[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルStructural insights into the substrate uptake and inhibition of the human creatine transporter (hCRT).
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 122, Issue 36, Page e2426135122, Year 2025
掲載日2025年9月9日
著者Xinyi Yuan / Jian Yin / Chang Liu / Xudong Chen / Meiying Chen / Yixue Wang / Zi Yang / Yue Wang / Li Jiang / Niyun Zhou / Xiaojuan Wang / Botong Liu / Zhaoqi Ma / Kaiyan Wang / Hongen Li / Sensen Zhang / Yongfeng Shang / Maojun Yang /
PubMed 要旨Creatine plays a vital role in cellular energy production and adenosine triphosphate (ATP) homeostasis and has also been identified as a neurotransmitter in the mammalian brain. Creatine is ...Creatine plays a vital role in cellular energy production and adenosine triphosphate (ATP) homeostasis and has also been identified as a neurotransmitter in the mammalian brain. Creatine is transported into cells by the human creatine transporter (hCRT) (SLC6A8), an Na/Cl-dependent symporter encoded on the X chromosome. Mutations in hCRT cause cerebral creatine deficiency syndrome 1, a neurological disorder marked by intellectual disability, speech delay, and seizures. Beyond its role in the brain and muscle, hCRT is highly expressed in metabolically active tumors. Many cancer cells, including colorectal cancer and glioblastoma, upregulate hCRT to sustain intracellular creatine levels and buffer ATP under energy stress. Pharmacological blockade of hCRT by RGX202 has been shown to impair tumor growth by disrupting energy homeostasis. Here, we report the high-resolution cryo-Electron Microscopy (cryo-EM) structures of human hCRT in three states: apo, creatine-bound, and RGX202-bound. hCRT adopts a canonical LeuT-fold with 12 transmembrane helices and two pseudosymmetric inverted repeats. Creatine is coordinated in the central substrate-binding site through interactions with transmembrane helices TM1, TM3, TM6, and TM8, while the inhibitor RGX202 occupies the same binding pocket, engaging in overlapping contacts that competitively block creatine access. Our structural and mechanistic findings clarify substrate recognition and inhibitory binding of hCRT, providing a molecular rationale for targeting hCRT in both inherited metabolic diseases and cancer therapy.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:40892912 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.75 - 3.28 Å
構造データ

64853

9v8w

EMDB-64853, PDB-9v8w:
membrane protein S6A8 with RGX
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.75 Å

64854

9v8x

EMDB-64854, PDB-9v8x:
membrane protein S6A8 with Crea
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.85 Å

64855

9v8y

EMDB-64855, PDB-9v8y:
membrane protein S6A8 apo
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.28 Å

化合物

ChemComp-NA:
Unknown entry

ChemComp-CL:
Unknown entry

PDB-1d9s:
TUMOR SUPPRESSOR P15(INK4B) STRUCTURE BY COMPARATIVE MODELING AND NMR DATA

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-CRN:
N-[(E)-AMINO(IMINO)METHYL]-N-METHYLGLYCINE

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / membrane protein S6A8 / membrane protein S6A8 with Crea / membrane protein S6A8 apo

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る