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- EMDB-4300: Structure of a prehandover mammalian ribosomal SRP and SRP recept... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4300
タイトルStructure of a prehandover mammalian ribosomal SRP and SRP receptor targeting complex
マップデータ
試料
  • 複合体: Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor
    • 複合体: Ribosome
      • RNA: x 4種
      • タンパク質・ペプチド: x 45種
    • 複合体: SRP
      • RNA: x 1種
      • タンパク質・ペプチド: x 6種
    • 複合体: SRP receptor
      • タンパク質・ペプチド: x 2種
    • 複合体: Signal sequence
  • リガンド: x 4種
機能・相同性
機能・相同性情報


SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / signal recognition particle receptor complex / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition / signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting / endoplasmic reticulum signal peptide binding / granulocyte differentiation / signal recognition particle binding / signal-recognition-particle GTPase / negative regulation of translational elongation / protein targeting to ER ...SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / signal recognition particle receptor complex / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition / signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting / endoplasmic reticulum signal peptide binding / granulocyte differentiation / signal recognition particle binding / signal-recognition-particle GTPase / negative regulation of translational elongation / protein targeting to ER / 7S RNA binding / exocrine pancreas development / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation / cytoplasmic microtubule / vesicle-mediated transport / neutrophil chemotaxis / intracellular protein transport / GDP binding / nuclear speck / GTPase activity / endoplasmic reticulum membrane / nucleolus / GTP binding / Golgi apparatus / endoplasmic reticulum / ATP hydrolysis activity / nucleoplasm / nucleus / cytosol
類似検索 - 分子機能
Signal recognition particle receptor, alpha subunit, N-terminal / Signal recognition particle, alpha subunit, N-terminal / Signal recognition particle, SRP72 subunit, RNA-binding / Signal recognition particle receptor, beta subunit / Signal recognition particle, SRP72 subunit / Putative TPR-like repeat / SRP72 RNA-binding domain / Signal recognition particle receptor beta subunit / Putative TPR-like repeat / Signal recognition particle, SRP9 subunit ...Signal recognition particle receptor, alpha subunit, N-terminal / Signal recognition particle, alpha subunit, N-terminal / Signal recognition particle, SRP72 subunit, RNA-binding / Signal recognition particle receptor, beta subunit / Signal recognition particle, SRP72 subunit / Putative TPR-like repeat / SRP72 RNA-binding domain / Signal recognition particle receptor beta subunit / Putative TPR-like repeat / Signal recognition particle, SRP9 subunit / SRP9 domain / Signal recognition particle SRP9 / Signal recognition particle 9 kDa protein (SRP9) / Signal recognition particle, SRP14 subunit / Signal recognition particle, SRP9/SRP14 subunit / Signal recognition particle 14kD protein / Signal recognition particle subunit SRP68 / Signal recognition particle subunit SRP68, RNA-binding domain / SRP68, N-terminal domain superfamily / RNA-binding signal recognition particle 68 / Signal recognition particle, SRP54 subunit, eukaryotic / Signal recognition particle, SRP19 subunit / Signal recognition particle, subunit SRP19-like superfamily / SRP19 protein / SRP/SRP receptor, N-terminal / Signal recognition particle, SRP54 subunit / Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain / Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain superfamily / Signal peptide binding domain / SRP54-type proteins GTP-binding domain signature. / Small GTPase superfamily, ARF type / Signal recognition particle SRP54, helical bundle / Signal recognition particle SRP54, N-terminal domain superfamily / SRP54-type protein, helical bundle domain / SRP54-type protein, helical bundle domain / Signal recognition particle, SRP54 subunit, GTPase domain / SRP54-type protein, GTPase domain / SRP54-type protein, GTPase domain / small GTPase Arf family profile. / Longin-like domain superfamily / Tetratricopeptide repeat / TPR repeat region circular profile. / TPR repeat profile. / Tetratricopeptide repeats / Tetratricopeptide repeat / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
Signal recognition particle receptor subunit beta / SRP receptor subunit alpha / Signal recognition particle 19 kDa protein / Signal recognition particle 14 kDa protein / Signal recognition particle 9 kDa protein / Signal recognition particle subunit SRP72 / Signal recognition particle subunit SRP54 / Signal recognition particle subunit SRP68
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Canis lupus familiaris (イヌ) / Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / Rabbit (ウサギ) / Dog (イヌ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.7 Å
データ登録者Kobayashi K / Jomaa A / Ban N
引用ジャーナル: Science / 年: 2018
タイトル: Structure of a prehandover mammalian ribosomal SRP·SRP receptor targeting complex.
著者: Kan Kobayashi / Ahmad Jomaa / Jae Ho Lee / Sowmya Chandrasekar / Daniel Boehringer / Shu-Ou Shan / Nenad Ban /
要旨: Signal recognition particle (SRP) targets proteins to the endoplasmic reticulum (ER). SRP recognizes the ribosome synthesizing a signal sequence and delivers it to the SRP receptor (SR) on the ER ...Signal recognition particle (SRP) targets proteins to the endoplasmic reticulum (ER). SRP recognizes the ribosome synthesizing a signal sequence and delivers it to the SRP receptor (SR) on the ER membrane followed by the transfer of the signal sequence to the translocon. Here, we present the cryo-electron microscopy structure of the mammalian translating ribosome in complex with SRP and SR in a conformation preceding signal sequence handover. The structure visualizes all eukaryotic-specific SRP and SR proteins and reveals their roles in stabilizing this conformation by forming a large protein assembly at the distal site of SRP RNA. We provide biochemical evidence that the guanosine triphosphate hydrolysis of SRP·SR is delayed at this stage, possibly to provide a time window for signal sequence handover to the translocon.
履歴
登録2018年2月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年3月28日-
マップ公開2018年3月28日-
更新2018年5月2日-
現状2018年5月2日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.064
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.064
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-6frk
  • 表面レベル: 0.064
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  • 単純化した表面モデル + あてはめた原子モデル
  • 原子モデルPDB-6frk
  • Jmolによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4300.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4300.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.39 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.064 / ムービー #1: 0.064
最小 - 最大-0.30947837 - 0.50414824
平均 (標準偏差)0.0016471847 (±0.0280388)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 444.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.391.391.39
M x/y/z320320320
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z444.800444.800444.800
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS320320320
D min/max/mean-0.3090.5040.002

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添付データ

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_4300_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #2

ファイルemd_4300_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor

全体名称: Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor
要素
  • 複合体: Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor
    • 複合体: Ribosome
      • RNA: tRNA
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL28
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L12
      • RNA: 28S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: 60S acidic ribosomal protein P0
      • RNA: 5S ribosomal RNA
      • RNA: 5.8S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L8
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL3
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL4
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL18
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL6
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL30
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL8
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL6
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL16
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL5
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL13
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL14
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL13
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL22
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL18
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL19
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL20
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL21
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL22
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L23
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL24
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL23
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL24
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL15
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL30
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL31
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL32
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL33
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL34
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein uL29
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL36
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL38
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL39
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL40
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL41
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL42
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein eL43
      • タンパク質・ペプチド: Signal sequence
    • 複合体: SRP
      • RNA: Canis lupus familiaris RNA, 7SL, cytoplasmic 1 (RN7SL1), SRP RNA
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle subunit SRP19
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle subunit SRP72,Signal recognition particle subunit SRP72,Signal recognition particle subunit SRP72
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle subunit SRP68
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 9 kDa protein
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 54 kDa protein
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 14 kDa protein
    • 複合体: SRP receptor
      • タンパク質・ペプチド: SRP receptor beta subunit
      • タンパク質・ペプチド: SRP receptor alpha subunit
    • 複合体: Signal sequence
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

+
超分子 #1: Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor

超分子名称: Translating ribosome bound to SRP and SRP receptor / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58

+
超分子 #2: Ribosome

超分子名称: Ribosome / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2-#49, #52
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

+
超分子 #3: SRP

超分子名称: SRP / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1, #50-#51, #53, #55-#56, #58
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)

+
超分子 #4: SRP receptor

超分子名称: SRP receptor / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #54, #57
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #5: Signal sequence

超分子名称: Signal sequence / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #52
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

+
分子 #1: Canis lupus familiaris RNA, 7SL, cytoplasmic 1 (RN7SL1), SRP RNA

分子名称: Canis lupus familiaris RNA, 7SL, cytoplasmic 1 (RN7SL1), SRP RNA
タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 96.826289 KDa
配列文字列: GCCGGGCGCG GUGGCGCGCG CCUGUAGUCC CAGCUACUCG GGAGGCUGAG GCAGGAGGAU CGCUUGAGCC CAGGAGUUCU GGGCUGCAG UGCGCUAUGC CGAUCGGGUG UCCGCACUAA GUUCGGCAUC AAUAUGGUGA CCUCCCGGGA GCGGGGGACC A CCAGGUUG ...文字列:
GCCGGGCGCG GUGGCGCGCG CCUGUAGUCC CAGCUACUCG GGAGGCUGAG GCAGGAGGAU CGCUUGAGCC CAGGAGUUCU GGGCUGCAG UGCGCUAUGC CGAUCGGGUG UCCGCACUAA GUUCGGCAUC AAUAUGGUGA CCUCCCGGGA GCGGGGGACC A CCAGGUUG CCUAAGGAGG GGUGAACCGG CCCAGGUCGG AAACGGAGCA GGUCAAAACU CCCGUGCUGA UCAGUAGUGG GA UCGCGCC UGUGAAUAGC CACUGCACUC CAGCCUGGGC AACAUAGCGA GACCCCGUCU CU

+
分子 #2: tRNA

分子名称: tRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.437535 KDa
配列文字列:
GUUUCCGUAG UGUAGUGGUU AUCACGUUCG CCUAACACGC GAAAGGUCCC CGGUUCGAAA CCGGGCGGAA ACACCA

+
分子 #5: 28S ribosomal RNA

分子名称: 28S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.185357625 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAG AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGACA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAG AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGACA UGUGGCGUAC G GAAGACCC GCUCCCCGGC GCCGCUCGUG GGGGGCCCAA GUCCUUCUGA UCGAGGCCCA GCCCGUGGAC GGUGUGAGGC CG GUAGCGG CCCCCGGCGC GCCGGGCCCG GGUCUUCCCG GAGUCGGGUU GCUUGGGAAU GCAGCCCAAA GCGGGUGGUA AAC UCCAUC UAAGGCUAAA UACCGGCACG AGACCGAUAG UCAACAAGUA CCGUAAGGGA AAGUUGAAAA GAACUUUGAA GAGA GAGUU CAAGAGGGCG UGAAACCGUU AAGAGGUAAA CGGGUGGGGU CCGCGCAGUC CGCCCGGAGG AUUCAACCCG GCGGC GGGU CCGGCCGUGU CGGCGGCCCG GCGGAUCUUU CCCGCGCGGG GGACCGUCCC CCGACCGGCG ACCGGCCGCC GCCGGG CGC AUUUCCACCG CGGCGGUGCG CCGCGACCGG CUCCGGGACG GCUGGGAAGG CCCGGCGGGG AAGGUGGCUC GGCCGAG UG UUACAGCCCC CCCGGCAGCA GCACUCGCCG AAUCCCGGGG CCGAGGGAGC GAGACCCGUC GCCGCGCUCU CCCCCCUC C CGGCGCCGCC GGGGGGGGCC GGGCCACCCC UCCCACGGCG CGACCGCUCG GGGCGGACUG UCCCCAGUGC GCCCCGGGC GGGUCGCGCC GUCGGGCCCG GGGGAGGGGC CACGCGCGCG UCCCCCGAAG AGGGGGACGG CGGAGCGAGC GCACGGGGUC GGCGGCGAC GUCGGCUACC CACCCGACCC GUCUUGAAAC ACGGACCAAG GAGUCUAACA CGUGCGCGAG UCGGGGGCUC G CACGAAAG CCGCCGUGGC GCAAUGAAGG UGAAGGCCGG CGCGCUCGCC GGCCGAGGUG GGAUCCCGAG GCCUCUCCAG UC CGCCGAG GGCGCACCAC CGGCCCGUCU CGCCCGCCGC GCCGGGGAGG UGGAGCACGA GCGCACGUGU UAGGACCCGA AAG AUGGUG AACUAUGCCU GGGCAGGGCG AAGCCAGAGG AAACUCUGGU GGAGGUCCGU AGCGGUCCUG ACGUGCAAAU CGGU CGUCC GACCUGGGUA UAGGGGCGAA AGACUAAUCG AACCAUCUAG UAGCUGGUUC CCUCCGAAGU UUCCCUCAGG AUAGC UGGC GCUCUCGCAC ACGCAGUUUU AUCCGGUAAA GCGAAUGAUU AGAGGUCUUG GGGCCGAAAC GAUCUCAACC UAUUCU CAA ACUUUAAAUG GGUAAGAAGC CCGGCUCGCU GGCGUGAGCC GGGCGUGGAA UGGAGUGCCU AGUGGGCCAC UUUUGGU AA GCAGAACUGG CGCUGCGGGA UGAACCGAAC GCCGGGUUAA GGCGCCCGAU GCCGACGCUC AUCAGACCCC AGAAAAGG U GUUGGUUGAU AUAGACAGCA GGACGGUGGC CAUGGAAGUC GGAAUCCGCU AAGGAGUGUG UAACAACUCA CCUGCCGAA UCAACUAGCC CUGAAAAUGG AUGGCGCUGG AGCGUCGGGC CCAUACCCGG CCGUCGCCGG CAGUCGAGAG UGGACGGGAG CGGCGGGGG CGGCGCGCGC GCGCGCCCGC CCCCGGAGCC CCGCGGACGC UACGCCGCGA CGAGUAGGAG GGCCGCUGCG G UGAGCCUU GAAGCCUAGG GCGCGGGCCC GGGUGGAGCC GCCGCAGGUG CAGAUCUUGG UGGUAGUAGC AAAUAUUCAA AC GAGAACU UUGAAGGCCG AAGUGGAGAA GGGUUCCAUG UGAACAGCAG UUGAACAUGG GUCAGUCGGU CCUGAGAGAU GGG CGAGCG CCGUUCCGAA GGGACGGGCG AUGGCCUCCG UUGCCCUCGG CCGAUCGAAA GGGAGUCGGG UUCAGAUCCC CGAA UCCGG AGUGGCGGAG AUGGGCGCCG CGAGGCGUCC AGUGCGGUAA CGCGACCGAU CCCGGAGAAG CCGGCGGGAG CCCCG GGGA GAGUUCUCUU UUCUUUGUGA AGGGCAGGGC GCCCUGGAAU GGGUUCGCCC CGAGAGAGGG GCCCGUGCCU UGGAAA GCG UCGCGGUUCC GGCGGCGUCC GGUGAGCUCU CGCUGGCCCU UGAAAAUCCG GGGGAGAGGG UGUAAAUCUC GCGCCGG GC CGUACCCAUA UCCGCAGCAG GUCUCCAAGG UGAACAGCCU CUGGCAUGUU GGAACAAUGU AGGUAAGGGA AGUCGGCA A GCCGGAUCCG UAACUUCGGG AUAAGGAUUG GCUCUAAGGG CUGGGUCGGU CGUCGGCCGG CGCCUAGCAG CCGACUUAG AACUGGUGCG GACCAGGGGA AUCCGACUGU UUAAUUAAAA CAAAGCAUCG CGAAGGCCCG CGGCGGGUGU UGACGCGAUG UGAUUUCUG CCCAGUGCUC UGAAUGUCAA AGUGAAGAAA UUCAAUGAAG CGCGGGUAAA CGGCGGGAGU AACUAUGACU C UCUUAAGG UAGCCAAAUG CCUCGUCAUC UAAUUAGUGA CGCGCAUGAA UGGAUGAACG AGAUUCCCAC UGUCCCUACC UA CUAUCCA GCGAAACCAC AGCCAAGGGA ACGGGCUUGG CGGAAUCAGC GGGGAAAGAA GACCCUGUUG AGCUUGACUC UAG UCUGGC ACGGUGAAGA GACAUGUUUU UUCACUGACC CGGUGAGGCG GGGGGGCGAG CCCCGAGGGG CUCUCGCUUC UGGC GCCAA GCGCCCGGCC GCGCGCCGGC CGGGCGCGAC CCGCUCCGGG GACAGUGCCA GGUGGGGAGU UUGACUGGGG CGGUA CACC UGUCAAACGG UAACGCAGGU GUCCUAAGGC GAGCUCAGGG AGGACAGAAA CCUCCCGUGG AGCAGAAGGG CAAAAG CUC GCUUGAUCUU GAUUUUCAGU ACGAAUACAG ACCGUGAAAG CGGGGCCUCA CGAUCCUUCU GACCUUUUGG GUUUUAA GC AGGAGGUGUC AGAAAAGUUA CCACAGGGAU AACUGGCUUG UGGCGGCCAA GCGUUCAUAG CGACGUCGCU UUUUGAUC C UUCGAUGUCG GCUCUUCCUA UCAUUGUGAA GCAGAAUUCA CCAAGCGUUG GAUUGUUCAC CCACUAAUAG GGAACGUGA GCUGGGUUUA GACCGUCGUG AGACAGGUUA GUUUUACCCU ACUGAUGAUG UGUUGUUGCC AUGGUAAUCC UGCUCAGUAC GAGAGGAAC CGCAGGUUCA GACAUUUGGU GUAUGUGCUU GGCUGAGGAG CCAAUGGGGC GAAGCUACCA UCUGUGGGAU U AUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCCAGGCG GAACGAUACG GCAGCGCCGC GGAGCCUCGG UUGGCCUCGG AU AGCCGGU CCCCCGCGGG GUCCGGUGCG GAGUGCCCUU CGUCCUGGGA AACGGGGCGC GGCCGGAGAG GCGGCCGCCC CCU CGCCCG UCACGCACGC CGUUCGUGGG GAACCUGGCG CUAAACCAUU CGUAGACGAC CUGCUUCUGG GUCGGGGUUU CGUA CGUAG CAGAGCAGCU CGCUGCGAUC UAUUGAAAGU CAGCCCUCGA CACAAGGGUU UGU

+
分子 #7: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

+
分子 #8: 5.8S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 50.143648 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGA CACAUUGAU CAUCGACACU UCGAACGCAC UUGCGGCCCC GGGUUCCUCC CGGGGCUACG CCUGUCUGAG CGUCGCU

+
分子 #3: Ribosomal protein eL28

分子名称: Ribosomal protein eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.301777 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHHKTVGV EPAADGKGVV VVIKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYRPDLRMAA IRRASAILRS QKPVMV

+
分子 #4: Ribosomal protein L12

分子名称: Ribosomal protein L12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.689461 KDa
配列文字列:
MPPKFDPNEI KVVYLRCTGG EVGATSALAP KIGPLGLSPK KVGDDIAKAT GDWKGLRITV KLTIQNRQAQ IEVVPSASAL IIKALKEPP RDRKKQKNIK HSGNITFDEI VNIARQMRHR SLARELSGTI KEILGTAQSV GCNVDGRHPH DIIDDINSGA V ECP

+
分子 #6: 60S acidic ribosomal protein P0

分子名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 22.21784 KDa
配列文字列: DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLR ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA ...文字列:
DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLR ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA TLLNMLNISP FSFGLVIQQV FDNGSIYNPE VLDI

+
分子 #9: Ribosomal protein L8

分子名称: Ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.570105 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGR

+
分子 #10: Ribosomal protein uL3

分子名称: Ribosomal protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 44.759359 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDSSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMIVVGIV GYVETPRGLR TFKTIFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDA AGAAALAADF SSMKAYCQVI R VIAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDSSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMIVVGIV GYVETPRGLR TFKTIFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDA AGAAALAADF SSMKAYCQVI R VIAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVNQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKD

+
分子 #11: Ribosomal protein uL4

分子名称: Ribosomal protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 41.635141 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVES Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVES Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCI IYNEDNGIIK AFRNIPGITL LNVSKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDELYGTWR KAATLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYAKTMRR NTILRQARNH KIRMDKAAAA AAALKAKSGE K

+
分子 #12: Ribosomal protein uL18

分子名称: Ribosomal protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 33.942223 KDa
配列文字列: FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG ...文字列:
FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIL GQNVADYMRY LIEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKK EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQERA

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分子 #13: Ribosomal protein eL6

分子名称: Ribosomal protein eL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.052178 KDa
配列文字列: PHCSRNPVLV RGIGRYSRSA MYSRMAMYKR KYSAAVLATV TKPVGGDKNG GTRVVKLRKM PRYYPTEDVP RKLLSHGKKP FSKHVRKLR ASITPGTILI ILTGRHRGKR VIFLKQLSSG LLLVTGPLVL NRVPLRRTHQ KFVIATSTKI DISGVKIPKH L TDAYFKKK ...文字列:
PHCSRNPVLV RGIGRYSRSA MYSRMAMYKR KYSAAVLATV TKPVGGDKNG GTRVVKLRKM PRYYPTEDVP RKLLSHGKKP FSKHVRKLR ASITPGTILI ILTGRHRGKR VIFLKQLSSG LLLVTGPLVL NRVPLRRTHQ KFVIATSTKI DISGVKIPKH L TDAYFKKK KLRKPRHQEG EIFDTEKEKY EISEQRKVDQ KAVDSQILRR IKAVPQLQGY LRSVFALTNG IYPHKLVF

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分子 #14: Ribosomal protein uL30

分子名称: Ribosomal protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.590725 KDa
配列文字列: NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN ALIARSLGKY G IICMEDLI ...文字列:
NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN ALIARSLGKY G IICMEDLI HEIYTVGKRF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGG DAGNREDQIN RLIRRMN

+
分子 #15: Ribosomal protein eL8

分子名称: Ribosomal protein eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.258246 KDa
配列文字列: KVVNLLFEKR PKNFGIGQDI QPKRDLTRFV KWPRYIRLQR QRAILYKRLK VPPTINQFTQ ALDRQTATQL LKLTHKYRPE TKQEKKQRL LARAEKKAAG KGDVPTKRPP VLRAGVNTVT TLVENKKAQL VVIAHDVDPI ELVVFLPALC RKMGVPYCII K GKARLGRL ...文字列:
KVVNLLFEKR PKNFGIGQDI QPKRDLTRFV KWPRYIRLQR QRAILYKRLK VPPTINQFTQ ALDRQTATQL LKLTHKYRPE TKQEKKQRL LARAEKKAAG KGDVPTKRPP VLRAGVNTVT TLVENKKAQL VVIAHDVDPI ELVVFLPALC RKMGVPYCII K GKARLGRL VHRKTCTTVA FTQVNSEDKG ALAKLVEAIR TNYNDRYNEI RRHWGGNVLG PKSVARITKL EKAKAKELAT

+
分子 #16: Ribosomal protein uL6

分子名称: Ribosomal protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.655268 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDITL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELILEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDITL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELILEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

+
分子 #17: Ribosomal protein uL16

分子名称: Ribosomal protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.465791 KDa
配列文字列: GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLGGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG RDGFHMRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNEEHVIE ALRRAKFKFP G RQKIHISK ...文字列:
GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLGGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG RDGFHMRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNEEHVIE ALRRAKFKFP G RQKIHISK KWGFTKFNAD EFENMVAKKC LIPDGCGVKY VPNHGPLDKW RVLHS

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分子 #18: Ribosomal protein uL5

分子名称: Ribosomal protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 19.359393 KDa
配列文字列:
ENPMRELRIR KLCLNICVGE SGDRLTRAAK VLEQLTGQTP VFSKARYTVR SFGIRRNEKI AVHCTVRGAK AEEILEKGLK VREYELRKN NFSDTGNFGF GIQEHIDLGI KYDPSIGIYG LDFYVVLGRP GFSIADKKRR TGCIGAKHRI SKEEAMRWFQ Q KHDGIILP GN

+
分子 #19: Ribosomal protein eL13

分子名称: Ribosomal protein eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.234566 KDa
配列文字列: APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA KARRIAPRPA SGPLRPVVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKCTESL QANVQRLKEY RSKLILFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV Y KREKARVI ...文字列:
APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA KARRIAPRPA SGPLRPVVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKCTESL QANVQRLKEY RSKLILFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV Y KREKARVI TDEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

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分子 #20: Ribosomal protein eL14

分子名称: Ribosomal protein eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.129309 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTQVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INAKWAATR WAKKIEAREK KAKMTDFDRY KVMKARKMRN RLIKLEVKKL QKAALLKAS

+
分子 #21: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

+
分子 #22: Ribosomal protein uL13

分子名称: Ribosomal protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.43509 KDa
配列文字列: EGQVLVLDGR GHLLGRLAAI VAKQVLLGRK VVVVRCEGIN ISGNFYRNKL KYLAFLRKRM NTNPSRGPYH FRAPSRIFWR TVRGMLPHK TKRGQAALDR LKVFDGIPPP YDKKKRMVVP AALKVVRLKP TRKFAYLGRL AHEVGWKYQA VTATLEEKRK E KAKIHYRK ...文字列:
EGQVLVLDGR GHLLGRLAAI VAKQVLLGRK VVVVRCEGIN ISGNFYRNKL KYLAFLRKRM NTNPSRGPYH FRAPSRIFWR TVRGMLPHK TKRGQAALDR LKVFDGIPPP YDKKKRMVVP AALKVVRLKP TRKFAYLGRL AHEVGWKYQA VTATLEEKRK E KAKIHYRK KKQLMRLRKQ AEKNVEKKID RFTEVLKTHG FLV

+
分子 #23: Ribosomal protein uL22

分子名称: Ribosomal protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.757627 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLQKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #24: Ribosomal protein eL18

分子名称: Ribosomal protein eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.457391 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGREGKTAV VVGTITDDV RVQEVPKLKV CALRVSSRAR SRILKAGGKI LTFDQLALDS PKGCGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

+
分子 #25: Ribosomal protein eL19

分子名称: Ribosomal protein eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #26: Ribosomal protein eL20

分子名称: Ribosomal protein eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 20.696363 KDa
配列文字列:
KASGTLREYK VVGRCLPTPK CRTPPLYRMR IFAPNHVVAK SRFWYFVSQL KKMKKSSGEI VYCGQVFEKS PLRVKNFGIW LRYDSRSGT HNMYREYRDL TTAGAVTQCY RDMGARHRAR AHSIQIMKVE EIAASKCRRP AVKQFHDSKI KFPLPHRVLR R QHKPRFTT KRPNTFF

+
分子 #27: Ribosomal protein eL21

分子名称: Ribosomal protein eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

+
分子 #28: Ribosomal protein eL22

分子名称: Ribosomal protein eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.481249 KDa
配列文字列:
QVLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVTIERS KSKITVTSEV PFSKRYLKYL TKKYLKKNNL RDWLRVVAN SKESYELRYF

+
分子 #29: Ribosomal protein L23

分子名称: Ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

+
分子 #30: Ribosomal protein eL24

分子名称: Ribosomal protein eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.512774 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQ

+
分子 #31: Ribosomal protein uL23

分子名称: Ribosomal protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.85636 KDa
配列文字列:
KKIRTSPTFR RPKTLRLRRQ PKYPRKSAPR RNKLDHYAII KFPLTTESAM KKIEDNNTLV FIVDVKANKH QIKQAVKKLY DIDVAKVNT LIRPDGEKKA YVRLAPDYDA LDVANKIGII

+
分子 #32: Ribosomal protein uL24

分子名称: Ribosomal protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

+
分子 #34: Ribosomal protein uL15

分子名称: Ribosomal protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.503391 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRINA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.722283 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMSARAEA IKALV

+
分子 #36: Ribosomal protein eL30

分子名称: Ribosomal protein eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.496355 KDa
配列文字列:
SINSRLQLVM KSGKYVLGYK QTLKMIRQGK AKLVILANNC PALRKSEIEY YAMLAKTGVH HYSGNNIELG TACGKYYRVC TLAIIDPGD SDIIR

+
分子 #37: Ribosomal protein eL31

分子名称: Ribosomal protein eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

+
分子 #38: Ribosomal protein eL32

分子名称: Ribosomal protein eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

+
分子 #39: Ribosomal protein eL33

分子名称: Ribosomal protein eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.433548 KDa
配列文字列:
SGRLWSKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #40: Ribosomal protein eL34

分子名称: Ribosomal protein eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #41: Ribosomal protein uL29

分子名称: Ribosomal protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.460454 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL EDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE NLKTKKQQRK ERLYPLRKFA VKA

+
分子 #42: Ribosomal protein eL36

分子名称: Ribosomal protein eL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.915396 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SNVLAAMRKA AAK

+
分子 #43: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.102944 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG ITPKPK

+
分子 #44: Ribosomal protein eL38

分子名称: Ribosomal protein eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #45: Ribosomal protein eL39

分子名称: Ribosomal protein eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.295562 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIRMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #46: Ribosomal protein eL40

分子名称: Ribosomal protein eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.199574 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC RKCYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK VK

+
分子 #47: Ribosomal protein eL41

分子名称: Ribosomal protein eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.213075 KDa
配列文字列:
RAKWRKKRMR RLKRKRRKMR QRS

+
分子 #48: Ribosomal protein eL42

分子名称: Ribosomal protein eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.198603 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVIQ

+
分子 #49: Ribosomal protein eL43

分子名称: Ribosomal protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #50: Signal recognition particle subunit SRP19

分子名称: Signal recognition particle subunit SRP19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 12.159153 KDa
配列文字列:
DRFICIYPAY LNNKKTIAEG RRIPISKAVE NPTATEIQDV CSAVGLNVFL EKNKMYSREW NRDVQYRGRV RVQLKQEDGS LCLVQFPSR KSVMLYAAEM IPKLKT

+
分子 #51: Signal recognition particle subunit SRP72,Signal recognition part...

分子名称: Signal recognition particle subunit SRP72,Signal recognition particle subunit SRP72,Signal recognition particle subunit SRP72
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 67.314922 KDa
配列文字列: MASGGSGGVS VPALWSEVNR YGQNGDFTRA LKTVNKILQI NKDDVTALHC KVVCLIQNGS FKEALNVINT HTKVLANNSL SFEKAYCEY RLNRIENALK TIESANQQTD KLKELYGQVL YRLERYDECL AVYRDLVRNS QDDYDEERKT NLSAVVAAQS N WEKVVPEN ...文字列:
MASGGSGGVS VPALWSEVNR YGQNGDFTRA LKTVNKILQI NKDDVTALHC KVVCLIQNGS FKEALNVINT HTKVLANNSL SFEKAYCEY RLNRIENALK TIESANQQTD KLKELYGQVL YRLERYDECL AVYRDLVRNS QDDYDEERKT NLSAVVAAQS N WEKVVPEN LGLQEGTHEL CYNAACALIG QGQLSQAMKI LQKAEDLCRR SLSEDSDGTE EDPQAELAII HGQMAYILQL QG RTEEALQ LYNQIIKLKP TDVGLLAVIA NNIITINKDQ NVFDSKKKVK LTNAEGVEFK LSKKQLQAIE FNKALLAMYT NQA EQCRKI SASLQSQSPE HLLPVLIQAA QLCREKQHTK AIELLQEFSD QHPENAAEIK LTMAQLKISQ GNISKACLIL RSIE ELKHK PGMVSALVTM YSHEEDIDSA IEVFTQAIQW YQNHQPKSSA HLSLIREAAN FKLKYGRKKE AISDLEQLWK QNPKD IHTL AQLISAYSLV DPEKAKALSK HLPSSDSMSL KVDVEALENS PGATYIRKKG GKVAGDSQPK EQGQGDLKKK KKKKKG KLP KNYDPKVTPD PERWLPMR(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #52: Signal sequence

分子名称: Signal sequence / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
分子量理論値: 1.262751 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
LLLLLLLLLL L

+
分子 #53: Signal recognition particle subunit SRP68

分子名称: Signal recognition particle subunit SRP68 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 65.569984 KDa
配列文字列: LSLEILQIIK ESQQQHGLRH GDFQRYRGYC SRRQRRLRKT LNFKMGNRHK FTGKKVTEDL LTDNRYLLLV LMDAERAWSY AMQLKQEAN TEPRKRFHLL SRLRKAVKHA EELERLCESN RVDAKTKLEA QAYTAYLSGM LRFEHQEWKA AIEAFNKCKT I YEKLASAF ...文字列:
LSLEILQIIK ESQQQHGLRH GDFQRYRGYC SRRQRRLRKT LNFKMGNRHK FTGKKVTEDL LTDNRYLLLV LMDAERAWSY AMQLKQEAN TEPRKRFHLL SRLRKAVKHA EELERLCESN RVDAKTKLEA QAYTAYLSGM LRFEHQEWKA AIEAFNKCKT I YEKLASAF TEEQAVLYNQ RVEEISPNIR YCAYNIGDQS AINELMQMRL RSGGTEGLLA EKLEALITQT RAKQAATMSE VE WRGRTVP VKIDKVRIFL LGLADNEAAI AQAESEETKE RLFESMLSEC RDAIQAVREE LKPDQKQRDY TLDGESGKVS NLQ YLHSYL TYIKLSTAIR RNENMAKGLQ KALQQQPEDE SKRSPRPQDL IRLYDIILQN LVELLQLPGL EEDRAFQKEI GLKT LVFKA YRCFFIAQSY VLVKKWSEAL VLYDRVLKYA NEVNSDAGAF RNSLKDLPDV QELITQVRSE KCSLQAAAIL DASDS HQPE TSSQVKDNKP LVERFETFCL DPSLVTKQAN LVHFPPGFQP IPCKPLFFDL ALNHVAFPPL EDKLEQKTKS GLTGYI KGI FGFRS

+
分子 #54: SRP receptor beta subunit

分子名称: SRP receptor beta subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.588018 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MRRSSQRAVL LLGLCDSGKT LLFVRLLTGH YRDTQTSITD SSATYRVNNN RGNSLTLIDL PGHESLRLQF LERFKTSARA VVFVVDSAA FQREVKDVAE FLYQVLIDSM SLKNTPSFLI ACNKQDIAMA KSAKLIQQQL EKELNTLRVT RSAAPSTLDS S STAPAQLG ...文字列:
MRRSSQRAVL LLGLCDSGKT LLFVRLLTGH YRDTQTSITD SSATYRVNNN RGNSLTLIDL PGHESLRLQF LERFKTSARA VVFVVDSAA FQREVKDVAE FLYQVLIDSM SLKNTPSFLI ACNKQDIAMA KSAKLIQQQL EKELNTLRVT RSAAPSTLDS S STAPAQLG KKGKEFEFSQ LPLKVEFLEC SAKGGRGDPG SADIQDLEKW LAKIA

+
分子 #55: Signal recognition particle 9 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 9 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 8.694115 KDa
配列文字列:
AQYQTWEEFS RAAEKLYLAD PMKARVVLKY RHSDGSLCIK VTDDLVCLVY RTDQAQDVKK IEKFHSQLMR LMVA

+
分子 #56: Signal recognition particle 54 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 54 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 55.775672 KDa
配列文字列: MVLADLGRKI TSALRSLSNA TIINEEVLNA MLKEVCTALL EADVNIKLVK QLRENVKSAI DLEEMASGLN KRKMIQHAVF KELVKLVDP GVKAWTPTKG KQNVIMFVGL QGSGKTTTCS KLAYYYQRKG WKTCLICADT FRAGAFDQLK QNATKARIPF Y GSYTEMDP ...文字列:
MVLADLGRKI TSALRSLSNA TIINEEVLNA MLKEVCTALL EADVNIKLVK QLRENVKSAI DLEEMASGLN KRKMIQHAVF KELVKLVDP GVKAWTPTKG KQNVIMFVGL QGSGKTTTCS KLAYYYQRKG WKTCLICADT FRAGAFDQLK QNATKARIPF Y GSYTEMDP VIIASEGVEK FKNENFEIII VDTSGRHKQE DSLFEEMLQV ANAIQPDNIV YVMDASIGQA CEAQAKAFKD KV DVASVIV TKLDGHAKGG GALSAVAATK SPIIFIGTGE HIDDFEPFKT QPFISKLLGM GDIEGLIDKV NELKLDDNEA LIE KLKHGQ FTLRDMYEQF QNIMKMGPFS QILGMIPGFG TDFMSKGNEQ ESMARLKKLM TIMDSMNDQE LDSTDGAKVF SKQP GRIQR VARGSGVSTR DVQELLTQYT KFAQMVKKMG GIKGLFKGGD MSKNVSQSQM AKLNQQMAKM MDPRVLHHMG GMAGL QSMM RQFQQGAAGN MKGMMGFNNM

+
分子 #57: SRP receptor alpha subunit

分子名称: SRP receptor alpha subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 72.232578 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: HHHHHHDYDI PTTENLYFQG MLDFFTIFSK GGLVLWCFQG VSDSCTGPVN ALIRSVLLQE RGGNNSFTHE ALTLKYKLDN QFELVFVVG FQKILTLTYV DKLIDDVHRL FRDKYRTEIQ QQSALSLLNG TFDFQNDFLR LLREAEESSK IRAPTTMKKF E DSEKAKKP ...文字列:
HHHHHHDYDI PTTENLYFQG MLDFFTIFSK GGLVLWCFQG VSDSCTGPVN ALIRSVLLQE RGGNNSFTHE ALTLKYKLDN QFELVFVVG FQKILTLTYV DKLIDDVHRL FRDKYRTEIQ QQSALSLLNG TFDFQNDFLR LLREAEESSK IRAPTTMKKF E DSEKAKKP VRSMIETRGE KPKEKAKNSK KKGAKKEGSD GPLATSKAVP AEKSGLPVGP ENGVELSKEE LIRRKREEFI QK HGRGLEK SSKSKSEAPK EKGKKAPRVW ELGGCANKEV LDYSTPTTNG APEAALSEDI NLIRGTGPGG QLQDLDCSSS DDE GAAQNS TKPSSTKGTL GGMFGMLKGL VGSKSLSRED MESVLDKMRD HLIAKNVAAD IAVQLCESVA NKLEGKVMGT FSTV TSTVK QALQESLVQI LQPQRRVDML RDIMDAQRRQ RPYVVTFCGV NGVGKSTNLA KISFWLLENG FSVLIAACDT FRAGA VEQL RTHTRRLSAL HPPEKHGGRT MVQLFEKGYG KDAAGIAMEA IAFARNQGFD VVLVDTAGRM QDNAPLMTAL AKLITV NTP DLVLFVGEAL VGNEAVDQLV KFNRALADHS MAQTPRLIDG IVLTKFDTID DKVGAAISMT YITSKPIVFV GTGQTYC DL RSLNAKAVVA ALMKA

+
分子 #58: Signal recognition particle 14 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 14 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 12.512716 KDa
配列文字列:
MVLLESEQFL TELTRLFQKC RLSGSVFITL KKYDGRTKPI PRKGSVEGFE PSDNKCLLRA TDGKKKISTV VSSKEVNKFQ MAYSNLLRA NMDGLKKRDK KSKSKKSKPA Q

+
分子 #59: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 133 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #60: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #61: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

+
分子 #62: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 2 / 式: GNP
分子量理論値: 522.196 Da
Chemical component information

ChemComp-GNP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Gpp(NH)p / GppNHp, GMPPNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 45800
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING

-
原子モデル構築 1

精密化空間: RECIPROCAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-6frk:
Structure of a prehandover mammalian ribosomal SRP and SRP receptor targeting complex

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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