登録情報 | データベース: PDB / ID: 4zqt |
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タイトル | Crystal structure of PfA-M1 with virtual ligand inhibitor |
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要素 | M1 family aminopeptidase |
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE inhibitor / aminopeptidase / hydrolase / HYDROLASE-HYDROLASE inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
symbiont-containing vacuole membrane / vacuolar lumen / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; アミノペプチターゼ / food vacuole / dipeptidase activity / metalloaminopeptidase activity / aminopeptidase activity / chloroplast / proteolysis / zinc ion binding ...symbiont-containing vacuole membrane / vacuolar lumen / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; アミノペプチターゼ / food vacuole / dipeptidase activity / metalloaminopeptidase activity / aminopeptidase activity / chloroplast / proteolysis / zinc ion binding / membrane / nucleus / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal domain / Aminopeptidase N, middle-beta domain / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, Ig-like fold / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal domain superfamily / Alanyl aminopeptidase, Ig-like domain superfamily / Domain of unknown function (DUF3458) Ig-like fold / Domain of unknown function (DUF3458_C) ARM repeats / Zincin-like fold ...Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal domain / Aminopeptidase N, middle-beta domain / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, Ig-like fold / Peptidase M1, alanyl aminopeptidase, C-terminal domain superfamily / Alanyl aminopeptidase, Ig-like domain superfamily / Domain of unknown function (DUF3458) Ig-like fold / Domain of unknown function (DUF3458_C) ARM repeats / Zincin-like fold / Zincin-like - #30 / Zincin-like / tricorn interacting facor f3 domain / Aminopeptidase N-like , N-terminal domain / Peptidase M1, alanine aminopeptidase/leukotriene A4 hydrolase / Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase / Peptidase family M1 domain / Peptidase M1 N-terminal domain / Aminopeptidase N-like , N-terminal domain superfamliy / Neutral Protease Domain 2 / Neutral Protease; domain 2 / Peptidase M4/M1, CTD superfamily / Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region signature. / Alpha Horseshoe / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-4QP / Aminopeptidase N / Aminopeptidase N類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_eukaryote.gif) Plasmodium falciparum 3D7 (マラリア病原虫) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.981 Å |
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データ登録者 | Ruggeri, C. / Drinkwater, N. / McGowan, S. |
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資金援助 | オーストラリア, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Health and Medical Research Council (NHMRC, Australia) | 1063786 | オーストラリア | Australian Research Council (ARC) | 100100690 | オーストラリア |
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引用 | ジャーナル: Plos One / 年: 2015 タイトル: Identification and Validation of a Potent Dual Inhibitor of the P. falciparum M1 and M17 Aminopeptidases Using Virtual Screening. 著者: Ruggeri, C. / Drinkwater, N. / Sivaraman, K.K. / Bamert, R.S. / McGowan, S. / Paiardini, A. |
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履歴 | 登録 | 2015年5月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2015年10月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations カテゴリ: diffrn_source / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.2 | 2018年1月17日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.3 | 2020年1月1日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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