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- EMDB-38590: Cryo-EM structure of the Ycf2-FtsHi motor complex from chlamydomo... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-38590
タイトルCryo-EM structure of the Ycf2-FtsHi motor complex from chlamydomonas reinhardtii in apo state
マップデータ
試料
  • 複合体: The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas
    • タンパク質・ペプチド: x 21種
  • リガンド: x 8種
キーワードATP-motor / Ycf2 / Fhl / MEMBRANE PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor / phytochromobilin biosynthetic process / cobalt ion binding / acyl carrier activity / chloroplast / fatty acid metabolic process / oxidoreductase activity / hydrolase activity / membrane
類似検索 - 分子機能
Fatty acid desaturase / Acyl carrier protein, chloroplastic / Ferredoxin-dependent bilin reductase / Ferredoxin-dependent bilin reductase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 / ADP-ribosylglycohydrolase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 superfamily / : / : / Acyl carrier protein (ACP) ...Fatty acid desaturase / Acyl carrier protein, chloroplastic / Ferredoxin-dependent bilin reductase / Ferredoxin-dependent bilin reductase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 / ADP-ribosylglycohydrolase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 superfamily / : / : / Acyl carrier protein (ACP) / Phosphopantetheine attachment site / ACP-like superfamily / Carrier protein (CP) domain profile. / Phosphopantetheine binding ACP domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
Cell division protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein / Flagellar associated protein / ADP-ribosylhydrolase ARH3 / Fatty acid desaturase domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein ...Cell division protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein / Flagellar associated protein / ADP-ribosylhydrolase ARH3 / Fatty acid desaturase domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Acyl carrier protein
類似検索 - 構成要素
生物種Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
データ登録者Liang K / Zhan X / Wu J / Yan Z
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)32271239 中国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2024
タイトル: Conservation and specialization of the Ycf2-FtsHi chloroplast protein import motor in green algae.
著者: Ke Liang / Xiechao Zhan / Yuxin Li / Yi Yang / Yanqiu Xie / Zeyu Jin / Xiaoyan Xu / Wenwen Zhang / Yang Lu / Sheng Zhang / Yilong Zou / Shan Feng / Jianping Wu / Zhen Yan /
要旨: The protein import motor in chloroplasts plays a pivotal role in their biogenesis and homeostasis by driving the translocation of preproteins into chloroplasts. While the Ycf2-FtsHi complex serves as ...The protein import motor in chloroplasts plays a pivotal role in their biogenesis and homeostasis by driving the translocation of preproteins into chloroplasts. While the Ycf2-FtsHi complex serves as the import motor in land plants, its evolutionary conservation, specialization, and mechanisms across photosynthetic organisms are largely unexplored. Here, we isolated and determined the cryogenic electron microscopy (cryo-EM) structures of the native Ycf2-FtsHi complex from Chlamydomonas reinhardtii, uncovering a complex composed of up to 19 subunits, including multiple green-algae-specific components. The heterohexameric AAA+ ATPase motor module is tilted, potentially facilitating preprotein handover from the translocon at the inner chloroplast membrane (TIC) complex. Preprotein interacts with Ycf2-FtsHi and enhances its ATPase activity in vitro. Integrating Ycf2-FtsHi and translocon at the outer chloroplast membrane (TOC)-TIC supercomplex structures reveals insights into their physical and functional interplay during preprotein translocation. By comparing these findings with those from land plants, our study establishes a structural foundation for understanding the assembly, function, evolutionary conservation, and diversity of chloroplast protein import motors.
履歴
登録2024年1月5日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年9月11日-
マップ公開2024年9月11日-
更新2024年9月11日-
現状2024年9月11日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_38590.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_38590.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.09 Å/pix.
x 360 pix.
= 391.32 Å		1.09 Å/pix.
x 360 pix.
= 391.32 Å		1.09 Å/pix.
x 360 pix.
= 391.32 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.087 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.35
最小 - 最大-2.8555303 - 5.355778
平均 (標準偏差)0.008031426 (±0.1295211)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ360360360
Spacing360360360
セルA=B=C: 391.32 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_38590_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_38590_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas

全体名称: The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas
要素
  • 複合体: The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas
    • タンパク質・ペプチド: Fhl1
    • タンパク質・ペプチド: Fhl3
    • タンパク質・ペプチド: Ycf2
    • タンパク質・ペプチド: Ctap1
    • タンパク質・ペプチド: Ctap6
    • タンパク質・ペプチド: ARHL
    • タンパク質・ペプチド: PcyA
    • タンパク質・ペプチド: CrTam39
    • タンパク質・ペプチド: ACP
    • タンパク質・ペプチド: CrTam29
    • タンパク質・ペプチド: CrTam34
    • タンパク質・ペプチド: FADL
    • タンパク質・ペプチド: CrTam15
    • タンパク質・ペプチド: CrTam49
    • タンパク質・ペプチド: Ctap7
    • タンパク質・ペプチド: Tic22
    • タンパク質・ペプチド: DnaJ
    • タンパク質・ペプチド: CrTam35
    • タンパク質・ペプチド: UNK
    • タンパク質・ペプチド: UNK
    • タンパク質・ペプチド: CrTam31
  • リガンド: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
  • リガンド: DIACYL GLYCEROL
  • リガンド: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
  • リガンド: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
  • リガンド: Phytosterol
  • リガンド: ZINC ION

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超分子 #1: The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas

超分子名称: The Ycf2-FtsHi motor complex from Chlamydomonas / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#21
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)

+
分子 #1: Fhl1

分子名称: Fhl1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 128.932844 KDa
配列文字列: MQAAMHAQRP AGPPCSSAPS TSYPVAPSPV SSRSRGLHAR RGVAEQRSLG CRSTGSSDQH SNTNDGASGP SRPEQGPELD WSGLPRRQL AAMAMSPFAA LSLPLVNDPA WQQSFETYGG KLREVLLGQQ EAAKNVAKQL DEGVTYMDWT YRSTGVDLSA V WDPELWIR ...文字列:
MQAAMHAQRP AGPPCSSAPS TSYPVAPSPV SSRSRGLHAR RGVAEQRSLG CRSTGSSDQH SNTNDGASGP SRPEQGPELD WSGLPRRQL AAMAMSPFAA LSLPLVNDPA WQQSFETYGG KLREVLLGQQ EAAKNVAKQL DEGVTYMDWT YRSTGVDLSA V WDPELWIR FREAVAQNEP AIFWNKLLDR VQYKENLPQA GLVGDMRISY AKFLELLKDQ RVKRLVVYGD MRTAVVEVPH PW SASVLGH PATHPFYEDS AHNRVSMLRP NPAAPEDVTQ WFCAEMPEWD MEKYRFYVDL PGDFWESGVL QRHLAAQRAE GAV WDPASG QYILPYRAQK KVFQVSTEVQ LLDPQESWDF LGWLLAPGRL EFYEKAACVA IALRVLGIVI AISTGSPLFK LVNV GWGKL RGKGKKNATK DPKKMSKQEK KESQWERLTS SRAREFMTKD EKTGKMRDTG VRFEDIAGME FLVTEMREIV RMLKG DEAY KRVGAKCPKG IIFQGPPGTG KTYLARAIAG EAEVPFFSSV GSEFVEMFAG VAAARVNSLF YNARKKAPAI IFIDEI DAI GRARSTLGGD PGSMERESAL LAMLVQMDGI ANKTEQVLTI GATNLAQELD AALLRPGRFE VVYEVPQPGP SARMAIL RY HAKGKPLEGD GQRLLLKTAE ATQGWSAAAL ANLMNEAAIL TVRRNVPAIS LPMVLELVEG LNWGEQAPRI PDSEAKDR L ALITAAKAVA FALTPGLEPI KSVTMWSGRR GLGPSVDFIA MEDKAAMDMH PEETELMGWR TNFKTNAAVV GDEPLGEFA HVAGLLVPLY AGRAAEVALF GKDGASLATA QPLADCFEIA YYCVRNSQVH PRFKSLPPLH TTMWLGRDDA GRWRRDPLAI GFDEELGYH KLTLTLLKAS WRRALRLVAQ RRSAITKVAA EMLAAPEEKI TGARLVEIIE STPLDDLGGE GLDGAAAAAV V EEAGNEFL PLLKEVLGQV PGIILTGESL AQTDDQGRPL PPSSASTSSA DAAASDAAAS AGPATELRLD DATLAAVSRT LM GRLDVVD LIGRNTAVEA AERVRDALLH PETRERLLAM RRWVEGGPGA PEFPPSPLSP EQTAAMSPSG PLYGNLALNL DWW RRRQDN VISWSAMEIL MSRRQVDLYK QDADMTEGAI AKLGPPPAAP AAAIGSSSKS SSGQSS

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分子 #2: Fhl3

分子名称: Fhl3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 120.645609 KDa
配列文字列: MRMSGMAIRC AASGSLLASP AASSRPAWRA APVLCSPRVP CTPLELGVSC RRSCMQRRWS RAANVRTLAT SRGEQPQDSG PSTSGRAEL PLDSGIGKLI STTAKAIGLV GLMAVAVLSG PTRAAHARDR LSAQPAAEAL IHHQQPYQQP HHHQQQHRSA G AVANPVLS ...文字列:
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分子 #3: Ycf2

分子名称: Ycf2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 342.188906 KDa
配列文字列: MTFLNHYTYL FSIPEKQADK VSGILRLAQA RPIETLQNER INKQLNAFLK TYKFEKLITN YKKMQSFIPN NSLNGNKTNS STNKLYATS LNVFPENPPL MVRKAVSDEA DKFSKFTYSK VQVVTNNLNN GMNSKEFIKA NNLKPSLRAA ESLVLNHLTY N KFKENLYF ...文字列:
MTFLNHYTYL FSIPEKQADK VSGILRLAQA RPIETLQNER INKQLNAFLK TYKFEKLITN YKKMQSFIPN NSLNGNKTNS STNKLYATS LNVFPENPPL MVRKAVSDEA DKFSKFTYSK VQVVTNNLNN GMNSKEFIKA NNLKPSLRAA ESLVLNHLTY N KFKENLYF KTNNIQPTKS KSTSLFFLNI LSNSKPRTCS DFLSSPKIRK TWFRNTAWSL QTQQHRSSNG INLSLQLPYA LG PSVPAGA SGQNMYELPV AQSSSRFGTY YFLQKLLSKY LDVWNASADN GSVLSNSENI KLNFSMVSLL DSKMAIQTPN SLY FVFTQL NQKTFLSYWL LPVAGLALLT PTLLTLTGQS VSVQKFNSFI NKKTDMMVLS NTEMPSKSFG TPTLFGTSVE IYLP NSYMP KGEGESGINR VNSSINAVKK NTVTANLVLD SESQEVATSF QNDLISIKYC FNNLYNYISN KTALSTKNLF LFSAI KSNA TKHKRTQSFF SVENTTTLGN NSNFVKGHFK SSINAFSSYL PSTNVHSMIP LTSLPYLKAI SPLYSKFMID HSLKFI TPK TTLKLLQHKL NKSPKQMYTK TQNFTGLRDL RALNSFSFGQ VNFRTNHFLH SNSRPLNHYN QALKLINGYE QYKNNLQ IN CNKTLDLNTK NKLVYQVNKS HLFNQKCSQI VYKQSLYNRD LCTIRGTGTK VVDYFSHGDK LSNKNGIVLD YFVYSNLL F DNKTNTIINK DGKQNITKLK LNLTKTTVPF KTLIKKYTSI NSLVANEQTR NNLNLGLIHF NGHLSVVSNA NLLTGRPVK FIYYKFDKRL NSYLIYVNQN LKKFIQLNNN FLKPKPLSHQ KNKPVEDFNQ YATNNSSPPK TNVFEKSFVE DSSLRKPLTS LRGSKQFLN SLTILFKHQK MFKKKTLKAH KWHSDTQGIF RKHTNSSFGS ANFSNGPEES SLSTRLHIQK KRKAKKQRLE T RRQKKRTR FFPRPVWLRS RMFLNFLTER NKYYLNSTIT KQGFSLPSKD VVTTKLDWLK EDMRRLPLGA YQYKSLLTQK AG NKFQRQS FTEVVSTMEY INGIHKALNN SIFNKIVRKS LLSSSQNPLK LRLVANYSKM QFMHRVKLPF YRTLKHSEGT KNL ANKKQN LRDIKIKANY NNFKSQKANN QPQQNDKDKD KDTMFRDFWV WSYNNTQTNA FNQNLWWLLP NLTTKQSNLE FLTS TYPTA KETQRAKEEI HGNSIPTASK NQIALIRLNW ALNKTNINTF TDYSKRNNLW TTQKLRNQSK NNKTKSLEKQ FITNW EKFF LNKNLNIFSK KIISKVKQKK QKLNYMTSYL NVQSEHNVKI FHNSWWTHLN IKNLVNNQDM VIPVREGYFS VGNFNS EFI NSAIIKSINN KTLVENYVYS PSSEKETMQL LLMSSSILLH LCAIISLVSI SQVRCFVKFH LILLYKLSNV YNAILNQ LS NKLQKNLPIY NNINKLNSRY FYMNHQKSQI KQRKKLLTYF SLTLLKKQFV TVKPLQIRNF ASIKNQSSNN SNLTYTDM L PLSLRANKFR GSKYDISIRE EEGQSAHIKP SKSMYAKLNI LSLKTIFLKQ LLMNKKPSAL PSNVGLKSNR ETQKSQLIQ RIKTKELQIS LKKNIIGFSK VTKNHILKIL FNVIEVFQTA VRNISSFFEK PAEFTTTWIA YGFLVEWSSD FITIIPENVD IYIWNVFSK IYRTIPLSFI STTLGPASTV FDPVTNSTIP IQMGNFNYQK MVAFPILLSL SHLLHRRILY LFDTLFSTIT Q PDTDLIAR QEKGTLFWDI WADFLVTAAD YYNVNVAALS TIKAEQNSLI ENISNDFDNL TMSSKKPFFM PNKGVSNIKN IF WIKKLKE PQLPESIVQN REVFVRERKR TLKGLFNIYA PQEETLWNNP TSPKNLSDEK ISFKLFNQLN LQLFAEKNKI KPY FEAYFS TTQQKTNIMQ SAFPEANLNR WSVNQFITYQ SWHSHNGSNN SNGDLFIDYH PPKTFSHIPA LKYNSILQQP IGSL VCQIY SGLFNKQISK NILLVNPKTT SNNLVDYNVL LIQALAGETE MKIITDNAQR YALVNRGFAI GIKLLREVFD AIALN TPCI FLLEDIHAIG ERRPMLISDF GGGMSDDNGS FKEDFFGSQR DEVHEKNQVV YQLTRHAITH YKKPFKGDYS LAIPTN LYV TDLFLKLPTQ SISNLTNVEN HNLSIKNKIQ HNGTQSLTET KRNLGGDINK NSYLQLTQFT KTLAPPSTSP FSVLLLK EE KRLKPNKIVE ELPWTSLPGE QLATKPRTSY SVRAKVAMLA ELSLSNLSAK LDMITDLLVI IDSVRSNKGF VVFATTDI P HVLDPALRRP GRLDETICLP NIHTSNILNF TKNYEIFKSA KDTSNFGKKI ILNEMQNLTT TSTQRDMYLS CLPTNNQTH KTKREGVLTM NLKDYNILLN QVYFAEGTGG ILNSQMHKDS LQKSLNFALI SHSKKLKELN VSKLIGSNGT VSQGNVDQLG VFAGQIVNK QKKSLQQHLP NSKKSFKKKY KDKAIIYYEV GKFVLNYFLN NQLTQSSIID KPVSVTNKQT NDITIFGNDF L NLKTINYL SLYNSKNKIL LQLMLIFGGK ISQLLSSKNL VKSLKQASIN SYMVEEESGS ISSAGMPLGQ THLLPKALSV LA KPMIFSD GYNNQNLKTA TTLLLSFIHK RYLYRKNLIV PKLLSFADGN ILDEPPSPPF SSLLIPAKRF ENYKRFFRDT LTG DKMGQR KSQITLLEKL QYHMQLRSIK QLNATFSSQE NLDFQSNAAL TSQKLDTLMS LSTNNLLQNP TNINWYYQNR ILKR HGQYL TNQWWNGQLS EHNAETVFLS DIDWRSSFIK NKNINITKSK NLYRLTQQKN NTDGLDVLLD FPDTDQYYNP KRRRW LLNN GSWNFWFNFD KLYSEEIVTT WILESLIQTY KYLHKNTELL DFVTNKFITL GYIAPENANL QNISGFPSQS ELLSTK EII LTNSFKRF

UniProtKB: Cell division protein

+
分子 #4: Ctap1

分子名称: Ctap1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 107.778039 KDa
配列文字列: MRSAELGRPP RLAQSRLRNV SSHHVTNSCL WLRPPGCRRL VASCAASKES SSASLTAERF ITDAKELNAT GSGLPIIDGP DWEEQHWAA LKAMSAGRPV ALPTPHAKFG PEDLQRIAAS GPRLEDLTLE HAERLAGPGQ LPTAPDGVAL AFRYIPRSVL G DFRQEVEP ...文字列:
MRSAELGRPP RLAQSRLRNV SSHHVTNSCL WLRPPGCRRL VASCAASKES SSASLTAERF ITDAKELNAT GSGLPIIDGP DWEEQHWAA LKAMSAGRPV ALPTPHAKFG PEDLQRIAAS GPRLEDLTLE HAERLAGPGQ LPTAPDGVAL AFRYIPRSVL G DFRQEVEP DWRSLPAMSP AELYAGLRAR NWTSAHYDPA AEPWRLQVFS CDYKHTGVTG WPGYRVVVTS RGGRRRWVDL AE EGELVQL TEQAPPASPA DIGYSHVFAQ LYQAYEPRYS PEALAALYGS SSSKGKAAAA AAAQHDTPAL RHLDVSYHGT GSA VAPGSG TAFLMQPSWD AVTGAIRWGL ERSGLPELRA LRDSLLPEWR PPALELNRSN NNLGVVYFAV CLTLGIVIPA LRRS RILDI RTLEEDPGAA MEFARSKSEA RKEGLTGVEF RDVAGLGPIL NEVVEVVEFL KDPGTFSKLG ARPPKGILLE GDPGT GKTL LAKALAGEAM VPFYQMSGTE FTEGIVGLGA ARVRDLFKRA RATAPCVIFV DEIDALGLRR AENDSAKTNE EREQTL NQL LTEMDGFTPD TGVVFLGATN RADLLDPALM RPGRFDRKIR MPKPDTEGRL EILKLHLRNK QVAPDVDLLQ LARDLPG LV GADLANIVNE AAMTAVRSGR QQLTARDIYA GVDRFTQGEV RPSLPTAHKL PVLCFAAKEI GIALVAGELR DRYGRVEL V ERVSIQPKGR AYSRTMFQRG TDEEYQLMTR GRLLDRIRLA LAGGFAVRTA LGEETNFTAA DIKRATRMAK KYVFYYGFS EAGGAGITTW ANQPYSGDFV IGQQRARKVV STDAMDAFAD WPTVSEDFRF DAPSPSDVTW HRYTDEVRRV LKGCSEDVLG ILAERQEAM WAGIKALSDR KELLGSELRD IFDAHPAATS RDRDARAELA AAKLDMTIFT EGANSRWPYG IEWLDDAYPK P YWVQQQEA EAAEAQAKQP AAAL

+
分子 #5: Ctap6

分子名称: Ctap6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 109.355469 KDa
配列文字列: MKATGLPSLP ARALGAAGCS TSPRPAALGW SSRGCASGRR RACARVHVAD AEAVASGVAA TEAAAAVPAL PARATAVVAP LPEKNYGSL RGGRWPFLYD NVYGLPVVRQ VASYGEVLEG IRTGRISQVL WFQAPRAVTA SAAAPPPGLG GPQQPQPPPL A SPDGRCLV ...文字列:
MKATGLPSLP ARALGAAGCS TSPRPAALGW SSRGCASGRR RACARVHVAD AEAVASGVAA TEAAAAVPAL PARATAVVAP LPEKNYGSL RGGRWPFLYD NVYGLPVVRQ VASYGEVLEG IRTGRISQVL WFQAPRAVTA SAAAPPPGLG GPQQPQPPPL A SPDGRCLV RFANGQVKQA VIPPGEPRIS QALQQYGTAV SYIPLEPRYM PELAAMRARG AQEAVLGEVD TGAVATPVEL PE DERRGAA VGPTAFEAVA AYGSPEQLAA ALDDNYQAAA GQVAALLAER EAWVAEQEAL EAAARAERSM SDRAGGGGGG GGT ALVPSG GFSVGAWLDS IQLTNEQQAM VLKYVPILGP ILGSGFIIGL YLLARLVKGD LTDRLKMMDS EADKKKKTAL KEAR IAFLE EEVPGLVAKG ASLDDVRKRV QPVNARLGTK LAIGDGEIQS TYEACRLLLS EGVDLSAASS TAASGALAQM ESDER RAAA GAAEGGGEGG DAMNAMMEMG KLNTARIRKA TDPKIMDVKK RVRDVRRKLK RESKVQLSDE IIFFDDIAGN KQAKVE LME VVDFFRTPEK FKASGARAPK GVLLVGPPGN GKTLMARAVA GESGVAFISS SAAEFIEMYM GLGAARVRDL FNTARSV AP CIIFIDELDA VGRQRQGGGR SNDERDNTVN QLLTEMDGFE AEQQGIVVMG ATNRKDVLDA ALTRPGRFDR SIEVRRPD F QGRLEAVKVH LRDKPVAAEI DYVSLASLMG GMSGAQIAGV ANTACFLASR DGRSEVNQTD LTLAVEQAKY GRAYDQSRF VGAGRKKRFA VMEASIALAA TLLPAIEPVE YATIIPSTRS PLGRTVLKPH VGRYTTGVWT YRYLREQLLV ALAGRAGEEL VLGRDELSS LNQHRLQMAR QVAWKIMNSG MSSHPDYQHL RGLGSNYFDG SSEPGRFQQT TVVMDANQTR SEAVDADMEV E GLLNGGYK QVFELLVRNR AALDALTELL LEREKISGEE VVQVVEELGH PEDLARRAQW AGYELL

+
分子 #6: ARHL

分子名称: ARHL / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 51.410547 KDa
配列文字列: MRQSVRSPGT RASLQSGRAA SSCLPVTPLC PLVASTTSAP ATSISSSDAL LRSTAVASTS TSSPATVPIA ARRRHQPRSR SVAAATPAA APSPAAAAAP AWRGPGEVGD EDKAVGCLLG AAVGNVLAAP YQGDRHFEVI RLRRNGVTDF WKYDIGAQPV Q YGQYTGDF ...文字列:
MRQSVRSPGT RASLQSGRAA SSCLPVTPLC PLVASTTSAP ATSISSSDAL LRSTAVASTS TSSPATVPIA ARRRHQPRSR SVAAATPAA APSPAAAAAP AWRGPGEVGD EDKAVGCLLG AAVGNVLAAP YQGDRHFEVI RLRRNGVTDF WKYDIGAQPV Q YGQYTGDF ANLLAVATSL SASRGVEPAH LLGALTRAYA EGGSSVEVED ASGGSSSGFL PARRYSPYDR LVMDAVLAGT DP LKVPELA ERYLAETTRR HASSSSDRPD REPHGPSDLG AAARAAPIGL AYRRAGGERL LAAVRRSLEF SHPTPLGLDA AHV VAAAAA WCGRQQPGDA VGATPAALLS HLLNDVAVTA EQCGKLRLLR DNLFQLDEVT DWRAFYAGPQ WARLTALFSR LSFH GLATA GSEFASVVLL ALLSSWGRPE QAVIVAASLG GHAPATAQTV GALAGTLYGQ SWVPERWWRG LGEGVEGEAG REAVV QAGR ALAAVELADG L

UniProtKB: ADP-ribosylhydrolase ARH3

+
分子 #7: PcyA

分子名称: PcyA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 61.329266 KDa
配列文字列: MMSSIPKSIG AQRSAASTRA HALARPVVLA PAASIPARSQ GVTSTSGRCL APPPRAAAGA GAPGTAGPTN AGAAAHEVEV DAVESPLSP EDIMRLVQQH EDVAAAAESE QLVAQFRDDP QGLYEYVNRA YAEGPRRVTT PISLLQEEIT GAVTESYPAA V ANDIIGMG ...文字列:
MMSSIPKSIG AQRSAASTRA HALARPVVLA PAASIPARSQ GVTSTSGRCL APPPRAAAGA GAPGTAGPTN AGAAAHEVEV DAVESPLSP EDIMRLVQQH EDVAAAAESE QLVAQFRDDP QGLYEYVNRA YAEGPRRVTT PISLLQEEIT GAVTESYPAA V ANDIIGMG SWRLKDDVDP VIEFLVARLE GCWREILDTD LCLYPREKWK EQGWDLVDSM DPHQELEGFS YADIPDPAKG EA GYPRLQL ENRVYCSKVF RKLHVEVGLR QDGLQVLHVV VYPRYSYDMP IFGMDIVMVD GRVTLAVVDC CPVRADLKLQ PHY METMAL LQRTFLEGTD PALRRIPEWG SKIFSPLALC ITPSGPEELA AFAKYAVALH RAYLTMSLNA VPVVAGPGDR REAA RLQEI QDGQKRFCDN QLVNKKTRRV LEVAMGVEWT EAYMSQLMFD FDPKYEPPYF DASFEKLYTY FDENPSFGEM ADEAM ELER GAEAERANET MAAALSGRSV SREKLAMAMG FLFQNDATFR AAVQTLSGGQ VDGNIEERLT DDLMQLLERS E

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #8: CrTam39

分子名称: CrTam39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 39.328336 KDa
配列文字列: MSPGALYQLA PERLRASSRR SAAATIFRRD RMRLLRCSAA AQPGEPGEAA GPSTSGSDNS NWWASINRKT GIRGPDPAPA EEHTNGPAR DIIGDRMSRR LEDINKAERQ RVWDAMRVAA AHRYASGQMP AWFDPEWLQQ EEAPLNAMDR MRGEQRRIEE Q QQQQGEAS ...文字列:
MSPGALYQLA PERLRASSRR SAAATIFRRD RMRLLRCSAA AQPGEPGEAA GPSTSGSDNS NWWASINRKT GIRGPDPAPA EEHTNGPAR DIIGDRMSRR LEDINKAERQ RVWDAMRVAA AHRYASGQMP AWFDPEWLQQ EEAPLNAMDR MRGEQRRIEE Q QQQQGEAS SSDKLAMEGG GGDSGAGAGG WSGGGSGGGW WREDDPYWPL RDWGDHPMRW WTLAFAAIMA AGGLATSVAT GY VEPVQAG LGAGALLALA GAAMSDARCV PGALGVKLAW AVCALIVLKE VSVGWQHKRK RRLAASAPRL ELTGLAAAAL CAG YMLTDM SGMGEVALPP NPGAVFKSPD VAYRASVWQK WGYGQVQMRV

+
分子 #9: ACP

分子名称: ACP / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.779737 KDa
配列文字列:
MALSMIRKSA AAPVRRAAAA PVVVRGRRVI TFAAVDKAKV LEDVRSIIST QLGTELEKVA PEAKFVDLGA D(4HH)LDTV EIM MALEEKFEIA LEEEGAEKIA TVQDAADMIA AQIAAKGN

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #10: CrTam29

分子名称: CrTam29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 29.084951 KDa
配列文字列: MRPCPAVHRR VPPGPVAGHK QLLPLQRSCR GAPLVCRTAA PMAPSWAETR SAAASAPILE PDMLPSTSAP FISPMTPYVP EEEPTRTPP SIKDTGTLRP ASEWYPQWMQ YRRREDNYVF WQDKFMRCST DIPWAEKRWT LFSTVWYLVQ QLRFVGTPPA L RYVAFLGW ...文字列:
MRPCPAVHRR VPPGPVAGHK QLLPLQRSCR GAPLVCRTAA PMAPSWAETR SAAASAPILE PDMLPSTSAP FISPMTPYVP EEEPTRTPP SIKDTGTLRP ASEWYPQWMQ YRRREDNYVF WQDKFMRCST DIPWAEKRWT LFSTVWYLVQ QLRFVGTPPA L RYVAFLGW RALMFQVYAA HKALVLWQCK LDAGLARIGS GGATATFSKT MALRRLHWRN SPLAEALYAL NLYKTGRVHL LP PVAKPIP RPTFFWLF

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #11: CrTam34

分子名称: CrTam34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 34.185254 KDa
配列文字列: MQSAARGCHA PAGLSSSLLR SRTYVPPCAP SSSGRVVGSR HITARAAGGK GGGKDDKAKE KADFSALWAL RIKNFFSSRR KYLQQAEQV GDDDKEKAFK AEIAKEERSI RELKDELVAI SMEEIEEQEK QGDPRPALAA TDIAQARMDL QTSPLTRAVL A VVRVRELL ...文字列:
MQSAARGCHA PAGLSSSLLR SRTYVPPCAP SSSGRVVGSR HITARAAGGK GGGKDDKAKE KADFSALWAL RIKNFFSSRR KYLQQAEQV GDDDKEKAFK AEIAKEERSI RELKDELVAI SMEEIEEQEK QGDPRPALAA TDIAQARMDL QTSPLTRAVL A VVRVRELL RALLLLPFSA VGGAVAAWQG LFNSQRYENF LMSEGERIWA WRNRSENERW FWEVFAWDRL IFPILVIVAW EY LVPNHLV WAVLAPLALL TWMSGRLPTP ATPEFWMLAY FGFYRKVWPD AAAWLQGYVV PLMGFA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #12: FADL

分子名称: FADL / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 70.334234 KDa
配列文字列: MNTTRQMAAS TSCSSFTSLV APGTRLRTTV RAPAMQLRNG QRESGAAGTA ASASSSSCWR LAATALGQAQ LHSGARVSCM GGVIRSPAV LLRAGVPTRL PQSAHASPLA AVQPVTSTSG SVGELGAASR RTSSGAACSS SSSGSRSAVC TSGPVRGLGR P LPSAGLRR ...文字列:
MNTTRQMAAS TSCSSFTSLV APGTRLRTTV RAPAMQLRNG QRESGAAGTA ASASSSSCWR LAATALGQAQ LHSGARVSCM GGVIRSPAV LLRAGVPTRL PQSAHASPLA AVQPVTSTSG SVGELGAASR RTSSGAACSS SSSGSRSAVC TSGPVRGLGR P LPSAGLRR RRGASPIAAV GTPAVGSGSG VADSGANGST GSGNGADAAA AATAAAAPSN HHPPGSSNGD NGSSAAASAS TS SATAASA SDPAPEPEPA AASTSLDGLP ETQKYVYADE WGFSRVGADF PPGSHPSLFS QLLPQALFAF DARAAVAAVA VPL AAMAAG YGWLWYMHSI APVWQQALCA ALIGTGYAGL FKVAHECAMM RFIPQMPGLQ AALGTLLMAP ALYSLPSWRL HHLH HLLHT NMLWQDVWGW HPLTKVELAD EMVRSGGSGG AAMAAARLVL TTPIKLFASV GHWLRSWDGL DLRHFHPASY VEVLS GWAA PLAFAGLVLP AVVSAGGLSG FVSCYLAPWL VFHFWLSVLS LTAHTAPHIP WRAEGDGWDA GRAAVAGTVT LRLPRP LEV LLNNANYMLP QAVAPGLPMW SAPAAYAVLA ARLGPYLTEA SMSLKLLTNH VTRWQIYDEE AHTYRPMEEV VDEIEAD LQ QLAAAAQQAQ QQLAAQDQEA RAQQVEGREE GSGGGVPAVA

UniProtKB: Fatty acid desaturase domain-containing protein

+
分子 #13: CrTam15

分子名称: CrTam15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.265472 KDa
配列文字列:
MGGELAERKA SSASAGPRVV QMRREAIPAE LLLVKEDPSK LPAGVLQTRE QLKQAQRDIN WAGKREQVFA AVAAGWHLAS FALNLAFWG VEGMPPDRYW PTSPRIRLQI RPGRYGNMDG GQRVYMDYLA RSEGVPLN

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #14: CrTam49

分子名称: CrTam49 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 48.618184 KDa
配列文字列: MQSSIAHRSL AACPVQRNRF VPARCKLASN RIGPKLLSAA IAGTPEQPAT STSTPSSEAG TKDAAVVVGP ALVAKEVVST SGHSDAVPD PNFPELPLST NRAAGTQYLA IGAAYAVAAG AVAVAALQGP QLLLASPAAA DPWSSVLLGC VAATYLRAAG V FLQLKAAS ...文字列:
MQSSIAHRSL AACPVQRNRF VPARCKLASN RIGPKLLSAA IAGTPEQPAT STSTPSSEAG TKDAAVVVGP ALVAKEVVST SGHSDAVPD PNFPELPLST NRAAGTQYLA IGAAYAVAAG AVAVAALQGP QLLLASPAAA DPWSSVLLGC VAATYLRAAG V FLQLKAAS DAAELLCWRH QRLALTAAAY GMVAVLTQAA GLASPQLLGL QLLLSVASAA VVANVARSAW AVRPFVSSLT EG RSPGGVL AAVAGAMTGS VSTVAGLLLT TTIVVSLYGL FAAVFAPAPA LPVAVGAWPG TAAAAAVMDG SAAGLRRLAA GGL LLTAAA SHGLFDFAGS VKQQGPIDVA QAVKKMVVMD MAAPRIRTLK YFLPNPTIYS LLNLGFVAAA VLQSYFLYIA PAWG VNVNW DTALWGPMYG TAFLGLVYGL VALTKFDWSS VVDAVLRVAC WFAELTMWFW DTFVWKFSWS EKTRRA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #15: Ctap7

分子名称: Ctap7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 71.675305 KDa
配列文字列: MATTSAPTSE PWTFDLVGQL RQKFGLGPEN WDRFKGQAAE VPGADVPPSG AHVTLKDLSR PAESLPARAD EAAVQAALAD DGGWVGTPD PSKYAAGTTQ LSARELQEEV AKGNVMTWKD FKQQVSGLQG PEREALLALV AQRVAAERMF FTLEDGSKVS L WDLQQYVD ...文字列:
MATTSAPTSE PWTFDLVGQL RQKFGLGPEN WDRFKGQAAE VPGADVPPSG AHVTLKDLSR PAESLPARAD EAAVQAALAD DGGWVGTPD PSKYAAGTTQ LSARELQEEV AKGNVMTWKD FKQQVSGLQG PEREALLALV AQRVAAERMF FTLEDGSKVS L WDLQQYVD NNPELAALAA SVRRIAVADP EDPAGRPLPG GGASGLDRSR GLTGAAHMSG QEAEELELDW GQVGRGALWR RR PTRWLLG GLDGVKDWEL EAYAHEPLAN QLLGAKYGGR DPRAVVADPA YAADVLRAGP LLGMTFVLRA ARDLPLQEVA SSW RGLLGN YLQRQAPLSL PKAVRPAHLD PTDLNGVAWP ALLSRPAAAA HAAAEAEAAG AVPDDEMGVA WRVQSGKEAA ASVA AAQQL LQSLPDALCP GPSPAAWPLT GTKLVDEGGR NWRRGGSVWV TLQPEGGVLV QAQTGGVVGE QESYLLTHVQ GQEAL AGAV MSAFMGPQPL DPELAAAARS VLLVPANGFT AANKERDPNH PLYPSFTGVR PGRAPRDVAA YTLAGGRTPL LAAGGP GEA KLASELRTVM EAALAAAARA EAEALADAAT SPSSTSSRAA PAAALAEAEA AEARRARGRA AAAAVMAEGL RRLGPDA VA MLERTAAEAE APQGGGAVVV AGAGSASGEK GVGLTSSDIF SLARTLEQE

UniProtKB: Flagellar associated protein

+
分子 #16: Tic22

分子名称: Tic22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 40.685465 KDa
配列文字列: MDQAPGPLGH LQRSFEHVGR GLASQLEQVE QAFVPMREGV TRWLERTPLA QIIRNAQEGV ATQQRQRDQG PWAPMLASIA MSGAGPRPQ PVMDLAMAKD EVKARLAPVP VYTVANPKNE FVLVAGENNT QLGFFFFRKE DAEALIEKIR EENPRLARDS K ILRVPMDN ...文字列:
MDQAPGPLGH LQRSFEHVGR GLASQLEQVE QAFVPMREGV TRWLERTPLA QIIRNAQEGV ATQQRQRDQG PWAPMLASIA MSGAGPRPQ PVMDLAMAKD EVKARLAPVP VYTVANPKNE FVLVAGENNT QLGFFFFRKE DAEALIEKIR EENPRLARDS K ILRVPMDN VYEVFTTPRE QTGLQGIHFR FMPDMKQVAH ALQLYKDAGV PTRQFIGVPV FQAEGLTVTT RDMQYVPLFL CK EDLDIAV QSAYVQRNAA QIKLYKDKAD KYQADYDQIA SQLEAAANGR ERGGLESRLA KARVKLEAAR DKVESVERAP LPK VEVGSF EEVVMRMTAS AGNELAAWSQ VMFVAPELLR DSAGAGGKK

+
分子 #17: DnaJ

分子名称: DnaJ / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 50.842508 KDa
配列文字列: MGQFYSREFD GDPYVDLMRS LPERELVWWA QKVIWLAEGF TFVDHFARTY PRLLQHKCQR CKGAGVMTCP ACLGDARVSG GARRRAALA GLGGVAEGRS AHDHDHEAGA DGGCRVCGTA CAWDAE(SEP)EWM ERWGEWESRL AYYDKATGPL MDEWYED VL ...文字列:
MGQFYSREFD GDPYVDLMRS LPERELVWWA QKVIWLAEGF TFVDHFARTY PRLLQHKCQR CKGAGVMTCP ACLGDARVSG GARRRAALA GLGGVAEGRS AHDHDHEAGA DGGCRVCGTA CAWDAE(SEP)EWM ERWGEWESRL AYYDKATGPL MDEWYED VL NAGNLEED(TPO)P PVEDDPPGPE VTGRWAEHDR ALHKDKKRMA ALMRRWGHPY DADANLGYQI VDPTASMGEN VWNM AQVYN SLPPELNPLR TQHLADRGGG NTQAAVEAAR SAFDAQVVME AALLQNLEAA AQDLPKPHRL PPTAGTVACN ECGGA AWGY SFFPNTAVMF GLERPFWGDT LARLSKYWNP TQVADPARTG QLLPYGEGGL RRLLAAGGGG EDEEGGALEA VVGKAP ATT GRYRRDLELL LAHPELRDGA LRVPGGWGPE GGLQTYLRGQ QEEQARMQRR RDLAAEASPL ELAPAGK

UniProtKB: 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein

+
分子 #18: CrTam35

分子名称: CrTam35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 34.403918 KDa
配列文字列: MVHVPFFGID LPEPRLAAVM PDAVYALVQG THKLGEYAHD LVFPPTPEDL RKLEQQVNAT IPREFDRVRQ RYAEGKIAND EQL(SEP)(SEP)ELED ASFNWYRRQL RTSVVGA(TPO)DE ELEDVAVRKL RLEPPALQAS LQERALAAAV TAAGGVDLA AEVADAAALA ...文字列:
MVHVPFFGID LPEPRLAAVM PDAVYALVQG THKLGEYAHD LVFPPTPEDL RKLEQQVNAT IPREFDRVRQ RYAEGKIAND EQL(SEP)(SEP)ELED ASFNWYRRQL RTSVVGA(TPO)DE ELEDVAVRKL RLEPPALQAS LQERALAAAV TAAGGVDLA AEVADAAALA ALAEQEAETR RLLAARQARL ADLRKQLRPA HRQAIGTITN ASAGMLVGVL VVKSVLTLVR RLFRKKRPAG AKAPAGAAA RRQGSVQSSA AQLQSLAAPA ARQQQQSAAA ALASAQQAAM RPQAGASASA AAAASGKAAA SKEQPKAGAA A AAADAGAK KTRIVKKR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #19: UNK

分子名称: UNK / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 13.631775 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) Y(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) Y(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)VHVFRK (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #20: UNK

分子名称: UNK / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 7.337035 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #21: CrTam31

分子名称: CrTam31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 31.245342 KDa
配列文字列: MASTARRKPV PEAMSED(SEP)VE QEFGGDY(SEP)EA SLEYIRALGP KKGAPFAEVD PAEQAAALPP SQAECEAAKA VL ENYKRDI DALKTYRPSE QERAAIDARR ALALEATPEE LTWLKMREYY ATQRAAAADG AASTSAPGAG DAASAAADND VAA LRAEML ...文字列:
MASTARRKPV PEAMSED(SEP)VE QEFGGDY(SEP)EA SLEYIRALGP KKGAPFAEVD PAEQAAALPP SQAECEAAKA VL ENYKRDI DALKTYRPSE QERAAIDARR ALALEATPEE LTWLKMREYY ATQRAAAADG AASTSAPGAG DAASAAADND VAA LRAEML RVAMEALGSA TETEELEARA RSHLAASSAG RQWSRGVAGG AGAAASGEAS AAVLAAAADA AVASVMVGTG ARYR DDYLE EERLTRQVAK QRGQRSQAFA LSLAAAVGVS VARWWLRRGR GGAGAGGGSG GPSRSRSTQQ MQ

+
分子 #22: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

分子名称: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE / タイプ: ligand / ID: 22 / コピー数: 5 / 式: LMG
分子量理論値: 787.158 Da
Chemical component information

ChemComp-LMG:
1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

+
分子 #23: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 23 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #24: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

分子名称: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
タイプ: ligand / ID: 24 / コピー数: 3 / 式: SQD
分子量理論値: 795.116 Da
Chemical component information

ChemComp-SQD:
1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL / (2S)-1-O,2-O-ジパルミトイル-3-O-(6-スルホ-6-デオキシ-α-D-グルコピラノシル)グリセロ-ル

+
分子 #25: DIACYL GLYCEROL

分子名称: DIACYL GLYCEROL / タイプ: ligand / ID: 25 / コピー数: 2 / 式: DGA
分子量理論値: 625.018 Da
Chemical component information

ChemComp-DGA:
DIACYL GLYCEROL / 1-O,2-O-ジステアロイル-L-グリセロ-ル

+
分子 #26: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE

分子名称: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / タイプ: ligand / ID: 26 / コピー数: 2 / 式: Y01
分子量理論値: 486.726 Da
Chemical component information

ChemComp-Y01:
CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / コレステリルヘミスクシナ-ト

+
分子 #27: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

分子名称: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) / タイプ: ligand / ID: 27 / コピー数: 2 / 式: DGD
分子量理論値: 949.299 Da
Chemical component information

ChemComp-DGD:
DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

+
分子 #28: Phytosterol

分子名称: Phytosterol / タイプ: ligand / ID: 28 / コピー数: 2 / 式: A1LXL
分子量理論値: 414.707 Da

+
分子 #29: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 29 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 1.4000000000000001 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 461334
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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