	0.2928	0.0448	0.2674	0.8975	-8.9951	-26.788
8	0.3167	0.1196	-0.874	0.3599	-0.3826	2.5985	-0.1369	1.0924	-0.5436	-0.3779	-0.0409	0.0911	0.3541	-0.2024	0.1412	0.4204	-0.1266	-0.0199	0.4387	-0.112	0.304	-3.8466	-19.1367	-31.2012
9	4.2733	0.7865	0.0632	0.4406	0.1776	3.0557	-0.3864	0.7037	0.539	-0.8135	0.0496	0.0585	-0.5336	-0.7145	0.1312	0.5468	-0.1132	-0.1271	0.6188	0.0676	0.3708	-2.5135	-5.9201	-36.1005
10	3.4551	-0.2483	-0.6461	4.43	0.774	6.8617	-0.3876	0.0646	-0.0524	-0.4745	0.5753	-0.4952	0.3281	1.0461	-0.1692	0.3821	0.0563	-0.013	0.3063	-0.1164	0.4236	-0.3257	-38.0987	-69.1534
11	0.5905	0.2739	-0.7179	0.4912	0.192	1.4754	0.4098	0.2528	-0.546	-0.1936	-0.3171	1.0342	0.2997	-0.6172	0.1074	0.2735	-0.0261	-0.0779	0.3417	-0.0579	0.6301	-28.2019	-28.7999	-62.2538
12	9.1661	-1.2842	-3.6132	0.3082	0.5056	1.5498	-0.1369	-0.502	0.3334	0.1727	-0.4355	1.3635	-0.1202	-0.7286	0.1615	0.2923	-0.1103	-0.0694	0.2775	-0.4767	0.8689	-24.9376	-33.3292	-63.2852
13	2.2098	0.3509	-0.5066	2.0348	0.1063	3.0705	-0.0317	0.1754	-0.0248	0.0054	-0.0154	0.1198	-0.0942	-0.2492	0.1068	0.2325	0.0185	0.0026	0.1847	-0.0411	0.2463	-16.1028	-25.8314	-66.2136
14	2.4482	0.4584	-2.1646	1.1805	1.0707	5.4109	-0.0496	0.0237	-0.2554	0.7236	-0.0059	0.1474	0.6004	-0.1972	0.1055	0.5262	-0.0742	0.0792	0.1917	-0.0356	0.342	-22.2129	-37.1388	-50.4871
15	0.68	-0.8082	-0.0649	1.1981	-0.4399	1.0958	0.0258	-0.1269	0.2511	0.0724	-0.0388	0.2019	-0.1908	-0.1698	-0.0439	0.4669	0.0093	-0.025	0.1721	-0.048	0.3769	-17.731	-13.8716	-53.7549
16	1.4178	-0.2909	-0.08	1.2959	0.3619	2.2459	-0.0396	-0.2492	-0.0038	0.164	0.1336	-0.0622	0.0544	0.1478	0.0324	0.2533	-0.0072	-0.0248	0.1884	-0.0152	0.3055	-10.3971	-26.5699	-55.2292
17	2.3344	-1.1836	1.1776	2.5071	-0.9684	2.8255	-0.134	-0.2257	0.1046	0.9395	0.0404	0.2798	-0.0775	-0.4156	-0.0414	0.4363	-0.0092	0.032	0.196	-0.0214	0.3218	-19.3499	-25.2551	-48.9222
18	0.1268	-0.1535	0.7707	0.7479	-1.3749	4.8029	-0.0019	-0.6213	0.2467	0.6515	0.1953	-0.5016	0.0467	0.3795	0.1318	0.4549	0.0094	-0.0998	0.391	-0.0245	0.3294	-6.4354	-24.9719	-45.1193
19	1.7287	0.9848	-0.6562	3.0747	-0.198	4.1346	0.056	-0.2662	0.1996	0.6348	-0.1174	0.2822	-0.0837	-0.367	-0.0963	0.5109	0.0064	0.0257	0.2727	-0.0345	0.2704	-16.1619	-21.2643	-42.808
20	3.8939	-0.7824	-1.0178	4.4946	-0.9153	9.2784	0.2433	-0.9241	0.4506	0.3153	-0.1783	-0.4269	-1.6044	-0.1915	0.0401	0.3383	0.0412	-0.0319	0.5707	-0.1074	0.3254	-4.0788	-3.9576	0.2918
21	4.0085	3.0027	1.7332	7.9775	1.839	1.9041	0.1786	0.0178	-1.1343	0.5897	0.5339	-0.187	0.5454	-0.0798	-0.1707	0.3475	0.0083	-0.0335	0.7202	0.2859	0.7172	-19.2972	-30.8735	8.2817
22	2.7522	0.8798	-0.0587	1.9054	0.0127	1.7409	-0.1089	-0.5508	-0.4048	-0.1057	0.0925	0.0018	0.1568	-0.0605	-0.0517	0.2241	0.0208	0.0102	0.6126	0.0864	0.3308	-18.7506	-18.8527	4.1476
23	0.2736	0.4378	-0.5262	1.154	0.4194	4.3202	0.3138	-1.21	-0.7943	0.5963	-0.0116	-0.0872	0.5448	-0.0233	-0.312	0.3211	0.0538	-0.2322	1.6889	0.4696	0.3022	-10.4296	-25.324	20.1825
24	0.2199	-0.6017	-0.0379	1.8546	-0.1661	0.3339	0.1003	-0.6855	-0.1464	0.1472	0.0227	0.7741	-0.0268	-0.2517	0.0801	-0.0615	-0.0129	0.1604	1.6165	0.2367	0.4294	-31.7738	-16.4891	16.6351
25	0.5696	-0.4907	0.4121	2.2717	0.1777	2.6602	0.2236	-1.426	-0.129	0.5477	-0.1023	0.3049	-0.0985	0.0905	-0.0765	0.369	-0.0271	0.0421	1.1446	0.0788	0.2583	-19.3019	-14.7347	17.0219
26	0.4805	-0.0947	0.5696	1.2607	0.2133	1.425	-0.132	-1.0617	0.3245	0.733	0.089	0.0384	0.0898	0.0831	-0.0893	0.691	-0.0567	0.0604	1.3666	-0.0306	0.3052	-22.5517	-11.9038	25.999
27	3.6635	-0.3668	-0.4437	4.2506	0.1759	6.3623	-0.3936	-0.1463	-0.1899	-0.5217	-0.281	0.008	-0.437	-1.3991	0.0883	0.5049	0.1188	-0.0853	0.4546	-0.0887	0.3173	-20.6946	-22.6794	-77.9011
28	3.8303	1.8438	0.0257	3.4191	0.1317	-0.0248	0.2628	-0.0811	0.0752	-0.1482	-0.1893	-0.7378	0.0509	0.309	0.0022	0.5131	0.0191	0.1529	0.4306	-0.0157	0.5351	1.668	-3.5192	-85.0012
29	1.119	-0.0513	0.185	1.4072	-0.0341	2.4376	0.1364	-0.0022	0.1275	-0.3749	-0.0196	-0.5143	-0.0809	0.181	-0.0871	0.4952	0.071	0.1297	0.2317	0.0056	0.3708	-9.6612	-6.4364	-80.9365
30	1.0814	0.1434	-0.594	1.2224	-1.52	4.2945	0.1839	0.7355	-0.0433	-0.7033	0.1331	-0.6732	0.5618	0.8596	0.0022	0.8256	0.1563	0.2634	0.62	0.0001	0.4771	-1.3682	-12.9917	-96.7125
31	1.3641	-0.4699	-0.1885	1.719	1.4051	1.1696	-0.005	0.3128	0.732	-0.3951	-0.1722	0.0197	-0.4139	-0.0253	0.1109	1.2238	0.1589	0.0864	0.3751	0.0898	0.564	-14.6358	6.2274	-93.1698
32	1.7227	-0.339	0.1925	0.1996	0.5393	2.3835	-0.0396	0.5457	0.3363	-1.056	0.1656	0.1156	0.06	-0.0771	-0.1379	0.8527	0.0961	0.1002	0.359	0.0235	0.2547	-13.7431	-6.6446	-93.8413
33	0.0721	-0.0542	-0.1645	0.3037	1.0043	3.3449	-0.174	0.5855	0.3142	-0.8524	0.4049	0.1106	-0.5754	-0.3773	-0.0994	0.8035	0.1131	0.0031	0.7115	0.032	0.3182	-20.2513	-8.6092	-102.3247
34	2.7303	-1.6233	-0.7207	1.8244	1.6476	2.108	0.4038	1.7851	1.1693	-0.9531	0.0187	-0.4258	-0.5698	0.0879	-0.2376	1.0406	0.1458	0.13	0.8505	0.2113	0.4237	-12.8258	-1.172	-104.343

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 30 through 42 )	A	30 - 42
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 43 through 55 )	A	43 - 55
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 56 through 66 )	A	56 - 66
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 67 through 95 )	A	67 - 95
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 96 through 110 )	A	96 - 110
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 111 through 142 )	A	111 - 142
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 143 through 172 )	A	143 - 172
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 173 through 194 )	A	173 - 194
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 195 through 217 )	A	195 - 217
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 30 through 42 )	B	30 - 42
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 43 through 55 )	B	43 - 55
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 56 through 66 )	B	56 - 66
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 67 through 95 )	B	67 - 95
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 96 through 110 )	B	96 - 110
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 111 through 125 )	B	111 - 125
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 126 through 156 )	B	126 - 156
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 157 through 172 )	B	157 - 172
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 173 through 186 )	B	173 - 186
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resid 187 through 217 )	B	187 - 217
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 28 through 42 )	C	28 - 42
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 43 through 59 )	C	43 - 59
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 60 through 95 )	C	60 - 95
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 96 through 110 )	C	96 - 110
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 111 through 125 )	C	111 - 125
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 126 through 172 )	C	126 - 172
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 173 through 217 )	C	173 - 217
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 30 through 42 )	D	30 - 42
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 43 through 59 )	D	43 - 59
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 60 through 95 )	D	60 - 95
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 96 through 110 )	D	96 - 110
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 111 through 125 )	D	111 - 125
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 126 through 172 )	D	126 - 172
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 173 through 186 )	D	173 - 186
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 187 through 217 )	D	187 - 217

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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