ChemComp-5SP: 5-O-phosphono-D-xylulose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 5SP
• 名称: 名称: 5-O-phosphono-D-xylulose / 別称: D-xylulose 5-phosphate / 日化辞名称: D-キシルロ-ス5-りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₁O₈P / 原子数: 25 / 化学式量: 230.11 / 形式電荷: 0

その他

3lqu

タイプ: saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: 5SP / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3LQU

履歴

作成	2010年3月12日
Modify synonyms	2010年10月28日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(OCC(O)C(O)C(=O)CO)(O)O
• CACTVS 3.370: OCC(=O)[CH](O)[CH](O)CO[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: C(C(C(C(=O)CO)O)O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: OCC(=O)[C@@H](O)[C@H](O)CO[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: C([C@H]([C@@H](C(=O)CO)O)O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H11O8P/c6-1-3(7)5(9)4(8)2-13-14(10,11)12/h4-6,8-9H,1-2H2,(H2,10,11,12)/t4-,5-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FNZLKVNUWIIPSJ-RFZPGFLSSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5-O-phosphono-D-xylulose
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: [(2R,3S)-2,3,5-trihydroxy-4-oxo-pentyl] dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-3lqu:
Crystal structure of 3,4-Dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase complexed with Ribulose-5 phosphate

PDB-3ovr:
Crystal Structure of hRPE and D-Xylulose 5-Phosphate Complex

PDB-5i5e:
Crystal Structure of Transketolase mutants-H66/261C complex with xylulose-5-phoaphate from Pichia Stipitis

PDB-6tj9:
Escherichia coli transketolase in complex with cofactor analog 2'-methoxythiamine and substrate xylulose 5-phosphate

PDB-7uf2:
RibB from Vibrio cholera bound with D-xylulose-5-phosphate (D-Xy5P) and manganese