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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rgc | ||||||
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タイトル | THE COMPLEX BETWEEN RIBONUCLEASE T1 AND 3'-GUANYLIC ACID SUGGESTS GEOMETRY OF ENZYMATIC REACTION PATH. AN X-RAY STUDY | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE T1 | ||||||
![]() | HYDROLASE(ENDORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() hyphal tip / ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / cell septum / endonuclease activity / lyase activity / RNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Heydenreich, A. / Koellner, G. / Choe, H.W. / Cordes, F. / Kisker, C. / Schindelin, H. / Adamiak, R. / Hahn, U. / Saenger, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The complex between ribonuclease T1 and 3'GMP suggests geometry of enzymic reaction path. An X-ray study. 著者: Heydenreich, A. / Koellner, G. / Choe, H.W. / Cordes, F. / Kisker, C. / Schindelin, H. / Adamiak, R. / Hahn, U. / Saenger, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 51.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 39 / 2: CIS PROLINE - PRO A 55 / 3: CIS PROLINE - PRO B 39 / 4: CIS PROLINE - PRO B 55 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11094.694 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.19 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.81 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 4 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 2.2 Å / % possible obs: 76 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2→10 Å / σ(F): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 11338 / σ(F): 1 / Rfactor obs: 0.153 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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