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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | Bacteriophage HRP29 Asymmetric Reconstruction | |||||||||||||||
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![]() | Shigella phage HRP29 != Shigella phage Buco Shigella phage HRP29
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![]() | HRP29 / VIRUS | |||||||||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.1 Å | |||||||||||||||
![]() | Subramanian S / Bergland Drarvik SM / Parent KN | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of Shigella bacteriophage HRP29 著者: Subramanian S / Bergland Drarvik SM / Parent KN | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 207.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.7 KB 13.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 28 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 205.4 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 1.9 GB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() | 1.6 GB 1.6 GB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 969.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 969.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 35.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 47.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.632 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_28227_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_28227_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Shigella phage HRP29
全体 | 名称: Shigella phage HRP29 |
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要素 |
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-超分子 #1: Shigella phage Buco
超分子 | 名称: Shigella phage Buco / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / NCBI-ID: 2530183 / 生物種: Shigella phage Buco / ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: OTHER / ウイルス・エンベロープ: No / ウイルス・中空状態: No |
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宿主 | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 構成要素:
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 33.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |