ChemComp-25L: [[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-amin...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 25L
名称	名称: [[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-3-hydroxy-oxolan- ...名称: [[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate 別称: 2'-5'-oligoadenylate trimer

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: 25L

名称

名称: [[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-3-hydroxy-oxolan- ...
別称: 2'-5'-oligoadenylate trimer

組成

組成式: C₃₀H₄₀N₁₅O₂₅P₅ / 原子数: 115 / 化学式量: 1165.593 / 形式電荷: 0

その他

3jqi
PDB 未公開エントリ

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 25L / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3JQI

履歴

作成	2009年9月15日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
公開	2014年2月5日
Modify synonyms	2021年3月1日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

CACTVS 3.352	Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[CH]4[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[CH]5[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH]5n6cnc7c(N)ncnc67)O[CH]4n8cnc9c(N)ncnc89)[CH](O)[CH]3O
OpenEye OEToolkits 1.7.0	c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OC4C(C(OC4n5cnc6c5ncnc6N)COP(=O)(O)OC7C(C(OC7n8cnc9c8ncnc9N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O)O)N

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.352	Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[C@@H]4[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[C@@H]5[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H]5n6cnc7c(N)ncnc67)O[C@H]4n8cnc9c(N)ncnc89)[C@@H](O)[C@H]3O
OpenEye OEToolkits 1.7.0	c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H](O[C@H]4n5cnc6c5ncnc6N)CO[P@](=O)(O)O[C@@H]7[C@@H]([C@H](O[C@H]7n8cnc9c8ncnc9N)CO[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O)O)N

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C30H40N15O25P5/c31-22-13-25(37-4-34-22)43(7-40-13)28-19(49)16(46)10(64-28)1-61-72(53,54)67-20-17(47)11(65-29(20)44-8-41-14-23(32)35-5-38-26(14)44)2-62-73(55,56)68-21-18(48)12(3-63-74(57,58)70-75(59,60)69-71(50,51)52)66-30(21)45-9-42-15-24(33)36-6-39-27(15)45/h4-12,16-21,28-30,46-49H,1-3H2,(H,53,54)(H,55,56)(H,57,58)(H,59,60)(H2,31,34,37)(H2,32,35,38)(H2,33,36,39)(H2,50,51,52)/t10-,11-,12-,16-,17-,18-,19-,20-,21-,28-,29-,30-/m1/s1

InChI 1.03

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InChIKey

InChI 1.03	RTAGLZBJCCVJET-UQTMIEBXSA-N

全6件を表示しています

PDB-4o1o:
Crystal Structure of RNase L in complex with 2-5A

PDB-4o1p:
Crystal Structure of RNase L in complex with 2-5A and AMP-PNP

PDB-6m12:
Crystal Structure of Rnase L in complex with SU11652

PDB-6m13:
Crystal structure of Rnase L in complex with Toceranib

PDB-7elw:
Crystal structure of RNase L in complex with Myricetin

PDB-7ucw:
Structure of mouse Decr1 in complex with 2'-5' oligoadenylate

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関連情報:EMDBヘッダ

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URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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