- PDB-3o83: Structure of BasE N-terminal domain from Acinetobacter baumannii ... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3o83
タイトル
Structure of BasE N-terminal domain from Acinetobacter baumannii bound to 2-(4-n-dodecyl-1,2,3-triazol-1-yl)-5'-O-[N-(2-hydroxybenzoyl)sulfamoyl]adenosine
要素
Peptide arylation enzyme
キーワード
LIGASE / Adenylation of 2 / 3-dihydroxybenzoate and transfer to pantetheine cofactor of BasF / Non-Ribosomal Peptide Synthetase (NRPS)
機能・相同性
機能・相同性情報
2,3-dihydroxybenzoate--[aryl-carrier protein] ligase / siderophore biosynthetic process / ATP binding 類似検索 - 分子機能
THIS ENTRY USES A UNIPROT REFERENCE THAT IS FOR A DIFFERENT STRAIN OF A. BAUMANNI. THESE CHANGES ...THIS ENTRY USES A UNIPROT REFERENCE THAT IS FOR A DIFFERENT STRAIN OF A. BAUMANNI. THESE CHANGES ARE STRAIN RELATED DIFFERENCES AS FOUND IN GENBANK ENTRY ZP_04661818.
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.92 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.92 %
結晶化
温度: 287 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 5-15% PEG 8000, 5% MPD, 250-600 mM CaCl2, 50 mM BTP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
モノクロメーター: Side scattering bent cube-root I-beam single crystal; asymmetric cut 4.965 degs Crystal Type Si プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
解像度: 1.9→38.95 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.953 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.943 / SU B: 2.78 / SU ML: 0.08 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.123 / ESU R Free: 0.115 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.21661
5308
5 %
RANDOM
Rwork
0.19383
-
-
-
all
0.19497
101409
-
-
obs
0.19497
101409
94.43 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK