登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fhd |
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タイトル | Spore photoproduct lyase complexed with dinucleoside spore photoproduct |
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要素 | Spore photoproduct lyase |
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キーワード | LYASE / partial TIM-barrel / DNA repair / damaged DNA |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA photolyase activity / endospore-forming forespore / S-adenosyl-L-methionine binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Rossmann fold - #12110 / pyruvate-formate lyase- activating enzyme - #30 / Spore photoproduct lyase / Spore photoproduct lyase, Bacilli type / : / Spore photoproduct lyase / pyruvate-formate lyase- activating enzyme / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Alpha-Beta Horseshoe ...Rossmann fold - #12110 / pyruvate-formate lyase- activating enzyme - #30 / Spore photoproduct lyase / Spore photoproduct lyase, Bacilli type / : / Spore photoproduct lyase / pyruvate-formate lyase- activating enzyme / Radical SAM core domain profile. / Radical SAM / Alpha-Beta Horseshoe / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-0TT / Chem-EEM / PYROPHOSPHATE 2- / IRON/SULFUR CLUSTER / Spore photoproduct lyase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Geobacillus thermodenitrificans (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Benjdia, A. / Heil, K. / Barends, T.R.M. / Carell, T. / Schlichting, I. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2012 タイトル: Structural insights into recognition and repair of UV-DNA damage by Spore Photoproduct Lyase, a radical SAM enzyme. 著者: Benjdia, A. / Heil, K. / Barends, T.R. / Carell, T. / Schlichting, I. |
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履歴 | 登録 | 2012年6月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年7月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2012年10月31日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2012年11月21日 | Group: Non-polymer description |
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改定 1.3 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.4 | 2024年4月3日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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