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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae | |||||||||
![]() | A HAT complex from S. cerevisiae | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() : / RHOB GTPase cycle / : / RHOA GTPase cycle / cellular bud neck contractile ring / piccolo histone acetyltransferase complex / ascospore wall assembly / vacuole inheritance / actin cortical patch / mitotic actomyosin contractile ring contraction ...: / RHOB GTPase cycle / : / RHOA GTPase cycle / cellular bud neck contractile ring / piccolo histone acetyltransferase complex / ascospore wall assembly / vacuole inheritance / actin cortical patch / mitotic actomyosin contractile ring contraction / Swr1 complex / SLIK (SAGA-like) complex / Ino80 complex / SAGA complex / intracellular non-membrane-bounded organelle / establishment of cell polarity / NuA4 histone acetyltransferase complex / actin filament bundle / positive regulation of macroautophagy / protein secretion / Ub-specific processing proteases / actin filament / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; 酸無水物に作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / structural constituent of cytoskeleton / endocytosis / nucleosome / chromatin organization / hydrolase activity / chromatin remodeling / cell cycle / DNA repair / DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / chromatin / regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP binding / identical protein binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.0 Å | |||||||||
![]() | Ji LT / Zhao LX / Xu K / Gao HH / Zhou Y / Kornberg RD / Zhang HQ | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of the NuA4 histone acetyltransferase complex. 著者: Liting Ji / Lixia Zhao / Ke Xu / Huihan Gao / Yang Zhou / Roger D Kornberg / Heqiao Zhang / ![]() ![]() 要旨: Nucleosome acetyltransferase of H4 (NuA4), one of two major histone acetyltransferase complexes in specifically acetylates histone H2A and H4, resulting in increased transcriptional activity. Here ...Nucleosome acetyltransferase of H4 (NuA4), one of two major histone acetyltransferase complexes in specifically acetylates histone H2A and H4, resulting in increased transcriptional activity. Here we present a 3.8-4.0 Å resolution structure of the NuA4 complex from cryoelectron microscopy and associated biochemical studies. The determined structure comprises six subunits and appropriately 5,000 amino acids, with a backbone formed by subunits Eaf1 and Eaf2 spanning from an Actin-Arp4 module to a platform subunit Tra1. Seven subunits are missing from the cryo-EM map. The locations of missing components, Yaf9, and three subunits of the Piccolo module Esa1, Yng2, and Eaf6 were determined. Biochemical studies showed that the Piccolo module and the complete NuA4 exhibit comparable histone acetyltransferase activities, but the Piccolo module binds to nucleosomes, whereas the complete NuA4 does not. The interaction lifetime of NuA4 and nucleosome is evidently short, possibly because of subunits of the NuA4 complex that diminish the affinity of the Piccolo module for the nucleosome, enabling rapid movement from nucleosome to nucleosome. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 450.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 25.8 KB 25.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 18.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 34.8 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 442.9 MB 442.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 32.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7yfpMC ![]() 7yfnC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | A HAT complex from S. cerevisiae | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.66 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Half map B
ファイル | emd_33796_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map A
ファイル | emd_33796_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : The NuA4 histone acetyltransferase complex
全体 | 名称: The NuA4 histone acetyltransferase complex |
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要素 |
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-超分子 #1: The NuA4 histone acetyltransferase complex
超分子 | 名称: The NuA4 histone acetyltransferase complex / タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#4, #6, #5 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: Actin
分子 | 名称: Actin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 41.402184 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: EVAALVIDNG SGMCKAGFAG DDAPRAVFPS IVGRPRHQGI MVGMGQKDSY VGDEAQSKRG ILTLRYPIEH GIVTNWDDME KIWHHTFYN ELRVAPEEHP VLLTEAPMNP KSNREKMTQI MFETFNVPAF YVSIQAVLSL YSSGRTTGIV LDSGDGVTHV V PIYAGFSL ...文字列: EVAALVIDNG SGMCKAGFAG DDAPRAVFPS IVGRPRHQGI MVGMGQKDSY VGDEAQSKRG ILTLRYPIEH GIVTNWDDME KIWHHTFYN ELRVAPEEHP VLLTEAPMNP KSNREKMTQI MFETFNVPAF YVSIQAVLSL YSSGRTTGIV LDSGDGVTHV V PIYAGFSL PHAILRIDLA GRDLTDYLMK ILSERGYSFS TTAEREIVRD IKEKLCYVAL DFEQEMQTAA QSSSIEKSYE LP DGQVITI GNERFRAPEA LFHPSVLGLE SAGIDQTTYN SIMKCDVDVR KELYGNIVMS GGTTMFPGIA ERMQKEITAL APS SMKVKI IAPPERKYSV WIGGSILASL TTFQQMWISK QEYDESGPSI VHHKCF |
-分子 #2: ARP4 isoform 1
分子 | 名称: ARP4 isoform 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 54.021672 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: VYGGDEVSAV VIDPGSYTTN IGYSGSDFPQ SILPSVYGKY TADEGNKKIF SEQSIGIPRK DYELKPIIEN GLVIDWDTAQ EQWQWALQN ELYLNSNSGI PALLTEPVWN STENRKKSLE VLLEGMQFEA CYLAPTSTCV SFAAGRPNCL VVDIGHDTCS V SPIVDGMT ...文字列: VYGGDEVSAV VIDPGSYTTN IGYSGSDFPQ SILPSVYGKY TADEGNKKIF SEQSIGIPRK DYELKPIIEN GLVIDWDTAQ EQWQWALQN ELYLNSNSGI PALLTEPVWN STENRKKSLE VLLEGMQFEA CYLAPTSTCV SFAAGRPNCL VVDIGHDTCS V SPIVDGMT LSKSTRRNFI AGKFINHLIK KALEPKEIIP LFAIKQRKPE FIKKTFDYEV DKSLYDYANN RGFFQECKET LC HICPTKT LEETKTELSS TAKRSIESPW NEEIVFDNET RYGFAEELFL PKEDDIPANW PRSNSGVVKT WRNDYVPLKR TKP SGVNKS DKKVTPTEEK EQEAVSKSTS PAANSADTPN ETGKRPLEEE KPPKENNELI GLADLVYSSI MSSDVDLRAT LAHN VVLTG GTSSIPGLSD RLMTELNKIL PSLKFRILTT GHTIERQYQS WLGGSILTSL GTFHQLWVGK KEYEEVGVER LLNDR F |
-分子 #3: Chromatin modification-related protein EAF1
分子 | 名称: Chromatin modification-related protein EAF1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 112.667008 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MSSRPSSAVP NSASLSEDQS SDRSKFPKAD DLIDERDRKL TELYCVSRLN QLLELTDENK LRKEIDAFLK KNDIRRGIRF DEASLPKLL HTAATPITKK KLKDVNLINV PNQRLSDSKM SRELPENSEN VSVKSESHFV PSHDNSIREN MMDSLRPAEK T GGMWNKRP ...文字列: MSSRPSSAVP NSASLSEDQS SDRSKFPKAD DLIDERDRKL TELYCVSRLN QLLELTDENK LRKEIDAFLK KNDIRRGIRF DEASLPKLL HTAATPITKK KLKDVNLINV PNQRLSDSKM SRELPENSEN VSVKSESHFV PSHDNSIREN MMDSLRPAEK T GGMWNKRP LESTMGGEEE RHEKRQKMQS QSLESSNNSE MASLPISPRP PVPNALAHYT YYENIEYPPA DPTEVQPAVK FK DPLIKNI MAKEIDTSDH YNENNVDALE TVFLLMNDYI PSKIPQALPL AELKYMSQTL PLINLIPRAH KALTTNIINN ALN EARITV VGSRIEELRR LGLWSLRQPK RFIDPWKQHN THQNILLEEA KWMQADFKEG HKYKVAICTA MAQAIKDYWT YGEI CCVKR KTLLPGKENK LSDDGRISEK SGRPSDTSRN DSDISIAGKD DIGIIANVDD ITEKESAAAN DNDENGKNEA GAKSD FDFA DGLLSQEGAH DQIISSIDTK LLLKKPSSSS EVVLIQHEVA ASSALIETEE SKKELAPPFK LSIFVDELNT FEKTLI QDL PLYNGINEER PKKDDSLPFI PISKSVVSLD DNGFYKLLER QLIDEEPSIS QLSKRRGMFY GNRRNHYLRP PAVPSLR YL QNRTPTIWLS EDDQELVKNI NTYGYNWELI SAHMTHRLTY SYLSNIERRT PWQCFERFVQ LNERFNFSDL KGPRAHSA Q QWLIEAHKFQ QRQNRRISPL GVNTESIQRG HRRLRWASMF EAIRKCMKKR ENTPRPNPTQ PRKPLDCKNM KVPTPAEMS LLKAQRDEAL RRDIQLRRTV KNRLQQRQQQ SQQAHSSRAQ SPIPSNGKSS SNLARNGQAS APRPNQKQYT EQDIIESYSR KLLEQKPDI GPEMALKAAK NYYRTLREQQ QQLKQHQIQQ QRQQLQEESS HVQQLQQLQP GSQAPPPKSS PSQSSLSNIS N INSAPRIK SPTPQEILQR FQKQ |
-分子 #4: SWR1-complex protein 4
分子 | 名称: SWR1-complex protein 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 55.297684 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MSSSDIFDVL NIKQKSRSPT NGQVSVPSSS AANRPKPQVT GMQRELFNLL GENQPPVVIK SGNNFKEKML STSKPSPWSF VEFKANNSV TLRHWVKGSK ELIGDTPKES PYSKFNQHLS IPSFTKEEYE AFMNENEGTQ KSVESEKNHN ENFTNEKKDE S KNSWSFEE ...文字列: MSSSDIFDVL NIKQKSRSPT NGQVSVPSSS AANRPKPQVT GMQRELFNLL GENQPPVVIK SGNNFKEKML STSKPSPWSF VEFKANNSV TLRHWVKGSK ELIGDTPKES PYSKFNQHLS IPSFTKEEYE AFMNENEGTQ KSVESEKNHN ENFTNEKKDE S KNSWSFEE IEYLFNLCKK YDLRWFLIFD RYSYNNSRTL EDLKEKFYYT CRNYFKASDP SNPLLSSLNF SAEKEIERKK YL QRLLSRS AAEIAEEEAL VVESKKFEMA AKRTLAERES LLRLLDSPHS DQTITQYLTS QGMSQLYNAL LADKTRKRKH DLN IPENPW MKQQQQFAQH RQLQQLNVKK SEVKENLSPK KTKRQRQEMQ TALKRKSESA YAEQLLKDFN SDERKALGVI THGE KLSPG VYLRSTKLST FKPALQNKIL AILQELSLPS RPVMPSFDVM ERQEELLKKI NTLIDLKKHV DKYEAGMSIT K |
-分子 #5: Enhancer of polycomb-like protein 1
分子 | 名称: Enhancer of polycomb-like protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 96.889867 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MPTPSNAIEI NDGSHKSGRS TRRSGSRSAH DDGLDSFSKG DSGAGASAGS SNSRFRHRKI SVKQHLKIYL PNDLKHLDKD ELQQREVVE IETGVEKNEE KEVHLHRILQ MGSGHTKHKD YIPTPDASMT WNEYDKFYTG SFQETTSYIK FSATVEDCCG T NYNMDERD ...文字列: MPTPSNAIEI NDGSHKSGRS TRRSGSRSAH DDGLDSFSKG DSGAGASAGS SNSRFRHRKI SVKQHLKIYL PNDLKHLDKD ELQQREVVE IETGVEKNEE KEVHLHRILQ MGSGHTKHKD YIPTPDASMT WNEYDKFYTG SFQETTSYIK FSATVEDCCG T NYNMDERD ETFLNEQVNK GSSDILTEDE FEILCSSFEH AIHERQPFLS MDPESILSFE ELKPTLIKSD MADFNLRNQL NH EINSHKT HFITQFDPVS QMNTRPLIQL IEKFGSKIYD YWRERKIEVN GYEIFPQLKF ERPGEKEEID PYVCFRRREV RHP RKTRRI DILNSQRLRA LHQELKNAKD LALLVAKREN VSLNWINDEL KIFDQRVKIK NLKRSLNISG EDDDLINHKR KRPT IVTVE QREAELRKAE LKRAAAAAAA AKAKNNKRNN QLEDKSSRLT KQQQQQLLQQ QQQQQQNALK TENGKQLANA SSSST SQPI TSHVYVKLPS SKIPDIVLED VDALLNSKEK NARKFVQEKM EKRKIEDADV FFNLTDDPFN PVFDMSLPKN FSTSNV PFA SIASSKFQID RSFYSSHLPE YLKGISDDIR IYDSNGRSRN KDNYNLDTKR IKKTELYDPF QENLEIHSRE YPIKFRK RV GRSNIKYVDR MPNFTTSSTK SACSLMDFVD FDSIEKEQYS REGSNDTDSI NVYDSKYDEF VRLYDKWKYD SPQNEYGI K FSDEPARLNQ ISNDTQVIRF GTMLGTKSYE QLREATIKYR RDYITRLKQK HIQHLQQQQQ QQQQQQQQAQ QQKQKSQNN NSNSSNSLKK LNDSLINSEA KQNSSITQKN SS |
-分子 #6: Transcription-associated protein 1
分子 | 名称: Transcription-associated protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 433.677281 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MSLTEQIEQF ASRFRDDDAT LQSRYSTLSE LYDIMELLNS PEDYHFFLQA VIPLLLNQLK EVPISYDAHS PEQKLRNSML DIFNRCLMN QTFQPYAMEV LEFLLSVLPK ENEENGILCM KVLTTLFKSF KSILQDKLDS FIRIIIQIYK NTPNLINQTF Y EAGKAEQG ...文字列: MSLTEQIEQF ASRFRDDDAT LQSRYSTLSE LYDIMELLNS PEDYHFFLQA VIPLLLNQLK EVPISYDAHS PEQKLRNSML DIFNRCLMN QTFQPYAMEV LEFLLSVLPK ENEENGILCM KVLTTLFKSF KSILQDKLDS FIRIIIQIYK NTPNLINQTF Y EAGKAEQG DLDSPKEPQA DELLDEFSKN DEEKDFPSKQ SSTEPRFENS TSSNGLRSSM FSFKILSECP ITMVTLYSSY KQ LTSTSLP EFTPLIMNLL NIQIKQQQEA REQAESRGEH FTSISTEIIN RPAYCDFILA QIKATSFLAY VFIRGYAPEF LQD YVNFVP DLIIRLLQDC PSELSSARKE LLHATRHILS TNYKKLFLPK LDYLFDERIL IGNGFTMHET LRPLAYSTVA DFIH NIRSE LQLSEIEKTI KIYTGYLLDE SLALTVQIMS AKLLLNLVER ILKLGKENPQ EAPRAKKLLM IIIDSYMNRF KTLNR QYDT IMKYYGRYET HKKEKAEKLK NSIQDNDKES EEFMRKVLEP SDDDHLMPQP KKEDINDSPD VEMTESDKVV KNDVEM FDI KNYAPILLLP TPTNDPIKDA FYLYRTLMSF LKTIIHDLKV FNPPPNEYTV ANPKLWASVS RVFSYEEVIV FKDLFHE CI IGLKFFKDHN EKLSPETTKK HFDISMPSLP VSATKDAREL MDYLAFMFMQ MDNATFNEII EQELPFVYER MLEDSGLL H VAQSFLTSEI TSPNFAGILL RFLKGKLKDL GNVDFNTSNV LIRLFKLSFM SVNLFPNINE VVLLPHLNDL ILNSLKYST TAEEPLVYFY LIRTLFRSIG GGRFENLYRS IKPILQVLLQ SLNQMILTAR LPHERELYVE LCITVPVRLS VLAPYLPFLM KPLVFALQQ YPDLVSQGLR TLELCIDNLT AEYFDPIIEP VIDDVSKALF NLLQPQPFNH AISHNVVRIL GKLGGRNRQF L KPPTDLTE KTELDIDAIA DFKINGMPED VPLSVTPGIQ SALNILQSYK SDIHYRKSAY KYLTCVLLLM TKSSAEFPTN YT ELLKTAV NSIKLERIGI EKNFDLEPTV NKRDYSNQEN LFLRLLESVF YATSIKELKD DAMDLLNNLL DHFCLLQVNT TLL NKRNYN GTFNIDLKNP NFMLDSSLIL DAIPFALSYY IPEVREVGVL AYKRIYEKSC LIYGEELALS HSFIPELAKQ FIHL CYDET YYNKRGGVLG IKVLIDNVKS SSVFLKKYQY NLANGLLFVL KDTQSEAPSA ITDSAEKLLI DLLSITFADV KEEDL GNKV LENTLTDIVC ELSNANPKVR NACQKSLHTI SNLTGIPIVK LMDHSKQFLL SPIFAKPLRA LPFTMQIGNV DAITFC LSL PNTFLTFNEE LFRLLQESIV LADAEDESLS TNIQKTTEYS TSEQLVQLRI ACIKLLAIAL KNEEFATAQQ GNIRIRI LA VFFKTMLKTS PEIINTTYEA LKGSLAENSK LPKELLQNGL KPLLMNLSDH QKLTVPGLDA LSKLLELLIA YFKVEIGR K LLDHLTAWCR VEVLDTLFGQ DLAEQMPTKI IVSIINIFHL LPPQADMFLN DLLLKVMLLE RKLRLQLDSP FRTPLARYL NRFHNPVTEY FKKNMTLRQL VLFMCNIVQR PEAKELAEDF EKELDNFYDF YISNIPKNQV RVVSFFTNMV DLFNTMVITN GDEWLKKKG NMILKLKDML NLTLKTIKEN SFYIDHLQLN QSIAKFQALY LRFTELSERD QNPLLLDFID FSFSNGIKAS Y SLKKFIFH NIIASSNKEK QNNFINDATL FVLSDKCLDA RIFVLKNVIN STLIYEVATS GSLKSYLVED KKPKWLELLH NK IWKNSNA ILAYDVLDHH DLFRFELLQL SAIFIKADPE IIAEIKKDII KFCWNFIKLE DTLIKQSAYL VTSYFISKFD FPI KVVTQV FVALLRSSHV EARYLVKQSL DVLTPVLHER MNAAGTPDTW INWVKRVMVE NSSSQNNILY QFLISHPDLF FNSR DLFIS NIIHHMNKIT FMSNSNSDSH TLAIDLASLI LYWENKTLEI TNVNNTKTDS DGDVVMSDSK SDINPVEADT TAIIV DANN NSPISLHLRE ACTAFLIRYV CASNHRAIET ELGLRAINIL SELISDKHWT NVNVKLVYFE KFLIFQDLDS ENILYY CMN ALDVLYVFFK NKTKEWIMEN LPTIQNLLEK CIKSDHHDVQ EALQKVLQVI MKAIKAQGVS VIIEEESPGK TFIQMLT SV ITQDLQETSS VTAGVTLAWV LFMNFPDNIV PLLTPLMKTF SKLCKDHLSI SQPKDAMALE EARITTKLLE KVLYILSL K VSLLGDSRRP FLSTVALLID HSMDQNFLRK IVNMSRSWIF NTEIFPTVKE KAAILTKMLA FEIRGEPSLS KLFYEIVLK LFDQEHFNNT EITVRMEQPF LVGTRVEDIG IRKRFMTILD NSLERDIKER LYYVIRDQNW EFIADYPWLN QALQLLYGSF NREKELSLK NIYCLSPPSI LQEYLPENAE MVTEVNDLEL SNFVKGHIAS MQGLCRIISS DFIDSLIEIF YQDPKAIHRA W VTLFPQVY KSIPKNEKYG FVRSIITLLS KPYHTRQISS RTNVINMLLD SISKIESLEL PPHLVKYLAI SYNAWYQSIN IL ESIQSNT SIDNTKIIEA NEDALLELYV NLQEEDMFYG LWRRRAKYTE TNIGLSYEQI GLWDKAQQLY EVAQVKARSG ALP YSQSEY ALWEDNWIQC AEKLQHWDVL TELAKHEGFT DLLLECGWRV ADWNSDRDAL EQSVKSVMDV PTPRRQMFKT FLAL QNFAE SRKGDQEVRK LCDEGIQLSL IKWVSLPIRY TPAHKWLLHG FQQYMEFLEA TQIYANLHTT TVQNLDSKAQ EIKRI LQAW RDRLPNTWDD VNMWNDLVTW RQHAFQVINN AYLPLIPALQ QSNSNSNINT HAYRGYHEIA WVINRFAHVA RKHNMP DVC ISQLARIYTL PNIEIQEAFL KLREQAKCHY QNMNELTTGL DVISNTNLVY FGTVQKAEFF TLKGMFLSKL RAYEEAN QA FATAVQIDLN LAKAWAQWGF FNDRRLSEEP NNISFASNAI SCYLQAAGLY KNSKIRELLC RILWLISIDD ASGMLTNA F DSFRGEIPVW YWITFIPQLL TSLSHKEANM VRHILIRIAK SYPQALHFQL RTTKEDFAVI QRQTMAVMGD KPDTNDRNG RRQPWEYLQE LNNILKTAYP LLALSLESLV AQINDRFKST TDEDLFRLIN VLLIDGTLNY NRLPFPRKNP KLPENTEKNL VKFSTTLLA PYIRPKFNAD FIDNKPDYET YIKRLRYWRR RLENKLDRAS KKENLEVLCP HLSNFHHQKF EDIEIPGQYL L NKDNNVHF IKIARFLPTV DFVRGTHSSY RRLMIRGHDG SVHSFAVQYP AVRHSRREER MFQLYRLFNK SLSKNVETRR RS IQFNLPI AIPLSPQVRI MNDSVSFTTL HEIHNEFCKK KGFDPDDIQD FMADKLNAAH DDALPAPDMT ILKVEIFNSI QTM FVPSNV LKDHFTSLFT QFEDFWLFRK QFASQYSSFV FMSYMMMINN RTPHKIHVDK TSGNVFTLEM LPSRFPYERV KPLL KNHDL SLPPDSPIFH NNEPVPFRLT PNIQSLIGDS ALEGIFAVNL FTISRALIEP DNELNTYLAL FIRDEIISWF SNLHR PIIE NPQLREMVQT NVDLIIRKVA QLGHLNSTPT VTTQFILDCI GSAVSPRNLA RTDVNFMPWF |
-分子 #7: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子 | 名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 1 / 式: ATP |
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分子量 | 理論値: 507.181 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-ATP: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.3 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
+
画像解析
-原子モデル構築 1
初期モデル | Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model |
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精密化 | プロトコル: RIGID BODY FIT |
得られたモデル | ![]() PDB-7yfp: |