登録情報 データベース : PDB / ID : 3pd4 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the editing domain of threonyl-tRNA synthetase from Pyrococcus abyssi in complex with glycyl-3'-aminoadenosine 要素Threonyl-tRNA synthetase 詳細 キーワード LIGASE / alpha/beta fold / deacylase / editing / aminoacyl-tRNA synthetase / translation機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
threonine-tRNA ligase / threonyl-tRNA aminoacylation / threonine-tRNA ligase activity / tRNA binding / zinc ion binding / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Threonyl-tRNA synthetase, editing domain, archaea / Archaea-specific editing domain of threonyl-tRNA synthetase / D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase / D-aminoacyl-tRNA deacylase-like superfamily / Threonine-tRNA ligase, class IIa / Threonine-tRNA ligase catalytic core domain / : / D-tyrosyl-trna(Tyr) Deacylase; Chain: A; / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (G/ P/ S/T) / tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T) ... Threonyl-tRNA synthetase, editing domain, archaea / Archaea-specific editing domain of threonyl-tRNA synthetase / D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase / D-aminoacyl-tRNA deacylase-like superfamily / Threonine-tRNA ligase, class IIa / Threonine-tRNA ligase catalytic core domain / : / D-tyrosyl-trna(Tyr) Deacylase; Chain: A; / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (G/ P/ S/T) / tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T) / Anticodon-binding / Anticodon binding domain / Anticodon-binding domain superfamily / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / 3-Layer(bba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 3'-deoxy-3'-(glycylamino)adenosine / Threonine--tRNA ligase 類似検索 - 構成要素生物種 Pyrococcus abyssi (古細菌)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 2.4 Å 詳細データ登録者 Hussain, T. / Kamarthapu, V. / Kruparani, S.P. / Sankaranarayanan, R. 引用ジャーナル : Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年 : 2010タイトル : Mechanistic insights into cognate substrate discrimination during proofreading in translation著者 : Hussain, T. / Kamarthapu, V. / Kruparani, S.P. / Deshmukh, M.V. / Sankaranarayanan, R. 履歴 登録 2010年10月22日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2010年12月8日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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