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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Molecular Basis of Sulfosugar Selectivity in Sulfoglycolysis.
ジャーナル・号・ページ	Acs Cent. Sci., Vol. 7, Page 476-487, Year 2021
掲載日	2020年9月21日 (構造データの登録日)
著者	Sharma, M. / Abayakoon, P. / Epa, R. / Jin, Y. / Lingford, J.P. / Shimada, T. / Nakano, M. / Mui, J.W. / Ishihama, A. / Goddard-Borger, E.D. ...Sharma, M. / Abayakoon, P. / Epa, R. / Jin, Y. / Lingford, J.P. / Shimada, T. / Nakano, M. / Mui, J.W. / Ishihama, A. / Goddard-Borger, E.D. / Davies, G.J. / Williams, S.J.
リンク	Acs Cent. Sci. / PubMed:33791429
手法	X線回折
解像度	1.5 - 2.97 Å
構造データ	PDB-7ag1: Crystal structure of E. coli SFP aldolase (YihT) from sulfo-EMP pathway 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.0 Å PDB-7ag4: Crystal structure of active site mutant of SQ Isomerase (YihS-H248A) from Salmonella enterica in complex with sulfofructose (SF) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.13 Å PDB-7ag6: Crystal structure of SF kinase YihV from E. coli in complex with sulfofructose (SF), ADP-Mg 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.08 Å PDB-7ag7: Crystal structure of SFP aldolase YihT from Salmonella enterica in complex with sulfate bound at the active site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å PDB-7agh: Crystal structure of SF kinase YihV from E. coli in complex with AMPPNP-Mg 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.93 Å PDB-7agk: Crystal structure of E. coli SF kinase (YihV) in complex with product sulfofructose phosphate (SFP) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.97 Å PDB-7ne2: Crystal structure of class I SFP aldolase YihT from Salmonella enterica with SFP/ DHAP (Schiff base complex with active site Lys193) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.5 Å
化合物	ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-RB8: 6-deoxy-6-sulfo-D-fructose ChemComp-ADP: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子YM / アデノシン二リン酸 ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン / 硫酸塩 ChemComp-ANP: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / AMP-PNP / AMP-PNP, エネルギー貯蔵分子類似体YM ChemComp-RAH: [(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]methanesulfonic acid ChemComp-U8W: (2~{S},3~{S},4~{R})-2,3,4,5-tetrakis(oxidanyl)-6-phosphonooxy-hexane-1-sulfonic acid ChemComp-U8Z: [(~{E})-2,3-bis(oxidanyl)prop-1-enyl] dihydrogen phosphate
由来	escherichia coli (strain k12) (大腸菌) salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720) (サルモネラ菌) salmonella enterica (サルモネラ菌)
キーワード	LYASE (リアーゼ) / sulfofructose phosphate / SFP aldolase / sulfoglycolysis / sulfolactaldehyde / sulfoEMP / ISOMERASE (異性化酵素) / sulfofructose / sulfoquinovose / SQ isomerase / TRANSFERASE (転移酵素) / SF kinase / carbohydrate kinase / sulfoEMP pathway / class I / DHAP / dihydroxyacetone phosphate (ジヒドロキシアセトンリン酸)