ChemComp-3DR: 1',2'-DIDEOXYRIBOFURANOSE-5'-PHOSPHATE

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 3DR
名称	名称: 1',2'-dideoxyribofuranose-5'-phosphate / 別称: ABASIC DIDEOXYRIBOSE 日化辞名称: 1,2-ジデオキシ-β-D-リボフラノ-ス5-りん酸

組成

組成式: C₅H₁₁O₆P / 原子数: 23 / 化学式量: 198.111 / 形式電荷: 0

その他

1qum

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: N / 3文字コード: 3DR / モデル座標のPDB-ID: 1QUM

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

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ACDLabs 10.04	O=P(OCC1OCCC1O)(O)O
CACTVS 3.341	O[CH]1CCO[CH]1CO[P](O)(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	C1COC(C1O)COP(=O)(O)O

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CACTVS 3.341	O[C@H]1CCO[C@@H]1CO[P](O)(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	C1CO[C@@H]([C@H]1O)COP(=O)(O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C5H11O6P/c6-4-1-2-10-5(4)3-11-12(7,8)9/h4-6H,1-3H2,(H2,7,8,9)/t4-,5+/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	BVOBPNSQIRMLCA-CRCLSJGQSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	1,4-anhydro-2-deoxy-5-O-phosphono-D-erythro-pentitol
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[(2R,3S)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

全4件を表示しています

PDB-1q9x:
Crystal structure of Enterobacteria phage RB69 gp43 DNA polymerase complexed with tetrahydrofuran containing DNA

PDB-8ka3:
Arabidopsis AP endonuclease ARP complex with 22bp THF-containing DNA

PDB-8ka5:
Arabidopsis AP endonuclease ARP complex with 20bp THF-containing DNA

PDB-8qhr:
Crystal structure of the human DNPH1 glycosyl-enzyme intermediate

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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