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タイトルStructures of butyrophilin multimers reveal a plier-like mechanism for Vγ9Vδ2 T cell receptor activation.
ジャーナル・号・ページImmunity, Vol. 58, Issue 7, Page 1660-11669.e7, Year 2025
掲載日2025年7月8日
著者Mai Zhang / Yiqing Wang / Ningning Cai / Yingying Qu / Xianqiang Ma / Jing Xue / Xiaorui Chen / Xueguang Zhang / Junyu Xiao / Yonghui Zhang /
PubMed 要旨Vγ9Vδ2 T cells, the major circulating human γδ T cell subset, respond to infections and tumors by recognizing phosphoantigens (pAgs) via transmembrane butyrophilins (BTN3A1, BTN3A2, and BTN2A1). ...Vγ9Vδ2 T cells, the major circulating human γδ T cell subset, respond to infections and tumors by recognizing phosphoantigens (pAgs) via transmembrane butyrophilins (BTN3A1, BTN3A2, and BTN2A1). Here, using cryoelectron microscopy, we resolved the structures of BTN multimers bound to the microbial pAg HMBPP alone and in complex with the T cell receptor (TCR). These structures reveal that BTN3A1 and BTN2A1 cooperate to sense pAgs through their intracellular B30.2 domains, whereas BTN3A2 and BTN2A1 interact extracellularly. TCR engagement triggers its conformational changes, allowing BTN2A1 to bind the Vγ9 chain laterally and BTN3A2 to interact apically with the Vδ2 chain's germline-encoded regions and CDR3 motif, as well as the Vγ9 CDR3. Our study uncovers a "plier-like gripping" mechanism, where BTN multimers bridge the TCR surface to drive activation. These findings establish a structural foundation for γδ T cell-targeted immunotherapies distinct from αβ T cell strategies reliant on major-histocompatibility-complex-mediated antigen presentation.
リンクImmunity / PubMed:40505658
手法EM (単粒子)
解像度3.0 - 4.51 Å
構造データ

61724

9jq6

EMDB-61724, PDB-9jq6:
Cryo-EM structure of BTN2A1 in complex with antagonist antibody TH002
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.34 Å

61732

9jqp

EMDB-61732, PDB-9jqp:
Cryo-EM structure of the HMBPP-primed BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 in complex with agonist antibody TH001
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.34 Å

EMDB-61733: Extracellular region of the HMBPP-primed BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex (EMReady)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.17 Å

EMDB-61734: TM/JM/B30.2 regions of the HMBPP-primed BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex (EMReady)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.58 Å

EMDB-61735: Raw consensus map of the HMBPP-primed BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.74 Å

61736

9jqq

EMDB-61736, PDB-9jqq:
Cryo-EM structure of the HMBPP-primed BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.26 Å

EMDB-61737: Extracellular region of the Vgamma9Vdelta2 TCR-engaged BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex (EMReady)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.21 Å

EMDB-61738: TM/JM/B30.2 regions of the Vgamma9Vdelta2 TCR-engaged BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex (EMReady)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.51 Å

EMDB-61739: Raw consensus map of the Vgamma9Vdelta2 TCR-engaged BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.22 Å

61740

9jqr

EMDB-61740, PDB-9jqr:
Cryo-EM structure of the Vgamma9Vdelta2 TCR-engaged BTN3A1-BTN3A2-BTN2A1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-H6P:
(2E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl trihydrogen diphosphate / HMBPP

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードIMMUNE SYSTEM / receptor / butyrophilin / antagonist / antibody / agonist / phosphoantigen

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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