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タイトルA Novel α-Synuclein K58N Missense Variant in a Patient with Parkinson's Disease.
ジャーナル・号・ページMov Disord, Vol. 40, Issue 12, Page 2732-2745, Year 2025
掲載日2025年9月4日
著者Mohammed Al-Azzani / Sandrina Weber / Nagendran Ramalingam / Maria Ramón / Liana Shvachiy / Gonçalo Mestre / Michael Zech / Kevin Sicking / Alain Ibáñez de Opakua / Vidyashree Jayanthi / Leslie Amaral / Aishwarya Agarwal / Aswathy Chandran / Susana R Chaves / Juliane Winkelmann / Claudia Trenkwalder / Maike Schwager / Silke Pauli / Ulf Dettmer / Claudio O Fernández / Janin Lautenschläger / Markus Zweckstetter / Ruben Fernandez-Busnadiego / Brit Mollenhauer / Tiago Fleming Outeiro /
PubMed 要旨BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is a complex multifactorial disorder with a genetic component in about 15% of cases. Multiplications and point mutations in SNCA gene, encoding α-synuclein (aSyn) ...BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is a complex multifactorial disorder with a genetic component in about 15% of cases. Multiplications and point mutations in SNCA gene, encoding α-synuclein (aSyn), are linked to rare familial forms of PD.
OBJECTIVE: Our goal was to assess the clinical presentation and the biological effects of a novel K58N aSyn mutation identified in a patient with PD.
手法: We describe the clinical presentation associated with the novel mutation, together with genetic testing through whole exome sequencing (WES). Furthermore, we conducted extensive biophysical and cellular assays to assess the functional consequences of this novel variant.
RESULTS: The patient exhibited typical features of sporadic PD with early onset and a benign disease course. WES showed a novel heterozygous missense variant in SNCA (NM_000345.4, c.174G>C; p.K58N). A positive family history of PD was evident, because both a parent and a grandparent had been diagnosed with PD but were deceased. The patient underwent deep brain stimulation surgery 13 years postdiagnosis, showing stable, long-term improvements in motor symptoms. Biophysical studies demonstrated K58N substitution causes local structural effects, disrupts membrane binding, and enhances aSyn in vitro aggregation. In cellular systems, K58N aSyn produces fewer inclusions per cell and does not form condensates. The variant increases aSyn cytoplasmic distribution and displays aberrant activity-dependent dynamic serine-129 phosphorylation.
CONCLUSIONS: The clinical presentation associated with the novel K58N aSyn mutation suggests a relatively benign PD course consistent with the phenotypic spectrum of idiopathic PD. Overall, our molecular studies provide novel insight into the biology and pathobiology of aSyn. © 2025 The Author(s). Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.
リンクMov Disord / PubMed:40905240 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.0 - 3.7 Å
構造データ

52166

9hgs

EMDB-52166, PDB-9hgs:
In vitro grown G14R Alpha-Synuclein Fibrils
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

52458

9hxa

EMDB-52458, PDB-9hxa:
In vitro grown K58N Alpha-Synuclein Fibrils
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Alpha-Synuclein / G14R Mutation / Fibrils / Cryo-EM / Protein Aggregation / Amyloid Structure / K58N Mutation

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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