ChemComp-4Y3: [[(2S,5R)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 4Y3
• 名称: 名称: [[(2S,5R)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate; 日化辞名称: β-L-FddC-TP

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₅FN₃O₁₂P₃ / 原子数: 43 / 化学式量: 469.148 / 形式電荷: 0

その他

5c53

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 4Y3 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5C53

履歴

作成	2015年6月19日
公開	2016年1月27日

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詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: NC1=NC(=O)N(C=C1F)[CH]2CC[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: C1CC(OC1COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N2C=C(C(=NC2=O)N)F

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=NC(=O)N(C=C1F)[C@H]2CC[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: C1C[C@@H](O[C@@H]1COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N2C=C(C(=NC2=O)N)F

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H15FN3O12P3/c10-6-3-13(9(14)12-8(6)11)7-2-1-5(23-7)4-22-27(18,19)25-28(20,21)24-26(15,16)17/h3,5,7H,1-2,4H2,(H,18,19)(H,20,21)(H2,11,12,14)(H2,15,16,17)/t5-,7+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ARRTZUVEPRJLPK-CAHLUQPWSA-N

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 1.9.2: [[(2S,5R)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-5c53:
Probing the Structural and Molecular Basis of Nucleotide Selectivity by Human Mitochondrial DNA Polymerase gamma