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Structure paper

タイトルStructural insights into PSL polysaccharide assembly and export to the cell surface via the Wzx/Wzy-dependent pathway.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Year 2026
掲載日2026年6月16日
著者Jiao Liu / Yanlong Han / Lanxin Wang / Luyan Z Ma / Dongchun Ni / Yihua Huang /
PubMed 要旨Bacterial extracellular polysaccharides play a crucial role in mediating pathogen-host interactions and bacterial fitness via biofilm formation. The Wzx/Wzy-dependent pathway is the most prevalent ...Bacterial extracellular polysaccharides play a crucial role in mediating pathogen-host interactions and bacterial fitness via biofilm formation. The Wzx/Wzy-dependent pathway is the most prevalent and conserved strategy for polysaccharide biosynthesis. Psl (polysaccharide synthesis locus) is a key biofilm matrix polysaccharide in Pseudomonas aeruginosa PAO1, and its biosynthesis machinery is predicted to be a Wzx/Wzy-dependent biosynthesis system. Here, using Psl in PAO1 as a model strain, we determine the cryo-EM structures of the PslD-PslE complex. These structures reveal that PslD-PslE complex forms a continuous, protected conduit across the entire cell envelope. Further structural and functional analyses demonstrate that the polymerase PslJ, is likely localized in the membrane lumen formed by the octameric arrangement of PslE's transmembrane helical pairs. We propose a mechanistic model in which Und-PP-linked pentasaccharide units of Psl access PslJ through side portals in the PslE octamer, shielding the polymerization and translocation processes from degradation by PlsG, a periplasm-localized endoglycosidase. The iterative addition of incoming repeat units to the reducing terminus of the growing polysaccharide chain is hypothesized to drive Psl export through the channel, a mechanism that may be conserved across the Wzx/Wzy-dependent polysaccharide biosynthesis pathways.
リンクNat Commun / PubMed:42303631
手法EM (単粒子)
解像度2.89 - 3.06 Å
構造データ

64802

9v6l

EMDB-64802, PDB-9v6l:
Psl polysaccharide related protein structures
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

64810

9v75

EMDB-64810, PDB-9v75:
Psl polysaccharide related protein structures
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.89 Å

由来
  • pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
キーワードPROTEIN TRANSPORT / complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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