登録情報 | データベース: PDB / ID: 3s7q |
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タイトル | Crystal Structure of a Monomeric Infrared Fluorescent Deinococcus radiodurans Bacteriophytochrome chromophore binding domain |
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要素 | Bacteriophytochrome |
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キーワード | FLUORESCENT PROTEIN / BILIVERDIN / PAS / GAF / phytochrome / bacteriophytochrome / photoreceptor |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
osmosensory signaling via phosphorelay pathway / detection of visible light / phosphorelay response regulator activity / protein kinase activator activity / histidine kinase / phosphorelay sensor kinase activity / photoreceptor activity / regulation of DNA-templated transcription / ATP binding / identical protein binding類似検索 - 分子機能 : / Phytochrome, PHY domain superfamily / PAS fold-2 / PAS fold / Phytochrome, central region / Phytochrome region / Phytochrome chromophore attachment domain / Phytochrome chromophore attachment site domain profile. / GAF domain / PAS domain ...: / Phytochrome, PHY domain superfamily / PAS fold-2 / PAS fold / Phytochrome, central region / Phytochrome region / Phytochrome chromophore attachment domain / Phytochrome chromophore attachment site domain profile. / GAF domain / PAS domain / Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor domain superfamily / Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal / Histidine kinase domain / Histidine kinase domain profile. / GAF domain / Domain present in phytochromes and cGMP-specific phosphodiesterases. / GAF domain / GAF-like domain superfamily / Beta-Lactamase / Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase / Histidine kinase-like ATPases / PAS domain superfamily / Histidine kinase/HSP90-like ATPase / Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-LBV / Chem-LBW / PHOSPHATE ION / Bacteriophytochrome類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Deinococcus radiodurans (放射線耐性) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.748 Å |
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データ登録者 | Auldridge, M.E. / Satyshur, K.A. / Forest, K.T. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2012 タイトル: Structure-guided engineering enhances a phytochrome-based infrared fluorescent protein. 著者: Auldridge, M.E. / Satyshur, K.A. / Anstrom, D.M. / Forest, K.T. |
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履歴 | 登録 | 2011年5月26日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年1月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2012年11月28日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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