ChemComp-5BU: 5-BROMO-URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 5BU
• 名称: 名称: 5-bromo-uridine-5'-monophosphate / 日化辞名称: 5-ブロモ-5′-ウリジル酸

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₂BrN₂O₉P / 原子数: 34 / 化学式量: 403.077 / 形式電荷: 0

その他

1jzv

U

タイプ: RNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: U / 3文字コード: 5BU / モデル座標のPDB-ID: 1JZV / 親要素: U

履歴

作成	2003年11月5日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / Brenda / ChEBI / ChEMBL / ChemicalBook / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: BrC=1C(=O)NC(=O)N(C=1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: O[CH]1[CH](O)[CH](O[CH]1CO[P](O)(O)=O)N2C=C(Br)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(C(=O)NC(=O)N1C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)O)Br

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(O)=O)N2C=C(Br)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(C(=O)NC(=O)N1[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O)Br

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H12BrN2O9P/c10-3-1-12(9(16)11-7(3)15)8-6(14)5(13)4(21-8)2-20-22(17,18)19/h1,4-6,8,13-14H,2H2,(H,11,15,16)(H2,17,18,19)/t4-,5-,6-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: IDPVUMJNEZFMNU-UAKXSSHOSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5-bromouridine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(5-bromo-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-2qcg:
Crystal structure of the orotidine-5'-monophosphate decarboxylase domain of human UMP synthase bound to 5-bromo-UMP

PDB-4p5a:
Crystal structure of a UMP/dUMP methylase PolB from Streptomyces cacaoi bound with 5-Br UMP